More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0213 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_0213  ribosomal protein L10  100 
 
 
175 aa  349  1e-95  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.623588  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0276  50S ribosomal protein L10  47.43 
 
 
175 aa  174  6e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000204852  hitchhiker  0.000495958 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01070  ribosomal protein L10  46.2 
 
 
172 aa  164  4e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  5.51299e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0205  50S ribosomal protein L10  45.56 
 
 
181 aa  157  5e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000665859  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2470  50S ribosomal protein L10  45.03 
 
 
176 aa  157  9e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0147283  hitchhiker  0.00682166 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1927  ribosomal protein L10  44.17 
 
 
176 aa  155  3e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0948645  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2722  50S ribosomal protein L10P  42.7 
 
 
178 aa  150  8.999999999999999e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000314918  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0408  50S ribosomal protein L10  44 
 
 
174 aa  148  3e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.79305e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0310  ribosomal protein L10  43.6 
 
 
176 aa  145  3e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.109625  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0857  50S ribosomal protein L10  42.2 
 
 
177 aa  145  4.0000000000000006e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000259828  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0183  ribosomal protein L10  40.48 
 
 
176 aa  140  9e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000324199  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0140  50S ribosomal protein L10  42.29 
 
 
174 aa  139  9.999999999999999e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000236563  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1821  ribosomal protein L10  39.39 
 
 
179 aa  136  2e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4318  50S ribosomal protein L10  41.92 
 
 
187 aa  136  2e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.561909  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0389  ribosomal protein L10  42.35 
 
 
174 aa  135  4e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3328  50S ribosomal protein L10  41.92 
 
 
186 aa  135  4e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.211537 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2722  ribosomal protein L10  41.62 
 
 
170 aa  131  3.9999999999999996e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0525449  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2344  ribosomal protein L10  37.57 
 
 
173 aa  131  5e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.032292  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1474  50S ribosomal protein L10  39.77 
 
 
181 aa  130  9e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000103472  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0700  ribosomal protein L10  39.29 
 
 
174 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.299689  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1372  50S ribosomal protein L10  36.05 
 
 
178 aa  126  2.0000000000000002e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.188772  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0671  50S ribosomal protein L10  39.18 
 
 
174 aa  124  7e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1956  ribosomal protein L10  37.14 
 
 
174 aa  123  2e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2164  50S ribosomal protein L10P  43.87 
 
 
174 aa  120  7e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0596262  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0100  50S ribosomal protein L10  39.13 
 
 
166 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000689021  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2724  50S ribosomal protein L10  35.5 
 
 
166 aa  119  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000159716  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2410  50S ribosomal protein L10  35.5 
 
 
166 aa  119  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000332682  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0096  50S ribosomal protein L10  40.48 
 
 
166 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0617  50S ribosomal protein L10  37.06 
 
 
174 aa  118  3.9999999999999996e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000383704 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1529  ribosomal protein L10  34.78 
 
 
183 aa  117  7.999999999999999e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000554953  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2865  50S ribosomal protein L10  35.88 
 
 
174 aa  117  9e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.161934  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3337  50S ribosomal protein L10  35.47 
 
 
173 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000271161 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0924  50S ribosomal protein L10  35.47 
 
 
173 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1124  ribosomal protein L10  39.88 
 
 
174 aa  116  9.999999999999999e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0838  50S ribosomal protein L10P  38.6 
 
 
172 aa  117  9.999999999999999e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0707377  normal  0.0995834 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0180  50S ribosomal protein L10  37.21 
 
 
166 aa  115  3e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0693527  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1337  50S ribosomal protein L10  38.27 
 
 
174 aa  115  3e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.900212  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0567  50S ribosomal protein L10  37.14 
 
 
167 aa  115  3.9999999999999997e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00969269  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1059  50S ribosomal protein L10  35.88 
 
 
174 aa  114  5e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0531801  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0576  50S ribosomal protein L10  35.76 
 
 
166 aa  114  6e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000179203  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0562  50S ribosomal protein L10  35.76 
 
 
166 aa  114  6e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000233555  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1509  ribosomal protein L10  36.72 
 
 
176 aa  114  6e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000272992  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29850  LSU ribosomal protein L10P  38.82 
 
 
176 aa  114  7.999999999999999e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17270  LSU ribosomal protein L10P  38.27 
 
 
173 aa  114  1.0000000000000001e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08440  ribosomal protein L10  37.57 
 
 
173 aa  112  2.0000000000000002e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.166227  normal  0.704722 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2074  50S ribosomal protein L10  33.73 
 
 
172 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1387  50S ribosomal protein L10  37.5 
 
 
171 aa  112  2.0000000000000002e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000123079  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0099  50S ribosomal protein L10  35.4 
 
 
166 aa  112  3e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000477259  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0099  50S ribosomal protein L10  35.4 
 
 
166 aa  112  3e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000073314  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0095  50S ribosomal protein L10  35.4 
 
