More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2722 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2722  50S ribosomal protein L10P  100 
 
 		 178 aa  350  5e-96  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000314918  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0310  ribosomal protein L10  64.94 
 
 		 176 aa  234  7e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.109625  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0857  50S ribosomal protein L10  51.16 
 
 		 177 aa  174  5e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000259828  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01070  ribosomal protein L10  50 
 
 		 172 aa  174  8e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  5.51299e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2470  50S ribosomal protein L10  52.98 
 
 		 176 aa  163  1.0000000000000001e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0147283  hitchhiker  0.00682166 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0276  50S ribosomal protein L10  46.07 
 
 		 175 aa  158  3e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000204852  hitchhiker  0.000495958 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2722  ribosomal protein L10  51.68 
 
 		 170 aa  158  3e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0525449  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1529  ribosomal protein L10  50.89 
 
 		 183 aa  158  4e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000554953  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2344  ribosomal protein L10  42.86 
 
 		 173 aa  153  1e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.032292  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5206  50S ribosomal protein L10  43.6 
 
 		 166 aa  153  1e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000252117  unclonable  5.898740000000001e-26 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0094  50S ribosomal protein L10  43.6 
 
 		 166 aa  152  2e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000793252  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1387  50S ribosomal protein L10  44 
 
 		 171 aa  152  2e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000123079  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0110  50S ribosomal protein L10  43.02 
 
 		 166 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.02318e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0130  50S ribosomal protein L10  43.02 
 
 		 166 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000124346  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0099  50S ribosomal protein L10  43.02 
 
 		 166 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000477259  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0099  50S ribosomal protein L10  43.02 
 
 		 166 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000073314  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0095  50S ribosomal protein L10  43.02 
 
 		 166 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  8.69083e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0093  50S ribosomal protein L10  43.02 
 
 		 166 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000338487  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0099  50S ribosomal protein L10  43.02 
 
 		 166 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000718586  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0120  50S ribosomal protein L10  43.02 
 
 		 166 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000126178  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0213  ribosomal protein L10  42.7 
 
 		 175 aa  150  8.999999999999999e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.623588  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0205  50S ribosomal protein L10  43.58 
 
 		 181 aa  149  1e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000665859  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0093  50S ribosomal protein L10  43.02 
 
 		 166 aa  149  2e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000759135  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0408  50S ribosomal protein L10  43.82 
 
 		 174 aa  149  2e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.79305e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1927  ribosomal protein L10  47.59 
 
 		 176 aa  149  2e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0948645  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2164  50S ribosomal protein L10P  44.97 
 
 		 174 aa  149  2e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0596262  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0100  50S ribosomal protein L10  44.77 
 
 		 166 aa  148  3e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000689021  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0096  50S ribosomal protein L10  43.53 
 
 		 166 aa  145  3e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2724  50S ribosomal protein L10  46.2 
 
 		 166 aa  144  8.000000000000001e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000159716  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2410  50S ribosomal protein L10  46.2 
 
 		 166 aa  144  8.000000000000001e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000332682  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0567  50S ribosomal protein L10  42.05 
 
 		 167 aa  144  8.000000000000001e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00969269  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0180  50S ribosomal protein L10  41.62 
 
 		 166 aa  143  1e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0693527  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0617  50S ribosomal protein L10  46.34 
 
 		 174 aa  144  1e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000383704 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1302  50S ribosomal protein L10  42.61 
 
 		 166 aa  140  7e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000076628  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1059  50S ribosomal protein L10  45.78 
 
 		 174 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0531801  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0692  50S ribosomal protein L10  41.57 
 
 		 172 aa  139  3e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000112903  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0671  50S ribosomal protein L10  43.79 
 
 		 174 aa  137  8.999999999999999e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2865  50S ribosomal protein L10  42.86 
 
 		 174 aa  136  1e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.161934  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0924  50S ribosomal protein L10  42.6 
 
 		 173 aa  136  1e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3691  ribosomal protein L10  48.3 
 
 		 164 aa  137  1e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000101089  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0183  ribosomal protein L10  39.08 
 
 		 176 aa  136  1e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000324199  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3337  50S ribosomal protein L10  42.6 
 
 		 173 aa  136  1e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000271161 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0700  ribosomal protein L10  42.11 
 
 		 174 aa  136  2e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.299689  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1337  50S ribosomal protein L10  45.18 
 
 		 174 aa  134  5e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.900212  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0562  50S ribosomal protein L10  39.31 
 
 		 166 aa  133  9.999999999999999e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000233555  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0576  50S ribosomal protein L10  39.31 
 
 		 166 aa  133  9.999999999999999e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000179203  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_863  ribosomal protein L10  40.72 
 
 		 176 aa  132  1.9999999999999998e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000130926  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0991  50S ribosomal protein L10  40.72 
 
 		 176 aa  132  3e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000204805  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0838  50S ribosomal protein L10P  44.58 
 
 		 172 aa  128  5.0000000000000004e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0707377  normal  0.0995834 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1821  ribosomal protein L10  40.99 
 
