More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1547 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_1547  50S ribosomal protein L10  100 
 
 		 173 aa  340  4e-93  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.834427 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2074  50S ribosomal protein L10  46.78 
 
 		 172 aa  163  9e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0700  ribosomal protein L10  49.71 
 
 		 174 aa  163  1.0000000000000001e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.299689  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0692  50S ribosomal protein L10  50.29 
 
 		 172 aa  163  1.0000000000000001e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000112903  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0617  50S ribosomal protein L10  49.42 
 
 		 174 aa  154  5.0000000000000005e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000383704 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1059  50S ribosomal protein L10  48.26 
 
 		 174 aa  154  6e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0531801  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3337  50S ribosomal protein L10  45.35 
 
 		 173 aa  151  5e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000271161 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0924  50S ribosomal protein L10  45.35 
 
 		 173 aa  151  5e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2865  50S ribosomal protein L10  47.67 
 
 		 174 aa  150  7e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.161934  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0671  50S ribosomal protein L10  45.09 
 
 		 174 aa  147  7e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2783  50S ribosomal protein L10  45.03 
 
 		 172 aa  146  1.0000000000000001e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00189787  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0183  ribosomal protein L10  42.11 
 
 		 176 aa  144  4.0000000000000006e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000324199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1927  ribosomal protein L10  45.09 
 
 		 176 aa  144  5e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0948645  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1337  50S ribosomal protein L10  43.6 
 
 		 174 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.900212  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1453  50S ribosomal protein L10  39.41 
 
 		 173 aa  137  7e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0857  50S ribosomal protein L10  42.94 
 
 		 177 aa  137  7.999999999999999e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000259828  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01070  ribosomal protein L10  44.77 
 
 		 172 aa  137  8.999999999999999e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  5.51299e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0441  50S ribosomal protein L10  41.76 
 
 		 189 aa  137  1e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1964  50S ribosomal protein L10  42.44 
 
 		 172 aa  135  4e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.202865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0276  50S ribosomal protein L10  42.26 
 
 		 175 aa  133  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000204852  hitchhiker  0.000495958 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1821  ribosomal protein L10  43.03 
 
 		 179 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0231  50S ribosomal protein L10  40.7 
 
 		 172 aa  130  1.0000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0103356  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0310  ribosomal protein L10  44.38 
 
 		 176 aa  128  3e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.109625  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0838  50S ribosomal protein L10P  43.93 
 
 		 172 aa  128  4.0000000000000003e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0707377  normal  0.0995834 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0355  50S ribosomal protein L10  40.12 
 
 		 172 aa  125  2.0000000000000002e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000413063  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2681  50S ribosomal protein L10  39.53 
 
 		 172 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000132453  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1509  ribosomal protein L10  42.94 
 
 		 176 aa  125  3e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000272992  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0757  50S ribosomal protein L10  41.62 
 
 		 174 aa  125  3e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2470  50S ribosomal protein L10  41.04 
 
 		 176 aa  124  6e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0147283  hitchhiker  0.00682166 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1634  50S ribosomal protein L10  39.31 
 
 		 174 aa  124  6e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2724  50S ribosomal protein L10  42.21 
 
 		 166 aa  122  2e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000159716  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2410  50S ribosomal protein L10  42.21 
 
 		 166 aa  122  2e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000332682  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2722  ribosomal protein L10  41.29 
 
 		 170 aa  122  4e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0525449  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2994  50S ribosomal protein L10  40.46 
 
 		 173 aa  120  7e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1529  ribosomal protein L10  42.6 
 
 		 183 aa  120  9.999999999999999e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000554953  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2722  50S ribosomal protein L10P  39.64 
 
 		 178 aa  119  1.9999999999999998e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000314918  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0194  50S ribosomal protein L10  39.53 
 
 		 172 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000548969  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2344  ribosomal protein L10  39.16 
 
 		 173 aa  117  6e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.032292  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0408  50S ribosomal protein L10  41.18 
 
 		 174 aa  117  6e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.79305e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0317  50S ribosomal protein L10  36.42 
 
 		 173 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0060406  hitchhiker  0.00087235 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4318  50S ribosomal protein L10  36.9 
 
 		 187 aa  115  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.561909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0286  50S ribosomal protein L10  37.79 
 
 		 172 aa  114  5e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000520195  hitchhiker  0.00386218 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0488  50S ribosomal protein L10  42.51 
 
 		 173 aa  114  7.999999999999999e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.169718  hitchhiker  0.00000169108 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0317  50S ribosomal protein L10  42.51 
 
 		 173 aa  114  7.999999999999999e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.146286  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0205  50S ribosomal protein L10  40.35 
 
 		 181 aa  114  8.999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000665859  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0297  50S ribosomal protein L10  46.76 
 
 		 172 aa  113  1.0000000000000001e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0300  ribosomal protein L10  39.88 
 
 		 181 aa  110  7.000000000000001e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000817286  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0270  50S ribosomal protein L10  39.88 
 
 		 174 aa  110  9e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.247547  hitchhiker  0.00145059 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3328  50S ribosomal protein L10  36.31 
 
