More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_0276 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_0276  50S ribosomal protein L10  100 
 
 
175 aa  349  1e-95  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000204852  hitchhiker  0.000495958 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0205  50S ribosomal protein L10  60.34 
 
 
181 aa  212  1.9999999999999998e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000665859  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0408  50S ribosomal protein L10  54.86 
 
 
174 aa  187  7e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.79305e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0183  ribosomal protein L10  53.85 
 
 
176 aa  184  4e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000324199  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2470  50S ribosomal protein L10  55.7 
 
 
176 aa  183  1.0000000000000001e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0147283  hitchhiker  0.00682166 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01070  ribosomal protein L10  54.39 
 
 
172 aa  181  7e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  5.51299e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1927  ribosomal protein L10  50 
 
 
176 aa  174  4e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0948645  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0213  ribosomal protein L10  47.43 
 
 
175 aa  174  6e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.623588  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2722  ribosomal protein L10  52.33 
 
 
170 aa  174  7e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0525449  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0310  ribosomal protein L10  51.43 
 
 
176 aa  170  9e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.109625  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1821  ribosomal protein L10  48.55 
 
 
179 aa  165  4e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0857  50S ribosomal protein L10  46.24 
 
 
177 aa  161  4.0000000000000004e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000259828  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3337  50S ribosomal protein L10  48.24 
 
 
173 aa  160  6e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000271161 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0924  50S ribosomal protein L10  48.24 
 
 
173 aa  160  6e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2722  50S ribosomal protein L10P  46.07 
 
 
178 aa  158  3e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000314918  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0692  50S ribosomal protein L10  45.88 
 
 
172 aa  157  9e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000112903  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1059  50S ribosomal protein L10  45.93 
 
 
174 aa  154  8e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0531801  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0617  50S ribosomal protein L10  45.03 
 
 
174 aa  152  2.9999999999999998e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000383704 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0838  50S ribosomal protein L10P  48.21 
 
 
172 aa  150  7e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0707377  normal  0.0995834 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0096  50S ribosomal protein L10  51.39 
 
 
166 aa  150  1e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2344  ribosomal protein L10  42.2 
 
 
173 aa  147  5e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.032292  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0100  50S ribosomal protein L10  48.48 
 
 
166 aa  147  7e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000689021  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0180  50S ribosomal protein L10  45.34 
 
 
166 aa  147  8e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0693527  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1337  50S ribosomal protein L10  46.2 
 
 
174 aa  146  1.0000000000000001e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.900212  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5206  50S ribosomal protein L10  46.67 
 
 
166 aa  146  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000252117  unclonable  5.898740000000001e-26 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2724  50S ribosomal protein L10  46.98 
 
 
166 aa  145  2.0000000000000003e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000159716  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2410  50S ribosomal protein L10  46.98 
 
 
166 aa  145  2.0000000000000003e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000332682  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0093  50S ribosomal protein L10  46.67 
 
 
166 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000759135  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0671  50S ribosomal protein L10  44.12 
 
 
174 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2865  50S ribosomal protein L10  43.86 
 
 
174 aa  145  3e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.161934  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0099  50S ribosomal protein L10  46.67 
 
 
166 aa  144  5e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000477259  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0099  50S ribosomal protein L10  46.67 
 
 
166 aa  144  5e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000073314  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0095  50S ribosomal protein L10  46.67 
 
 
166 aa  144  5e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  8.69083e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0093  50S ribosomal protein L10  46.67 
 
 
166 aa  144  5e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000338487  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0099  50S ribosomal protein L10  46.67 
 
 
166 aa  144  5e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000718586  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0120  50S ribosomal protein L10  46.67 
 
 
166 aa  144  5e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000126178  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0130  50S ribosomal protein L10  46.67 
 
 
166 aa  144  5e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000124346  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0110  50S ribosomal protein L10  46.67 
 
 
166 aa  144  5e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.02318e-62 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0576  50S ribosomal protein L10  45.45 
 
 
166 aa  144  6e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000179203  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0562  50S ribosomal protein L10  45.45 
 
 
166 aa  144  6e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000233555  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0094  50S ribosomal protein L10  46.06 
 
 
166 aa  142  2e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000793252  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0700  ribosomal protein L10  43.98 
 
 
174 aa  141  5e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.299689  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1529  ribosomal protein L10  43.11 
 
 
183 aa  137  7e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000554953  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0571  50S ribosomal protein L10  44.19 
 
 
187 aa  136  1e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2074  50S ribosomal protein L10  40.35 
 
 
172 aa  134  6.0000000000000005e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1547  50S ribosomal protein L10  42.26 
 
 
173 aa  133  9.999999999999999e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.834427 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_863  ribosomal protein L10  41.52 
 
 
176 aa  132  3e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000130926  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3691  ribosomal protein L10  49.23 
 
 
164 aa  131  5e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000101089  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1387  50S ribosomal protein L10  44.68 
 
 
171 aa  130  6.999999999999999e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000123079  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1474  50S ribosomal protein L10  41.52 
 
