More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_0488 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_0317  50S ribosomal protein L10  100 
 
 		 173 aa  340  4e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.146286  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0488  50S ribosomal protein L10  100 
 
 		 173 aa  340  4e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.169718  hitchhiker  0.00000169108 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0270  50S ribosomal protein L10  56.07 
 
 		 174 aa  189  1e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.247547  hitchhiker  0.00145059 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0757  50S ribosomal protein L10  53.22 
 
 		 174 aa  186  2e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0838  50S ribosomal protein L10P  48.54 
 
 		 172 aa  160  6e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0707377  normal  0.0995834 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0396  50S ribosomal protein L10  52.08 
 
 		 173 aa  153  1e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.252363  hitchhiker  0.00709296 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3036  50S ribosomal protein L10  49.67 
 
 		 168 aa  151  2.9999999999999998e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0878547 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3336  50S ribosomal protein L10  47.71 
 
 		 173 aa  150  8e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3316  50S ribosomal protein L10  47.8 
 
 		 168 aa  150  1e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.354504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0310  50S ribosomal protein L10  49.35 
 
 		 165 aa  150  1e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0746923  normal  0.0249908 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2969  50S ribosomal protein L10  47.8 
 
 		 168 aa  150  1e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.45658 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0314  ribosomal protein L10  44.83 
 
 		 175 aa  149  2e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000329441  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3191  50S ribosomal protein L10  45.91 
 
 		 173 aa  149  3e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.579756  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3347  50S ribosomal protein L10  48.98 
 
 		 167 aa  147  7e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.862427  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0317  50S ribosomal protein L10  47.06 
 
 		 165 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00438278  normal  0.203557 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2850  50S ribosomal protein L10  47.06 
 
 		 165 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.675463 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2769  50S ribosomal protein L10  47.06 
 
 		 165 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0338  50S ribosomal protein L10  47.06 
 
 		 165 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.550948  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3437  50S ribosomal protein L10  45.75 
 
 		 165 aa  143  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2178  ribosomal protein L10  46.63 
 
 		 175 aa  140  6e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.905696 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3453  50S ribosomal protein L10  43.93 
 
 		 174 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0925685  normal  0.446601 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0385  50S ribosomal protein L10  43.93 
 
 		 177 aa  138  4.999999999999999e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0360  50S ribosomal protein L10  43.93 
 
 		 177 aa  138  4.999999999999999e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0586  50S ribosomal protein L10  43.93 
 
 		 177 aa  137  8.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0596  50S ribosomal protein L10  42.94 
 
 		 172 aa  136  1e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0140503  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3078  50S ribosomal protein L10  49.62 
 
 		 165 aa  135  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.892062  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0239  50S ribosomal protein L10  49.62 
 
 		 165 aa  136  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0229066 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3756  50S ribosomal protein L10  49.62 
 
 		 184 aa  134  4e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0407684  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3467  50S ribosomal protein L10  49.62 
 
 		 184 aa  134  4e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0108818  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3818  50S ribosomal protein L10  49.62 
 
 		 184 aa  134  5e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.881367  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2643  50S ribosomal protein L10  49.62 
 
 		 165 aa  134  5e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3788  50S ribosomal protein L10  49.62 
 
 		 165 aa  134  5e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.166109  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1912  50S ribosomal protein L10  49.62 
 
 		 165 aa  134  5e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000184172  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3654  50S ribosomal protein L10  48.85 
 
 		 167 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0512272  hitchhiker  0.000000643388 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0304  50S ribosomal protein L10  48.85 
 
 		 167 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.125975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0044  50S ribosomal protein L10  43.51 
 
 		 215 aa  133  9.999999999999999e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000127438  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2333  50S ribosomal protein L10  44.25 
 
 		 175 aa  133  9.999999999999999e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00442702  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3594  50S ribosomal protein L10  42.77 
 
 		 178 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.196569  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0867  50S ribosomal protein L10  43.82 
 
 		 175 aa  132  1.9999999999999998e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0266  50S ribosomal protein L10  48.09 
 
 		 165 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.646007  normal  0.635943 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0040  50S ribosomal protein L10  43.51 
 
 		 179 aa  132  1.9999999999999998e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0245031  hitchhiker  0.0000000000023806 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0700  ribosomal protein L10  43.02 
 
 		 174 aa  133  1.9999999999999998e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.299689  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0922  50S ribosomal protein L10  42.44 
 
 		 176 aa  132  3e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00116615  hitchhiker  0.00000161737 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2333  50S ribosomal protein L10  45.51 
 
 		 176 aa  132  3e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.275074  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0257  50S ribosomal protein L10  48.09 
 
 		 188 aa  132  3e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0591157  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3180  50S ribosomal protein L10  49.22 
 
 		 140 aa  131  5e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000385503  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1064  50S ribosomal protein L10  44.83 
 
 		 175 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0220515  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0924  50S ribosomal protein L10  43.2 
 
 		 173 aa  129  3e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3337  50S ribosomal protein L10  43.2 
 
 		 173 aa  129  3e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000271161 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0508  50S ribosomal protein L10  44.9 
 
 		 175 aa  127  9.000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.270625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0449  50S ribosomal protein L10  42.7 
 
