More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_3316 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_3316  50S ribosomal protein L10  100 
 
 		 168 aa  327  3e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.354504  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2969  50S ribosomal protein L10  100 
 
 		 168 aa  327  3e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.45658 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3036  50S ribosomal protein L10  92.26 
 
 		 168 aa  301  2.0000000000000002e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0878547 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3191  50S ribosomal protein L10  87.73 
 
 		 173 aa  281  4.0000000000000003e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.579756  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2850  50S ribosomal protein L10  80.12 
 
 		 165 aa  264  4e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.675463 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3437  50S ribosomal protein L10  79.52 
 
 		 165 aa  262  1e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153429  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0317  50S ribosomal protein L10  78.92 
 
 		 165 aa  261  4e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00438278  normal  0.203557 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2769  50S ribosomal protein L10  78.92 
 
 		 165 aa  261  4e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0338  50S ribosomal protein L10  78.92 
 
 		 165 aa  261  4e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.550948  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3336  50S ribosomal protein L10  85.62 
 
 		 173 aa  258  2e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3078  50S ribosomal protein L10  80.12 
 
 		 165 aa  235  2e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.892062  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0266  50S ribosomal protein L10  79.52 
 
 		 165 aa  234  3e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.646007  normal  0.635943 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0257  50S ribosomal protein L10  80.49 
 
 		 188 aa  234  3e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0591157  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0239  50S ribosomal protein L10  79.52 
 
 		 165 aa  233  7e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0229066 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2643  50S ribosomal protein L10  79.52 
 
 		 165 aa  233  8e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3788  50S ribosomal protein L10  79.52 
 
 		 165 aa  233  8e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.166109  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1912  50S ribosomal protein L10  79.52 
 
 		 165 aa  233  8e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000184172  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3818  50S ribosomal protein L10  79.88 
 
 		 184 aa  231  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.881367  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3756  50S ribosomal protein L10  79.88 
 
 		 184 aa  231  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0407684  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3467  50S ribosomal protein L10  79.88 
 
 		 184 aa  231  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0108818  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3654  50S ribosomal protein L10  79.04 
 
 		 167 aa  231  3e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0512272  hitchhiker  0.000000643388 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0304  50S ribosomal protein L10  79.04 
 
 		 167 aa  231  3e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.125975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0310  50S ribosomal protein L10  71.52 
 
 		 165 aa  229  9e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0746923  normal  0.0249908 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3347  50S ribosomal protein L10  79.59 
 
 		 167 aa  227  6e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.862427  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3180  50S ribosomal protein L10  79.43 
 
 		 140 aa  224  3e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000385503  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0270  50S ribosomal protein L10  65.66 
 
 		 174 aa  214  5.9999999999999996e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.247547  hitchhiker  0.00145059 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0040  50S ribosomal protein L10  69.48 
 
 		 179 aa  207  7e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0245031  hitchhiker  0.0000000000023806 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3453  50S ribosomal protein L10  65.84 
 
 		 174 aa  207  8e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0925685  normal  0.446601 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0044  50S ribosomal protein L10  68.18 
 
 		 215 aa  204  3e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000127438  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0757  50S ribosomal protein L10  59.64 
 
 		 174 aa  203  1e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4533  50S ribosomal protein L10  64.29 
 
 		 168 aa  198  3e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3899  50S ribosomal protein L10  63.1 
 
 		 168 aa  195  2.0000000000000003e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3248  50S ribosomal protein L10  63.1 
 
 		 168 aa  195  2.0000000000000003e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0586  50S ribosomal protein L10  62.58 
 
 		 177 aa  191  3e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0508  50S ribosomal protein L10  62.2 
 
 		 175 aa  189  1e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.270625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2262  50S ribosomal protein L10  63.41 
 
 		 174 aa  189  2e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.168271  normal  0.476107 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3869  50S ribosomal protein L10  64.38 
 
 		 182 aa  185  2e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3594  50S ribosomal protein L10  60.74 
 
 		 178 aa  185  3e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.196569  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4444  50S ribosomal protein L10  61.35 
 
 		 176 aa  184  5e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.651473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3642  50S ribosomal protein L10  60.87 
 
 		 183 aa  182  3e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.279713 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0396  50S ribosomal protein L10  61.45 
 
 		 173 aa  157  9e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.252363  hitchhiker  0.00709296 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0286  ribosomal protein L10  50.9 
 
 		 166 aa  156  1e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0147275  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0488  50S ribosomal protein L10  47.8 
 
 		 173 aa  150  1e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.169718  hitchhiker  0.00000169108 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0317  50S ribosomal protein L10  47.8 
 
 		 173 aa  150  1e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.146286  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0385  50S ribosomal protein L10  47.9 
 
 		 177 aa  148  3e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0360  50S ribosomal protein L10  47.9 
 
 		 177 aa  148  3e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5206  50S ribosomal protein L10  48.47 
 
 		 166 aa  146  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000252117  unclonable  5.898740000000001e-26 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0099  50S ribosomal protein L10  48.47 
 
 		 166 aa  145  3e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000477259  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0099  50S ribosomal protein L10  48.47 
 
 		 166 aa  145  3e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000073314  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0095  50S ribosomal protein L10  48.47 
 
 		 166 aa  145  3e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  8.69083e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0093  50S ribosomal protein L10  48.47 
 
