More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0355 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_0355  50S ribosomal protein L10  100 
 
 		 172 aa  348  3e-95  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000413063  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2681  50S ribosomal protein L10  81.98 
 
 		 172 aa  295  2e-79  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000132453  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1964  50S ribosomal protein L10  75.58 
 
 		 172 aa  279  1e-74  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.202865  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0194  50S ribosomal protein L10  76.16 
 
 		 172 aa  276  7e-74  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000548969  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0231  50S ribosomal protein L10  76.74 
 
 		 172 aa  275  2e-73  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0103356  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0317  50S ribosomal protein L10  68.02 
 
 		 173 aa  248  4e-65  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0060406  hitchhiker  0.00087235 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0286  50S ribosomal protein L10  68.02 
 
 		 172 aa  245  2e-64  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000520195  hitchhiker  0.00386218 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0692  50S ribosomal protein L10  40.7 
 
 		 172 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000112903  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1106  ribosomal protein L10  45.16 
 
 		 176 aa  127  7.000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0567771  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1547  50S ribosomal protein L10  40.12 
 
 		 173 aa  125  2.0000000000000002e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.834427 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0183  ribosomal protein L10  36.47 
 
 		 176 aa  120  9e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000324199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0700  ribosomal protein L10  40.83 
 
 		 174 aa  120  9.999999999999999e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.299689  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2722  ribosomal protein L10  38.01 
 
 		 170 aa  119  3e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0525449  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0857  50S ribosomal protein L10  35.29 
 
 		 177 aa  118  3.9999999999999996e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000259828  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2074  50S ribosomal protein L10  38.37 
 
 		 172 aa  118  3.9999999999999996e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0310  ribosomal protein L10  41.67 
 
 		 176 aa  116  9.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.109625  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01070  ribosomal protein L10  38.95 
 
 		 172 aa  112  2.0000000000000002e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  5.51299e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0617  50S ribosomal protein L10  37.57 
 
 		 174 aa  111  5e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000383704 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2470  50S ribosomal protein L10  35.09 
 
 		 176 aa  111  5e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0147283  hitchhiker  0.00682166 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1372  50S ribosomal protein L10  35.47 
 
 		 178 aa  108  4.0000000000000004e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.188772  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1634  50S ribosomal protein L10  35.47 
 
 		 174 aa  108  5e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2722  50S ribosomal protein L10P  34.73 
 
 		 178 aa  107  6e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000314918  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2724  50S ribosomal protein L10  35.71 
 
 		 166 aa  105  3e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000159716  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2410  50S ribosomal protein L10  35.71 
 
 		 166 aa  105  3e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000332682  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2865  50S ribosomal protein L10  36.42 
 
 		 174 aa  105  4e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.161934  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0276  50S ribosomal protein L10  35.54 
 
 		 175 aa  104  6e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000204852  hitchhiker  0.000495958 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3337  50S ribosomal protein L10  36.57 
 
 		 173 aa  102  3e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000271161 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0924  50S ribosomal protein L10  36.57 
 
 		 173 aa  102  3e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2344  ribosomal protein L10  32.94 
 
 		 173 aa  100  9e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.032292  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5206  50S ribosomal protein L10  34.32 
 
 		 166 aa  100  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000252117  unclonable  5.898740000000001e-26 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0094  50S ribosomal protein L10  34.91 
 
 		 166 aa  100  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000793252  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0099  50S ribosomal protein L10  34.32 
 
 		 166 aa  99.4  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000477259  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0099  50S ribosomal protein L10  34.32 
 
 		 166 aa  99.4  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000073314  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0095  50S ribosomal protein L10  34.32 
 
 		 166 aa  99.4  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  8.69083e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0093  50S ribosomal protein L10  34.32 
 
 		 166 aa  99.4  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000338487  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0110  50S ribosomal protein L10  34.32 
 
 		 166 aa  99.4  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.02318e-62 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0120  50S ribosomal protein L10  34.32 
 
 		 166 aa  99.4  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000126178  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0099  50S ribosomal protein L10  34.32 
 
 		 166 aa  99.4  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000718586  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0093  50S ribosomal protein L10  33.73 
 
 		 166 aa  99.4  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000759135  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0130  50S ribosomal protein L10  34.32 
 
 		 166 aa  99.4  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000124346  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2783  50S ribosomal protein L10  34.68 
 
 		 172 aa  98.6  3e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00189787  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1529  ribosomal protein L10  34.91 
 
 		 183 aa  98.2  5e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000554953  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0838  50S ribosomal protein L10P  37.36 
 
 		 172 aa  97.8  6e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0707377  normal  0.0995834 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0096  50S ribosomal protein L10  31.95 
 
 		 166 aa  97.8  7e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0205  50S ribosomal protein L10  35.71 
 
 		 181 aa  97.4  9e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000665859  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0180  50S ribosomal protein L10  33.73 
 
 		 166 aa  96.3  2e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0693527  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4479  ribosomal protein L10  37.97 
 
 		 177 aa  96.3  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.028261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0270  50S ribosomal protein L10  35.88 
 
 		 174 aa  95.9  2e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.247547  hitchhiker  0.00145059 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0562  50S ribosomal protein L10  34.32 
 
 		 166 aa  96.3  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000233555  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0576  50S ribosomal protein L10  34.32 
 
