More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0578 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_0578  ribosomal protein L10  100 
 
 		 212 aa  420  1e-117  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.141737  normal  0.0136421 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29850  LSU ribosomal protein L10P  81.14 
 
 		 176 aa  277  7e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0618  ribosomal protein L10  77.91 
 
 		 173 aa  244  9.999999999999999e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2669  ribosomal protein L10  77.14 
 
 		 175 aa  239  2e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.69004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0915  ribosomal protein L10  70.86 
 
 		 174 aa  231  9e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.690445  normal  0.23712 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3157  ribosomal protein L10  73.26 
 
 		 173 aa  227  8e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500065  normal  0.290514 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2656  50S ribosomal protein L10  69.19 
 
 		 175 aa  215  2.9999999999999998e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.220618  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17270  LSU ribosomal protein L10P  65.7 
 
 		 173 aa  215  4e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0678  ribosomal protein L10  63.31 
 
 		 190 aa  214  7e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5114  ribosomal protein L10  66.67 
 
 		 175 aa  208  4e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.316499  normal  0.732887 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23960  LSU ribosomal protein L10P  61.05 
 
 		 172 aa  207  1e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0698  50S ribosomal protein L10  66.67 
 
 		 228 aa  207  1e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20980  LSU ribosomal protein L10P  64.29 
 
 		 203 aa  206  3e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.996084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0571  50S ribosomal protein L10  63.91 
 
 		 187 aa  204  1e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0541  50S ribosomal protein L10  65.12 
 
 		 174 aa  203  2e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.367918  normal  0.103583 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1018  ribosomal protein L10  62.13 
 
 		 202 aa  203  2e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6059  50S ribosomal protein L10  63.31 
 
 		 182 aa  198  3.9999999999999996e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.749447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0226  ribosomal protein L10  61.05 
 
 		 173 aa  196  2.0000000000000003e-49  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1667  50S ribosomal protein L10  61.05 
 
 		 173 aa  194  7e-49  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1072  LSU ribosomal protein L10P  63.91 
 
 		 174 aa  193  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.37271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10664  50S ribosomal protein L10  60.23 
 
 		 178 aa  192  2e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.50048e-25  normal  0.41253 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6637  ribosomal protein L10  60.36 
 
 		 184 aa  192  3e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.858869  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4351  ribosomal protein L10  66.04 
 
 		 184 aa  191  9e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3935  50S ribosomal protein L10  59.88 
 
 		 181 aa  191  9e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.193843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03670  LSU ribosomal protein L10P  63.74 
 
 		 181 aa  188  5e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.692531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4327  50S ribosomal protein L10  61.08 
 
 		 181 aa  187  8e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1124  ribosomal protein L10  58.72 
 
 		 174 aa  187  1e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0297  50S ribosomal protein L10  58.72 
 
 		 172 aa  182  3e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4521  ribosomal protein L10  59.15 
 
 		 200 aa  179  2e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5961  50S ribosomal protein L10  58.93 
 
 		 178 aa  176  2e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.527483  normal  0.892445 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1252  50S ribosomal protein L10  57.14 
 
 		 179 aa  172  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.268065 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2702  50S ribosomal protein L10  57.74 
 
 		 197 aa  169  3e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.107317 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5101  50S ribosomal protein L10  56 
 
 		 179 aa  169  4e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0801896 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0994  50S ribosomal protein L10  56 
 
 		 175 aa  167  7e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0966  50S ribosomal protein L10  56 
 
 		 175 aa  167  9e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.968319  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0984  50S ribosomal protein L10  56 
 
 		 175 aa  167  9e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.270382  normal  0.351336 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2990  50S ribosomal protein L10  56.55 
 
 		 196 aa  167  2e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.302741  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0750  ribosomal protein L10  56 
 
 		 176 aa  166  2.9999999999999998e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1821  ribosomal protein L10  50.32 
 
 		 179 aa  143  2e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0276  50S ribosomal protein L10  46.15 
 
 		 175 aa  134  7.000000000000001e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000204852  hitchhiker  0.000495958 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0389  ribosomal protein L10  46.47 
 
 		 174 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0838  50S ribosomal protein L10P  46.24 
 
 		 172 aa  126  2.0000000000000002e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0707377  normal  0.0995834 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0408  50S ribosomal protein L10  44.71 
 
 		 174 aa  124  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.79305e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0183  ribosomal protein L10  43.27 
 
 		 176 aa  123  2e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000324199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0213  ribosomal protein L10  42.35 
 
 		 175 aa  122  4e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.623588  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1927  ribosomal protein L10  42.86 
 
 		 176 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0948645  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3337  50S ribosomal protein L10  42.69 
 
 		 173 aa  119  3e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000271161 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0924  50S ribosomal protein L10  42.69 
 
 		 173 aa  119  3e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01070  ribosomal protein L10  42.35 
 
 		 172 aa  117  9.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  5.51299e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2470  50S ribosomal protein L10  41.07 
 
 		 176 aa  117  9.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0147283  hitchhiker  0.00682166 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0671  50S ribosomal protein L10  43.02 
 
