More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0396 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_0396  50S ribosomal protein L10  100 
 
 		 173 aa  345  1e-94  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.252363  hitchhiker  0.00709296 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0757  50S ribosomal protein L10  71.35 
 
 		 174 aa  267  5.9999999999999995e-71  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0270  50S ribosomal protein L10  73.56 
 
 		 174 aa  256  1e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.247547  hitchhiker  0.00145059 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0310  50S ribosomal protein L10  63.58 
 
 		 165 aa  206  1e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0746923  normal  0.0249908 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3191  50S ribosomal protein L10  61.35 
 
 		 173 aa  204  5e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.579756  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3347  50S ribosomal protein L10  67.35 
 
 		 167 aa  199  1.9999999999999998e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.862427  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3336  50S ribosomal protein L10  62.75 
 
 		 173 aa  199  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3437  50S ribosomal protein L10  64.71 
 
 		 165 aa  197  3.9999999999999996e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153429  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3316  50S ribosomal protein L10  61.45 
 
 		 168 aa  197  7e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.354504  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2969  50S ribosomal protein L10  61.45 
 
 		 168 aa  197  7e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.45658 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3036  50S ribosomal protein L10  62.26 
 
 		 168 aa  196  1.0000000000000001e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0878547 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0317  50S ribosomal protein L10  64.71 
 
 		 165 aa  196  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00438278  normal  0.203557 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2769  50S ribosomal protein L10  64.71 
 
 		 165 aa  196  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0338  50S ribosomal protein L10  64.71 
 
 		 165 aa  196  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.550948  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2850  50S ribosomal protein L10  64.05 
 
 		 165 aa  194  4.0000000000000005e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.675463 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0044  50S ribosomal protein L10  58.44 
 
 		 215 aa  181  4.0000000000000006e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000127438  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0040  50S ribosomal protein L10  57.79 
 
 		 179 aa  179  2e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0245031  hitchhiker  0.0000000000023806 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2643  50S ribosomal protein L10  67.32 
 
 		 165 aa  177  7e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3788  50S ribosomal protein L10  67.32 
 
 		 165 aa  177  7e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.166109  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1912  50S ribosomal protein L10  67.32 
 
 		 165 aa  177  7e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000184172  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0317  50S ribosomal protein L10  52.02 
 
 		 173 aa  176  1e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.146286  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0488  50S ribosomal protein L10  52.02 
 
 		 173 aa  176  1e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.169718  hitchhiker  0.00000169108 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3467  50S ribosomal protein L10  67.55 
 
 		 184 aa  176  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0108818  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3818  50S ribosomal protein L10  67.55 
 
 		 184 aa  176  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.881367  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3756  50S ribosomal protein L10  67.55 
 
 		 184 aa  176  2e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0407684  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0239  50S ribosomal protein L10  66.67 
 
 		 165 aa  174  6e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0229066 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3078  50S ribosomal protein L10  66.67 
 
 		 165 aa  174  7e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.892062  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3654  50S ribosomal protein L10  65.36 
 
 		 167 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0512272  hitchhiker  0.000000643388 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0304  50S ribosomal protein L10  65.36 
 
 		 167 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.125975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0266  50S ribosomal protein L10  65.36 
 
 		 165 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.646007  normal  0.635943 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3453  50S ribosomal protein L10  57.52 
 
 		 174 aa  171  3.9999999999999995e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0925685  normal  0.446601 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0314  ribosomal protein L10  51.43 
 
 		 175 aa  171  5.999999999999999e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000329441  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0257  50S ribosomal protein L10  65.56 
 
 		 188 aa  168  4e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0591157  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3180  50S ribosomal protein L10  61.94 
 
 		 140 aa  167  5e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000385503  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0867  50S ribosomal protein L10  52 
 
 		 175 aa  165  2e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0596  50S ribosomal protein L10  45.93 
 
 		 172 aa  163  9e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0140503  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1064  50S ribosomal protein L10  57.14 
 
 		 175 aa  155  2e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0220515  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0586  50S ribosomal protein L10  54.9 
 
 		 177 aa  155  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2178  ribosomal protein L10  48.57 
 
 		 175 aa  154  9e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.905696 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4533  50S ribosomal protein L10  52.41 
 
 		 168 aa  153  1e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0385  50S ribosomal protein L10  47.4 
 
 		 177 aa  152  2.9999999999999998e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0360  50S ribosomal protein L10  47.4 
 
 		 177 aa  152  2.9999999999999998e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0700  ribosomal protein L10  47.09 
 
 		 174 aa  152  2.9999999999999998e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.299689  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2262  50S ribosomal protein L10  54.09 
 
 		 174 aa  152  2.9999999999999998e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.168271  normal  0.476107 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3899  50S ribosomal protein L10  52.2 
 
 		 168 aa  150  7e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3248  50S ribosomal protein L10  52.2 
 
 		 168 aa  150  7e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0508  50S ribosomal protein L10  51.53 
 
 		 175 aa  150  1e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.270625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2333  50S ribosomal protein L10  51.15 
 
 		 176 aa  150  1e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.275074  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3594  50S ribosomal protein L10  51.57 
 
 		 178 aa  148  4e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.196569  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3642  50S ribosomal protein L10  54.05 
 
 		 183 aa  147  5e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.279713 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4444  50S ribosomal protein L10  50.31 
 
 		 176 aa  146  2.0000000000000003e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.651473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0838  50S ribosomal protein L10P  45.51 
 