 		 166 aa  96.3  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000179203  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1337  50S ribosomal protein L10  34.68 
 
 		 174 aa  95.5  3e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.900212  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0100  50S ribosomal protein L10  32.54 
 
 		 166 aa  95.5  3e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000689021  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0671  50S ribosomal protein L10  34.48 
 
 		 174 aa  95.1  4e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1453  50S ribosomal protein L10  32.16 
 
 		 173 aa  94.7  6e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0441  50S ribosomal protein L10  30.41 
 
 		 189 aa  94.4  6e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0757  50S ribosomal protein L10  31.98 
 
 		 174 aa  94.4  8e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1059  50S ribosomal protein L10  33.71 
 
 		 174 aa  93.6  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0531801  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3451  ribosomal protein L10  38.75 
 
 		 176 aa  93.2  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00335052  normal  0.0391621 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0408  50S ribosomal protein L10  31.95 
 
 		 174 aa  92.8  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.79305e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1667  50S ribosomal protein L10  36.05 
 
 		 173 aa  91.3  5e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2994  50S ribosomal protein L10  31.98 
 
 		 173 aa  90.1  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1387  50S ribosomal protein L10  31.14 
 
 		 171 aa  90.5  1e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000123079  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2164  50S ribosomal protein L10P  34.1 
 
 		 174 aa  89.7  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0596262  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4521  ribosomal protein L10  36.43 
 
 		 200 aa  87.4  9e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1927  ribosomal protein L10  31.07 
 
 		 176 aa  86.7  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0948645  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1509  ribosomal protein L10  31.03 
 
 		 176 aa  86.3  2e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000272992  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4758  50S ribosomal protein L10  34.81 
 
 		 166 aa  85.5  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00494482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20980  LSU ribosomal protein L10P  35.85 
 
 		 203 aa  85.1  4e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.996084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0226  ribosomal protein L10  33.72 
 
 		 173 aa  85.5  4e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0578  ribosomal protein L10  41.22 
 
 		 212 aa  84.7  6e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.141737  normal  0.0136421 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1821  ribosomal protein L10  32.32 
 
 		 179 aa  84.7  6e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0445  50S ribosomal protein L10  33.97 
 
 		 166 aa  84.3  7e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.470652  unclonable  0.000000241771 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0475  50S ribosomal protein L10  33.97 
 
 		 166 aa  84.3  7e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.372242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0478  50S ribosomal protein L10  36.62 
 
 		 195 aa  84.3  7e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00597987  hitchhiker  0.00527924 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03861  50S ribosomal protein L10  38.64 
 
 		 165 aa  84.3  8e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000311393  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4010  ribosomal protein L10  38.64 
 
 		 165 aa  84.3  8e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000237202  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03814  hypothetical protein  38.64 
 
 		 165 aa  84.3  8e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000360524  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4040  50S ribosomal protein L10  38.64 
 
 		 165 aa  84.3  8e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00830699  hitchhiker  0.000887574 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4525  50S ribosomal protein L10  38.64 
 
 		 165 aa  84.3  8e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000111294  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4433  50S ribosomal protein L10  38.64 
 
 		 165 aa  84.3  8e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000818528  hitchhiker  0.00000264015 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4218  50S ribosomal protein L10  38.64 
 
 		 165 aa  84.3  8e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.4618e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5450  50S ribosomal protein L10  38.64 
 
 		 165 aa  84.3  8e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000850473  hitchhiker  0.000626343 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4473  50S ribosomal protein L10  38.64 
 
 		 165 aa  84.3  8e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000239877  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2178  ribosomal protein L10  30.99 
 
 		 175 aa  83.6  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.905696 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0567  50S ribosomal protein L10  30.54 
 
 		 167 aa  82.8  0.000000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00969269  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3316  50S ribosomal protein L10  37.4 
 
 		 168 aa  82  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.354504  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2969  50S ribosomal protein L10  37.4 
 
 		 168 aa  82  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.45658 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0479  ribosomal protein L10  32.53 
 
 		 164 aa  82  0.000000000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0171  50S ribosomal protein L10  38.52 
 
 		 163 aa  82  0.000000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0111095  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0297  50S ribosomal protein L10  34.29 
 
 		 172 aa  82.4  0.000000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0618  ribosomal protein L10  39.69 
 
 		 173 aa  81.6  0.000000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0300  ribosomal protein L10  30.54 
 
 		 181 aa  81.6  0.000000000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000817286  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3171  50S ribosomal protein L10  38.78 
 
 		 167 aa  81.6  0.000000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08440  ribosomal protein L10  29.88 
 
 		 173 aa  81.6  0.000000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.166227  normal  0.704722 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2223  50S ribosomal protein L10  35.21 
 
 		 174 aa  81.6  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00194446 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0195  50S ribosomal protein L10  37.88 
 
 		 165 aa  81.3  0.000000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000187486  normal  0.229046 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0313  50S ribosomal protein L10  29.41 
 
 		 166 aa  81.3  0.000000000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000558823  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0314  ribosomal protein L10  30.18 
 
 		 175 aa  81.3  0.000000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000329441  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1145  ribosomal protein L10  33.73 
 
 		 182 aa  80.9  0.000000000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000000394665  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2697  50S ribosomal protein L10P  35.42 
 
 		 172 aa  80.5  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.561782  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>