 
181 aa  130  7.999999999999999e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000103472  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0991  50S ribosomal protein L10  41.52 
 
 
176 aa  130  1.0000000000000001e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000204805  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6059  50S ribosomal protein L10  43.98 
 
 
182 aa  128  3e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.749447  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4318  50S ribosomal protein L10  37.87 
 
 
187 aa  128  4.0000000000000003e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.561909  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0567  50S ribosomal protein L10  41.61 
 
 
167 aa  127  6e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00969269  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1509  ribosomal protein L10  38.42 
 
 
176 aa  127  8.000000000000001e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000272992  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3328  50S ribosomal protein L10  38.46 
 
 
186 aa  126  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.211537 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0479  50S ribosomal protein L10  40.45 
 
 
179 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.488036  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0464  50S ribosomal protein L10  40.45 
 
 
179 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0359791  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0389  ribosomal protein L10  40 
 
 
174 aa  126  1.0000000000000001e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29850  LSU ribosomal protein L10P  42.11 
 
 
176 aa  126  2.0000000000000002e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20980  LSU ribosomal protein L10P  42.42 
 
 
203 aa  126  2.0000000000000002e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.996084  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17270  LSU ribosomal protein L10P  42.6 
 
 
173 aa  126  2.0000000000000002e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0915  ribosomal protein L10  42.77 
 
 
174 aa  125  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.690445  normal  0.23712 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0578  ribosomal protein L10  46.15 
 
 
212 aa  125  3e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.141737  normal  0.0136421 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0271  50S ribosomal protein L10  43.04 
 
 
178 aa  125  3e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00121092  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08440  ribosomal protein L10  40.35 
 
 
173 aa  124  5e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.166227  normal  0.704722 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4521  ribosomal protein L10  41.38 
 
 
200 aa  124  6e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1956  ribosomal protein L10  37.14 
 
 
174 aa  124  6e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1325  ribosomal protein L10  40.72 
 
 
256 aa  124  7e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0882  50S ribosomal protein L10  40.85 
 
 
176 aa  124  7e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.629984  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2164  50S ribosomal protein L10P  40.12 
 
 
174 aa  123  1e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0596262  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0297  50S ribosomal protein L10  43.6 
 
 
172 aa  123  1e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1302  50S ribosomal protein L10  39.49 
 
 
166 aa  122  2e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000076628  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1372  50S ribosomal protein L10  37.79 
 
 
178 aa  122  2e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.188772  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0757  50S ribosomal protein L10  43.37 
 
 
174 aa  123  2e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0270  50S ribosomal protein L10  43.45 
 
 
174 aa  122  2e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.247547  hitchhiker  0.00145059 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0441  50S ribosomal protein L10  38.24 
 
 
189 aa  121  4e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0140  50S ribosomal protein L10  38.29 
 
 
174 aa  120  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000236563  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0618  ribosomal protein L10  44.19 
 
 
173 aa  119  3e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0361  50S ribosomal protein L10  41.07 
 
 
190 aa  118  4.9999999999999996e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000502234  hitchhiker  0.0000804712 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2223  50S ribosomal protein L10  37.72 
 
 
174 aa  117  6e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00194446 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3935  50S ribosomal protein L10  41.04 
 
 
181 aa  117  7e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.193843  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0488  50S ribosomal protein L10  39.29 
 
 
173 aa  116  9.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.169718  hitchhiker  0.00000169108 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4327  50S ribosomal protein L10  45.1 
 
 
181 aa  117  9.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0317  50S ribosomal protein L10  39.29 
 
 
173 aa  116  9.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.146286  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0541  50S ribosomal protein L10  42.2 
 
 
174 aa  116  9.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.367918  normal  0.103583 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1018  ribosomal protein L10  42.26 
 
 
202 aa  117  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23960  LSU ribosomal protein L10P  40.23 
 
 
172 aa  116  1.9999999999999998e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1417  50S ribosomal protein L10  39.02 
 
 
197 aa  116  1.9999999999999998e-25  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000013127  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0313  50S ribosomal protein L10  41.1 
 
 
166 aa  115  3e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000558823  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5114  ribosomal protein L10  42.5 
 
 
175 aa  115  3.9999999999999997e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.316499  normal  0.732887 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2669  ribosomal protein L10  43.02 
 
 
175 aa  114  5e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.69004  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6637  ribosomal protein L10  45.45 
 
 
184 aa  113  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.858869  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0678  ribosomal protein L10  42.21 
 
 
190 aa  113  1.0000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3157  ribosomal protein L10  42.44 
 
 
173 aa  113  1.0000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500065  normal  0.290514 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1964  50S ribosomal protein L10  35.5 
 
 
172 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.202865  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4018  ribosomal protein L10  36.09 
 
 
174 aa  112  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.491975 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0504  50S ribosomal protein L10  35.75 
 
 
180 aa  112  3e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000340487  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0300  ribosomal protein L10  37.21 
 
 
181 aa  112  3e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000817286  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1072  LSU ribosomal protein L10P  42.2 
 
 
174 aa  112  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.37271  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>