More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0180 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP0180  50S ribosomal protein L10  100 
 
 
166 aa  330  5e-90  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0693527  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0576  50S ribosomal protein L10  90.36 
 
 
166 aa  303  8.000000000000001e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000179203  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0562  50S ribosomal protein L10  90.36 
 
 
166 aa  303  8.000000000000001e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000233555  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5206  50S ribosomal protein L10  66.26 
 
 
166 aa  224  4e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000252117  unclonable  5.898740000000001e-26 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0099  50S ribosomal protein L10  65.64 
 
 
166 aa  224  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000477259  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0099  50S ribosomal protein L10  65.64 
 
 
166 aa  224  5.0000000000000005e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000073314  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0095  50S ribosomal protein L10  65.64 
 
 
166 aa  224  5.0000000000000005e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  8.69083e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0093  50S ribosomal protein L10  65.64 
 
 
166 aa  224  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000338487  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0130  50S ribosomal protein L10  65.64 
 
 
166 aa  224  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000124346  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0099  50S ribosomal protein L10  65.64 
 
 
166 aa  224  5.0000000000000005e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000718586  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0120  50S ribosomal protein L10  65.64 
 
 
166 aa  224  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000126178  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0110  50S ribosomal protein L10  65.64 
 
 
166 aa  224  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.02318e-62 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0096  50S ribosomal protein L10  65.64 
 
 
166 aa  222  1e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0094  50S ribosomal protein L10  65.64 
 
 
166 aa  222  2e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000793252  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0100  50S ribosomal protein L10  64.24 
 
 
166 aa  221  4e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000689021  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0093  50S ribosomal protein L10  65.03 
 
 
166 aa  219  9.999999999999999e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000759135  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1387  50S ribosomal protein L10  61.96 
 
 
171 aa  199  1.9999999999999998e-50  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000123079  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2722  ribosomal protein L10  58.13 
 
 
170 aa  190  7e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0525449  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0567  50S ribosomal protein L10  57.67 
 
 
167 aa  189  1e-47  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00969269  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1302  50S ribosomal protein L10  57.67 
 
 
166 aa  189  2e-47  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000076628  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0361  50S ribosomal protein L10  50.31 
 
 
190 aa  171  5e-42  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000502234  hitchhiker  0.0000804712 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0408  50S ribosomal protein L10  50.58 
 
 
174 aa  155  2e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.79305e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0271  50S ribosomal protein L10  48.72 
 
 
178 aa  154  4e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00121092  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1417  50S ribosomal protein L10  46.91 
 
 
197 aa  154  5.0000000000000005e-37  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000013127  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2724  50S ribosomal protein L10  45.91 
 
 
166 aa  151  4e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000159716  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2410  50S ribosomal protein L10  45.91 
 
 
166 aa  151  4e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000332682  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0310  ribosomal protein L10  46.75 
 
 
176 aa  148  3e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.109625  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0276  50S ribosomal protein L10  45.34 
 
 
175 aa  147  7e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000204852  hitchhiker  0.000495958 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0313  50S ribosomal protein L10  44.79 
 
 
166 aa  145  2.0000000000000003e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000558823  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01070  ribosomal protein L10  44.31 
 
 
172 aa  144  5e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  5.51299e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2470  50S ribosomal protein L10  42.69 
 
 
176 aa  143  9e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0147283  hitchhiker  0.00682166 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2722  50S ribosomal protein L10P  41.62 
 
 
178 aa  143  1e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000314918  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3691  ribosomal protein L10  46.63 
 
 
164 aa  143  1e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000101089  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0692  50S ribosomal protein L10  43.42 
 
 
172 aa  133  9.999999999999999e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000112903  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0183  ribosomal protein L10  39.2 
 
 
176 aa  132  1.9999999999999998e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000324199  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0205  50S ribosomal protein L10  41.72 
 
 
181 aa  130  9e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000665859  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0838  50S ribosomal protein L10P  46 
 
 
172 aa  129  1.0000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0707377  normal  0.0995834 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0010  50S ribosomal protein L10  39.74 
 
 
166 aa  126  1.0000000000000001e-28  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.76481  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3036  50S ribosomal protein L10  43.21 
 
 
168 aa  125  3e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0878547 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2969  50S ribosomal protein L10  41.1 
 
 
168 aa  119  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.45658 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3316  50S ribosomal protein L10  41.1 
 
 
168 aa  119  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.354504  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2865  50S ribosomal protein L10  39.87 
 
 
174 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.161934  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1124  ribosomal protein L10  41.57 
 
 
174 aa  119  1.9999999999999998e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0857  50S ribosomal protein L10  36.72 
 
 
177 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000259828  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1059  50S ribosomal protein L10  39.22 
 
 
174 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0531801  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3191  50S ribosomal protein L10  40.49 
 
 
173 aa  118  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.579756  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1821  ribosomal protein L10  44.76 
 
 
179 aa  118  3.9999999999999996e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2344  ribosomal protein L10  38.16 
 
 
173 aa  118  3.9999999999999996e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.032292  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0617  50S ribosomal protein L10  41.18 
 
 
174 aa  117  6e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000383704 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1145  ribosomal protein L10  39.55 
 