 		 175 aa  127  1.0000000000000001e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3248  50S ribosomal protein L10  44.9 
 
 		 168 aa  125  2.0000000000000002e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4533  50S ribosomal protein L10  44.9 
 
 		 168 aa  126  2.0000000000000002e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3899  50S ribosomal protein L10  44.9 
 
 		 168 aa  125  2.0000000000000002e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0671  50S ribosomal protein L10  42.86 
 
 		 174 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1059  50S ribosomal protein L10  44.17 
 
 		 174 aa  125  3e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0531801  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0325  50S ribosomal protein L10  40.23 
 
 		 174 aa  125  4.0000000000000003e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00522529  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1864  50S ribosomal protein L10  40.23 
 
 		 174 aa  125  4.0000000000000003e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0922754  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0710  50S ribosomal protein L10  40.7 
 
 		 176 aa  125  4.0000000000000003e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.303715  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0692  50S ribosomal protein L10  42.42 
 
 		 172 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000112903  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3869  50S ribosomal protein L10  41.52 
 
 		 182 aa  123  1e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2179  50S ribosomal protein L10  42.13 
 
 		 175 aa  121  5e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.82519  normal  0.0244994 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2038  50S ribosomal protein L10  43.26 
 
 		 175 aa  120  8e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0258299  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2865  50S ribosomal protein L10  43.37 
 
 		 174 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.161934  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2262  50S ribosomal protein L10  43.54 
 
 		 174 aa  120  9.999999999999999e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.168271  normal  0.476107 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1889  50S ribosomal protein L10  41.57 
 
 		 175 aa  119  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00905403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4444  50S ribosomal protein L10  42.86 
 
 		 176 aa  119  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.651473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0617  50S ribosomal protein L10  43.71 
 
 		 174 aa  119  3e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000383704 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0204  50S ribosomal protein L10  40.7 
 
 		 166 aa  117  6e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000122994  hitchhiker  0.000100039 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0276  50S ribosomal protein L10  39.29 
 
 		 175 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000204852  hitchhiker  0.000495958 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3642  50S ribosomal protein L10  40.12 
 
 		 183 aa  117  9.999999999999999e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.279713 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01070  ribosomal protein L10  41.57 
 
 		 172 aa  117  9.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  5.51299e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0310  ribosomal protein L10  40.83 
 
 		 176 aa  117  9.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.109625  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0175  50S ribosomal protein L10  40.8 
 
 		 165 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000220587  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0408  50S ribosomal protein L10  42 
 
 		 174 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.79305e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0445  50S ribosomal protein L10  39.08 
 
 		 166 aa  115  3e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.470652  unclonable  0.000000241771 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0475  50S ribosomal protein L10  39.08 
 
 		 166 aa  115  3e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.372242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3918  50S ribosomal protein L10  39.08 
 
 		 166 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4758  50S ribosomal protein L10  39.08 
 
 		 166 aa  114  6e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00494482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1547  50S ribosomal protein L10  42.51 
 
 		 173 aa  114  7.999999999999999e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.834427 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0183  ribosomal protein L10  37.35 
 
 		 176 aa  113  1.0000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000324199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4326  50S ribosomal protein L10  38.95 
 
 		 166 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000437071  unclonable  0.0000000000820773 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3862  50S ribosomal protein L10  40.23 
 
 		 165 aa  113  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000104786  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2808  50S ribosomal protein L10  40.23 
 
 		 165 aa  113  1.0000000000000001e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000036942  normal  0.222423 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0337  50S ribosomal protein L10  40.23 
 
 		 165 aa  113  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.239078  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1529  ribosomal protein L10  37.13 
 
 		 183 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000554953  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4699  50S ribosomal protein L10  40.7 
 
 		 166 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000246782  hitchhiker  0.00000548606 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0149  50S ribosomal protein L10  39.08 
 
 		 165 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000191294  normal  0.034689 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0161  50S ribosomal protein L10  40.7 
 
 		 166 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000494732  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1337  50S ribosomal protein L10  39.18 
 
 		 174 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.900212  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2722  ribosomal protein L10  39.49 
 
 		 170 aa  112  3e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0525449  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0232  50S ribosomal protein L10  38.79 
 
 		 172 aa  112  3e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0685965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0205  50S ribosomal protein L10  39.88 
 
 		 181 aa  112  3e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000665859  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0478  50S ribosomal protein L10  38.51 
 
 		 195 aa  112  3e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00597987  hitchhiker  0.00527924 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3448  ribosomal protein L10  38.37 
 
 		 167 aa  111  4.0000000000000004e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00000199113  hitchhiker  0.00604494 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0222  50S ribosomal protein L10  39.53 
 
 		 166 aa  111  5e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0190  50S ribosomal protein L10  39.53 
 
 		 166 aa  111  5e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000262315  hitchhiker  0.00315877 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0185  50S ribosomal protein L10  39.53 
 
 		 166 aa  111  5e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000592329  normal  0.0118628 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0190  50S ribosomal protein L10  39.53 
 
 		 166 aa  111  5e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000177262  hitchhiker  0.000758972 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0139  50S ribosomal protein L10  40.7 
 
 		 166 aa  111  6e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000054937  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>