More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1667 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_1667  50S ribosomal protein L10  100 
 
 
173 aa  340  5.999999999999999e-93  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0226  ribosomal protein L10  87.86 
 
 
173 aa  308  2.9999999999999997e-83  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29850  LSU ribosomal protein L10P  60.36 
 
 
176 aa  188  4e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17270  LSU ribosomal protein L10P  57.23 
 
 
173 aa  185  2e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3935  50S ribosomal protein L10  56.21 
 
 
181 aa  180  1e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.193843  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2669  ribosomal protein L10  59.41 
 
 
175 aa  179  2e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.69004  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2656  50S ribosomal protein L10  56.4 
 
 
175 aa  178  2.9999999999999997e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.220618  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0541  50S ribosomal protein L10  54.65 
 
 
174 aa  177  5.999999999999999e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.367918  normal  0.103583 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4327  50S ribosomal protein L10  57.4 
 
 
181 aa  177  8e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0578  ribosomal protein L10  61.05 
 
 
212 aa  176  2e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.141737  normal  0.0136421 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0618  ribosomal protein L10  56.65 
 
 
173 aa  174  4e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1018  ribosomal protein L10  52.07 
 
 
202 aa  174  5e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0915  ribosomal protein L10  55.56 
 
 
174 aa  174  7e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.690445  normal  0.23712 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23960  LSU ribosomal protein L10P  52.91 
 
 
172 aa  173  9.999999999999999e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6059  50S ribosomal protein L10  50.87 
 
 
182 aa  171  2.9999999999999996e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.749447  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3157  ribosomal protein L10  58.38 
 
 
173 aa  172  2.9999999999999996e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500065  normal  0.290514 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6637  ribosomal protein L10  51.76 
 
 
184 aa  170  6.999999999999999e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.858869  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5114  ribosomal protein L10  51.72 
 
 
175 aa  170  7.999999999999999e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.316499  normal  0.732887 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0571  50S ribosomal protein L10  51.76 
 
 
187 aa  170  7.999999999999999e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4351  ribosomal protein L10  55.97 
 
 
184 aa  169  2e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0698  50S ribosomal protein L10  51.46 
 
 
228 aa  168  4e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5961  50S ribosomal protein L10  55.36 
 
 
178 aa  167  6e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.527483  normal  0.892445 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1124  ribosomal protein L10  50 
 
 
174 aa  167  6e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1072  LSU ribosomal protein L10P  51.74 
 
 
174 aa  167  9e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.37271  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20980  LSU ribosomal protein L10P  51.18 
 
 
203 aa  166  1e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.996084  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0678  ribosomal protein L10  52.07 
 
 
190 aa  166  2e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03670  LSU ribosomal protein L10P  52.07 
 
 
181 aa  158  3e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.692531  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10664  50S ribosomal protein L10  49.7 
 
 
178 aa  155  2e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.50048e-25  normal  0.41253 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0750  ribosomal protein L10  51.48 
 
 
176 aa  152  2e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5101  50S ribosomal protein L10  49.7 
 
 
179 aa  149  2e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0801896 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0297  50S ribosomal protein L10  49.11 
 
 
172 aa  149  2e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0994  50S ribosomal protein L10  50.3 
 
 
175 aa  147  6e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0966  50S ribosomal protein L10  50.3 
 
 
175 aa  147  7e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.968319  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0984  50S ribosomal protein L10  50.3 
 
 
175 aa  147  7e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.270382  normal  0.351336 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1252  50S ribosomal protein L10  48.52 
 
 
179 aa  144  5e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.268065 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4521  ribosomal protein L10  45.56 
 
 
200 aa  142  2e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2702  50S ribosomal protein L10  51.59 
 
 
197 aa  139  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.107317 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2990  50S ribosomal protein L10  49.71 
 
 
196 aa  139  3e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.302741  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0389  ribosomal protein L10  44.64 
 
 
174 aa  134  7.000000000000001e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01070  ribosomal protein L10  43.35 
 
 
172 aa  123  1e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  5.51299e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1821  ribosomal protein L10  44.16 
 
 
179 aa  121  5e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2724  50S ribosomal protein L10  43.59 
 
 
166 aa  118  3e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000159716  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2410  50S ribosomal protein L10  43.59 
 
 
166 aa  118  3e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000332682  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0408  50S ribosomal protein L10  41.76 
 
 
174 aa  117  7e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.79305e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0183  ribosomal protein L10  39.53 
 
 
176 aa  116  9.999999999999999e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000324199  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2722  ribosomal protein L10  39.24 
 
 
170 aa  112  2.0000000000000002e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0525449  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0276  50S ribosomal protein L10  40.36 
 
 
175 aa  111  5e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000204852  hitchhiker  0.000495958 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1784  50S ribosomal protein L10  36.87 
 
 
181 aa  110  9e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0205  50S ribosomal protein L10  41.52 
 
 
181 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000665859  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0692  50S ribosomal protein L10  35.67 
 
