More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A3453 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A3453  50S ribosomal protein L10  100 
 
 		 174 aa  336  8e-92  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0925685  normal  0.446601 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3869  50S ribosomal protein L10  80 
 
 		 182 aa  242  1.9999999999999999e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0586  50S ribosomal protein L10  73.46 
 
 		 177 aa  228  3e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2262  50S ribosomal protein L10  70.11 
 
 		 174 aa  219  1.9999999999999999e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.168271  normal  0.476107 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3437  50S ribosomal protein L10  68.86 
 
 		 165 aa  217  5e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3594  50S ribosomal protein L10  70.81 
 
 		 178 aa  217  7e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.196569  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3642  50S ribosomal protein L10  71.43 
 
 		 183 aa  217  7e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.279713 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3036  50S ribosomal protein L10  69.38 
 
 		 168 aa  215  2.9999999999999998e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0878547 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2850  50S ribosomal protein L10  67.07 
 
 		 165 aa  215  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.675463 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2769  50S ribosomal protein L10  67.66 
 
 		 165 aa  212  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0317  50S ribosomal protein L10  67.66 
 
 		 165 aa  212  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00438278  normal  0.203557 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0338  50S ribosomal protein L10  67.66 
 
 		 165 aa  212  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.550948  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3899  50S ribosomal protein L10  67.84 
 
 		 168 aa  211  2.9999999999999995e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3248  50S ribosomal protein L10  67.84 
 
 		 168 aa  211  2.9999999999999995e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4533  50S ribosomal protein L10  69.64 
 
 		 168 aa  211  2.9999999999999995e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0508  50S ribosomal protein L10  70 
 
 		 175 aa  209  1e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.270625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4444  50S ribosomal protein L10  68.52 
 
 		 176 aa  209  1e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.651473  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2969  50S ribosomal protein L10  65.48 
 
 		 168 aa  207  5e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.45658 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3316  50S ribosomal protein L10  65.48 
 
 		 168 aa  207  5e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.354504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0310  50S ribosomal protein L10  66.88 
 
 		 165 aa  207  8e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0746923  normal  0.0249908 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3191  50S ribosomal protein L10  65.62 
 
 		 173 aa  204  4e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.579756  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3347  50S ribosomal protein L10  68.71 
 
 		 167 aa  203  9e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.862427  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3336  50S ribosomal protein L10  66.67 
 
 		 173 aa  199  9.999999999999999e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0040  50S ribosomal protein L10  64.71 
 
 		 179 aa  194  5.000000000000001e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0245031  hitchhiker  0.0000000000023806 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0044  50S ribosomal protein L10  64.71 
 
 		 215 aa  194  6e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000127438  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0266  50S ribosomal protein L10  68.86 
 
 		 165 aa  191  5e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.646007  normal  0.635943 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0257  50S ribosomal protein L10  68.86 
 
 		 188 aa  191  6e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0591157  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2643  50S ribosomal protein L10  67.66 
 
 		 165 aa  188  4e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3788  50S ribosomal protein L10  67.66 
 
 		 165 aa  188  4e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.166109  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1912  50S ribosomal protein L10  67.66 
 
 		 165 aa  188  4e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000184172  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3078  50S ribosomal protein L10  67.66 
 
 		 165 aa  188  4e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.892062  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0239  50S ribosomal protein L10  67.07 
 
 		 165 aa  187  9e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0229066 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0270  50S ribosomal protein L10  60.78 
 
 		 174 aa  186  1e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.247547  hitchhiker  0.00145059 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3467  50S ribosomal protein L10  67.07 
 
 		 184 aa  186  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0108818  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3818  50S ribosomal protein L10  67.07 
 
 		 184 aa  186  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.881367  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3756  50S ribosomal protein L10  67.07 
 
 		 184 aa  186  2e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0407684  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3654  50S ribosomal protein L10  65.27 
 
 		 167 aa  184  4e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0512272  hitchhiker  0.000000643388 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0304  50S ribosomal protein L10  65.27 
 
 		 167 aa  184  4e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.125975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3180  50S ribosomal protein L10  67.38 
 
 		 140 aa  178  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000385503  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0757  50S ribosomal protein L10  58.17 
 
 		 174 aa  177  8e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0286  ribosomal protein L10  48.81 
 
 		 166 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0147275  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0488  50S ribosomal protein L10  44.44 
 
 		 173 aa  140  9.999999999999999e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.169718  hitchhiker  0.00000169108 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0317  50S ribosomal protein L10  44.44 
 
 		 173 aa  140  9.999999999999999e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.146286  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0747  50S ribosomal protein L10  46.63 
 
 		 178 aa  137  6e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0329012  normal  0.965103 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0396  50S ribosomal protein L10  54.84 
 
 		 173 aa  137  8.999999999999999e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.252363  hitchhiker  0.00709296 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04532  50S ribosomal protein L10  46.01 
 
 		 177 aa  136  1e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.165522  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3691  ribosomal protein L10  45.81 
 
 		 164 aa  134  8e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000101089  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06150  50S ribosomal protein L10  43.03 
 
 		 166 aa  133  9.999999999999999e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0867  50S ribosomal protein L10  46.36 
 
 		 175 aa  132  3e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0922  50S ribosomal protein L10  45.45 
 
