More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_0567 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008532  STER_0567  50S ribosomal protein L10  100 
 
 
167 aa  321  4e-87  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00969269  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1302  50S ribosomal protein L10  88.41 
 
 
166 aa  280  9e-75  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000076628  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1387  50S ribosomal protein L10  70.48 
 
 
171 aa  228  4e-59  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000123079  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0096  50S ribosomal protein L10  61.08 
 
 
166 aa  197  3.9999999999999996e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5206  50S ribosomal protein L10  57.67 
 
 
166 aa  196  9e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000252117  unclonable  5.898740000000001e-26 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0094  50S ribosomal protein L10  57.06 
 
 
166 aa  195  2.0000000000000003e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000793252  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0099  50S ribosomal protein L10  57.06 
 
 
166 aa  194  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000477259  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0099  50S ribosomal protein L10  57.06 
 
 
166 aa  194  4.0000000000000005e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000073314  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0095  50S ribosomal protein L10  57.06 
 
 
166 aa  194  4.0000000000000005e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  8.69083e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0093  50S ribosomal protein L10  57.06 
 
 
166 aa  194  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000338487  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0099  50S ribosomal protein L10  57.06 
 
 
166 aa  194  4.0000000000000005e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000718586  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0130  50S ribosomal protein L10  57.06 
 
 
166 aa  194  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000124346  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0110  50S ribosomal protein L10  57.06 
 
 
166 aa  194  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.02318e-62 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0120  50S ribosomal protein L10  57.06 
 
 
166 aa  194  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000126178  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0093  50S ribosomal protein L10  57.49 
 
 
166 aa  194  5.000000000000001e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000759135  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0100  50S ribosomal protein L10  59.88 
 
 
166 aa  192  2e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000689021  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0180  50S ribosomal protein L10  57.67 
 
 
166 aa  189  1e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0693527  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0271  50S ribosomal protein L10  58.75 
 
 
178 aa  185  2e-46  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00121092  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0562  50S ribosomal protein L10  55.83 
 
 
166 aa  177  8e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000233555  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0576  50S ribosomal protein L10  55.83 
 
 
166 aa  177  8e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000179203  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0313  50S ribosomal protein L10  55.09 
 
 
166 aa  176  2e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000558823  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1417  50S ribosomal protein L10  54.82 
 
 
197 aa  173  9.999999999999999e-43  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000013127  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2722  ribosomal protein L10  51.55 
 
 
170 aa  172  1.9999999999999998e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0525449  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0361  50S ribosomal protein L10  53.61 
 
 
190 aa  172  1.9999999999999998e-42  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000502234  hitchhiker  0.0000804712 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2722  50S ribosomal protein L10P  42.05 
 
 
178 aa  144  7.0000000000000006e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000314918  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2724  50S ribosomal protein L10  39.87 
 
 
166 aa  135  3.0000000000000003e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000159716  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2410  50S ribosomal protein L10  39.87 
 
 
166 aa  135  3.0000000000000003e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000332682  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0857  50S ribosomal protein L10  41.07 
 
 
177 aa  131  3e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000259828  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0310  ribosomal protein L10  42.44 
 
 
176 aa  130  6e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.109625  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3691  ribosomal protein L10  47.01 
 
 
164 aa  130  7.999999999999999e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000101089  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2470  50S ribosomal protein L10  40.25 
 
 
176 aa  127  6e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0147283  hitchhiker  0.00682166 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0276  50S ribosomal protein L10  41.61 
 
 
175 aa  127  6e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000204852  hitchhiker  0.000495958 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0408  50S ribosomal protein L10  40.83 
 
 
174 aa  122  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.79305e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01070  ribosomal protein L10  40.62 
 
 
172 aa  121  4e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  5.51299e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1529  ribosomal protein L10  41.3 
 
 
183 aa  121  5e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000554953  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0617  50S ribosomal protein L10  42.21 
 
 
174 aa  117  7e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000383704 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2865  50S ribosomal protein L10  40.26 
 
 
174 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.161934  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl602  50S ribosomal protein L10  39.24 
 
 
166 aa  115  3e-25  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0183  ribosomal protein L10  37.06 
 
 
176 aa  115  3e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000324199  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0213  ribosomal protein L10  37.14 
 
 
175 aa  115  3.9999999999999997e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.623588  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0828  50S ribosomal protein L10  41.94 
 
 
166 aa  114  5e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0279492  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08740  50S ribosomal protein L10  41.94 
 
 
166 aa  114  5e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00037754 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2951  ribosomal protein L10  40 
 
 
186 aa  114  6.9999999999999995e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0265827  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0010  50S ribosomal protein L10  38.96 
 
 
166 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.76481  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0300  ribosomal protein L10  36.77 
 
 
181 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000817286  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0692  50S ribosomal protein L10  37.25 
 
 
172 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000112903  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5088  50S ribosomal protein L10  41.29 
 
 
166 aa  112  3e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000128873  normal  0.821712 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3918  50S ribosomal protein L10  40.65 
 
 
166 aa  112  3e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0067  50S ribosomal protein L10  40.38 
 
