More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3337 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_3337  50S ribosomal protein L10  100 
 
 		 173 aa  351  2.9999999999999997e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000271161 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0924  50S ribosomal protein L10  100 
 
 		 173 aa  351  2.9999999999999997e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1059  50S ribosomal protein L10  84.3 
 
 		 174 aa  299  1e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0531801  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2865  50S ribosomal protein L10  76.16 
 
 		 174 aa  267  7e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.161934  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0617  50S ribosomal protein L10  73.84 
 
 		 174 aa  261  4e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000383704 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0671  50S ribosomal protein L10  73.68 
 
 		 174 aa  261  4e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1337  50S ribosomal protein L10  72.09 
 
 		 174 aa  248  3e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.900212  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0692  50S ribosomal protein L10  56.4 
 
 		 172 aa  188  2.9999999999999997e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000112903  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0205  50S ribosomal protein L10  50.58 
 
 		 181 aa  162  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000665859  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0857  50S ribosomal protein L10  50.29 
 
 		 177 aa  162  3e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000259828  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0276  50S ribosomal protein L10  48.24 
 
 		 175 aa  160  6e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000204852  hitchhiker  0.000495958 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0700  ribosomal protein L10  47.98 
 
 		 174 aa  157  7e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.299689  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2470  50S ribosomal protein L10  49.71 
 
 		 176 aa  156  1e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0147283  hitchhiker  0.00682166 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0310  ribosomal protein L10  51.19 
 
 		 176 aa  153  1e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.109625  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0270  50S ribosomal protein L10  47.98 
 
 		 174 aa  151  4e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.247547  hitchhiker  0.00145059 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1547  50S ribosomal protein L10  45.35 
 
 		 173 aa  151  5e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.834427 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0838  50S ribosomal protein L10P  48.85 
 
 		 172 aa  151  5e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0707377  normal  0.0995834 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0757  50S ribosomal protein L10  44.51 
 
 		 174 aa  147  7e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2722  ribosomal protein L10  43.59 
 
 		 170 aa  143  1e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0525449  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0408  50S ribosomal protein L10  45.93 
 
 		 174 aa  142  2e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.79305e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1821  ribosomal protein L10  45.18 
 
 		 179 aa  140  7e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1927  ribosomal protein L10  43.27 
 
 		 176 aa  136  1e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0948645  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2722  50S ribosomal protein L10P  42.6 
 
 		 178 aa  136  1e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000314918  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0183  ribosomal protein L10  40.59 
 
 		 176 aa  137  1e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000324199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2724  50S ribosomal protein L10  45.16 
 
 		 166 aa  136  2e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000159716  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2410  50S ribosomal protein L10  45.16 
 
 		 166 aa  136  2e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000332682  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2344  ribosomal protein L10  41.67 
 
 		 173 aa  134  5e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.032292  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01070  ribosomal protein L10  43.02 
 
 		 172 aa  132  1.9999999999999998e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  5.51299e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2223  50S ribosomal protein L10  39.53 
 
 		 174 aa  132  3e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00194446 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0488  50S ribosomal protein L10  43.2 
 
 		 173 aa  129  3e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.169718  hitchhiker  0.00000169108 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0317  50S ribosomal protein L10  43.2 
 
 		 173 aa  129  3e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.146286  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0100  50S ribosomal protein L10  44.44 
 
 		 166 aa  126  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000689021  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5206  50S ribosomal protein L10  42.48 
 
 		 166 aa  125  3e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000252117  unclonable  5.898740000000001e-26 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1529  ribosomal protein L10  42.26 
 
 		 183 aa  125  3e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000554953  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2074  50S ribosomal protein L10  39.53 
 
 		 172 aa  124  5e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0099  50S ribosomal protein L10  41.83 
 
 		 166 aa  124  6e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000477259  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0099  50S ribosomal protein L10  41.83 
 
 		 166 aa  124  6e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000073314  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0095  50S ribosomal protein L10  41.83 
 
 		 166 aa  124  6e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  8.69083e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0093  50S ribosomal protein L10  41.83 
 
 		 166 aa  124  6e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000338487  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0120  50S ribosomal protein L10  41.83 
 
 		 166 aa  124  6e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000126178  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0099  50S ribosomal protein L10  41.83 
 
 		 166 aa  124  6e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000718586  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0110  50S ribosomal protein L10  41.83 
 
 		 166 aa  124  6e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.02318e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0130  50S ribosomal protein L10  41.83 
 
 		 166 aa  124  6e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000124346  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0093  50S ribosomal protein L10  41.83 
 
 		 166 aa  123  1e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000759135  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0096  50S ribosomal protein L10  43.79 
 
 		 166 aa  123  1e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0094  50S ribosomal protein L10  41.83 
 
 		 166 aa  122  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000793252  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3691  ribosomal protein L10  42.48 
 
 		 164 aa  122  2e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000101089  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0300  ribosomal protein L10  42.01 
 
 		 181 aa  120  8e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000817286  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2361  50S ribosomal protein L10  36.99 
 
 		 174 aa  120  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2273  50S ribosomal protein L10  36.99 
 
