More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0508 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_0508  50S ribosomal protein L10  100 
 
 		 175 aa  343  5e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.270625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4533  50S ribosomal protein L10  98.18 
 
 		 168 aa  320  8e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3248  50S ribosomal protein L10  95.88 
 
 		 168 aa  301  2.0000000000000002e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3899  50S ribosomal protein L10  95.88 
 
 		 168 aa  301  2.0000000000000002e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4444  50S ribosomal protein L10  90.18 
 
 		 176 aa  275  2e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.651473  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0586  50S ribosomal protein L10  88.34 
 
 		 177 aa  269  2e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2262  50S ribosomal protein L10  88.96 
 
 		 174 aa  268  2.9999999999999997e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.168271  normal  0.476107 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3642  50S ribosomal protein L10  86.88 
 
 		 183 aa  261  3e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.279713 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3594  50S ribosomal protein L10  84.05 
 
 		 178 aa  254  6e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.196569  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3453  50S ribosomal protein L10  70 
 
 		 174 aa  224  4e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0925685  normal  0.446601 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3869  50S ribosomal protein L10  71.88 
 
 		 182 aa  222  2e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3191  50S ribosomal protein L10  65.64 
 
 		 173 aa  213  9.999999999999999e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.579756  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3316  50S ribosomal protein L10  62.42 
 
 		 168 aa  202  2e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.354504  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2969  50S ribosomal protein L10  62.42 
 
 		 168 aa  202  2e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.45658 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3437  50S ribosomal protein L10  61.88 
 
 		 165 aa  197  6e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153429  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3036  50S ribosomal protein L10  61.68 
 
 		 168 aa  196  9e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0878547 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2850  50S ribosomal protein L10  60.25 
 
 		 165 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.675463 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0317  50S ribosomal protein L10  60.87 
 
 		 165 aa  194  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00438278  normal  0.203557 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2769  50S ribosomal protein L10  60.87 
 
 		 165 aa  194  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0338  50S ribosomal protein L10  60.87 
 
 		 165 aa  194  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.550948  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3336  50S ribosomal protein L10  61.44 
 
 		 173 aa  190  9e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0044  50S ribosomal protein L10  57.79 
 
 		 215 aa  179  1e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000127438  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0266  50S ribosomal protein L10  62.11 
 
 		 165 aa  179  2e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.646007  normal  0.635943 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0040  50S ribosomal protein L10  57.79 
 
 		 179 aa  179  2.9999999999999997e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0245031  hitchhiker  0.0000000000023806 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0310  50S ribosomal protein L10  55.15 
 
 		 165 aa  177  7e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0746923  normal  0.0249908 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0270  50S ribosomal protein L10  53.94 
 
 		 174 aa  176  1e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.247547  hitchhiker  0.00145059 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0304  50S ribosomal protein L10  59.41 
 
 		 167 aa  176  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.125975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3654  50S ribosomal protein L10  59.41 
 
 		 167 aa  176  1e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0512272  hitchhiker  0.000000643388 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0257  50S ribosomal protein L10  61.49 
 
 		 188 aa  175  3e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0591157  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0239  50S ribosomal protein L10  60.25 
 
 		 165 aa  173  9.999999999999999e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0229066 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2643  50S ribosomal protein L10  59.63 
 
 		 165 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3788  50S ribosomal protein L10  59.63 
 
 		 165 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.166109  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1912  50S ribosomal protein L10  59.63 
 
 		 165 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000184172  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3347  50S ribosomal protein L10  57.82 
 
 		 167 aa  173  9.999999999999999e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.862427  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3078  50S ribosomal protein L10  59.63 
 
 		 165 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.892062  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3818  50S ribosomal protein L10  59.01 
 
 		 184 aa  170  6.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.881367  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3756  50S ribosomal protein L10  59.01 
 
 		 184 aa  171  6.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0407684  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3467  50S ribosomal protein L10  59.01 
 
 		 184 aa  171  6.999999999999999e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0108818  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3180  50S ribosomal protein L10  60 
 
 		 140 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000385503  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0757  50S ribosomal protein L10  47.27 
 
 		 174 aa  154  5.0000000000000005e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0838  50S ribosomal protein L10P  44.16 
 
 		 172 aa  136  1e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0707377  normal  0.0995834 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0317  50S ribosomal protein L10  44.9 
 
 		 173 aa  135  4e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.146286  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0488  50S ribosomal protein L10  44.9 
 
 		 173 aa  135  4e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.169718  hitchhiker  0.00000169108 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0396  50S ribosomal protein L10  50.72 
 
 		 173 aa  131  3.9999999999999996e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.252363  hitchhiker  0.00709296 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0747  50S ribosomal protein L10  43.9 
 
 		 178 aa  130  1.0000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0329012  normal  0.965103 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2697  50S ribosomal protein L10P  42.68 
 
 		 172 aa  128  3e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.561782  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0867  50S ribosomal protein L10  40.62 
 
 		 175 aa  127  1.0000000000000001e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04532  50S ribosomal protein L10  42.68 
 
 		 177 aa  125  4.0000000000000003e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.165522  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3362  50S ribosomal protein L10  42.04 
 
 		 172 aa  124  5e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.256068  normal  0.223881 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4497  50S ribosomal protein L10  43.31 
 
