More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_2410 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_2724  50S ribosomal protein L10  100 
 
 		 166 aa  325  1.0000000000000001e-88  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000159716  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2410  50S ribosomal protein L10  100 
 
 		 166 aa  325  1.0000000000000001e-88  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000332682  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0857  50S ribosomal protein L10  51.59 
 
 		 177 aa  171  3.9999999999999995e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000259828  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3691  ribosomal protein L10  53.75 
 
 		 164 aa  161  3e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000101089  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2722  ribosomal protein L10  47.2 
 
 		 170 aa  158  3e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0525449  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0183  ribosomal protein L10  50 
 
 		 176 aa  157  4e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000324199  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0100  50S ribosomal protein L10  48.48 
 
 		 166 aa  157  5e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000689021  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0096  50S ribosomal protein L10  47.85 
 
 		 166 aa  157  7e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0310  ribosomal protein L10  50.63 
 
 		 176 aa  154  6e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.109625  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0180  50S ribosomal protein L10  45.91 
 
 		 166 aa  151  4e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0693527  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0093  50S ribosomal protein L10  45.4 
 
 		 166 aa  151  4e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000759135  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0094  50S ribosomal protein L10  46.63 
 
 		 166 aa  150  7e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000793252  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0099  50S ribosomal protein L10  46.01 
 
 		 166 aa  150  1e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000477259  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0099  50S ribosomal protein L10  46.01 
 
 		 166 aa  150  1e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000073314  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0095  50S ribosomal protein L10  46.01 
 
 		 166 aa  150  1e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  8.69083e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0093  50S ribosomal protein L10  46.01 
 
 		 166 aa  150  1e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000338487  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0099  50S ribosomal protein L10  46.01 
 
 		 166 aa  150  1e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000718586  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0110  50S ribosomal protein L10  46.01 
 
 		 166 aa  150  1e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.02318e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0130  50S ribosomal protein L10  46.01 
 
 		 166 aa  150  1e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000124346  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0120  50S ribosomal protein L10  46.01 
 
 		 166 aa  150  1e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000126178  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0576  50S ribosomal protein L10  46.45 
 
 		 166 aa  148  3e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000179203  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0562  50S ribosomal protein L10  46.45 
 
 		 166 aa  148  3e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000233555  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1387  50S ribosomal protein L10  45.64 
 
 		 171 aa  147  7e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000123079  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0205  50S ribosomal protein L10  49.33 
 
 		 181 aa  147  9e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000665859  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5206  50S ribosomal protein L10  45.4 
 
 		 166 aa  146  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000252117  unclonable  5.898740000000001e-26 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2470  50S ribosomal protein L10  43.75 
 
 		 176 aa  145  2.0000000000000003e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0147283  hitchhiker  0.00682166 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0276  50S ribosomal protein L10  46.98 
 
 		 175 aa  145  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000204852  hitchhiker  0.000495958 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2722  50S ribosomal protein L10P  46.2 
 
 		 178 aa  144  6e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000314918  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0617  50S ribosomal protein L10  47.74 
 
 		 174 aa  144  7.0000000000000006e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000383704 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01070  ribosomal protein L10  50 
 
 		 172 aa  143  1e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  5.51299e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1529  ribosomal protein L10  43.75 
 
 		 183 aa  142  2e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000554953  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0408  50S ribosomal protein L10  51.05 
 
 		 174 aa  141  5e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.79305e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1302  50S ribosomal protein L10  45.03 
 
 		 166 aa  140  9.999999999999999e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000076628  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0671  50S ribosomal protein L10  45.16 
 
 		 174 aa  138  3e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0692  50S ribosomal protein L10  47.71 
 
 		 172 aa  138  3.9999999999999997e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000112903  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2865  50S ribosomal protein L10  42.58 
 
 		 174 aa  137  7.999999999999999e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.161934  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3337  50S ribosomal protein L10  45.16 
 
 		 173 aa  136  2e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000271161 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0924  50S ribosomal protein L10  45.16 
 
 		 173 aa  136  2e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1337  50S ribosomal protein L10  42.86 
 
 		 174 aa  135  2e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.900212  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0567  50S ribosomal protein L10  39.87 
 
 		 167 aa  135  3.0000000000000003e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00969269  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1821  ribosomal protein L10  44.3 
 
 		 179 aa  134  8e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1059  50S ribosomal protein L10  43.23 
 
 		 174 aa  132  9.999999999999999e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0531801  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20980  LSU ribosomal protein L10P  47.97 
 
 		 203 aa  128  3e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.996084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3191  50S ribosomal protein L10  44.24 
 
 		 173 aa  128  4.0000000000000003e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.579756  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0700  ribosomal protein L10  41.18 
 
 		 174 aa  128  5.0000000000000004e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.299689  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3437  50S ribosomal protein L10  45.18 
 
 		 165 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2769  50S ribosomal protein L10  45.18 
 
 		 165 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0317  50S ribosomal protein L10  45.18 
 
 		 165 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00438278  normal  0.203557 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0271  50S ribosomal protein L10  42.21 
 
