More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_2344 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_2344  ribosomal protein L10  100 
 
 		 173 aa  343  6e-94  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.032292  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0310  ribosomal protein L10  44.97 
 
 		 176 aa  153  1e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.109625  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2722  50S ribosomal protein L10P  42.86 
 
 		 178 aa  153  1e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000314918  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0205  50S ribosomal protein L10  46.15 
 
 		 181 aa  151  5e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000665859  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2470  50S ribosomal protein L10  44.91 
 
 		 176 aa  150  7e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0147283  hitchhiker  0.00682166 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01070  ribosomal protein L10  43.86 
 
 		 172 aa  148  3e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  5.51299e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0276  50S ribosomal protein L10  42.2 
 
 		 175 aa  147  5e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000204852  hitchhiker  0.000495958 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0408  50S ribosomal protein L10  45.61 
 
 		 174 aa  144  7.0000000000000006e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.79305e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0617  50S ribosomal protein L10  43.53 
 
 		 174 aa  143  1e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000383704 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1059  50S ribosomal protein L10  43.53 
 
 		 174 aa  141  5e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0531801  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0700  ribosomal protein L10  42.11 
 
 		 174 aa  141  5e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.299689  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0099  50S ribosomal protein L10  43.2 
 
 		 166 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000477259  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0099  50S ribosomal protein L10  43.2 
 
 		 166 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000073314  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0095  50S ribosomal protein L10  43.2 
 
 		 166 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  8.69083e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0093  50S ribosomal protein L10  43.2 
 
 		 166 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000338487  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0099  50S ribosomal protein L10  43.2 
 
 		 166 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000718586  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0110  50S ribosomal protein L10  43.2 
 
 		 166 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.02318e-62 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0120  50S ribosomal protein L10  43.2 
 
 		 166 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000126178  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0130  50S ribosomal protein L10  43.2 
 
 		 166 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000124346  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0857  50S ribosomal protein L10  40.48 
 
 		 177 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000259828  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0094  50S ribosomal protein L10  43.2 
 
 		 166 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000793252  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5206  50S ribosomal protein L10  44.74 
 
 		 166 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000252117  unclonable  5.898740000000001e-26 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0671  50S ribosomal protein L10  43.2 
 
 		 174 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0093  50S ribosomal protein L10  44.74 
 
 		 166 aa  138  3.9999999999999997e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000759135  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0692  50S ribosomal protein L10  41.52 
 
 		 172 aa  136  2e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000112903  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1927  ribosomal protein L10  43.11 
 
 		 176 aa  136  2e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0948645  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2865  50S ribosomal protein L10  41.76 
 
 		 174 aa  135  3.0000000000000003e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.161934  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0924  50S ribosomal protein L10  41.67 
 
 		 173 aa  134  5e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1337  50S ribosomal protein L10  42.86 
 
 		 174 aa  134  5e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.900212  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3337  50S ribosomal protein L10  41.67 
 
 		 173 aa  134  5e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000271161 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0100  50S ribosomal protein L10  42.01 
 
 		 166 aa  132  3e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000689021  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0213  ribosomal protein L10  37.57 
 
 		 175 aa  131  5e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.623588  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2164  50S ribosomal protein L10P  42.94 
 
 		 174 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0596262  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0096  50S ribosomal protein L10  42.11 
 
 		 166 aa  127  6e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0183  ribosomal protein L10  39.52 
 
 		 176 aa  127  1.0000000000000001e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000324199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2722  ribosomal protein L10  38.26 
 
 		 170 aa  126  1.0000000000000001e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0525449  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2724  50S ribosomal protein L10  39.6 
 
 		 166 aa  124  5e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000159716  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2410  50S ribosomal protein L10  39.6 
 
 		 166 aa  124  5e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000332682  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0838  50S ribosomal protein L10P  40.24 
 
 		 172 aa  123  1e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0707377  normal  0.0995834 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0576  50S ribosomal protein L10  38.16 
 
 		 166 aa  120  9.999999999999999e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000179203  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0562  50S ribosomal protein L10  38.16 
 
 		 166 aa  120  9.999999999999999e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000233555  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0180  50S ribosomal protein L10  38.16 
 
 		 166 aa  118  3.9999999999999996e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0693527  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1821  ribosomal protein L10  38.1 
 
 		 179 aa  118  4.9999999999999996e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0325  50S ribosomal protein L10  36.47 
 
 		 174 aa  117  6e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00522529  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1864  50S ribosomal protein L10  36.47 
 
 		 174 aa  117  6e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0922754  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_863  ribosomal protein L10  39.88 
 
 		 176 aa  117  6e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000130926  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1547  50S ribosomal protein L10  39.16 
 
 		 173 aa  117  6e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.834427 
 
 
-
 
NC_002936  DET0991  50S ribosomal protein L10  39.88 
 
 		 176 aa  116  9.999999999999999e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000204805  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3691  ribosomal protein L10  39.22 
 
 		 164 aa  116  9.999999999999999e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000101089  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1509  ribosomal protein L10  38.73 
 
 		 176 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000272992  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1145  ribosomal protein L10  37.21 
 