 
172 aa  108  3e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000112903  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0838  50S ribosomal protein L10P  38.15 
 
 
172 aa  108  3e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0707377  normal  0.0995834 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0671  50S ribosomal protein L10  38.01 
 
 
174 aa  107  8.000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0562  50S ribosomal protein L10  41.33 
 
 
166 aa  106  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000233555  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0576  50S ribosomal protein L10  41.33 
 
 
166 aa  106  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000179203  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0213  ribosomal protein L10  38.24 
 
 
175 aa  105  4e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.623588  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1337  50S ribosomal protein L10  38.95 
 
 
174 aa  104  5e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.900212  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0270  50S ribosomal protein L10  38.46 
 
 
174 aa  104  5e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.247547  hitchhiker  0.00145059 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08440  ribosomal protein L10  35.84 
 
 
173 aa  103  1e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.166227  normal  0.704722 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0310  ribosomal protein L10  37.28 
 
 
176 aa  103  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.109625  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1547  50S ribosomal protein L10  36.99 
 
 
173 aa  103  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.834427 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2727  ribosomal protein L10  38.15 
 
 
172 aa  103  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.12165  normal  0.845294 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0924  50S ribosomal protein L10  34.88 
 
 
173 aa  102  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0479  50S ribosomal protein L10  33.52 
 
 
179 aa  102  2e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.488036  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0464  50S ribosomal protein L10  33.52 
 
 
179 aa  102  2e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0359791  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3337  50S ribosomal protein L10  34.88 
 
 
173 aa  102  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000271161 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1927  ribosomal protein L10  36.42 
 
 
176 aa  102  2e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0948645  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2423  50S ribosomal protein L10  36.97 
 
 
205 aa  102  3e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0700  ribosomal protein L10  36.09 
 
 
174 aa  102  3e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.299689  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0617  50S ribosomal protein L10  38.37 
 
 
174 aa  102  3e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000383704 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0757  50S ribosomal protein L10  37.87 
 
 
174 aa  102  3e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0100  50S ribosomal protein L10  36.6 
 
 
166 aa  102  3e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000689021  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0096  50S ribosomal protein L10  37.91 
 
 
166 aa  101  4e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1821  50S ribosomal protein L10  39.31 
 
 
172 aa  102  4e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0871653  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0180  50S ribosomal protein L10  39.16 
 
 
166 aa  101  5e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0693527  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1246  50S ribosomal protein L10  40.23 
 
 
172 aa  101  7e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.208748  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0504  50S ribosomal protein L10  34.46 
 
 
180 aa  100  9e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000340487  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1945  50S ribosomal protein L10  39.66 
 
 
172 aa  99.8  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.137242  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2722  50S ribosomal protein L10P  33.53 
 
 
178 aa  99.4  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000314918  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1372  50S ribosomal protein L10  34.29 
 
 
178 aa  99.4  2e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.188772  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1207  50S ribosomal protein L10  40.12 
 
 
194 aa  97.8  7e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.347273  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1509  ribosomal protein L10  33.33 
 
 
176 aa  97.4  8e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000272992  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1059  50S ribosomal protein L10  34.3 
 
 
174 aa  95.9  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0531801  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2697  50S ribosomal protein L10P  35.84 
 
 
172 aa  96.3  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.561782  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2361  50S ribosomal protein L10  37.14 
 
 
174 aa  96.7  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3453  50S ribosomal protein L10  41.29 
 
 
174 aa  96.3  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0925685  normal  0.446601 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1325  ribosomal protein L10  38.71 
 
 
256 aa  95.9  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2273  50S ribosomal protein L10  36.99 
 
 
174 aa  95.5  3e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0976  50S ribosomal protein L10  36.42 
 
 
195 aa  94.7  5e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0194348 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1590  50S ribosomal protein L10  36.99 
 
 
174 aa  94.4  8e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2223  50S ribosomal protein L10  35.47 
 
 
174 aa  94.4  8e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00194446 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5083  50S ribosomal protein L10  36.99 
 
 
172 aa  93.6  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.614366  normal  0.894165 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3362  50S ribosomal protein L10  36.42 
 
 
172 aa  93.6  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.256068  normal  0.223881 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1964  50S ribosomal protein L10  34.48 
 
 
172 aa  92.8  2e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.202865  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2865  50S ribosomal protein L10  33.72 
 
 
174 aa  92  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.161934  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0569  50S ribosomal protein L10  36.99 
 
 
172 aa  92.4  3e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000818206  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0867  50S ribosomal protein L10  34.91 
 
 
175 aa  91.7  5e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1804  50S ribosomal protein L10P  34.32 
 
 
171 aa  91.3  5e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.160084 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02410  ribosomal protein L10  35.9 
 
 
173 aa  91.3  6e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.609192 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0355  50S ribosomal protein L10  36.05 
 
 
172 aa  91.3  6e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000413063  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0231  50S ribosomal protein L10  33.33 
 
 
172 aa  91.3  6e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0103356  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>