 
182 aa  117  6e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000000394665  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3336  50S ribosomal protein L10  43.05 
 
 
173 aa  117  7.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1864  50S ribosomal protein L10  44.22 
 
 
174 aa  116  9.999999999999999e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0922754  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0325  50S ribosomal protein L10  44.22 
 
 
174 aa  116  9.999999999999999e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00522529  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10664  50S ribosomal protein L10  42.42 
 
 
178 aa  116  9.999999999999999e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.50048e-25  normal  0.41253 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2164  50S ribosomal protein L10P  42.01 
 
 
174 aa  117  9.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0596262  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0700  ribosomal protein L10  37.72 
 
 
174 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.299689  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20980  LSU ribosomal protein L10P  44.53 
 
 
203 aa  115  1.9999999999999998e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.996084  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4285  ribosomal protein L10  39.39 
 
 
166 aa  116  1.9999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000716484  hitchhiker  0.000000472968 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3337  50S ribosomal protein L10  37.91 
 
 
173 aa  115  3e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000271161 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0067  50S ribosomal protein L10  40.26 
 
 
165 aa  115  3e-25  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0213  ribosomal protein L10  37.21 
 
 
175 aa  115  3e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.623588  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0924  50S ribosomal protein L10  37.91 
 
 
173 aa  115  3e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0757  50S ribosomal protein L10  38.67 
 
 
174 aa  114  5e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0828  50S ribosomal protein L10  38.18 
 
 
166 aa  114  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0279492  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1337  50S ribosomal protein L10  39.58 
 
 
174 aa  114  6.9999999999999995e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.900212  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08740  50S ribosomal protein L10  38.18 
 
 
166 aa  114  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00037754 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0671  50S ribosomal protein L10  37.67 
 
 
174 aa  114  7.999999999999999e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0991  50S ribosomal protein L10  41.61 
 
 
176 aa  113  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000204805  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0310  50S ribosomal protein L10  39.87 
 
 
165 aa  113  1.0000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0746923  normal  0.0249908 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5961  50S ribosomal protein L10  43.08 
 
 
178 aa  112  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.527483  normal  0.892445 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2038  50S ribosomal protein L10  41.4 
 
 
175 aa  112  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0258299  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5088  50S ribosomal protein L10  38.18 
 
 
166 aa  112  3e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000128873  normal  0.821712 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2850  50S ribosomal protein L10  39.49 
 
 
165 aa  112  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.675463 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_863  ribosomal protein L10  40.27 
 
 
176 aa  111  4.0000000000000004e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000130926  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0187  50S ribosomal protein L10  39.16 
 
 
166 aa  111  5e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000330294  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0191  50S ribosomal protein L10  39.16 
 
 
166 aa  111  5e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000192331  hitchhiker  0.000568378 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3437  50S ribosomal protein L10  38.75 
 
 
165 aa  111  5e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153429  normal 
 
 
-
 
NC_009037  Sbal_4473  50S ribosomal protein L10  39.16 
 
 
166 aa  111  5e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3768  50S ribosomal protein L10  39.16 
 
 
166 aa  111  5e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000062266  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4065  50S ribosomal protein L10  39.16 
 
 
166 aa  111  5e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000275908  hitchhiker  0.00991378 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0222  50S ribosomal protein L10  38.55 
 
 
166 aa  110  7.000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2223  50S ribosomal protein L10  35.95 
 
 
174 aa  110  7.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00194446 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0190  50S ribosomal protein L10  38.55 
 
 
166 aa  110  7.000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000262315  hitchhiker  0.00315877 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0185  50S ribosomal protein L10  38.55 
 
 
166 aa  110  7.000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000592329  normal  0.0118628 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0190  50S ribosomal protein L10  38.55 
 
 
166 aa  110  7.000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000177262  hitchhiker  0.000758972 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4699  50S ribosomal protein L10  38.55 
 
 
166 aa  110  9e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000246782  hitchhiker  0.00000548606 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1529  ribosomal protein L10  40.82 
 
 
183 aa  110  9e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000554953  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl602  50S ribosomal protein L10  36.48 
 
 
166 aa  110  1.0000000000000001e-23  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0317  50S ribosomal protein L10  38.75 
 
 
165 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00438278  normal  0.203557 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0385  50S ribosomal protein L10  37.33 
 
 
177 aa  110  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0360  50S ribosomal protein L10  37.33 
 
 
177 aa  110  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0270  50S ribosomal protein L10  38.67 
 
 
174 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.247547  hitchhiker  0.00145059 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2769  50S ribosomal protein L10  38.75 
 
 
165 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0338  50S ribosomal protein L10  38.75 
 
 
165 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.550948  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4018  ribosomal protein L10  37.89 
 
 
174 aa  109  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.491975 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0445  50S ribosomal protein L10  36.36 
 
 
166 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.470652  unclonable  0.000000241771 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4758  50S ribosomal protein L10  36.97 
 
 
166 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00494482  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0475  50S ribosomal protein L10  36.36 
 
 
166 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.372242  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0204  50S ribosomal protein L10  37.35 
 
 
166 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000122994  hitchhiker  0.000100039 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3918  50S ribosomal protein L10  36.97 
 
 
166 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>