 		 182 aa  115  3e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000000394665  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0757  50S ribosomal protein L10  35.12 
 
 		 174 aa  115  3e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1387  50S ribosomal protein L10  37.5 
 
 		 171 aa  113  1.0000000000000001e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000123079  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1529  ribosomal protein L10  38.32 
 
 		 183 aa  113  1.0000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000554953  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1372  50S ribosomal protein L10  34.3 
 
 		 178 aa  113  2.0000000000000002e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.188772  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2074  50S ribosomal protein L10  35.12 
 
 		 172 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1634  50S ribosomal protein L10  38.01 
 
 		 174 aa  112  3e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1325  ribosomal protein L10  35.54 
 
 		 256 aa  111  4.0000000000000004e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0882  50S ribosomal protein L10  39.13 
 
 		 176 aa  110  8.000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.629984  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0479  50S ribosomal protein L10  36.78 
 
 		 179 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.488036  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0464  50S ribosomal protein L10  36.78 
 
 		 179 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0359791  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0314  ribosomal protein L10  36.31 
 
 		 175 aa  109  2.0000000000000002e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000329441  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1474  50S ribosomal protein L10  39.56 
 
 		 181 aa  109  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000103472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0270  50S ribosomal protein L10  38.1 
 
 		 174 aa  108  3e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.247547  hitchhiker  0.00145059 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2969  50S ribosomal protein L10  38.16 
 
 		 168 aa  108  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.45658 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3316  50S ribosomal protein L10  38.16 
 
 		 168 aa  108  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.354504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3453  50S ribosomal protein L10  38 
 
 		 174 aa  107  6e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0925685  normal  0.446601 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3191  50S ribosomal protein L10  37.82 
 
 		 173 aa  107  7.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.579756  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0310  50S ribosomal protein L10  38.16 
 
 		 165 aa  107  8.000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0746923  normal  0.0249908 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1043  ribosomal protein L10  36.18 
 
 		 167 aa  107  9.000000000000001e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.144449  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3036  50S ribosomal protein L10  38.16 
 
 		 168 aa  107  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0878547 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2783  50S ribosomal protein L10  36.9 
 
 		 172 aa  106  1e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00189787  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0504  50S ribosomal protein L10  36 
 
 		 180 aa  106  1e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000340487  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1784  50S ribosomal protein L10  37.93 
 
 		 181 aa  106  2e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3336  50S ribosomal protein L10  38.31 
 
 		 173 aa  105  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4318  50S ribosomal protein L10  35.15 
 
 		 187 aa  105  5e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.561909  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1302  50S ribosomal protein L10  36.18 
 
 		 166 aa  104  7e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000076628  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0040  50S ribosomal protein L10  38.06 
 
 		 179 aa  104  7e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0245031  hitchhiker  0.0000000000023806 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0317  50S ribosomal protein L10  32.35 
 
 		 173 aa  103  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0060406  hitchhiker  0.00087235 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3328  50S ribosomal protein L10  37.35 
 
 		 186 aa  103  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.211537 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2038  50S ribosomal protein L10  33.93 
 
 		 175 aa  103  1e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0258299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0567  50S ribosomal protein L10  34.87 
 
 		 167 aa  103  1e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00969269  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0710  50S ribosomal protein L10  31.95 
 
 		 176 aa  103  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.303715  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0044  50S ribosomal protein L10  37.42 
 
 		 215 aa  103  1e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000127438  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2333  50S ribosomal protein L10  36.11 
 
 		 176 aa  102  3e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.275074  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1964  50S ribosomal protein L10  31.76 
 
 		 172 aa  102  3e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.202865  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0922  50S ribosomal protein L10  33.14 
 
 		 176 aa  102  3e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00116615  hitchhiker  0.00000161737 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02311  50S ribosomal protein L10  35.37 
 
 		 175 aa  102  3e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0300  ribosomal protein L10  35.12 
 
 		 181 aa  101  4e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000817286  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0488  50S ribosomal protein L10  34.3 
 
 		 173 aa  101  5e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.169718  hitchhiker  0.00000169108 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1453  50S ribosomal protein L10  35.29 
 
 		 173 aa  101  5e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0317  50S ribosomal protein L10  34.3 
 
 		 173 aa  101  5e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.146286  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2178  ribosomal protein L10  32.74 
 
 		 175 aa  101  5e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.905696 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2154  50S ribosomal protein L10  32.93 
 
 		 175 aa  101  6e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.44563  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0632  50S ribosomal protein L10  35.81 
 
 		 175 aa  100  7e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.346234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2179  50S ribosomal protein L10  35.12 
 
 		 175 aa  100  7e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.82519  normal  0.0244994 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02201  50S ribosomal protein L10  34.76 
 
 		 175 aa  100  8e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.825352  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0355  50S ribosomal protein L10  32.94 
 
 		 172 aa  100  9e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000413063  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2554  50S ribosomal protein L10  34.5 
 
 		 181 aa  100  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0140545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0297  50S ribosomal protein L10  33.72 
 
 		 172 aa  100  1e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>