More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2783 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_2783  50S ribosomal protein L10  100 
 
 		 172 aa  349  1e-95  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00189787  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2074  50S ribosomal protein L10  58.48 
 
 		 172 aa  204  4e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1634  50S ribosomal protein L10  57.65 
 
 		 174 aa  198  3e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1453  50S ribosomal protein L10  55.88 
 
 		 173 aa  194  4.0000000000000005e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2994  50S ribosomal protein L10  55.56 
 
 		 173 aa  193  1e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0441  50S ribosomal protein L10  56.47 
 
 		 189 aa  191  3e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0700  ribosomal protein L10  46.2 
 
 		 174 aa  154  5.0000000000000005e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.299689  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1547  50S ribosomal protein L10  45.03 
 
 		 173 aa  146  1.0000000000000001e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.834427 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0838  50S ribosomal protein L10P  42.11 
 
 		 172 aa  132  3e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0707377  normal  0.0995834 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01070  ribosomal protein L10  40.94 
 
 		 172 aa  130  9e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  5.51299e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0692  50S ribosomal protein L10  40.35 
 
 		 172 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000112903  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0617  50S ribosomal protein L10  42.44 
 
 		 174 aa  122  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000383704 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0757  50S ribosomal protein L10  38.6 
 
 		 174 aa  118  4.9999999999999996e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2865  50S ribosomal protein L10  39.53 
 
 		 174 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.161934  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0183  ribosomal protein L10  35.88 
 
 		 176 aa  116  9.999999999999999e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000324199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0408  50S ribosomal protein L10  39.41 
 
 		 174 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.79305e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2470  50S ribosomal protein L10  37.57 
 
 		 176 aa  116  1.9999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0147283  hitchhiker  0.00682166 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1059  50S ribosomal protein L10  38.37 
 
 		 174 aa  115  3e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0531801  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3337  50S ribosomal protein L10  38.37 
 
 		 173 aa  115  3e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000271161 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2722  ribosomal protein L10  39.35 
 
 		 170 aa  115  3e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0525449  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0924  50S ribosomal protein L10  38.37 
 
 		 173 aa  115  3e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0205  50S ribosomal protein L10  38.01 
 
 		 181 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000665859  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1529  ribosomal protein L10  39.05 
 
 		 183 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000554953  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0671  50S ribosomal protein L10  38.6 
 
 		 174 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0857  50S ribosomal protein L10  38.82 
 
 		 177 aa  112  3e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000259828  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0276  50S ribosomal protein L10  36.99 
 
 		 175 aa  111  6e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000204852  hitchhiker  0.000495958 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2164  50S ribosomal protein L10P  38.37 
 
 		 174 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0596262  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0310  ribosomal protein L10  38.55 
 
 		 176 aa  108  5e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.109625  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0213  ribosomal protein L10  34.32 
 
 		 175 aa  107  6e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.623588  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0231  50S ribosomal protein L10  34.88 
 
 		 172 aa  107  6e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0103356  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2344  ribosomal protein L10  36.9 
 
 		 173 aa  106  1e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.032292  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1337  50S ribosomal protein L10  37.21 
 
 		 174 aa  104  7e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.900212  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0488  50S ribosomal protein L10  35.93 
 
 		 173 aa  103  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.169718  hitchhiker  0.00000169108 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0317  50S ribosomal protein L10  35.93 
 
 		 173 aa  103  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.146286  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0745  50S ribosomal protein L10  31.18 
 
 		 171 aa  102  3e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00501407 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1964  50S ribosomal protein L10  33.53 
 
 		 172 aa  101  4e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.202865  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2361  50S ribosomal protein L10  34.5 
 
 		 174 aa  101  5e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0270  50S ribosomal protein L10  34.43 
 
 		 174 aa  101  5e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.247547  hitchhiker  0.00145059 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1590  50S ribosomal protein L10  40.88 
 
 		 174 aa  100  7e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2273  50S ribosomal protein L10  34.5 
 
 		 174 aa  100  7e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3036  50S ribosomal protein L10  37.79 
 
 		 168 aa  100  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0878547 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0286  50S ribosomal protein L10  33.91 
 
 		 172 aa  100  1e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000520195  hitchhiker  0.00386218 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2223  50S ribosomal protein L10  33.33 
 
 		 174 aa  100  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00194446 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0355  50S ribosomal protein L10  34.68 
 
 		 172 aa  98.6  3e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000413063  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3477  50S ribosomal protein L10  39.07 
 
 		 171 aa  99  3e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.232416  hitchhiker  0.0000717521 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0096  50S ribosomal protein L10  41.55 
 
 		 166 aa  98.6  4e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0194  50S ribosomal protein L10  30.81 
 
 		 172 aa  98.2  5e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000548969  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0232  50S ribosomal protein L10  30.41 
 
 		 172 aa  97.4  8e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0685965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2724  50S ribosomal protein L10  35.29 
 
 		 166 aa  97.1  1e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000159716  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2410  50S ribosomal protein L10  35.29 
 
 		 166 aa  97.1  1e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000332682  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3691  ribosomal protein L10  37.33 
 