 		 174 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0617  50S ribosomal protein L10  42.86 
 
 		 174 aa  115  3.9999999999999997e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000383704 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2722  ribosomal protein L10  43.75 
 
 		 170 aa  115  3.9999999999999997e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0525449  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0205  50S ribosomal protein L10  43.37 
 
 		 181 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000665859  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0479  50S ribosomal protein L10  38.2 
 
 		 179 aa  113  3e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.488036  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0464  50S ribosomal protein L10  38.2 
 
 		 179 aa  113  3e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0359791  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0700  ribosomal protein L10  40.48 
 
 		 174 aa  111  9e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.299689  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2724  50S ribosomal protein L10  42.31 
 
 		 166 aa  110  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000159716  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2410  50S ribosomal protein L10  42.31 
 
 		 166 aa  110  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000332682  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2865  50S ribosomal protein L10  40.48 
 
 		 174 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.161934  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1372  50S ribosomal protein L10  36.63 
 
 		 178 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.188772  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1059  50S ribosomal protein L10  39.77 
 
 		 174 aa  108  6e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0531801  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0692  50S ribosomal protein L10  38.24 
 
 		 172 aa  108  7.000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000112903  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0096  50S ribosomal protein L10  43.79 
 
 		 166 aa  108  8.000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0310  ribosomal protein L10  40.48 
 
 		 176 aa  107  1e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.109625  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0100  50S ribosomal protein L10  45.1 
 
 		 166 aa  107  1e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000689021  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0562  50S ribosomal protein L10  41.61 
 
 		 166 aa  105  4e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000233555  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0576  50S ribosomal protein L10  41.61 
 
 		 166 aa  105  4e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000179203  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0270  50S ribosomal protein L10  41.07 
 
 		 174 aa  105  5e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.247547  hitchhiker  0.00145059 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08440  ribosomal protein L10  41.84 
 
 		 173 aa  105  5e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.166227  normal  0.704722 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1337  50S ribosomal protein L10  40.35 
 
 		 174 aa  104  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.900212  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0757  50S ribosomal protein L10  38.46 
 
 		 174 aa  103  2e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0180  50S ribosomal protein L10  40.27 
 
 		 166 aa  102  5e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0693527  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0857  50S ribosomal protein L10  37.65 
 
 		 177 aa  102  6e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000259828  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1325  ribosomal protein L10  43.45 
 
 		 256 aa  102  6e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1547  50S ribosomal protein L10  38.15 
 
 		 173 aa  101  7e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.834427 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0504  50S ribosomal protein L10  35.39 
 
 		 180 aa  100  1e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000340487  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2423  50S ribosomal protein L10  38.41 
 
 		 205 aa  100  2e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0094  50S ribosomal protein L10  42.86 
 
 		 166 aa  99.4  4e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000793252  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2074  50S ribosomal protein L10  34.71 
 
 		 172 aa  98.6  7e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5083  50S ribosomal protein L10  40 
 
 		 172 aa  98.2  8e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.614366  normal  0.894165 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0110  50S ribosomal protein L10  42.14 
 
 		 166 aa  97.4  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.02318e-62 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0099  50S ribosomal protein L10  42.14 
 
 		 166 aa  97.4  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000477259  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0099  50S ribosomal protein L10  42.14 
 
 		 166 aa  97.4  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000073314  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0095  50S ribosomal protein L10  42.14 
 
 		 166 aa  97.4  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  8.69083e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0093  50S ribosomal protein L10  42.14 
 
 		 166 aa  97.4  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000338487  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0099  50S ribosomal protein L10  42.14 
 
 		 166 aa  97.4  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000718586  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0120  50S ribosomal protein L10  42.14 
 
 		 166 aa  97.4  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000126178  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0130  50S ribosomal protein L10  42.14 
 
 		 166 aa  97.4  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000124346  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5206  50S ribosomal protein L10  42.14 
 
 		 166 aa  97.4  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000252117  unclonable  5.898740000000001e-26 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0093  50S ribosomal protein L10  41.43 
 
 		 166 aa  96.3  3e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000759135  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2722  50S ribosomal protein L10P  36.31 
 
 		 178 aa  96.7  3e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000314918  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1784  50S ribosomal protein L10  38.16 
 
 		 181 aa  96.3  3e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2333  50S ribosomal protein L10  38.96 
 
 		 175 aa  95.9  4e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00442702  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3841  50S ribosomal protein L10  39.88 
 
 		 172 aa  95.9  4e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0158219  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1529  ribosomal protein L10  33.33 
 
 		 183 aa  95.1  7e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000554953  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2697  50S ribosomal protein L10P  36.42 
 
 		 172 aa  94.7  9e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.561782  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1302  50S ribosomal protein L10  38.56 
 
 		 166 aa  94.4  1e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000076628  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3689  50S ribosomal protein L10  39.31 
 
 		 172 aa  93.6  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1018  50S ribosomal protein L10  32.18 
 
 		 178 aa  93.6  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00251564 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>