 
165 aa  111  4.0000000000000004e-24  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4557  50S ribosomal protein L10  40.65 
 
 
166 aa  110  8.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.669843  decreased coverage  0.0090203 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4758  50S ribosomal protein L10  40.65 
 
 
166 aa  110  9e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00494482  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0445  50S ribosomal protein L10  40 
 
 
166 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.470652  unclonable  0.000000241771 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3316  50S ribosomal protein L10  40.65 
 
 
168 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.354504  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0475  50S ribosomal protein L10  40 
 
 
166 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.372242  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2969  50S ribosomal protein L10  40.65 
 
 
168 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.45658 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3036  50S ribosomal protein L10  42.04 
 
 
168 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0878547 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0617  ribosomal protein L10  40 
 
 
166 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.532211  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1059  50S ribosomal protein L10  41.56 
 
 
174 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0531801  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0478  50S ribosomal protein L10  40 
 
 
195 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00597987  hitchhiker  0.00527924 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0479  ribosomal protein L10  40.26 
 
 
164 aa  108  3e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0700  ribosomal protein L10  38.46 
 
 
174 aa  108  5e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.299689  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0991  50S ribosomal protein L10  37.25 
 
 
176 aa  107  1e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000204805  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1337  50S ribosomal protein L10  39.86 
 
 
174 aa  107  1e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.900212  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06150  50S ribosomal protein L10  39.35 
 
 
166 aa  106  1e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0838  50S ribosomal protein L10P  41.94 
 
 
172 aa  105  2e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0707377  normal  0.0995834 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0924  50S ribosomal protein L10  37.75 
 
 
173 aa  105  4e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3337  50S ribosomal protein L10  37.75 
 
 
173 aa  105  4e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000271161 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2164  50S ribosomal protein L10P  38.69 
 
 
174 aa  105  4e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0596262  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0171  50S ribosomal protein L10  42.86 
 
 
163 aa  104  5e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0111095  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1325  ribosomal protein L10  38.41 
 
 
256 aa  103  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2344  ribosomal protein L10  34.87 
 
 
173 aa  103  1e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.032292  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2423  50S ribosomal protein L10  35.1 
 
 
205 aa  102  2e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6637  ribosomal protein L10  38.55 
 
 
184 aa  103  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.858869  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_863  ribosomal protein L10  35.95 
 
 
176 aa  102  2e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000130926  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3453  50S ribosomal protein L10  39.38 
 
 
174 aa  102  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0925685  normal  0.446601 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0882  50S ribosomal protein L10  36.23 
 
 
176 aa  102  2e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.629984  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0205  50S ribosomal protein L10  35.84 
 
 
181 aa  102  3e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000665859  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1927  ribosomal protein L10  37.13 
 
 
176 aa  102  3e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0948645  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1124  ribosomal protein L10  43.61 
 
 
174 aa  101  4e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0203  50S ribosomal protein L10  41.35 
 
 
165 aa  101  4e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0744309  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0208  50S ribosomal protein L10  41.35 
 
 
165 aa  100  6e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000217712  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03861  50S ribosomal protein L10  40.6 
 
 
165 aa  100  7e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000311393  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4010  ribosomal protein L10  40.6 
 
 
165 aa  100  7e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000237202  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4433  50S ribosomal protein L10  40.6 
 
 
165 aa  100  7e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000818528  hitchhiker  0.00000264015 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08440  ribosomal protein L10  38.36 
 
 
173 aa  100  7e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.166227  normal  0.704722 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4525  50S ribosomal protein L10  40.6 
 
 
165 aa  100  7e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000111294  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4040  50S ribosomal protein L10  40.6 
 
 
165 aa  100  7e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00830699  hitchhiker  0.000887574 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5450  50S ribosomal protein L10  40.6 
 
 
165 aa  100  7e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000850473  hitchhiker  0.000626343 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03814  hypothetical protein  40.6 
 
 
165 aa  100  7e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000360524  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4473  50S ribosomal protein L10  40.6 
 
 
165 aa  100  7e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000239877  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4218  50S ribosomal protein L10  40.6 
 
 
165 aa  100  7e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.4618e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0671  50S ribosomal protein L10  38.46 
 
 
174 aa  100  7e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4285  ribosomal protein L10  38.71 
 
 
166 aa  100  8e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000716484  hitchhiker  0.000000472968 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0571  50S ribosomal protein L10  38.46 
 
 
187 aa  100  8e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1701  50S ribosomal protein L10  41.78 
 
 
171 aa  100  9e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.302531  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1372  50S ribosomal protein L10  33.53 
 
 
178 aa  100  1e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.188772  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4557  50S ribosomal protein L10  39.85 
 
 
165 aa  99.8  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.153585  hitchhiker  0.0000000000122855 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1145  ribosomal protein L10  37.08 
 
 
182 aa  99.8  2e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000000394665  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4483  50S ribosomal protein L10  39.85 
 
 
165 aa  99.8  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.763348  hitchhiker  0.0000000000000236313 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4480  50S ribosomal protein L10  39.85 
 
 
165 aa  99.8  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.375547  hitchhiker  0.00110307 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>