More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2669 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_2669  ribosomal protein L10  100 
 
 
175 aa  336  9.999999999999999e-92  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.69004  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29850  LSU ribosomal protein L10P  82.86 
 
 
176 aa  281  2.0000000000000002e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0915  ribosomal protein L10  77.01 
 
 
174 aa  256  1e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.690445  normal  0.23712 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3157  ribosomal protein L10  79.31 
 
 
173 aa  252  2.0000000000000002e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500065  normal  0.290514 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0618  ribosomal protein L10  80.12 
 
 
173 aa  246  1e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0578  ribosomal protein L10  77.14 
 
 
212 aa  239  2e-62  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.141737  normal  0.0136421 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0571  50S ribosomal protein L10  67.82 
 
 
187 aa  229  1e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6059  50S ribosomal protein L10  67.43 
 
 
182 aa  225  2e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.749447  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0698  50S ribosomal protein L10  68.6 
 
 
228 aa  226  2e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1072  LSU ribosomal protein L10P  70 
 
 
174 aa  221  6e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.37271  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0678  ribosomal protein L10  65.68 
 
 
190 aa  219  9.999999999999999e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0541  50S ribosomal protein L10  67.84 
 
 
174 aa  217  7e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.367918  normal  0.103583 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5114  ribosomal protein L10  67.43 
 
 
175 aa  215  2.9999999999999998e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.316499  normal  0.732887 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2656  50S ribosomal protein L10  69.46 
 
 
175 aa  213  8e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.220618  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23960  LSU ribosomal protein L10P  61.18 
 
 
172 aa  211  5.999999999999999e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20980  LSU ribosomal protein L10P  66.28 
 
 
203 aa  208  2e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.996084  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17270  LSU ribosomal protein L10P  65.68 
 
 
173 aa  208  3e-53  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6637  ribosomal protein L10  62.94 
 
 
184 aa  207  5e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.858869  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3935  50S ribosomal protein L10  60.47 
 
 
181 aa  202  1e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.193843  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4351  ribosomal protein L10  68.55 
 
 
184 aa  201  4e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4327  50S ribosomal protein L10  61.63 
 
 
181 aa  201  5e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10664  50S ribosomal protein L10  61.54 
 
 
178 aa  199  9.999999999999999e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.50048e-25  normal  0.41253 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1018  ribosomal protein L10  58.58 
 
 
202 aa  198  3e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1124  ribosomal protein L10  59.76 
 
 
174 aa  197  5e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03670  LSU ribosomal protein L10P  64.57 
 
 
181 aa  197  7e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.692531  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0297  50S ribosomal protein L10  63.91 
 
 
172 aa  196  1.0000000000000001e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0226  ribosomal protein L10  60 
 
 
173 aa  195  2.0000000000000003e-49  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1667  50S ribosomal protein L10  59.41 
 
 
173 aa  190  9e-48  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4521  ribosomal protein L10  60.48 
 
 
200 aa  190  9e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5961  50S ribosomal protein L10  63.86 
 
 
178 aa  187  8e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.527483  normal  0.892445 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1252  50S ribosomal protein L10  60.36 
 
 
179 aa  186  1e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.268065 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5101  50S ribosomal protein L10  58.58 
 
 
179 aa  180  9.000000000000001e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0801896 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0994  50S ribosomal protein L10  57.14 
 
 
175 aa  174  4e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0966  50S ribosomal protein L10  57.14 
 
 
175 aa  174  5e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.968319  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0984  50S ribosomal protein L10  57.14 
 
 
175 aa  174  5e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.270382  normal  0.351336 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0750  ribosomal protein L10  56 
 
 
176 aa  173  9.999999999999999e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2702  50S ribosomal protein L10  63.12 
 
 
197 aa  170  1e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.107317 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2990  50S ribosomal protein L10  56.98 
 
 
196 aa  170  1e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.302741  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0408  50S ribosomal protein L10  45.88 
 
 
174 aa  130  1.0000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.79305e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0389  ribosomal protein L10  50 
 
 
174 aa  129  1.0000000000000001e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1821  ribosomal protein L10  47.59 
 
 
179 aa  128  4.0000000000000003e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0276  50S ribosomal protein L10  43.02 
 
 
175 aa  126  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000204852  hitchhiker  0.000495958 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1927  ribosomal protein L10  43.02 
 
 
176 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0948645  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3337  50S ribosomal protein L10  42.2 
 
 
173 aa  119  3e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000271161 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0924  50S ribosomal protein L10  42.2 
 
 
173 aa  119  3e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2722  ribosomal protein L10  44.87 
 
 
170 aa  118  4.9999999999999996e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0525449  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01070  ribosomal protein L10  47.59 
 
 
172 aa  115  3.9999999999999997e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  5.51299e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0096  50S ribosomal protein L10  45.1 
 
 
166 aa  115  3.9999999999999997e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0183  ribosomal protein L10  41.18 
 
 
176 aa  114  6e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000324199  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0100  50S ribosomal protein L10  45.1 
 
