More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0310 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_0310  ribosomal protein L10  100 
 
 		 176 aa  346  1e-94  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.109625  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2722  50S ribosomal protein L10P  64.94 
 
 		 178 aa  234  7e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000314918  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01070  ribosomal protein L10  54.22 
 
 		 172 aa  174  7e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  5.51299e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2470  50S ribosomal protein L10  52.63 
 
 		 176 aa  171  3.9999999999999995e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0147283  hitchhiker  0.00682166 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0276  50S ribosomal protein L10  51.43 
 
 		 175 aa  170  9e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000204852  hitchhiker  0.000495958 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0408  50S ribosomal protein L10  52.87 
 
 		 174 aa  169  3e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.79305e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0205  50S ribosomal protein L10  48.57 
 
 		 181 aa  162  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000665859  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0857  50S ribosomal protein L10  49.4 
 
 		 177 aa  161  4.0000000000000004e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000259828  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0692  50S ribosomal protein L10  51.5 
 
 		 172 aa  161  4.0000000000000004e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000112903  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5206  50S ribosomal protein L10  47.95 
 
 		 166 aa  160  7e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000252117  unclonable  5.898740000000001e-26 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0094  50S ribosomal protein L10  47.95 
 
 		 166 aa  160  9e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000793252  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0099  50S ribosomal protein L10  47.37 
 
 		 166 aa  158  3e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000477259  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0099  50S ribosomal protein L10  47.37 
 
 		 166 aa  158  3e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000073314  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0095  50S ribosomal protein L10  47.37 
 
 		 166 aa  158  3e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  8.69083e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0093  50S ribosomal protein L10  47.37 
 
 		 166 aa  158  3e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000338487  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0099  50S ribosomal protein L10  47.37 
 
 		 166 aa  158  3e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000718586  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0130  50S ribosomal protein L10  47.37 
 
 		 166 aa  158  3e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000124346  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0110  50S ribosomal protein L10  47.37 
 
 		 166 aa  158  3e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.02318e-62 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0120  50S ribosomal protein L10  47.37 
 
 		 166 aa  158  3e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000126178  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1529  ribosomal protein L10  50.6 
 
 		 183 aa  158  4e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000554953  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2722  ribosomal protein L10  53.69 
 
 		 170 aa  158  5e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0525449  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0093  50S ribosomal protein L10  47.95 
 
 		 166 aa  156  2e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000759135  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0617  50S ribosomal protein L10  52.98 
 
 		 174 aa  155  3e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000383704 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2724  50S ribosomal protein L10  50.63 
 
 		 166 aa  154  7e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000159716  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2410  50S ribosomal protein L10  50.63 
 
 		 166 aa  154  7e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000332682  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2865  50S ribosomal protein L10  51.19 
 
 		 174 aa  154  8e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.161934  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3337  50S ribosomal protein L10  51.19 
 
 		 173 aa  153  1e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000271161 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2344  ribosomal protein L10  44.97 
 
 		 173 aa  153  1e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.032292  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0924  50S ribosomal protein L10  51.19 
 
 		 173 aa  153  1e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0100  50S ribosomal protein L10  52.74 
 
 		 166 aa  150  8e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000689021  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2164  50S ribosomal protein L10P  49.4 
 
 		 174 aa  149  2e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0596262  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0700  ribosomal protein L10  51.16 
 
 		 174 aa  149  2e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.299689  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0180  50S ribosomal protein L10  46.75 
 
 		 166 aa  148  3e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0693527  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0096  50S ribosomal protein L10  52.74 
 
 		 166 aa  148  4e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1059  50S ribosomal protein L10  51.19 
 
 		 174 aa  148  5e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0531801  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0671  50S ribosomal protein L10  49.41 
 
 		 174 aa  147  5e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1927  ribosomal protein L10  46.75 
 
 		 176 aa  146  1.0000000000000001e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0948645  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0183  ribosomal protein L10  44.12 
 
 		 176 aa  146  1.0000000000000001e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000324199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0213  ribosomal protein L10  43.6 
 
 		 175 aa  145  3e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.623588  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0562  50S ribosomal protein L10  47.34 
 
 		 166 aa  145  4.0000000000000006e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000233555  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0576  50S ribosomal protein L10  47.34 
 
 		 166 aa  145  4.0000000000000006e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000179203  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3691  ribosomal protein L10  50 
 
 		 164 aa  144  5e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000101089  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0838  50S ribosomal protein L10P  48.21 
 
 		 172 aa  142  3e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0707377  normal  0.0995834 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1337  50S ribosomal protein L10  50 
 
 		 174 aa  141  5e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.900212  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1821  ribosomal protein L10  43.64 
 
 		 179 aa  135  3.0000000000000003e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1387  50S ribosomal protein L10  44.38 
 
 		 171 aa  134  8e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000123079  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_863  ribosomal protein L10  43.53 
 
 		 176 aa  131  6e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000130926  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0270  50S ribosomal protein L10  46.24 
 
 		 174 aa  130  6.999999999999999e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.247547  hitchhiker  0.00145059 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0567  50S ribosomal protein L10  42.44 
 