 		 174 aa  119  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1372  50S ribosomal protein L10  36.99 
 
 		 178 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.188772  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0576  50S ribosomal protein L10  38.56 
 
 		 166 aa  119  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000179203  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2850  50S ribosomal protein L10  43.59 
 
 		 165 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.675463 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0562  50S ribosomal protein L10  38.56 
 
 		 166 aa  119  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000233555  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1634  50S ribosomal protein L10  40.94 
 
 		 174 aa  118  3e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1509  ribosomal protein L10  36.42 
 
 		 176 aa  119  3e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000272992  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1590  50S ribosomal protein L10  37.34 
 
 		 174 aa  118  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3437  50S ribosomal protein L10  42.31 
 
 		 165 aa  118  4.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29850  LSU ribosomal protein L10P  43.45 
 
 		 176 aa  117  4.9999999999999996e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2164  50S ribosomal protein L10P  40.8 
 
 		 174 aa  117  7.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0596262  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17270  LSU ribosomal protein L10P  40.8 
 
 		 173 aa  116  9.999999999999999e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0317  50S ribosomal protein L10  42.31 
 
 		 165 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00438278  normal  0.203557 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4018  ribosomal protein L10  36.75 
 
 		 174 aa  117  9.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.491975 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0389  ribosomal protein L10  38.01 
 
 		 174 aa  116  9.999999999999999e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0541  50S ribosomal protein L10  41.04 
 
 		 174 aa  116  9.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.367918  normal  0.103583 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0213  ribosomal protein L10  35.47 
 
 		 175 aa  117  9.999999999999999e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.623588  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0618  ribosomal protein L10  44.51 
 
 		 173 aa  117  9.999999999999999e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2769  50S ribosomal protein L10  42.31 
 
 		 165 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1387  50S ribosomal protein L10  42.38 
 
 		 171 aa  117  9.999999999999999e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000123079  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0338  50S ribosomal protein L10  42.31 
 
 		 165 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.550948  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2783  50S ribosomal protein L10  38.37 
 
 		 172 aa  115  3e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00189787  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20980  LSU ribosomal protein L10P  40.12 
 
 		 203 aa  115  3e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.996084  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0180  50S ribosomal protein L10  37.91 
 
 		 166 aa  115  3.9999999999999997e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0693527  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3191  50S ribosomal protein L10  41.67 
 
 		 173 aa  115  3.9999999999999997e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.579756  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0915  ribosomal protein L10  42.86 
 
 		 174 aa  115  3.9999999999999997e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.690445  normal  0.23712 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3347  50S ribosomal protein L10  44.9 
 
 		 167 aa  114  6.9999999999999995e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.862427  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6059  50S ribosomal protein L10  40.7 
 
 		 182 aa  113  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.749447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0571  50S ribosomal protein L10  40.12 
 
 		 187 aa  113  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1474  50S ribosomal protein L10  42.5 
 
 		 181 aa  113  1.0000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000103472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23960  LSU ribosomal protein L10P  40.46 
 
 		 172 aa  113  1.0000000000000001e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0578  ribosomal protein L10  42.69 
 
 		 212 aa  112  3e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.141737  normal  0.0136421 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0479  50S ribosomal protein L10  35.23 
 
 		 179 aa  112  3e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.488036  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0310  50S ribosomal protein L10  42.77 
 
 		 165 aa  112  3e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0746923  normal  0.0249908 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1124  ribosomal protein L10  38.32 
 
 		 174 aa  112  3e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0464  50S ribosomal protein L10  35.23 
 
 		 179 aa  112  3e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0359791  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0297  50S ribosomal protein L10  39.77 
 
 		 172 aa  112  3e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3477  50S ribosomal protein L10  38.15 
 
 		 171 aa  111  4.0000000000000004e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.232416  hitchhiker  0.0000717521 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0140  50S ribosomal protein L10  36.54 
 
 		 174 aa  110  7.000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000236563  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08440  ribosomal protein L10  35.84 
 
 		 173 aa  110  7.000000000000001e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.166227  normal  0.704722 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3328  50S ribosomal protein L10  36.14 
 
 		 186 aa  110  8.000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.211537 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0441  50S ribosomal protein L10  35.84 
 
 		 189 aa  110  9e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3336  50S ribosomal protein L10  39.87 
 
 		 173 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0710  50S ribosomal protein L10  37.28 
 
 		 176 aa  110  1.0000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.303715  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4285  ribosomal protein L10  42.48 
 
 		 166 aa  109  2.0000000000000002e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000716484  hitchhiker  0.000000472968 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0789  50S ribosomal protein L10  38.92 
 
 		 172 aa  109  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.305137 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6637  ribosomal protein L10  39.52 
 
 		 184 aa  108  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.858869  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5114  ribosomal protein L10  38.76 
 
 		 175 aa  108  4.0000000000000004e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.316499  normal  0.732887 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4318  50S ribosomal protein L10  36.69 
 
 		 187 aa  108  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.561909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2656  50S ribosomal protein L10  40.59 
 
 		 175 aa  108  5e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.220618  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1453  50S ribosomal protein L10  36.99 
 
 		 173 aa  108  5e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>