 
166 aa  112  3e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  8.69083e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0093  50S ribosomal protein L10  35.4 
 
 
166 aa  112  3e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000338487  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0692  50S ribosomal protein L10  33.14 
 
 
172 aa  112  3e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000112903  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0099  50S ribosomal protein L10  35.4 
 
 
166 aa  112  3e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000718586  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0110  50S ribosomal protein L10  35.4 
 
 
166 aa  112  3e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.02318e-62 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0120  50S ribosomal protein L10  35.4 
 
 
166 aa  112  3e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000126178  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0130  50S ribosomal protein L10  35.4 
 
 
166 aa  112  3e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000124346  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0093  50S ribosomal protein L10  35.4 
 
 
166 aa  111  4.0000000000000004e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000759135  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5206  50S ribosomal protein L10  35.4 
 
 
166 aa  111  5e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000252117  unclonable  5.898740000000001e-26 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2656  50S ribosomal protein L10  38.73 
 
 
175 aa  111  5e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.220618  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0094  50S ribosomal protein L10  35.4 
 
 
166 aa  111  5e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000793252  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1453  50S ribosomal protein L10  34.5 
 
 
173 aa  110  8.000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0504  50S ribosomal protein L10  35.75 
 
 
180 aa  110  8.000000000000001e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000340487  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0464  50S ribosomal protein L10  37.99 
 
 
179 aa  110  9e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0359791  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0479  50S ribosomal protein L10  37.99 
 
 
179 aa  110  9e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.488036  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3935  50S ribosomal protein L10  37.29 
 
 
181 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.193843  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6637  ribosomal protein L10  36.9 
 
 
184 aa  110  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.858869  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0915  ribosomal protein L10  38.73 
 
 
174 aa  109  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.690445  normal  0.23712 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0578  ribosomal protein L10  42.35 
 
 
212 aa  109  2.0000000000000002e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.141737  normal  0.0136421 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1547  50S ribosomal protein L10  37.5 
 
 
173 aa  109  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.834427 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0297  50S ribosomal protein L10  39.53 
 
 
172 aa  109  2.0000000000000002e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0571  50S ribosomal protein L10  35.71 
 
 
187 aa  108  3e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0994  50S ribosomal protein L10  38.24 
 
 
175 aa  108  3e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4327  50S ribosomal protein L10  39.22 
 
 
181 aa  108  3e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1018  ribosomal protein L10  36.9 
 
 
202 aa  108  5e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4521  ribosomal protein L10  36.42 
 
 
200 aa  108  5e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0325  50S ribosomal protein L10  36.99 
 
 
174 aa  108  5e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00522529  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1864  50S ribosomal protein L10  36.99 
 
 
174 aa  108  5e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0922754  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0991  50S ribosomal protein L10  38.18 
 
 
176 aa  107  6e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000204805  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2783  50S ribosomal protein L10  34.32 
 
 
172 aa  107  7.000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00189787  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0966  50S ribosomal protein L10  37.87 
 
 
175 aa  107  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.968319  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0984  50S ribosomal protein L10  37.87 
 
 
175 aa  107  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.270382  normal  0.351336 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23960  LSU ribosomal protein L10P  37.14 
 
 
172 aa  107  9.000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1302  50S ribosomal protein L10  36.31 
 
 
166 aa  106  1e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000076628  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5961  50S ribosomal protein L10  37.5 
 
 
178 aa  107  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.527483  normal  0.892445 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2951  ribosomal protein L10  37.85 
 
 
186 aa  107  1e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0265827  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1072  LSU ribosomal protein L10P  37.5 
 
 
174 aa  107  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.37271  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0441  50S ribosomal protein L10  33.72 
 
 
189 aa  107  1e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1018  50S ribosomal protein L10  38.51 
 
 
178 aa  106  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00251564 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0698  50S ribosomal protein L10  43.06 
 
 
228 aa  106  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_863  ribosomal protein L10  36.97 
 
 
176 aa  105  3e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000130926  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2994  50S ribosomal protein L10  33.92 
 
 
173 aa  105  3e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1667  50S ribosomal protein L10  38.24 
 
 
173 aa  105  4e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5114  ribosomal protein L10  36.9 
 
 
175 aa  104  6e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.316499  normal  0.732887 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10664  50S ribosomal protein L10  35.67 
 
 
178 aa  104  8e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.50048e-25  normal  0.41253 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0226  ribosomal protein L10  38.24 
 
 
173 aa  103  8e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6059  50S ribosomal protein L10  34.52 
 
 
182 aa  103  9e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.749447  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1634  50S ribosomal protein L10  32.37 
 
 
174 aa  103  9e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2223  50S ribosomal protein L10  35.33 
 
 
174 aa  103  1e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00194446 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0678  ribosomal protein L10  35.67 
 
 
190 aa  103  1e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20980  LSU ribosomal protein L10P  35.5 
 
 
203 aa  103  1e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.996084  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>