267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0357 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_0357  50S ribosomal protein L10  100 
 
 
178 aa  351  2.9999999999999997e-96  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.395491  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0479  50S ribosomal protein L10  43.02 
 
 
179 aa  136  1e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.488036  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0464  50S ribosomal protein L10  43.02 
 
 
179 aa  136  1e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0359791  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1784  50S ribosomal protein L10  37.64 
 
 
181 aa  130  9e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0504  50S ribosomal protein L10  36.52 
 
 
180 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000340487  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2722  50S ribosomal protein L10P  35.63 
 
 
178 aa  97.8  7e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000314918  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0857  50S ribosomal protein L10  33.15 
 
 
177 aa  91.3  6e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000259828  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0700  ribosomal protein L10  31.46 
 
 
174 aa  90.1  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.299689  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0838  50S ribosomal protein L10P  35.47 
 
 
172 aa  89.7  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0707377  normal  0.0995834 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0310  ribosomal protein L10  33.33 
 
 
176 aa  87.4  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.109625  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1529  ribosomal protein L10  33.33 
 
 
183 aa  86.7  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000554953  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01070  ribosomal protein L10  29.94 
 
 
172 aa  86.7  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  5.51299e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1059  50S ribosomal protein L10  32.2 
 
 
174 aa  85.1  5e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0531801  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0205  50S ribosomal protein L10  30.11 
 
 
181 aa  84.7  7e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000665859  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0671  50S ribosomal protein L10  28.25 
 
 
174 aa  82.8  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0408  50S ribosomal protein L10  28 
 
 
174 aa  82.4  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.79305e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2470  50S ribosomal protein L10  33.33 
 
 
176 aa  82.4  0.000000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0147283  hitchhiker  0.00682166 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1172  ribosomal protein L10  27.68 
 
 
173 aa  82.8  0.000000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000357466  unclonable  0.0000000289216 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0183  ribosomal protein L10  27.27 
 
 
176 aa  82.4  0.000000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000324199  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0276  50S ribosomal protein L10  29.21 
 
 
175 aa  81.3  0.000000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000204852  hitchhiker  0.000495958 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0692  50S ribosomal protein L10  31.46 
 
 
172 aa  80.5  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000112903  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1372  50S ribosomal protein L10  32.08 
 
 
178 aa  80.9  0.00000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.188772  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0924  50S ribosomal protein L10  28.81 
 
 
173 aa  79.3  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3337  50S ribosomal protein L10  28.81 
 
 
173 aa  79.3  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000271161 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2865  50S ribosomal protein L10  29.38 
 
 
174 aa  78.2  0.00000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.161934  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08440  ribosomal protein L10  32.1 
 
 
173 aa  77  0.0000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.166227  normal  0.704722 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0300  ribosomal protein L10  32.39 
 
 
181 aa  76.3  0.0000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000817286  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2722  ribosomal protein L10  29.38 
 
 
170 aa  76.6  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0525449  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2994  50S ribosomal protein L10  29.78 
 
 
173 aa  75.5  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1956  ribosomal protein L10  30.49 
 
 
174 aa  75.5  0.0000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0213  ribosomal protein L10  28.49 
 
 
175 aa  75.5  0.0000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.623588  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2164  50S ribosomal protein L10P  30.17 
 
 
174 aa  74.3  0.0000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0596262  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0617  50S ribosomal protein L10  28.25 
 
 
174 aa  73.9  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000383704 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1018  50S ribosomal protein L10  28.19 
 
 
178 aa  71.6  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00251564 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0232  50S ribosomal protein L10  27.68 
 
 
172 aa  71.6  0.000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0685965  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1106  ribosomal protein L10  28.09 
 
 
176 aa  70.9  0.000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0567771  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0562  50S ribosomal protein L10  28.16 
 
 
166 aa  70.5  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000233555  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02410  ribosomal protein L10  30.43 
 
 
173 aa  70.5  0.00000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.609192 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1509  ribosomal protein L10  27.93 
 
 
176 aa  70.9  0.00000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000272992  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0389  ribosomal protein L10  27.91 
 
 
174 aa  70.5  0.00000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0140  50S ribosomal protein L10  26.25 
 
 
174 aa  70.9  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000236563  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0576  50S ribosomal protein L10  28.16 
 
 
166 aa  70.5  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000179203  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0424  50S ribosomal protein L10  26.97 
 
 
171 aa  69.7  0.00000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000721465  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1547  50S ribosomal protein L10  28.49 
 
 
173 aa  69.3  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.834427 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0297  50S ribosomal protein L10  30.56 
 
 
172 aa  68.9  0.00000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0313  50S ribosomal protein L10  28.32 
 
 
166 aa  68.6  0.00000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000558823  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0991  50S ribosomal protein L10  28.24 
 
 
176 aa  68.2  0.00000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000204805  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_863  ribosomal protein L10  28.24 
 
 
176 aa  67.8  0.00000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000130926  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1018  ribosomal protein L10  31.39 
 