 		 178 aa  125  2.0000000000000002e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00121092  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0338  50S ribosomal protein L10  45.18 
 
 		 165 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.550948  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3453  50S ribosomal protein L10  43.9 
 
 		 174 aa  125  3e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0925685  normal  0.446601 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2344  ribosomal protein L10  39.6 
 
 		 173 aa  124  4.0000000000000003e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.032292  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2850  50S ribosomal protein L10  45.18 
 
 		 165 aa  124  7e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.675463 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3036  50S ribosomal protein L10  44.79 
 
 		 168 aa  124  9e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0878547 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1927  ribosomal protein L10  41.67 
 
 		 176 aa  122  2e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0948645  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1547  50S ribosomal protein L10  42.21 
 
 		 173 aa  122  2e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.834427 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2969  50S ribosomal protein L10  44.24 
 
 		 168 aa  121  4e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.45658 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3316  50S ribosomal protein L10  44.24 
 
 		 168 aa  121  4e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.354504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1417  50S ribosomal protein L10  40 
 
 		 197 aa  120  7e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000013127  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0838  50S ribosomal protein L10P  41.78 
 
 		 172 aa  120  8e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0707377  normal  0.0995834 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0213  ribosomal protein L10  35.5 
 
 		 175 aa  119  9.999999999999999e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.623588  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0310  50S ribosomal protein L10  41.21 
 
 		 165 aa  120  9.999999999999999e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0746923  normal  0.0249908 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0757  50S ribosomal protein L10  36.57 
 
 		 174 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3336  50S ribosomal protein L10  43.87 
 
 		 173 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0361  50S ribosomal protein L10  39.24 
 
 		 190 aa  119  1.9999999999999998e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000502234  hitchhiker  0.0000804712 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1667  50S ribosomal protein L10  43.59 
 
 		 173 aa  118  3e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0226  ribosomal protein L10  43.59 
 
 		 173 aa  117  4.9999999999999996e-26  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0270  50S ribosomal protein L10  40.99 
 
 		 174 aa  117  9e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.247547  hitchhiker  0.00145059 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2951  ribosomal protein L10  41.1 
 
 		 186 aa  116  9.999999999999999e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0265827  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0479  ribosomal protein L10  42.95 
 
 		 164 aa  115  3e-25  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0140  50S ribosomal protein L10  40.35 
 
 		 174 aa  115  3e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000236563  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3594  50S ribosomal protein L10  43.48 
 
 		 178 aa  115  3e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.196569  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6059  50S ribosomal protein L10  41.42 
 
 		 182 aa  115  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.749447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1634  50S ribosomal protein L10  41.18 
 
 		 174 aa  114  6e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4318  50S ribosomal protein L10  36.42 
 
 		 187 aa  113  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.561909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0389  ribosomal protein L10  38.85 
 
 		 174 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0313  50S ribosomal protein L10  36.36 
 
 		 166 aa  111  5e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000558823  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0171  50S ribosomal protein L10  40.96 
 
 		 163 aa  111  5e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0111095  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2262  50S ribosomal protein L10  42.94 
 
 		 174 aa  110  6e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.168271  normal  0.476107 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0508  50S ribosomal protein L10  41.82 
 
 		 175 aa  110  7.000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.270625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0571  50S ribosomal protein L10  40.96 
 
 		 187 aa  110  9e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1124  ribosomal protein L10  40.59 
 
 		 174 aa  109  2.0000000000000002e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0266  50S ribosomal protein L10  45.14 
 
 		 165 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.646007  normal  0.635943 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4533  50S ribosomal protein L10  42.07 
 
 		 168 aa  109  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1509  ribosomal protein L10  36.84 
 
 		 176 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000272992  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0257  50S ribosomal protein L10  44.76 
 
 		 188 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0591157  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3328  50S ribosomal protein L10  35.76 
 
 		 186 aa  109  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.211537 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29850  LSU ribosomal protein L10P  42.95 
 
 		 176 aa  108  3e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0385  50S ribosomal protein L10  38.95 
 
 		 177 aa  108  3e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0360  50S ribosomal protein L10  38.95 
 
 		 177 aa  108  3e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3347  50S ribosomal protein L10  42.95 
 
 		 167 aa  108  3e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.862427  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0239  50S ribosomal protein L10  44.44 
 
 		 165 aa  108  3e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0229066 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4699  50S ribosomal protein L10  41.51 
 
 		 166 aa  108  3e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000246782  hitchhiker  0.00000548606 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3869  50S ribosomal protein L10  42.24 
 
 		 182 aa  108  3e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2656  50S ribosomal protein L10  41.04 
 
 		 175 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.220618  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0586  50S ribosomal protein L10  40.99 
 
 		 177 aa  108  4.0000000000000004e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3078  50S ribosomal protein L10  44.06 
 
 		 165 aa  108  5e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.892062  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3899  50S ribosomal protein L10  41.46 
 
 		 168 aa  107  6e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl602  50S ribosomal protein L10  37.35 
 
 		 166 aa  107  6e-23  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3248  50S ribosomal protein L10  41.46 
 
 		 168 aa  107  6e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>