More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0286 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_0286  ribosomal protein L10  100 
 
 		 166 aa  323  8.000000000000001e-88  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0147275  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0317  50S ribosomal protein L10  54.22 
 
 		 165 aa  167  8e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00438278  normal  0.203557 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2769  50S ribosomal protein L10  54.22 
 
 		 165 aa  167  8e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0338  50S ribosomal protein L10  54.22 
 
 		 165 aa  167  8e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.550948  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3437  50S ribosomal protein L10  53.01 
 
 		 165 aa  165  2.9999999999999998e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0867  50S ribosomal protein L10  50 
 
 		 175 aa  164  4e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0385  50S ribosomal protein L10  49.15 
 
 		 177 aa  162  1.0000000000000001e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0360  50S ribosomal protein L10  49.15 
 
 		 177 aa  162  1.0000000000000001e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3036  50S ribosomal protein L10  51.22 
 
 		 168 aa  162  2.0000000000000002e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0878547 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4285  ribosomal protein L10  51.81 
 
 		 166 aa  160  5.0000000000000005e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000716484  hitchhiker  0.000000472968 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2850  50S ribosomal protein L10  52.41 
 
 		 165 aa  160  6e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.675463 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0310  50S ribosomal protein L10  52.41 
 
 		 165 aa  159  1e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0746923  normal  0.0249908 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0275  50S ribosomal protein L10  50 
 
 		 165 aa  157  6e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000206065  normal  0.0858323 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2969  50S ribosomal protein L10  50.9 
 
 		 168 aa  156  1e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.45658 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3316  50S ribosomal protein L10  50.9 
 
 		 168 aa  156  1e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.354504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0596  50S ribosomal protein L10  50 
 
 		 172 aa  154  4e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0140503  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3733  50S ribosomal protein L10  49.39 
 
 		 165 aa  153  9e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3887  50S ribosomal protein L10  49.39 
 
 		 165 aa  153  9e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.452938  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2868  50S ribosomal protein L10  50.31 
 
 		 164 aa  153  1e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000140329  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0203  50S ribosomal protein L10  49.39 
 
 		 165 aa  152  2e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0744309  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0195  50S ribosomal protein L10  49.39 
 
 		 165 aa  151  2.9999999999999998e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000187486  normal  0.229046 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4557  50S ribosomal protein L10  49.39 
 
 		 165 aa  152  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.153585  hitchhiker  0.0000000000122855 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0314  ribosomal protein L10  45.4 
 
 		 175 aa  151  2.9999999999999998e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000329441  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4480  50S ribosomal protein L10  49.39 
 
 		 165 aa  152  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.375547  hitchhiker  0.00110307 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4483  50S ribosomal protein L10  49.39 
 
 		 165 aa  152  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.763348  hitchhiker  0.0000000000000236313 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4361  50S ribosomal protein L10  49.39 
 
 		 165 aa  152  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.43206  normal  0.360014 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4393  50S ribosomal protein L10  49.39 
 
 		 165 aa  152  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000406359  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0208  50S ribosomal protein L10  49.39 
 
 		 165 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000217712  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002171  LSU ribosomal protein L10p (P0)  49.7 
 
 		 164 aa  151  5e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000109594  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4771  50S ribosomal protein L10  50.3 
 
 		 164 aa  150  5.9999999999999996e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.709091  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06150  50S ribosomal protein L10  48.19 
 
 		 166 aa  150  5.9999999999999996e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0449  50S ribosomal protein L10  48.85 
 
 		 175 aa  150  7e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03861  50S ribosomal protein L10  49.39 
 
 		 165 aa  150  8e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000311393  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4010  ribosomal protein L10  49.39 
 
 		 165 aa  150  8e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000237202  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4433  50S ribosomal protein L10  49.39 
 
 		 165 aa  150  8e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000818528  hitchhiker  0.00000264015 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4473  50S ribosomal protein L10  49.39 
 
 		 165 aa  150  8e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000239877  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5450  50S ribosomal protein L10  49.39 
 
 		 165 aa  150  8e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000850473  hitchhiker  0.000626343 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4040  50S ribosomal protein L10  49.39 
 
 		 165 aa  150  8e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00830699  hitchhiker  0.000887574 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4525  50S ribosomal protein L10  49.39 
 
 		 165 aa  150  8e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000111294  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03814  hypothetical protein  49.39 
 
 		 165 aa  150  8e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000360524  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00227  50S ribosomal protein L10  49.7 
 
 		 178 aa  150  8e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4218  50S ribosomal protein L10  49.39 
 
 		 165 aa  150  8e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.4618e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4699  50S ribosomal protein L10  50.92 
 
 		 166 aa  149  1e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000246782  hitchhiker  0.00000548606 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5088  50S ribosomal protein L10  48.19 
 
 		 166 aa  149  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000128873  normal  0.821712 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0412  50S ribosomal protein L10P  50.9 
 
 		 167 aa  149  2e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.33563  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0828  50S ribosomal protein L10  46.99 
 
 		 166 aa  149  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0279492  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3336  50S ribosomal protein L10  51.32 
 
 		 173 aa  149  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08740  50S ribosomal protein L10  46.99 
 
 		 166 aa  149  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00037754 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0222  50S ribosomal protein L10  51.53 
 
 		 166 aa  148  3e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2178  ribosomal protein L10  50 
 
 		 175 aa  148  3e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.905696 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0190  50S ribosomal protein L10  51.53 
 