 		 172 aa  124  7e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0976  50S ribosomal protein L10  42.41 
 
 		 195 aa  124  7e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0194348 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0286  ribosomal protein L10  40.37 
 
 		 166 aa  123  1e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0147275  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2333  50S ribosomal protein L10  45.62 
 
 		 175 aa  122  3e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00442702  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0385  50S ribosomal protein L10  39.38 
 
 		 177 aa  121  4e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0360  50S ribosomal protein L10  39.38 
 
 		 177 aa  121  4e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0922  50S ribosomal protein L10  41.61 
 
 		 176 aa  121  5e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00116615  hitchhiker  0.00000161737 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2958  50S ribosomal protein L10  42.04 
 
 		 172 aa  120  7e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0648852 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1898  50S ribosomal protein L10  42.04 
 
 		 175 aa  120  8e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2724  50S ribosomal protein L10  43.11 
 
 		 166 aa  120  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000159716  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2410  50S ribosomal protein L10  43.11 
 
 		 166 aa  120  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000332682  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0314  ribosomal protein L10  41.25 
 
 		 175 aa  120  9.999999999999999e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000329441  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2722  ribosomal protein L10  37.21 
 
 		 170 aa  119  1.9999999999999998e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0525449  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4015  50S ribosomal protein L10  43.31 
 
 		 172 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.866731  normal  0.631329 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4384  50S ribosomal protein L10  43.31 
 
 		 172 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.313613 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06150  50S ribosomal protein L10  40.96 
 
 		 166 aa  119  3e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0362  50S ribosomal protein L10  41.4 
 
 		 175 aa  118  3e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.656463 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2108  50S ribosomal protein L10  39.26 
 
 		 175 aa  119  3e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000349119  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1945  50S ribosomal protein L10  39.49 
 
 		 172 aa  118  3.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.137242  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3841  50S ribosomal protein L10  40.76 
 
 		 172 aa  118  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0158219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0171  50S ribosomal protein L10  45.45 
 
 		 163 aa  118  3.9999999999999996e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0111095  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3691  ribosomal protein L10  42.31 
 
 		 164 aa  118  3.9999999999999996e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000101089  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0745  50S ribosomal protein L10  42.31 
 
 		 171 aa  117  6e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00501407 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0232  50S ribosomal protein L10  41.03 
 
 		 172 aa  117  7e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0685965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2198  50S ribosomal protein L10  39.26 
 
 		 175 aa  117  7e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000000455583  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1246  50S ribosomal protein L10  39.49 
 
 		 172 aa  117  9e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.208748  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1954  50S ribosomal protein L10  39.49 
 
 		 174 aa  116  9.999999999999999e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.262202  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0569  50S ribosomal protein L10  39.49 
 
 		 172 aa  116  9.999999999999999e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000818206  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2727  ribosomal protein L10  41.18 
 
 		 172 aa  116  9.999999999999999e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.12165  normal  0.845294 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1207  50S ribosomal protein L10  39.24 
 
 		 194 aa  116  9.999999999999999e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.347273  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0408  50S ribosomal protein L10  43.33 
 
 		 174 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.79305e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0449  50S ribosomal protein L10  38.12 
 
 		 175 aa  116  1.9999999999999998e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01070  ribosomal protein L10  41.1 
 
 		 172 aa  115  3e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  5.51299e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3918  50S ribosomal protein L10  39.16 
 
 		 166 aa  115  3e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1864  50S ribosomal protein L10  37.58 
 
 		 174 aa  115  3.9999999999999997e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0922754  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1822  50S ribosomal protein L10  39.49 
 
 		 172 aa  115  3.9999999999999997e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0325  50S ribosomal protein L10  37.58 
 
 		 174 aa  115  3.9999999999999997e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00522529  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1804  50S ribosomal protein L10P  40.54 
 
 		 171 aa  115  3.9999999999999997e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.160084 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2178  ribosomal protein L10  39.38 
 
 		 175 aa  114  6e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.905696 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1064  50S ribosomal protein L10  45.45 
 
 		 175 aa  114  8.999999999999998e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0220515  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5088  50S ribosomal protein L10  37.95 
 
 		 166 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000128873  normal  0.821712 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1322  50S ribosomal protein L10  38.22 
 
 		 172 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.850894  normal  0.161771 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08740  50S ribosomal protein L10  38.55 
 
 		 166 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00037754 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0828  50S ribosomal protein L10  38.55 
 
 		 166 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0279492  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0175  50S ribosomal protein L10  42.45 
 
 		 165 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000220587  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4285  ribosomal protein L10  36.75 
 
 		 166 aa  112  3e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000716484  hitchhiker  0.000000472968 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1345  50S ribosomal protein L10  38.22 
 
 		 172 aa  111  6e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0320244  normal  0.100348 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0094  50S ribosomal protein L10  37.74 
 
 		 166 aa  110  8.000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000793252  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0093  50S ribosomal protein L10  37.74 
 
 		 166 aa  110  8.000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000759135  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2283  50S ribosomal protein L10  39.49 
 
 		 172 aa  110  8.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0400383  normal  0.2116 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0700  ribosomal protein L10  38.99 
 
 		 174 aa  110  8.000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.299689  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>