More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A0304 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_3654  50S ribosomal protein L10  100 
 
 		 167 aa  329  1e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0512272  hitchhiker  0.000000643388 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0304  50S ribosomal protein L10  100 
 
 		 167 aa  329  1e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.125975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2850  50S ribosomal protein L10  96.93 
 
 		 165 aa  316  1e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.675463 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0317  50S ribosomal protein L10  92.02 
 
 		 165 aa  304  5.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00438278  normal  0.203557 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2769  50S ribosomal protein L10  92.02 
 
 		 165 aa  304  5.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0338  50S ribosomal protein L10  92.02 
 
 		 165 aa  304  5.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.550948  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3437  50S ribosomal protein L10  91.41 
 
 		 165 aa  302  1.0000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153429  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3036  50S ribosomal protein L10  83.23 
 
 		 168 aa  276  8e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0878547 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3078  50S ribosomal protein L10  93.25 
 
 		 165 aa  276  1e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.892062  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0239  50S ribosomal protein L10  92.64 
 
 		 165 aa  274  3e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0229066 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2643  50S ribosomal protein L10  92.64 
 
 		 165 aa  274  4e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3788  50S ribosomal protein L10  92.64 
 
 		 165 aa  274  4e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.166109  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1912  50S ribosomal protein L10  92.64 
 
 		 165 aa  274  4e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000184172  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0266  50S ribosomal protein L10  92.02 
 
 		 165 aa  274  5e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.646007  normal  0.635943 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3467  50S ribosomal protein L10  92.02 
 
 		 184 aa  273  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0108818  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3756  50S ribosomal protein L10  92.02 
 
 		 184 aa  273  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0407684  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3818  50S ribosomal protein L10  92.02 
 
 		 184 aa  272  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.881367  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0257  50S ribosomal protein L10  91.41 
 
 		 188 aa  270  9e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0591157  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3180  50S ribosomal protein L10  92.03 
 
 		 140 aa  259  1e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000385503  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3191  50S ribosomal protein L10  80 
 
 		 173 aa  259  1e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.579756  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3316  50S ribosomal protein L10  79.04 
 
 		 168 aa  258  3e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.354504  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2969  50S ribosomal protein L10  79.04 
 
 		 168 aa  258  3e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.45658 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3336  50S ribosomal protein L10  78.43 
 
 		 173 aa  247  6e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0310  50S ribosomal protein L10  72.46 
 
 		 165 aa  234  3e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0746923  normal  0.0249908 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3347  50S ribosomal protein L10  74.15 
 
 		 167 aa  219  9.999999999999999e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.862427  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0040  50S ribosomal protein L10  69.93 
 
 		 179 aa  211  4.9999999999999996e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0245031  hitchhiker  0.0000000000023806 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0044  50S ribosomal protein L10  69.28 
 
 		 215 aa  210  7e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000127438  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0270  50S ribosomal protein L10  62.79 
 
 		 174 aa  209  2e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.247547  hitchhiker  0.00145059 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3453  50S ribosomal protein L10  66.05 
 
 		 174 aa  208  3e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0925685  normal  0.446601 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0757  50S ribosomal protein L10  60.13 
 
 		 174 aa  194  6e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0586  50S ribosomal protein L10  62.35 
 
 		 177 aa  192  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3869  50S ribosomal protein L10  66.88 
 
 		 182 aa  192  3e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3594  50S ribosomal protein L10  60.62 
 
 		 178 aa  182  1.0000000000000001e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.196569  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4533  50S ribosomal protein L10  60.12 
 
 		 168 aa  182  2.0000000000000003e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0508  50S ribosomal protein L10  60.25 
 
 		 175 aa  180  6e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.270625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3642  50S ribosomal protein L10  60 
 
 		 183 aa  180  7e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.279713 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3899  50S ribosomal protein L10  59.52 
 
 		 168 aa  180  8.000000000000001e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3248  50S ribosomal protein L10  59.52 
 
 		 168 aa  180  8.000000000000001e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4444  50S ribosomal protein L10  59.26 
 
 		 176 aa  179  2e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.651473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2262  50S ribosomal protein L10  60.98 
 
 		 174 aa  177  5.999999999999999e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.168271  normal  0.476107 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0396  50S ribosomal protein L10  60 
 
 		 173 aa  159  2e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.252363  hitchhiker  0.00709296 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0286  ribosomal protein L10  50.61 
 
 		 166 aa  154  6e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0147275  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0488  50S ribosomal protein L10  46.41 
 
 		 173 aa  144  8.000000000000001e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.169718  hitchhiker  0.00000169108 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0317  50S ribosomal protein L10  46.41 
 
 		 173 aa  144  8.000000000000001e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.146286  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0385  50S ribosomal protein L10  43.68 
 
 		 177 aa  136  1e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0360  50S ribosomal protein L10  43.68 
 
 		 177 aa  136  1e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0314  ribosomal protein L10  46.75 
 
 		 175 aa  134  6.0000000000000005e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000329441  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0867  50S ribosomal protein L10  48.34 
 
 		 175 aa  134  6.0000000000000005e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0747  50S ribosomal protein L10  45.4 
 
 		 178 aa  133  9.999999999999999e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0329012  normal  0.965103 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04532  50S ribosomal protein L10  44.79 
 
 		 177 aa  133  9.999999999999999e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.165522  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5206  50S ribosomal protein L10  45.86 
 