 		 166 aa  148  3e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000262315  hitchhiker  0.00315877 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0185  50S ribosomal protein L10  51.53 
 
 		 166 aa  148  3e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000592329  normal  0.0118628 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0190  50S ribosomal protein L10  51.53 
 
 		 166 aa  148  3e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000177262  hitchhiker  0.000758972 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0175  50S ribosomal protein L10  49.39 
 
 		 165 aa  148  4e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000220587  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3448  ribosomal protein L10  49.1 
 
 		 167 aa  147  5e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00000199113  hitchhiker  0.00604494 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0187  50S ribosomal protein L10  51.53 
 
 		 166 aa  147  6e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000330294  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0191  50S ribosomal protein L10  51.53 
 
 		 166 aa  147  6e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000192331  hitchhiker  0.000568378 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3768  50S ribosomal protein L10  51.53 
 
 		 166 aa  147  6e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000062266  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4065  50S ribosomal protein L10  51.53 
 
 		 166 aa  147  6e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000275908  hitchhiker  0.00991378 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0270  50S ribosomal protein L10  45.98 
 
 		 174 aa  147  6e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.247547  hitchhiker  0.00145059 
 
 
-
 
NC_009037  Sbal_4473  50S ribosomal protein L10  51.53 
 
 		 166 aa  147  6e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0171  50S ribosomal protein L10  50.31 
 
 		 163 aa  147  7e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0111095  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3191  50S ribosomal protein L10  49.07 
 
 		 173 aa  146  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.579756  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0445  50S ribosomal protein L10  46.99 
 
 		 166 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.470652  unclonable  0.000000241771 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4326  50S ribosomal protein L10  48.47 
 
 		 166 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000437071  unclonable  0.0000000000820773 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0475  50S ribosomal protein L10  46.99 
 
 		 166 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.372242  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2333  50S ribosomal protein L10  51.14 
 
 		 176 aa  145  3e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.275074  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2728  50S ribosomal protein L10  48.17 
 
 		 162 aa  145  3e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000179395  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3453  50S ribosomal protein L10  48.45 
 
 		 174 aa  145  3e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0925685  normal  0.446601 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0149  50S ribosomal protein L10  48.78 
 
 		 165 aa  144  4.0000000000000006e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000191294  normal  0.034689 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2808  50S ribosomal protein L10  47.56 
 
 		 165 aa  144  5e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000036942  normal  0.222423 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3347  50S ribosomal protein L10  49.32 
 
 		 167 aa  144  5e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.862427  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3862  50S ribosomal protein L10  47.56 
 
 		 165 aa  144  5e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000104786  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0325  50S ribosomal protein L10  45.4 
 
 		 174 aa  144  5e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00522529  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1864  50S ribosomal protein L10  45.4 
 
 		 174 aa  144  5e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0922754  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0337  50S ribosomal protein L10  47.56 
 
 		 165 aa  144  5e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.239078  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0757  50S ribosomal protein L10  42.53 
 
 		 174 aa  144  6e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0266  50S ribosomal protein L10  52.41 
 
 		 165 aa  144  8.000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.646007  normal  0.635943 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2643  50S ribosomal protein L10  53.01 
 
 		 165 aa  143  8.000000000000001e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3788  50S ribosomal protein L10  53.01 
 
 		 165 aa  143  8.000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.166109  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1912  50S ribosomal protein L10  53.01 
 
 		 165 aa  143  8.000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000184172  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0239  50S ribosomal protein L10  53.01 
 
 		 165 aa  144  8.000000000000001e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0229066 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0478  50S ribosomal protein L10  46.39 
 
 		 195 aa  143  9e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00597987  hitchhiker  0.00527924 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3078  50S ribosomal protein L10  53.01 
 
 		 165 aa  143  1e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.892062  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4758  50S ribosomal protein L10  45.78 
 
 		 166 aa  143  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00494482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3818  50S ribosomal protein L10  53.05 
 
 		 184 aa  141  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.881367  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4557  50S ribosomal protein L10  45.78 
 
 		 166 aa  141  3e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.669843  decreased coverage  0.0090203 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3467  50S ribosomal protein L10  53.05 
 
 		 184 aa  141  3e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0108818  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3756  50S ribosomal protein L10  53.05 
 
 		 184 aa  141  3e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0407684  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3918  50S ribosomal protein L10  45.18 
 
 		 166 aa  141  4e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0617  ribosomal protein L10  45.78 
 
 		 166 aa  141  4e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.532211  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0257  50S ribosomal protein L10  51.81 
 
 		 188 aa  141  5e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0591157  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0161  50S ribosomal protein L10  49.69 
 
 		 166 aa  140  6e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000494732  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0139  50S ribosomal protein L10  49.08 
 
 		 166 aa  140  7e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000054937  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1889  50S ribosomal protein L10  49.43 
 
 		 175 aa  140  8e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00905403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0922  50S ribosomal protein L10  43.93 
 
 		 176 aa  139  9.999999999999999e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00116615  hitchhiker  0.00000161737 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2179  50S ribosomal protein L10  48.85 
 
 		 175 aa  139  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.82519  normal  0.0244994 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04532  50S ribosomal protein L10  45.96 
 
 		 177 aa  139  1.9999999999999998e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.165522  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2038  50S ribosomal protein L10  51.3 
 
 		 175 aa  139  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0258299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3180  50S ribosomal protein L10  53.24 
 
 		 140 aa  138  3e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000385503  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>