 		 179 aa  127  6e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0882  50S ribosomal protein L10  40.76 
 
 		 176 aa  126  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.629984  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1417  50S ribosomal protein L10  40.12 
 
 		 197 aa  123  1e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000013127  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1509  ribosomal protein L10  39.44 
 
 		 176 aa  122  2e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000272992  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0313  50S ribosomal protein L10  36.93 
 
 		 166 aa  122  4e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000558823  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0479  50S ribosomal protein L10  45.71 
 
 		 179 aa  121  5e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.488036  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0464  50S ribosomal protein L10  45.71 
 
 		 179 aa  121  5e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0359791  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1547  50S ribosomal protein L10  39.64 
 
 		 173 aa  119  1.9999999999999998e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.834427 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3328  50S ribosomal protein L10  37.57 
 
 		 186 aa  117  7e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.211537 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4678  50S ribosomal protein L10  40.59 
 
 		 182 aa  115  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000989378  decreased coverage  0.00291158 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1145  ribosomal protein L10  37.22 
 
 		 182 aa  116  1.9999999999999998e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000000394665  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0479  ribosomal protein L10  40.24 
 
 		 164 aa  115  3.9999999999999997e-25  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0271  50S ribosomal protein L10  39.46 
 
 		 178 aa  114  8.999999999999998e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00121092  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4318  50S ribosomal protein L10  35.47 
 
 		 187 aa  113  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.561909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1106  ribosomal protein L10  40.24 
 
 		 176 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0567771  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2223  50S ribosomal protein L10  36.97 
 
 		 174 aa  112  3e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00194446 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08440  ribosomal protein L10  40.49 
 
 		 173 aa  112  3e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.166227  normal  0.704722 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0504  50S ribosomal protein L10  36.36 
 
 		 180 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000340487  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1372  50S ribosomal protein L10  34.86 
 
 		 178 aa  111  6e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.188772  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2951  ribosomal protein L10  36.67 
 
 		 186 aa  109  2.0000000000000002e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0265827  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3036  50S ribosomal protein L10  37.87 
 
 		 168 aa  108  3e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0878547 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20980  LSU ribosomal protein L10P  38.67 
 
 		 203 aa  108  3e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.996084  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1956  ribosomal protein L10  35.96 
 
 		 174 aa  108  4.0000000000000004e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0361  50S ribosomal protein L10  35.8 
 
 		 190 aa  108  4.0000000000000004e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000502234  hitchhiker  0.0000804712 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0355  50S ribosomal protein L10  34.73 
 
 		 172 aa  107  6e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000413063  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0270  50S ribosomal protein L10  39.74 
 
 		 174 aa  107  6e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.247547  hitchhiker  0.00145059 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3316  50S ribosomal protein L10  37.75 
 
 		 168 aa  107  7.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.354504  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2969  50S ribosomal protein L10  37.75 
 
 		 168 aa  107  7.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.45658 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0140  50S ribosomal protein L10  35.39 
 
 		 174 aa  107  8.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000236563  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02410  ribosomal protein L10  37.95 
 
 		 173 aa  106  1e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.609192 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2697  50S ribosomal protein L10P  36.31 
 
 		 172 aa  107  1e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.561782  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1172  ribosomal protein L10  34.48 
 
 		 173 aa  105  2e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000357466  unclonable  0.0000000289216 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2994  50S ribosomal protein L10  37.35 
 
 		 173 aa  105  4e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1964  50S ribosomal protein L10  32.74 
 
 		 172 aa  104  5e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.202865  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0757  50S ribosomal protein L10  34.09 
 
 		 174 aa  104  5e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0310  50S ribosomal protein L10  37.21 
 
 		 165 aa  104  6e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0746923  normal  0.0249908 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1590  50S ribosomal protein L10  36.24 
 
 		 174 aa  104  7e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2361  50S ribosomal protein L10  35.57 
 
 		 174 aa  104  8e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3191  50S ribosomal protein L10  35.76 
 
 		 173 aa  104  9e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.579756  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0300  ribosomal protein L10  36.36 
 
 		 181 aa  104  9e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000817286  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2423  50S ribosomal protein L10  33.11 
 
 		 205 aa  103  1e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2273  50S ribosomal protein L10  35.57 
 
 		 174 aa  103  1e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2727  ribosomal protein L10  36.69 
 
 		 172 aa  103  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.12165  normal  0.845294 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2074  50S ribosomal protein L10  33.53 
 
 		 172 aa  103  1e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4521  ribosomal protein L10  40.69 
 
 		 200 aa  102  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0067  50S ribosomal protein L10  36.14 
 
 		 165 aa  102  2e-21  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1325  ribosomal protein L10  34.55 
 
 		 256 aa  102  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1474  50S ribosomal protein L10  37.14 
 
 		 181 aa  102  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000103472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2681  50S ribosomal protein L10  34.52 
 
 		 172 aa  102  2e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000132453  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0389  ribosomal protein L10  33.13 
 
 		 174 aa  102  3e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1453  50S ribosomal protein L10  35.33 
 
 		 173 aa  102  3e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>