More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0317 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0317  50S ribosomal protein L10  100 
 
 		 173 aa  345  2e-94  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0060406  hitchhiker  0.00087235 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0286  50S ribosomal protein L10  77.91 
 
 		 172 aa  273  6e-73  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000520195  hitchhiker  0.00386218 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0231  50S ribosomal protein L10  73.26 
 
 		 172 aa  263  8e-70  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0103356  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1964  50S ribosomal protein L10  71.51 
 
 		 172 aa  258  3e-68  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.202865  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0194  50S ribosomal protein L10  72.09 
 
 		 172 aa  255  2e-67  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000548969  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0355  50S ribosomal protein L10  68.02 
 
 		 172 aa  248  4e-65  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000413063  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2681  50S ribosomal protein L10  66.28 
 
 		 172 aa  244  4e-64  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000132453  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0183  ribosomal protein L10  37.43 
 
 		 176 aa  119  1.9999999999999998e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000324199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0692  50S ribosomal protein L10  33.72 
 
 		 172 aa  117  6e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000112903  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1547  50S ribosomal protein L10  36.42 
 
 		 173 aa  115  1.9999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.834427 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2722  ribosomal protein L10  35.84 
 
 		 170 aa  115  3.9999999999999997e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0525449  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0310  ribosomal protein L10  37.65 
 
 		 176 aa  113  1.0000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.109625  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2074  50S ribosomal protein L10  34.88 
 
 		 172 aa  113  1.0000000000000001e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1106  ribosomal protein L10  38.71 
 
 		 176 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0567771  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0700  ribosomal protein L10  33.33 
 
 		 174 aa  111  6e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.299689  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0617  50S ribosomal protein L10  34.1 
 
 		 174 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000383704 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0857  50S ribosomal protein L10  32.94 
 
 		 177 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000259828  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2865  50S ribosomal protein L10  32.37 
 
 		 174 aa  106  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.161934  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01070  ribosomal protein L10  35.2 
 
 		 172 aa  105  4e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  5.51299e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3337  50S ribosomal protein L10  33.71 
 
 		 173 aa  103  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000271161 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0924  50S ribosomal protein L10  33.71 
 
 		 173 aa  103  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1634  50S ribosomal protein L10  31.79 
 
 		 174 aa  103  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2344  ribosomal protein L10  32.35 
 
 		 173 aa  103  1e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.032292  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2724  50S ribosomal protein L10  35.06 
 
 		 166 aa  102  3e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000159716  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2410  50S ribosomal protein L10  35.06 
 
 		 166 aa  102  3e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000332682  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1372  50S ribosomal protein L10  31.98 
 
 		 178 aa  101  6e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.188772  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2722  50S ribosomal protein L10P  34.12 
 
 		 178 aa  101  6e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000314918  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0671  50S ribosomal protein L10  32.57 
 
 		 174 aa  99.8  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0276  50S ribosomal protein L10  33.73 
 
 		 175 aa  99  3e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000204852  hitchhiker  0.000495958 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2164  50S ribosomal protein L10P  35.84 
 
 		 174 aa  99  3e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0596262  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1337  50S ribosomal protein L10  32.37 
 
 		 174 aa  98.6  4e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.900212  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1059  50S ribosomal protein L10  31.79 
 
 		 174 aa  98.2  6e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0531801  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0838  50S ribosomal protein L10P  34.88 
 
 		 172 aa  97.8  6e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0707377  normal  0.0995834 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2223  50S ribosomal protein L10  33.33 
 
 		 174 aa  95.5  3e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00194446 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0100  50S ribosomal protein L10  32.94 
 
 		 166 aa  94.7  6e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000689021  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2783  50S ribosomal protein L10  30.64 
 
 		 172 aa  92.8  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00189787  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0096  50S ribosomal protein L10  32.68 
 
 		 166 aa  92.4  3e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0180  50S ribosomal protein L10  30 
 
 		 166 aa  90.1  1e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0693527  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2361  50S ribosomal protein L10  31.1 
 
 		 174 aa  90.1  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0093  50S ribosomal protein L10  30.59 
 
 		 166 aa  90.5  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000759135  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2273  50S ribosomal protein L10  31.03 
 
 		 174 aa  89.4  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0094  50S ribosomal protein L10  30.59 
 
 		 166 aa  90.1  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000793252  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5206  50S ribosomal protein L10  30 
 
 		 166 aa  90.1  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000252117  unclonable  5.898740000000001e-26 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0130  50S ribosomal protein L10  30 
 
 		 166 aa  89  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000124346  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0099  50S ribosomal protein L10  30 
 
 		 166 aa  89  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000477259  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0120  50S ribosomal protein L10  30 
 
 		 166 aa  89  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000126178  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0099  50S ribosomal protein L10  30 
 
 		 166 aa  89  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000073314  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0095  50S ribosomal protein L10  30 
 
 		 166 aa  89  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  8.69083e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0093  50S ribosomal protein L10  30 
 
 		 166 aa  89  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000338487  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0110  50S ribosomal protein L10  30 
 
 		 166 aa  89  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.02318e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0099  50S ribosomal protein L10  30 
 
 		 166 aa  89  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000718586  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0270  50S ribosomal protein L10  31.36 
 
