More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2958 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_2958  50S ribosomal protein L10  100 
 
 
172 aa  335  9.999999999999999e-92  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0648852 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1954  50S ribosomal protein L10  78.36 
 
 
174 aa  271  4.0000000000000004e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.262202  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4497  50S ribosomal protein L10  65.7 
 
 
172 aa  219  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3477  50S ribosomal protein L10  63.74 
 
 
171 aa  217  6e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.232416  hitchhiker  0.0000717521 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3362  50S ribosomal protein L10  63.95 
 
 
172 aa  215  2e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.256068  normal  0.223881 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1822  50S ribosomal protein L10  62.79 
 
 
172 aa  214  5e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0362  50S ribosomal protein L10  64.57 
 
 
175 aa  213  9.999999999999999e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.656463 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3841  50S ribosomal protein L10  63.95 
 
 
172 aa  213  9.999999999999999e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0158219  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1898  50S ribosomal protein L10  64 
 
 
175 aa  211  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1322  50S ribosomal protein L10  62.21 
 
 
172 aa  210  7e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.850894  normal  0.161771 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4015  50S ribosomal protein L10  65.7 
 
 
172 aa  207  8e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.866731  normal  0.631329 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4384  50S ribosomal protein L10  65.7 
 
 
172 aa  207  8e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.313613 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1420  50S ribosomal protein L10  60.47 
 
 
172 aa  206  9e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.291032 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2697  50S ribosomal protein L10P  60.47 
 
 
172 aa  206  1e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.561782  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1345  50S ribosomal protein L10  61.63 
 
 
172 aa  206  2e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0320244  normal  0.100348 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1821  50S ribosomal protein L10  62.21 
 
 
172 aa  206  2e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0871653  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1945  50S ribosomal protein L10  60.47 
 
 
172 aa  203  1e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.137242  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1701  50S ribosomal protein L10  59.65 
 
 
171 aa  202  2e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.302531  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3689  50S ribosomal protein L10  60.47 
 
 
172 aa  199  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1207  50S ribosomal protein L10  59.88 
 
 
194 aa  199  9.999999999999999e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.347273  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1246  50S ribosomal protein L10  59.3 
 
 
172 aa  198  1.9999999999999998e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.208748  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2727  ribosomal protein L10  60.47 
 
 
172 aa  199  1.9999999999999998e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.12165  normal  0.845294 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0976  50S ribosomal protein L10  58.72 
 
 
195 aa  197  7.999999999999999e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0194348 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0569  50S ribosomal protein L10  55.81 
 
 
172 aa  191  6e-48  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000818206  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0029  50S ribosomal protein L10  61.9 
 
 
170 aa  189  2e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.167833  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5083  50S ribosomal protein L10  56.4 
 
 
172 aa  186  1e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.614366  normal  0.894165 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2283  50S ribosomal protein L10  58.14 
 
 
172 aa  186  1e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0400383  normal  0.2116 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3197  50S ribosomal protein L10  57.56 
 
 
172 aa  186  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.383116 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3460  50S ribosomal protein L10  57.56 
 
 
172 aa  182  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1348  50S ribosomal protein L10  55.81 
 
 
172 aa  180  7e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.223396  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1529  50S ribosomal protein L10  56.98 
 
 
172 aa  180  7e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.908936  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3866  ribosomal protein L10  58.48 
 
 
171 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0292685 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0789  50S ribosomal protein L10  52.91 
 
 
172 aa  171  5.999999999999999e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.305137 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0232  50S ribosomal protein L10  45.93 
 
 
172 aa  148  3e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0685965  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0745  50S ribosomal protein L10  43.86 
 
 
171 aa  140  9.999999999999999e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00501407 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0566  50S ribosomal protein L10  47.62 
 
 
170 aa  135  2e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0838  50S ribosomal protein L10P  42.44 
 
 
172 aa  134  4e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0707377  normal  0.0995834 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0265  50S ribosomal protein L10  45.93 
 
 
172 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1804  50S ribosomal protein L10P  42.77 
 
 
171 aa  126  2.0000000000000002e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.160084 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0337  50S ribosomal protein L10  43.27 
 
 
171 aa  123  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.635722  normal  0.581622 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1701  50S ribosomal protein L10  43.27 
 
 
171 aa  123  1e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.653585  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0351  50S ribosomal protein L10  43.27 
 
 
171 aa  123  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.703447 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2544  50S ribosomal protein L10  43.27 
 
 
171 aa  122  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3642  50S ribosomal protein L10  44.59 
 
 
183 aa  115  1.9999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.279713 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0586  50S ribosomal protein L10  44.52 
 
 
177 aa  115  3e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3453  50S ribosomal protein L10  42.68 
 
 
174 aa  114  5e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0925685  normal  0.446601 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0671  50S ribosomal protein L10  43.37 
 
 
174 aa  114  8.999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3594  50S ribosomal protein L10  43.87 
 
 
178 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.196569  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3869  50S ribosomal protein L10  45.16 
 