 
202 aa  67.4  0.00000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1337  50S ribosomal protein L10  29.03 
 
 
174 aa  67  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.900212  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0317  50S ribosomal protein L10  26.86 
 
 
173 aa  67  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.146286  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1927  ribosomal protein L10  27.12 
 
 
176 aa  67  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0948645  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0745  50S ribosomal protein L10  23.73 
 
 
171 aa  67  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00501407 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0488  50S ribosomal protein L10  26.86 
 
 
173 aa  67  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.169718  hitchhiker  0.00000169108 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1821  ribosomal protein L10  26.74 
 
 
179 aa  66.6  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1453  50S ribosomal protein L10  28.09 
 
 
173 aa  66.6  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1474  50S ribosomal protein L10  27.27 
 
 
181 aa  65.9  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000103472  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0096  50S ribosomal protein L10  30.87 
 
 
166 aa  65.1  0.0000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2850  50S ribosomal protein L10  28.4 
 
 
165 aa  64.7  0.0000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.675463 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1821  50S ribosomal protein L10  27.06 
 
 
172 aa  64.7  0.0000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0871653  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0265  50S ribosomal protein L10  27.27 
 
 
172 aa  64.7  0.0000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0361  50S ribosomal protein L10  27.01 
 
 
190 aa  64.3  0.0000000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000502234  hitchhiker  0.0000804712 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0180  50S ribosomal protein L10  25.86 
 
 
166 aa  63.9  0.000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0693527  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0351  50S ribosomal protein L10  25.42 
 
 
171 aa  63.9  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.703447 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0337  50S ribosomal protein L10  25.42 
 
 
171 aa  63.9  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.635722  normal  0.581622 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1569  50S ribosomal protein L10  29.61 
 
 
175 aa  63.9  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2676  ribosomal protein L10  30.07 
 
 
174 aa  63.5  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000001837  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2074  50S ribosomal protein L10  25.99 
 
 
172 aa  63.5  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1701  50S ribosomal protein L10  25.42 
 
 
171 aa  63.9  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.653585  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5206  50S ribosomal protein L10  28.95 
 
 
166 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000252117  unclonable  5.898740000000001e-26 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0263  50S ribosomal protein L10  26.16 
 
 
190 aa  63.5  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.273866  normal  0.119153 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1804  50S ribosomal protein L10P  31.17 
 
 
171 aa  63.9  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.160084 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0441  50S ribosomal protein L10  28.09 
 
 
189 aa  63.5  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02311  50S ribosomal protein L10  27.03 
 
 
175 aa  63.9  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02781  50S ribosomal protein L10  29.61 
 
 
175 aa  63.9  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.210657  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0099  50S ribosomal protein L10  28.95 
 
 
166 aa  63.2  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000477259  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0099  50S ribosomal protein L10  28.95 
 
 
166 aa  63.2  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000073314  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0095  50S ribosomal protein L10  28.95 
 
 
166 aa  63.2  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  8.69083e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0093  50S ribosomal protein L10  28.95 
 
 
166 aa  63.2  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000338487  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0099  50S ribosomal protein L10  28.95 
 
 
166 aa  63.2  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000718586  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0110  50S ribosomal protein L10  28.95 
 
 
166 aa  63.2  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.02318e-62 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0270  50S ribosomal protein L10  25.28 
 
 
174 aa  63.2  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.247547  hitchhiker  0.00145059 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0094  50S ribosomal protein L10  28.95 
 
 
166 aa  63.2  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000793252  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0130  50S ribosomal protein L10  28.95 
 
 
166 aa  63.2  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000124346  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0120  50S ribosomal protein L10  28.95 
 
 
166 aa  63.2  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000126178  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2727  ribosomal protein L10  27.06 
 
 
172 aa  62.8  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.12165  normal  0.845294 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02201  50S ribosomal protein L10  26.85 
 
 
175 aa  62.4  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.756015  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0067  50S ribosomal protein L10  28.32 
 
 
165 aa  62.8  0.000000003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3451  ribosomal protein L10  25.56 
 
 
176 aa  62.8  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00335052  normal  0.0391621 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2544  50S ribosomal protein L10  25.42 
 
 
171 aa  62  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2769  50S ribosomal protein L10  27.78 
 
 
165 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0317  50S ribosomal protein L10  27.78 
 
 
165 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00438278  normal  0.203557 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0338  50S ribosomal protein L10  27.78 
 
 
165 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.550948  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00035  putative 50S ribosomal protein L10  23.6 
 
 
177 aa  61.6  0.000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0266  50S ribosomal protein L10  30 
 
 
165 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.646007  normal  0.635943 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0226  ribosomal protein L10  23.86 
 
 
173 aa  60.5  0.00000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3691  ribosomal protein L10  27.5 
 
 
164 aa  60.8  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000101089  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1325  ribosomal protein L10  24.72 
 
 
256 aa  60.5  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2344  ribosomal protein L10  26.44 
 
 
173 aa  60.5  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.032292  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27791  50S ribosomal protein L10  26.85 
 
 
175 aa  60.5  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>