 		 164 aa  96.7  1e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000101089  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0100  50S ribosomal protein L10  37.76 
 
 		 166 aa  97.1  1e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000689021  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4018  ribosomal protein L10  34.23 
 
 		 174 aa  95.9  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.491975 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0099  50S ribosomal protein L10  40.74 
 
 		 166 aa  96.3  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000477259  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0099  50S ribosomal protein L10  40.74 
 
 		 166 aa  96.3  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000073314  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0095  50S ribosomal protein L10  40.74 
 
 		 166 aa  96.3  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  8.69083e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0093  50S ribosomal protein L10  40.74 
 
 		 166 aa  96.3  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000338487  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3347  50S ribosomal protein L10  39.58 
 
 		 167 aa  96.3  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.862427  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3191  50S ribosomal protein L10  35.95 
 
 		 173 aa  96.3  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.579756  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0099  50S ribosomal protein L10  40.74 
 
 		 166 aa  96.3  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000718586  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5206  50S ribosomal protein L10  40.74 
 
 		 166 aa  96.7  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000252117  unclonable  5.898740000000001e-26 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0130  50S ribosomal protein L10  40.74 
 
 		 166 aa  96.3  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000124346  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0120  50S ribosomal protein L10  40.74 
 
 		 166 aa  96.3  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000126178  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0110  50S ribosomal protein L10  40.74 
 
 		 166 aa  96.3  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.02318e-62 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2722  50S ribosomal protein L10P  33.13 
 
 		 178 aa  96.3  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000314918  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0094  50S ribosomal protein L10  37.06 
 
 		 166 aa  96.7  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000793252  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2681  50S ribosomal protein L10  32.95 
 
 		 172 aa  95.5  3e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000132453  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0310  50S ribosomal protein L10  35.95 
 
 		 165 aa  95.5  3e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0746923  normal  0.0249908 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2850  50S ribosomal protein L10  33.72 
 
 		 165 aa  95.9  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.675463 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3437  50S ribosomal protein L10  34.3 
 
 		 165 aa  95.9  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1954  50S ribosomal protein L10  42.36 
 
 		 174 aa  95.5  3e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.262202  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4521  ribosomal protein L10  36.47 
 
 		 200 aa  95.1  4e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0314  ribosomal protein L10  33.33 
 
 		 175 aa  95.1  5e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000329441  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3316  50S ribosomal protein L10  38.26 
 
 		 168 aa  94.7  6e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.354504  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2969  50S ribosomal protein L10  38.26 
 
 		 168 aa  94.7  6e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.45658 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2769  50S ribosomal protein L10  32.56 
 
 		 165 aa  94.7  6e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0317  50S ribosomal protein L10  32.56 
 
 		 165 aa  94.7  6e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00438278  normal  0.203557 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0338  50S ribosomal protein L10  32.56 
 
 		 165 aa  94.7  6e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.550948  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2697  50S ribosomal protein L10P  33.33 
 
 		 172 aa  94.4  7e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.561782  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0093  50S ribosomal protein L10  36.36 
 
 		 166 aa  94  9e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000759135  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0789  50S ribosomal protein L10  38.19 
 
 		 172 aa  94  9e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.305137 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1064  50S ribosomal protein L10  37.93 
 
 		 175 aa  93.6  1e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0220515  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3336  50S ribosomal protein L10  35.29 
 
 		 173 aa  94  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1927  ribosomal protein L10  34.71 
 
 		 176 aa  93.6  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0948645  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0317  50S ribosomal protein L10  30.64 
 
 		 173 aa  92.8  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0060406  hitchhiker  0.00087235 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1821  ribosomal protein L10  34.1 
 
 		 179 aa  92.4  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5088  50S ribosomal protein L10  33.33 
 
 		 166 aa  92.4  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000128873  normal  0.821712 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4318  50S ribosomal protein L10  32.73 
 
 		 187 aa  92  4e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.561909  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0385  50S ribosomal protein L10  32.94 
 
 		 177 aa  91.7  4e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0360  50S ribosomal protein L10  32.94 
 
 		 177 aa  91.7  4e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1387  50S ribosomal protein L10  36.81 
 
 		 171 aa  91.7  4e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000123079  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2423  50S ribosomal protein L10  34.19 
 
 		 205 aa  91.7  5e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06150  50S ribosomal protein L10  33.53 
 
 		 166 aa  91.7  5e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0180  50S ribosomal protein L10  33.57 
 
 		 166 aa  90.9  7e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0693527  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0562  50S ribosomal protein L10  33.57 
 
 		 166 aa  90.9  8e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000233555  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0576  50S ribosomal protein L10  33.57 
 
 		 166 aa  90.9  8e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000179203  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0396  50S ribosomal protein L10  36.81 
 
 		 173 aa  90.1  1e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.252363  hitchhiker  0.00709296 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0922  50S ribosomal protein L10  33.53 
 
 		 176 aa  90.5  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00116615  hitchhiker  0.00000161737 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0304  50S ribosomal protein L10  36.24 
 
 		 167 aa  89.4  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.125975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0297  50S ribosomal protein L10  36.47 
 
 		 172 aa  89.4  2e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>