 
182 aa  113  2.0000000000000002e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0508  50S ribosomal protein L10  42.04 
 
 
175 aa  110  9e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.270625  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2223  50S ribosomal protein L10  38.79 
 
 
174 aa  110  9e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00194446 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3191  50S ribosomal protein L10  42.68 
 
 
173 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.579756  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2361  50S ribosomal protein L10  38.79 
 
 
174 aa  109  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1590  50S ribosomal protein L10  38.6 
 
 
174 aa  109  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4444  50S ribosomal protein L10  42.68 
 
 
176 aa  108  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.651473  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4533  50S ribosomal protein L10  42.04 
 
 
168 aa  109  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3899  50S ribosomal protein L10  41.4 
 
 
168 aa  108  3e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3248  50S ribosomal protein L10  41.4 
 
 
168 aa  108  3e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2273  50S ribosomal protein L10  38.79 
 
 
174 aa  108  3e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0408  50S ribosomal protein L10  42.67 
 
 
174 aa  108  4.0000000000000004e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.79305e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0617  50S ribosomal protein L10  41.57 
 
 
174 aa  107  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000383704 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17270  LSU ribosomal protein L10P  41.21 
 
 
173 aa  106  1e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2262  50S ribosomal protein L10  42.04 
 
 
174 aa  105  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.168271  normal  0.476107 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3337  50S ribosomal protein L10  38.73 
 
 
173 aa  105  3e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000271161 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0924  50S ribosomal protein L10  38.73 
 
 
173 aa  105  3e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1927  ribosomal protein L10  38.01 
 
 
176 aa  104  5e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0948645  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3328  50S ribosomal protein L10  37.5 
 
 
186 aa  103  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.211537 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3347  50S ribosomal protein L10  40.69 
 
 
167 aa  103  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.862427  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4318  50S ribosomal protein L10  37.5 
 
 
187 aa  103  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.561909  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3336  50S ribosomal protein L10  42.18 
 
 
173 aa  103  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6637  ribosomal protein L10  40.94 
 
 
184 aa  102  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.858869  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0757  50S ribosomal protein L10  34.3 
 
 
174 aa  102  3e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0270  50S ribosomal protein L10  36.05 
 
 
174 aa  102  3e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.247547  hitchhiker  0.00145059 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2722  ribosomal protein L10  39.52 
 
 
170 aa  101  4e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0525449  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0276  50S ribosomal protein L10  37.13 
 
 
175 aa  101  5e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000204852  hitchhiker  0.000495958 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3316  50S ribosomal protein L10  40.48 
 
 
168 aa  101  6e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.354504  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2969  50S ribosomal protein L10  40.48 
 
 
168 aa  101  6e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.45658 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0692  50S ribosomal protein L10  36.26 
 
 
172 aa  100  8e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000112903  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0040  50S ribosomal protein L10  41.06 
 
 
179 aa  100  1e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0245031  hitchhiker  0.0000000000023806 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0310  50S ribosomal protein L10  36.99 
 
 
165 aa  100  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0746923  normal  0.0249908 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0044  50S ribosomal protein L10  40.4 
 
 
215 aa  99.8  2e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000127438  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1337  50S ribosomal protein L10  37.79 
 
 
174 aa  99  3e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.900212  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1547  50S ribosomal protein L10  39.31 
 
 
173 aa  98.6  4e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.834427 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0700  ribosomal protein L10  34.68 
 
 
174 aa  98.2  5e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.299689  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1059  50S ribosomal protein L10  37.79 
 
 
174 aa  97.8  7e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0531801  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2164  50S ribosomal protein L10P  38.37 
 
 
174 aa  97.8  7e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0596262  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3036  50S ribosomal protein L10  38.01 
 
 
168 aa  97.1  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0878547 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10664  50S ribosomal protein L10  39.05 
 
 
178 aa  97.1  1e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.50048e-25  normal  0.41253 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1509  ribosomal protein L10  37.65 
 
 
176 aa  96.3  2e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000272992  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1124  ribosomal protein L10  38.15 
 
 
174 aa  95.9  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4018  ribosomal protein L10  35.26 
 
 
174 aa  95.5  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.491975 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1018  50S ribosomal protein L10  35.26 
 
 
178 aa  95.9  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00251564 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01070  ribosomal protein L10  36.63 
 
 
172 aa  95.5  3e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  5.51299e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0464  50S ribosomal protein L10  34.86 
 
 
179 aa  95.1  5e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0359791  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0310  ribosomal protein L10  40.27 
 
 
176 aa  94.7  5e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.109625  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0479  50S ribosomal protein L10  34.86 
 
 
179 aa  95.1  5e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.488036  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2865  50S ribosomal protein L10  37.21 
 
 
174 aa  94.7  6e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.161934  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0100  50S ribosomal protein L10  38.55 
 
 
166 aa  92.4  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000689021  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08440  ribosomal protein L10  42.36 
 
 
173 aa  92.8  2e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.166227  normal  0.704722 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0297  50S ribosomal protein L10  40.12 
 
 
172 aa  92.4  2e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>