 
166 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000689021  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2865  50S ribosomal protein L10  39.08 
 
 
174 aa  112  3e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.161934  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2470  50S ribosomal protein L10  40.12 
 
 
176 aa  111  5e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0147283  hitchhiker  0.00682166 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0205  50S ribosomal protein L10  39.18 
 
 
181 aa  111  5e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000665859  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0838  50S ribosomal protein L10P  41.28 
 
 
172 aa  111  5e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0707377  normal  0.0995834 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0671  50S ribosomal protein L10  41.86 
 
 
174 aa  111  5e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0617  50S ribosomal protein L10  40.23 
 
 
174 aa  110  8.000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000383704 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2724  50S ribosomal protein L10  41.98 
 
 
166 aa  110  8.000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000159716  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2410  50S ribosomal protein L10  41.98 
 
 
166 aa  110  8.000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000332682  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08440  ribosomal protein L10  44.76 
 
 
173 aa  109  2.0000000000000002e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.166227  normal  0.704722 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1372  50S ribosomal protein L10  36.05 
 
 
178 aa  109  2.0000000000000002e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.188772  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1059  50S ribosomal protein L10  39.43 
 
 
174 aa  108  3e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0531801  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0213  ribosomal protein L10  37.5 
 
 
175 aa  106  2e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.623588  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0310  ribosomal protein L10  45.65 
 
 
176 aa  103  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.109625  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0094  50S ribosomal protein L10  41.18 
 
 
166 aa  102  4e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000793252  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0857  50S ribosomal protein L10  35.06 
 
 
177 aa  101  6e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000259828  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5206  50S ribosomal protein L10  40.52 
 
 
166 aa  100  9e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000252117  unclonable  5.898740000000001e-26 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1337  50S ribosomal protein L10  38.51 
 
 
174 aa  100  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.900212  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0099  50S ribosomal protein L10  40.52 
 
 
166 aa  100  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000477259  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0099  50S ribosomal protein L10  40.52 
 
 
166 aa  100  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000073314  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0095  50S ribosomal protein L10  40.52 
 
 
166 aa  100  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  8.69083e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0093  50S ribosomal protein L10  40.52 
 
 
166 aa  100  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000338487  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0110  50S ribosomal protein L10  40.52 
 
 
166 aa  100  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.02318e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0099  50S ribosomal protein L10  40.52 
 
 
166 aa  100  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000718586  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0464  50S ribosomal protein L10  35.23 
 
 
179 aa  100  1e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0359791  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0130  50S ribosomal protein L10  40.52 
 
 
166 aa  100  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000124346  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0120  50S ribosomal protein L10  40.52 
 
 
166 aa  100  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000126178  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0479  50S ribosomal protein L10  35.23 
 
 
179 aa  100  1e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.488036  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0562  50S ribosomal protein L10  39.87 
 
 
166 aa  98.6  4e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000233555  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0093  50S ribosomal protein L10  39.87 
 
 
166 aa  98.6  4e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000759135  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0576  50S ribosomal protein L10  39.87 
 
 
166 aa  98.6  4e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000179203  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1547  50S ribosomal protein L10  42.66 
 
 
173 aa  98.6  4e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.834427 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2697  50S ribosomal protein L10P  37.79 
 
 
172 aa  97.8  6e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.561782  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0271  50S ribosomal protein L10  43.45 
 
 
178 aa  97.8  7e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00121092  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0692  50S ribosomal protein L10  35.67 
 
 
172 aa  97.1  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000112903  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0180  50S ribosomal protein L10  37.91 
 
 
166 aa  96.3  2e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0693527  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0700  ribosomal protein L10  43.48 
 
 
174 aa  95.9  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.299689  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1302  50S ribosomal protein L10  37.91 
 
 
166 aa  95.5  3e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000076628  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4678  50S ribosomal protein L10  37.72 
 
 
182 aa  95.1  4e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000989378  decreased coverage  0.00291158 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1784  50S ribosomal protein L10  37.33 
 
 
181 aa  95.1  4e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1325  ribosomal protein L10  42.76 
 
 
256 aa  94.4  7e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0757  50S ribosomal protein L10  36.31 
 
 
174 aa  93.6  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2423  50S ribosomal protein L10  37.27 
 
 
205 aa  92.8  2e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1509  ribosomal protein L10  33.92 
 
 
176 aa  92  4e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000272992  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02410  ribosomal protein L10  39.86 
 
 
173 aa  91.7  5e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.609192 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1529  ribosomal protein L10  34.32 
 
 
183 aa  91.3  7e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000554953  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2333  50S ribosomal protein L10  35.29 
 
 
175 aa  90.9  7e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00442702  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2074  50S ribosomal protein L10  36.84 
 
 
172 aa  91.3  7e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0140  50S ribosomal protein L10  39.57 
 
 
174 aa  90.9  8e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000236563  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2722  50S ribosomal protein L10P  39.57 
 
 
178 aa  90.1  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000314918  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0204  50S ribosomal protein L10  39.05 
 
 
166 aa  90.5  1e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000122994  hitchhiker  0.000100039 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>