 		 186 aa  110  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.211537 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0213  ribosomal protein L10  37.5 
 
 		 175 aa  109  2.0000000000000002e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.623588  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0541  50S ribosomal protein L10  37.57 
 
 		 174 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.367918  normal  0.103583 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0096  50S ribosomal protein L10  43.48 
 
 		 166 aa  108  5e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1018  ribosomal protein L10  38.82 
 
 		 202 aa  107  7.000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4521  ribosomal protein L10  44.12 
 
 		 200 aa  107  7.000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0479  50S ribosomal protein L10  38.76 
 
 		 179 aa  106  2e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.488036  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0464  50S ribosomal protein L10  38.76 
 
 		 179 aa  106  2e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0359791  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2223  50S ribosomal protein L10  37.79 
 
 		 174 aa  105  3e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00194446 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6637  ribosomal protein L10  43.26 
 
 		 184 aa  105  4e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.858869  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2697  50S ribosomal protein L10P  39.16 
 
 		 172 aa  105  4e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.561782  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6059  50S ribosomal protein L10  38.73 
 
 		 182 aa  104  6e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.749447  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0100  50S ribosomal protein L10  39.52 
 
 		 166 aa  103  8e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000689021  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1667  50S ribosomal protein L10  36.99 
 
 		 173 aa  103  1e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08440  ribosomal protein L10  37.2 
 
 		 173 aa  103  1e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.166227  normal  0.704722 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2656  50S ribosomal protein L10  37.14 
 
 		 175 aa  103  1e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.220618  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0389  ribosomal protein L10  38.1 
 
 		 174 aa  103  1e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2361  50S ribosomal protein L10  38.46 
 
 		 174 aa  102  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2469  50S ribosomal protein L10  39.62 
 
 		 175 aa  102  2e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.851244  normal  0.156602 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0571  50S ribosomal protein L10  38.37 
 
 		 187 aa  102  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0976  50S ribosomal protein L10  35.67 
 
 		 195 aa  103  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0194348 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0094  50S ribosomal protein L10  42.75 
 
 		 166 aa  102  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000793252  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2273  50S ribosomal protein L10  38.46 
 
 		 174 aa  102  3e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1590  50S ribosomal protein L10  39.1 
 
 		 174 aa  102  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5206  50S ribosomal protein L10  42.03 
 
 		 166 aa  101  4e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000252117  unclonable  5.898740000000001e-26 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1072  LSU ribosomal protein L10P  37.57 
 
 		 174 aa  101  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.37271  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1322  50S ribosomal protein L10  35.26 
 
 		 172 aa  101  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.850894  normal  0.161771 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0093  50S ribosomal protein L10  42.03 
 
 		 166 aa  102  4e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000759135  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0099  50S ribosomal protein L10  42.03 
 
 		 166 aa  101  6e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000477259  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0099  50S ribosomal protein L10  42.03 
 
 		 166 aa  101  6e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000073314  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0095  50S ribosomal protein L10  42.03 
 
 		 166 aa  101  6e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  8.69083e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0093  50S ribosomal protein L10  42.03 
 
 		 166 aa  101  6e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000338487  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0110  50S ribosomal protein L10  42.03 
 
 		 166 aa  101  6e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.02318e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0099  50S ribosomal protein L10  42.03 
 
 		 166 aa  101  6e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000718586  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0632  50S ribosomal protein L10  36.09 
 
 		 175 aa  101  6e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.346234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0130  50S ribosomal protein L10  42.03 
 
 		 166 aa  101  6e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000124346  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0120  50S ribosomal protein L10  42.03 
 
 		 166 aa  101  6e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000126178  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20980  LSU ribosomal protein L10P  38.6 
 
 		 203 aa  101  7e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.996084  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3157  ribosomal protein L10  44.78 
 
 		 173 aa  101  7e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500065  normal  0.290514 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0618  ribosomal protein L10  39.88 
 
 		 173 aa  100  8e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1954  50S ribosomal protein L10  39.18 
 
 		 174 aa  100  1e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.262202  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0234  ribosomal protein L10  36.18 
 
 		 164 aa  100  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.675629  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29850  LSU ribosomal protein L10P  43.36 
 
 		 176 aa  100  1e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1372  50S ribosomal protein L10  34.68 
 
 		 178 aa  99.4  2e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.188772  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1420  50S ribosomal protein L10  34.68 
 
 		 172 aa  99  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.291032 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2958  50S ribosomal protein L10  39.31 
 
 		 172 aa  98.6  4e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0648852 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3477  50S ribosomal protein L10  41.45 
 
 		 171 aa  98.6  4e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.232416  hitchhiker  0.0000717521 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23960  LSU ribosomal protein L10P  38.46 
 
 		 172 aa  98.2  5e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5114  ribosomal protein L10  35.26 
 
 		 175 aa  98.2  5e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.316499  normal  0.732887 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0562  50S ribosomal protein L10  35.93 
 
 		 166 aa  97.8  6e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000233555  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0360  50S ribosomal protein L10  35.88 
 
 		 177 aa  97.8  6e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17270  LSU ribosomal protein L10P  41.13 
 
 		 173 aa  97.8  6e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>