 		 166 aa  130  6e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000252117  unclonable  5.898740000000001e-26 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4285  ribosomal protein L10  43.29 
 
 		 166 aa  131  6e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000716484  hitchhiker  0.000000472968 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0838  50S ribosomal protein L10P  42.86 
 
 		 172 aa  130  6.999999999999999e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0707377  normal  0.0995834 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2333  50S ribosomal protein L10  49.03 
 
 		 175 aa  130  9e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00442702  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0093  50S ribosomal protein L10  45.86 
 
 		 166 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000759135  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0099  50S ribosomal protein L10  45.22 
 
 		 166 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000477259  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0099  50S ribosomal protein L10  45.22 
 
 		 166 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000073314  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0095  50S ribosomal protein L10  45.22 
 
 		 166 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  8.69083e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0130  50S ribosomal protein L10  45.22 
 
 		 166 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000124346  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0093  50S ribosomal protein L10  45.22 
 
 		 166 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000338487  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0099  50S ribosomal protein L10  45.22 
 
 		 166 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000718586  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0120  50S ribosomal protein L10  45.22 
 
 		 166 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000126178  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0094  50S ribosomal protein L10  45.22 
 
 		 166 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000793252  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2333  50S ribosomal protein L10  50.65 
 
 		 176 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.275074  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0110  50S ribosomal protein L10  45.22 
 
 		 166 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.02318e-62 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0222  50S ribosomal protein L10  45.4 
 
 		 166 aa  128  4.0000000000000003e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0596  50S ribosomal protein L10  44.19 
 
 		 172 aa  128  4.0000000000000003e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0140503  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0190  50S ribosomal protein L10  45.4 
 
 		 166 aa  128  4.0000000000000003e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000262315  hitchhiker  0.00315877 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0185  50S ribosomal protein L10  45.4 
 
 		 166 aa  128  4.0000000000000003e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000592329  normal  0.0118628 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0190  50S ribosomal protein L10  45.4 
 
 		 166 aa  128  4.0000000000000003e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000177262  hitchhiker  0.000758972 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0412  50S ribosomal protein L10P  43.64 
 
 		 167 aa  128  5.0000000000000004e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.33563  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4065  50S ribosomal protein L10  45.4 
 
 		 166 aa  127  6e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000275908  hitchhiker  0.00991378 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0187  50S ribosomal protein L10  45.4 
 
 		 166 aa  127  6e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000330294  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3768  50S ribosomal protein L10  45.4 
 
 		 166 aa  127  6e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000062266  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0191  50S ribosomal protein L10  45.4 
 
 		 166 aa  127  6e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000192331  hitchhiker  0.000568378 
 
 
-
 
NC_009037  Sbal_4473  50S ribosomal protein L10  45.4 
 
 		 166 aa  127  6e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0139  50S ribosomal protein L10  44.79 
 
 		 166 aa  127  7.000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000054937  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0408  50S ribosomal protein L10  47.71 
 
 		 174 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.79305e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5088  50S ribosomal protein L10  42.59 
 
 		 166 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000128873  normal  0.821712 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002171  LSU ribosomal protein L10p (P0)  42.94 
 
 		 164 aa  125  2.0000000000000002e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000109594  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0149  50S ribosomal protein L10  42.33 
 
 		 165 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000191294  normal  0.034689 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0700  ribosomal protein L10  43.27 
 
 		 174 aa  125  3e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.299689  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2178  ribosomal protein L10  44.16 
 
 		 175 aa  125  3e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.905696 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0204  50S ribosomal protein L10  44.17 
 
 		 166 aa  124  5e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000122994  hitchhiker  0.000100039 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0096  50S ribosomal protein L10  43.95 
 
 		 166 aa  124  8.000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0161  50S ribosomal protein L10  43.56 
 
 		 166 aa  123  9e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000494732  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4326  50S ribosomal protein L10  42.33 
 
 		 166 aa  123  1e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000437071  unclonable  0.0000000000820773 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4771  50S ribosomal protein L10  41.21 
 
 		 164 aa  123  1e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.709091  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1064  50S ribosomal protein L10  50.39 
 
 		 175 aa  122  2e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0220515  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3691  ribosomal protein L10  44.52 
 
 		 164 aa  122  2e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000101089  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0275  50S ribosomal protein L10  41.72 
 
 		 165 aa  122  2e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000206065  normal  0.0858323 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06150  50S ribosomal protein L10  41.72 
 
 		 166 aa  122  3e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0171  50S ribosomal protein L10  43.56 
 
 		 163 aa  122  3e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0111095  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2108  50S ribosomal protein L10  43.48 
 
 		 175 aa  121  4e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000349119  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2868  50S ribosomal protein L10  41.57 
 
 		 164 aa  121  5e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000140329  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4699  50S ribosomal protein L10  41.72 
 
 		 166 aa  120  6e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000246782  hitchhiker  0.00000548606 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3448  ribosomal protein L10  42.6 
 
 		 167 aa  121  6e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00000199113  hitchhiker  0.00604494 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0449  50S ribosomal protein L10  44.81 
 
 		 175 aa  120  7e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4557  50S ribosomal protein L10  41.36 
 
 		 166 aa  120  8e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.669843  decreased coverage  0.0090203 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0922  50S ribosomal protein L10  43.51 
 
 		 176 aa  120  8e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00116615  hitchhiker  0.00000161737 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>