 		 176 aa  131  3.9999999999999996e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00116615  hitchhiker  0.00000161737 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0408  50S ribosomal protein L10  48.67 
 
 		 174 aa  131  5e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.79305e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5088  50S ribosomal protein L10  41.82 
 
 		 166 aa  130  9e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000128873  normal  0.821712 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1064  50S ribosomal protein L10  50.32 
 
 		 175 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0220515  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0314  ribosomal protein L10  44.81 
 
 		 175 aa  128  4.0000000000000003e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000329441  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2724  50S ribosomal protein L10  44.58 
 
 		 166 aa  128  5.0000000000000004e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000159716  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2410  50S ribosomal protein L10  44.58 
 
 		 166 aa  128  5.0000000000000004e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000332682  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0700  ribosomal protein L10  45.1 
 
 		 174 aa  126  1.0000000000000001e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.299689  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4771  50S ribosomal protein L10  40.74 
 
 		 164 aa  125  2.0000000000000002e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.709091  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0828  50S ribosomal protein L10  41.82 
 
 		 166 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0279492  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08740  50S ribosomal protein L10  41.82 
 
 		 166 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00037754 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0838  50S ribosomal protein L10P  43.51 
 
 		 172 aa  126  2.0000000000000002e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0707377  normal  0.0995834 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4557  50S ribosomal protein L10  41.82 
 
 		 166 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.669843  decreased coverage  0.0090203 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3918  50S ribosomal protein L10  41.61 
 
 		 166 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0617  ribosomal protein L10  41.21 
 
 		 166 aa  124  7e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.532211  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0475  50S ribosomal protein L10  38.79 
 
 		 166 aa  122  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.372242  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0445  50S ribosomal protein L10  38.79 
 
 		 166 aa  122  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.470652  unclonable  0.000000241771 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2722  ribosomal protein L10  40.59 
 
 		 170 aa  122  2e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0525449  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2333  50S ribosomal protein L10  46.45 
 
 		 175 aa  122  2e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00442702  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4285  ribosomal protein L10  41.61 
 
 		 166 aa  122  2e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000716484  hitchhiker  0.000000472968 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0175  50S ribosomal protein L10  41.36 
 
 		 165 aa  122  4e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000220587  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0449  50S ribosomal protein L10  44.16 
 
 		 175 aa  121  4e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0385  50S ribosomal protein L10  40.65 
 
 		 177 aa  121  5e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0360  50S ribosomal protein L10  40.65 
 
 		 177 aa  121  5e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2178  ribosomal protein L10  39.61 
 
 		 175 aa  120  8e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.905696 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0478  50S ribosomal protein L10  39.62 
 
 		 195 aa  120  8e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00597987  hitchhiker  0.00527924 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4758  50S ribosomal protein L10  38.18 
 
 		 166 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00494482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2108  50S ribosomal protein L10  40 
 
 		 175 aa  119  1.9999999999999998e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000349119  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2697  50S ribosomal protein L10P  41.4 
 
 		 172 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.561782  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0362  50S ribosomal protein L10  40.57 
 
 		 175 aa  119  3e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.656463 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0171  50S ribosomal protein L10  41.61 
 
 		 163 aa  119  3e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0111095  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2198  50S ribosomal protein L10  40 
 
 		 175 aa  118  3e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000000455583  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2038  50S ribosomal protein L10  44.16 
 
 		 175 aa  118  3.9999999999999996e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0258299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1821  50S ribosomal protein L10  42.68 
 
 		 172 aa  118  3.9999999999999996e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0871653  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002171  LSU ribosomal protein L10p (P0)  41.36 
 
 		 164 aa  118  3.9999999999999996e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000109594  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0596  50S ribosomal protein L10  40.7 
 
 		 172 aa  118  4.9999999999999996e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0140503  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0275  50S ribosomal protein L10  39.51 
 
 		 165 aa  117  9.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000206065  normal  0.0858323 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1898  50S ribosomal protein L10  40 
 
 		 175 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0976  50S ribosomal protein L10  41.62 
 
 		 195 aa  116  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0194348 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0139  50S ribosomal protein L10  40.96 
 
 		 166 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000054937  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00227  50S ribosomal protein L10  40.12 
 
 		 178 aa  116  1.9999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2868  50S ribosomal protein L10  40.12 
 
 		 164 aa  115  3e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000140329  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5206  50S ribosomal protein L10  42.21 
 
 		 166 aa  115  3e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000252117  unclonable  5.898740000000001e-26 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2958  50S ribosomal protein L10  42.68 
 
 		 172 aa  115  3.9999999999999997e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0648852 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4699  50S ribosomal protein L10  39.51 
 
 		 166 aa  114  5e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000246782  hitchhiker  0.00000548606 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3362  50S ribosomal protein L10  39.87 
 
 		 172 aa  114  6e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.256068  normal  0.223881 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0093  50S ribosomal protein L10  41.56 
 
 		 166 aa  114  6e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000759135  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0671  50S ribosomal protein L10  41.03 
 
 		 174 aa  114  6e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1864  50S ribosomal protein L10  40.91 
 
 		 174 aa  114  6.9999999999999995e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0922754  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0161  50S ribosomal protein L10  40.74 
 
 		 166 aa  114  6.9999999999999995e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000494732  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0325  50S ribosomal protein L10  40.91 
 
 		 174 aa  114  6.9999999999999995e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00522529  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>