 		 172 aa  146  2.0000000000000003e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0707377  normal  0.0995834 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3869  50S ribosomal protein L10  53.46 
 
 		 182 aa  145  3e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0449  50S ribosomal protein L10  47.43 
 
 		 175 aa  144  6e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2333  50S ribosomal protein L10  50 
 
 		 175 aa  142  2e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00442702  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0922  50S ribosomal protein L10  44.77 
 
 		 176 aa  142  2e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00116615  hitchhiker  0.00000161737 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2038  50S ribosomal protein L10  44.57 
 
 		 175 aa  137  7.999999999999999e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0258299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0710  50S ribosomal protein L10  43.02 
 
 		 176 aa  137  8.999999999999999e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.303715  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0286  ribosomal protein L10  43.68 
 
 		 166 aa  136  2e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0147275  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4285  ribosomal protein L10  44.19 
 
 		 166 aa  135  3.0000000000000003e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000716484  hitchhiker  0.000000472968 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03861  50S ribosomal protein L10  44.89 
 
 		 165 aa  133  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000311393  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4010  ribosomal protein L10  44.89 
 
 		 165 aa  133  9.999999999999999e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000237202  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4525  50S ribosomal protein L10  44.89 
 
 		 165 aa  133  9.999999999999999e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000111294  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4040  50S ribosomal protein L10  44.89 
 
 		 165 aa  133  9.999999999999999e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00830699  hitchhiker  0.000887574 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4433  50S ribosomal protein L10  44.89 
 
 		 165 aa  133  9.999999999999999e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000818528  hitchhiker  0.00000264015 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5450  50S ribosomal protein L10  44.89 
 
 		 165 aa  133  9.999999999999999e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000850473  hitchhiker  0.000626343 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4473  50S ribosomal protein L10  44.89 
 
 		 165 aa  133  9.999999999999999e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000239877  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03814  hypothetical protein  44.89 
 
 		 165 aa  133  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000360524  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4218  50S ribosomal protein L10  44.89 
 
 		 165 aa  133  9.999999999999999e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.4618e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0325  50S ribosomal protein L10  41.95 
 
 		 174 aa  132  1.9999999999999998e-30  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00522529  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1864  50S ribosomal protein L10  41.95 
 
 		 174 aa  132  1.9999999999999998e-30  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0922754  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0175  50S ribosomal protein L10  44 
 
 		 165 aa  131  6e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000220587  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2179  50S ribosomal protein L10  42.29 
 
 		 175 aa  131  6e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.82519  normal  0.0244994 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1889  50S ribosomal protein L10  42.29 
 
 		 175 aa  130  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00905403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0208  50S ribosomal protein L10  44.32 
 
 		 165 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000217712  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3887  50S ribosomal protein L10  42.86 
 
 		 165 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.452938  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2697  50S ribosomal protein L10P  42.26 
 
 		 172 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.561782  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0203  50S ribosomal protein L10  44.32 
 
 		 165 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0744309  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3733  50S ribosomal protein L10  42.86 
 
 		 165 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4557  50S ribosomal protein L10  41.95 
 
 		 166 aa  129  3e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.669843  decreased coverage  0.0090203 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0692  50S ribosomal protein L10  41.92 
 
 		 172 aa  129  3e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000112903  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4557  50S ribosomal protein L10  43.75 
 
 		 165 aa  129  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.153585  hitchhiker  0.0000000000122855 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4361  50S ribosomal protein L10  43.75 
 
 		 165 aa  129  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.43206  normal  0.360014 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4483  50S ribosomal protein L10  43.75 
 
 		 165 aa  129  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.763348  hitchhiker  0.0000000000000236313 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4480  50S ribosomal protein L10  43.75 
 
 		 165 aa  129  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.375547  hitchhiker  0.00110307 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4393  50S ribosomal protein L10  43.75 
 
 		 165 aa  129  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000406359  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0617  ribosomal protein L10  41.38 
 
 		 166 aa  127  6e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.532211  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0195  50S ribosomal protein L10  43.18 
 
 		 165 aa  127  1.0000000000000001e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000187486  normal  0.229046 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0149  50S ribosomal protein L10  42.29 
 
 		 165 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000191294  normal  0.034689 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0275  50S ribosomal protein L10  40.23 
 
 		 165 aa  125  2.0000000000000002e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000206065  normal  0.0858323 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5088  50S ribosomal protein L10  39.66 
 
 		 166 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000128873  normal  0.821712 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3862  50S ribosomal protein L10  41.38 
 
 		 165 aa  124  9e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000104786  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0337  50S ribosomal protein L10  41.38 
 
 		 165 aa  124  9e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.239078  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04532  50S ribosomal protein L10  43.75 
 
 		 177 aa  124  9e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.165522  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2808  50S ribosomal protein L10  41.38 
 
 		 165 aa  124  9e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000036942  normal  0.222423 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2865  50S ribosomal protein L10  42.26 
 
 		 174 aa  123  1e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.161934  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0171  50S ribosomal protein L10  42.11 
 
 		 163 aa  123  1e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0111095  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4699  50S ribosomal protein L10  41.28 
 
 		 166 aa  122  2e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000246782  hitchhiker  0.00000548606 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0924  50S ribosomal protein L10  41.62 
 
 		 173 aa  122  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3337  50S ribosomal protein L10  41.62 
 
 		 173 aa  122  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000271161 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>