 		 166 aa  145  3e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000338487  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0099  50S ribosomal protein L10  48.47 
 
 		 166 aa  145  3e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000718586  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0110  50S ribosomal protein L10  48.47 
 
 		 166 aa  145  3e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.02318e-62 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0120  50S ribosomal protein L10  48.47 
 
 		 166 aa  145  3e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000126178  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0130  50S ribosomal protein L10  48.47 
 
 		 166 aa  145  3e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000124346  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0094  50S ribosomal protein L10  47.85 
 
 		 166 aa  144  5e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000793252  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0093  50S ribosomal protein L10  47.85 
 
 		 166 aa  144  6e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000759135  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04532  50S ribosomal protein L10  46.67 
 
 		 177 aa  141  4e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.165522  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0867  50S ribosomal protein L10  50.33 
 
 		 175 aa  141  4e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5088  50S ribosomal protein L10  45.56 
 
 		 166 aa  140  8e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000128873  normal  0.821712 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0747  50S ribosomal protein L10  46.06 
 
 		 178 aa  140  9.999999999999999e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0329012  normal  0.965103 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0314  ribosomal protein L10  46.25 
 
 		 175 aa  139  9.999999999999999e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000329441  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4285  ribosomal protein L10  47.31 
 
 		 166 aa  139  3e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000716484  hitchhiker  0.000000472968 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0838  50S ribosomal protein L10P  46.45 
 
 		 172 aa  138  3e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0707377  normal  0.0995834 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2178  ribosomal protein L10  46.25 
 
 		 175 aa  137  6e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.905696 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2868  50S ribosomal protein L10  44.91 
 
 		 164 aa  137  1e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000140329  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06150  50S ribosomal protein L10  45.51 
 
 		 166 aa  136  1e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0445  50S ribosomal protein L10  43.79 
 
 		 166 aa  136  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.470652  unclonable  0.000000241771 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0617  ribosomal protein L10  44.97 
 
 		 166 aa  136  2e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.532211  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0922  50S ribosomal protein L10  46.88 
 
 		 176 aa  135  2e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00116615  hitchhiker  0.00000161737 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4758  50S ribosomal protein L10  43.79 
 
 		 166 aa  135  2e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00494482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0475  50S ribosomal protein L10  43.79 
 
 		 166 aa  136  2e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.372242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4557  50S ribosomal protein L10  44.38 
 
 		 166 aa  134  4e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.669843  decreased coverage  0.0090203 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0596  50S ribosomal protein L10  45.62 
 
 		 172 aa  134  8e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0140503  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0478  50S ribosomal protein L10  43.2 
 
 		 195 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00597987  hitchhiker  0.00527924 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002171  LSU ribosomal protein L10p (P0)  43.71 
 
 		 164 aa  133  9.999999999999999e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000109594  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0828  50S ribosomal protein L10  43.79 
 
 		 166 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0279492  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0161  50S ribosomal protein L10  46.34 
 
 		 166 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000494732  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3918  50S ribosomal protein L10  43.79 
 
 		 166 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08740  50S ribosomal protein L10  43.79 
 
 		 166 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00037754 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0149  50S ribosomal protein L10  44.94 
 
 		 165 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000191294  normal  0.034689 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2333  50S ribosomal protein L10  50.62 
 
 		 176 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.275074  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2722  ribosomal protein L10  44.97 
 
 		 170 aa  131  5e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0525449  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0449  50S ribosomal protein L10  46.25 
 
 		 175 aa  131  5e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0139  50S ribosomal protein L10  46.2 
 
 		 166 aa  131  6e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000054937  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0310  ribosomal protein L10  49.01 
 
 		 176 aa  130  7.999999999999999e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.109625  n/a   
 
 
-
 
NC_009037  Sbal_4473  50S ribosomal protein L10  45.12 
 
 		 166 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3448  ribosomal protein L10  44.31 
 
 		 167 aa  129  1.0000000000000001e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00000199113  hitchhiker  0.00604494 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0191  50S ribosomal protein L10  45.12 
 
 		 166 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000192331  hitchhiker  0.000568378 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4065  50S ribosomal protein L10  45.12 
 
 		 166 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000275908  hitchhiker  0.00991378 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0187  50S ribosomal protein L10  45.12 
 
 		 166 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000330294  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3768  50S ribosomal protein L10  45.12 
 
 		 166 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000062266  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4771  50S ribosomal protein L10  42.86 
 
 		 164 aa  129  2.0000000000000002e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.709091  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0222  50S ribosomal protein L10  45.12 
 
 		 166 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0190  50S ribosomal protein L10  45.12 
 
 		 166 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000262315  hitchhiker  0.00315877 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0185  50S ribosomal protein L10  45.12 
 
 		 166 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000592329  normal  0.0118628 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01070  ribosomal protein L10  46.31 
 
 		 172 aa  129  2.0000000000000002e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  5.51299e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0190  50S ribosomal protein L10  45.12 
 
 		 166 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000177262  hitchhiker  0.000758972 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0204  50S ribosomal protein L10  45.73 
 
 		 166 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000122994  hitchhiker  0.000100039 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0408  50S ribosomal protein L10  46.84 
 
 		 174 aa  128  3e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.79305e-16  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>