 		 167 aa  130  6.999999999999999e-30  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00969269  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2969  50S ribosomal protein L10  49.01 
 
 		 168 aa  130  9e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.45658 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3316  50S ribosomal protein L10  49.01 
 
 		 168 aa  130  9e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.354504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2074  50S ribosomal protein L10  44.91 
 
 		 172 aa  130  1.0000000000000001e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0757  50S ribosomal protein L10  43.27 
 
 		 174 aa  129  1.0000000000000001e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0991  50S ribosomal protein L10  44.12 
 
 		 176 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000204805  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3036  50S ribosomal protein L10  49.33 
 
 		 168 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0878547 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1302  50S ribosomal protein L10  42.11 
 
 		 166 aa  129  2.0000000000000002e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000076628  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1547  50S ribosomal protein L10  44.38 
 
 		 173 aa  128  3e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.834427 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3191  50S ribosomal protein L10  45.86 
 
 		 173 aa  126  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.579756  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0479  ribosomal protein L10  42.07 
 
 		 164 aa  122  2e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2951  ribosomal protein L10  40.34 
 
 		 186 aa  122  2e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0265827  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3336  50S ribosomal protein L10  45.51 
 
 		 173 aa  122  3e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1509  ribosomal protein L10  40.59 
 
 		 176 aa  122  4e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000272992  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08440  ribosomal protein L10  42.33 
 
 		 173 aa  120  8e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.166227  normal  0.704722 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0882  50S ribosomal protein L10  42.86 
 
 		 176 aa  120  9e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.629984  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1417  50S ribosomal protein L10  43.05 
 
 		 197 aa  119  1.9999999999999998e-26  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000013127  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2850  50S ribosomal protein L10  44.87 
 
 		 165 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.675463 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20980  LSU ribosomal protein L10P  43.33 
 
 		 203 aa  118  3.9999999999999996e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.996084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0310  50S ribosomal protein L10  43.79 
 
 		 165 aa  117  6e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0746923  normal  0.0249908 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0271  50S ribosomal protein L10  42 
 
 		 178 aa  117  6e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00121092  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0040  50S ribosomal protein L10  42.68 
 
 		 179 aa  117  9e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0245031  hitchhiker  0.0000000000023806 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0317  50S ribosomal protein L10  40.83 
 
 		 173 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.146286  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0488  50S ribosomal protein L10  40.83 
 
 		 173 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.169718  hitchhiker  0.00000169108 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0044  50S ribosomal protein L10  42.04 
 
 		 215 aa  116  1.9999999999999998e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000127438  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0355  50S ribosomal protein L10  41.67 
 
 		 172 aa  116  1.9999999999999998e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000413063  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0464  50S ribosomal protein L10  41.38 
 
 		 179 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0359791  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0479  50S ribosomal protein L10  41.38 
 
 		 179 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.488036  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0504  50S ribosomal protein L10  37.14 
 
 		 180 aa  115  3e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000340487  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3477  50S ribosomal protein L10  43.62 
 
 		 171 aa  115  3e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.232416  hitchhiker  0.0000717521 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2697  50S ribosomal protein L10P  38.92 
 
 		 172 aa  114  5e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.561782  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0317  50S ribosomal protein L10  42.95 
 
 		 165 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00438278  normal  0.203557 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2769  50S ribosomal protein L10  42.95 
 
 		 165 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0338  50S ribosomal protein L10  42.95 
 
 		 165 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.550948  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0140  50S ribosomal protein L10  39.77 
 
 		 174 aa  114  7.999999999999999e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000236563  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3437  50S ribosomal protein L10  42.95 
 
 		 165 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0571  50S ribosomal protein L10  40.96 
 
 		 187 aa  114  8.999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0317  50S ribosomal protein L10  37.65 
 
 		 173 aa  113  1.0000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0060406  hitchhiker  0.00087235 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1634  50S ribosomal protein L10  40.59 
 
 		 174 aa  113  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0385  50S ribosomal protein L10  40.83 
 
 		 177 aa  112  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0360  50S ribosomal protein L10  40.83 
 
 		 177 aa  112  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0231  50S ribosomal protein L10  39.29 
 
 		 172 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0103356  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1172  ribosomal protein L10  39.26 
 
 		 173 aa  112  3e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000357466  unclonable  0.0000000289216 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0389  ribosomal protein L10  37.35 
 
 		 174 aa  111  5e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6059  50S ribosomal protein L10  41.28 
 
 		 182 aa  110  7.000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.749447  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1956  ribosomal protein L10  37.36 
 
 		 174 aa  110  8.000000000000001e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1784  50S ribosomal protein L10  39.88 
 
 		 181 aa  110  9e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2223  50S ribosomal protein L10  37.58 
 
 		 174 aa  110  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00194446 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3453  50S ribosomal protein L10  41.03 
 
 		 174 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0925685  normal  0.446601 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3328  50S ribosomal protein L10  36.63 
 
 		 186 aa  110  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.211537 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1325  ribosomal protein L10  38.55 
 
 		 256 aa  110  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3347  50S ribosomal protein L10  44.44 
 
 		 167 aa  108  3e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.862427  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>