 		 174 aa  89  3e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.247547  hitchhiker  0.00145059 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2470  50S ribosomal protein L10  29.82 
 
 		 176 aa  88.6  4e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0147283  hitchhiker  0.00682166 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0479  ribosomal protein L10  38.85 
 
 		 164 aa  88.6  4e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1529  ribosomal protein L10  32.94 
 
 		 183 aa  87.8  6e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000554953  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1590  50S ribosomal protein L10  30.49 
 
 		 174 aa  87.8  6e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0441  50S ribosomal protein L10  27.22 
 
 		 189 aa  87.4  8e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1667  50S ribosomal protein L10  32.37 
 
 		 173 aa  87  1e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl602  50S ribosomal protein L10  32.89 
 
 		 166 aa  86.7  2e-16  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2697  50S ribosomal protein L10P  30.23 
 
 		 172 aa  86.3  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.561782  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0300  ribosomal protein L10  30.18 
 
 		 181 aa  85.5  3e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000817286  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2994  50S ribosomal protein L10  28.74 
 
 		 173 aa  85.1  4e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1821  ribosomal protein L10  30.64 
 
 		 179 aa  85.1  4e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0226  ribosomal protein L10  32.57 
 
 		 173 aa  85.1  4e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0562  50S ribosomal protein L10  28.24 
 
 		 166 aa  85.1  4e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000233555  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0576  50S ribosomal protein L10  28.24 
 
 		 166 aa  85.1  4e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000179203  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0205  50S ribosomal protein L10  32.16 
 
 		 181 aa  82.8  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000665859  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1453  50S ribosomal protein L10  26.9 
 
 		 173 aa  82.8  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4479  ribosomal protein L10  35.85 
 
 		 177 aa  82.8  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.028261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0313  50S ribosomal protein L10  30.92 
 
 		 166 aa  81.6  0.000000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000558823  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0179  50S ribosomal protein L10  34.18 
 
 		 161 aa  82  0.000000000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.215322  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0757  50S ribosomal protein L10  27.06 
 
 		 174 aa  81.6  0.000000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1387  50S ribosomal protein L10  29.61 
 
 		 171 aa  81.6  0.000000000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000123079  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0408  50S ribosomal protein L10  32.81 
 
 		 174 aa  80.9  0.000000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.79305e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2951  ribosomal protein L10  35.66 
 
 		 186 aa  79.7  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0265827  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4018  ribosomal protein L10  34.81 
 
 		 174 aa  79.7  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.491975 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08440  ribosomal protein L10  27.78 
 
 		 173 aa  79.3  0.00000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.166227  normal  0.704722 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0922  50S ribosomal protein L10  27.75 
 
 		 176 aa  79  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00116615  hitchhiker  0.00000161737 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1318  50S ribosomal protein L10  33.54 
 
 		 161 aa  79  0.00000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000548659  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0567  50S ribosomal protein L10  30.77 
 
 		 167 aa  78.6  0.00000000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00969269  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3451  ribosomal protein L10  35.8 
 
 		 176 aa  78.2  0.00000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00335052  normal  0.0391621 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0172  50S ribosomal protein L10  33.54 
 
 		 161 aa  77.4  0.00000000000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.33126  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1302  50S ribosomal protein L10  30.92 
 
 		 166 aa  77  0.0000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000076628  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1018  ribosomal protein L10  30.38 
 
 		 202 aa  76.6  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0067  50S ribosomal protein L10  32.24 
 
 		 165 aa  77  0.0000000000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0488  50S ribosomal protein L10  29.82 
 
 		 173 aa  76.3  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.169718  hitchhiker  0.00000169108 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1889  50S ribosomal protein L10  27.81 
 
 		 175 aa  76.6  0.0000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00905403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0317  50S ribosomal protein L10  29.82 
 
 		 173 aa  76.3  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.146286  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4678  50S ribosomal protein L10  31.79 
 
 		 182 aa  76.3  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000989378  decreased coverage  0.00291158 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20980  LSU ribosomal protein L10P  30.52 
 
 		 203 aa  75.5  0.0000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.996084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3453  50S ribosomal protein L10  29.38 
 
 		 174 aa  75.1  0.0000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0925685  normal  0.446601 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0447  50S ribosomal protein L10  29.3 
 
 		 159 aa  75.1  0.0000000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000981328  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1762  50S ribosomal protein L10  26.06 
 
 		 189 aa  75.1  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.232126  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1738  50S ribosomal protein L10  26.06 
 
 		 189 aa  75.1  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1064  50S ribosomal protein L10  29.45 
 
 		 175 aa  74.7  0.0000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0220515  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0271  50S ribosomal protein L10  29.03 
 
 		 178 aa  74.7  0.0000000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00121092  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1474  50S ribosomal protein L10  31.84 
 
 		 181 aa  74.3  0.0000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000103472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2179  50S ribosomal protein L10  27.22 
 
 		 175 aa  74.3  0.0000000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.82519  normal  0.0244994 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0464  50S ribosomal protein L10  27.22 
 
 		 179 aa  73.6  0.000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0359791  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0479  50S ribosomal protein L10  27.22 
 
 		 179 aa  73.6  0.000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.488036  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>