More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2697 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2697  50S ribosomal protein L10P  100 
 
 		 172 aa  347  5e-95  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.561782  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2727  ribosomal protein L10  62.79 
 
 		 172 aa  221  4e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.12165  normal  0.845294 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2958  50S ribosomal protein L10  60.47 
 
 		 172 aa  206  1e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0648852 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1822  50S ribosomal protein L10  56.98 
 
 		 172 aa  202  2e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1945  50S ribosomal protein L10  56.4 
 
 		 172 aa  200  9e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.137242  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1246  50S ribosomal protein L10  55.81 
 
 		 172 aa  198  1.9999999999999998e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.208748  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1322  50S ribosomal protein L10  55.81 
 
 		 172 aa  198  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.850894  normal  0.161771 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2283  50S ribosomal protein L10  56.98 
 
 		 172 aa  198  3e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0400383  normal  0.2116 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1821  50S ribosomal protein L10  56.98 
 
 		 172 aa  197  6e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0871653  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1207  50S ribosomal protein L10  55.81 
 
 		 194 aa  197  6e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.347273  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3197  50S ribosomal protein L10  56.4 
 
 		 172 aa  197  9e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.383116 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3689  50S ribosomal protein L10  56.4 
 
 		 172 aa  196  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1420  50S ribosomal protein L10  54.65 
 
 		 172 aa  196  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.291032 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0976  50S ribosomal protein L10  54.65 
 
 		 195 aa  196  1.0000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0194348 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3477  50S ribosomal protein L10  55.56 
 
 		 171 aa  196  2.0000000000000003e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.232416  hitchhiker  0.0000717521 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1954  50S ribosomal protein L10  55.56 
 
 		 174 aa  194  5.000000000000001e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.262202  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1701  50S ribosomal protein L10  55.56 
 
 		 171 aa  194  6e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.302531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1345  50S ribosomal protein L10  54.65 
 
 		 172 aa  194  7e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0320244  normal  0.100348 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3362  50S ribosomal protein L10  54.65 
 
 		 172 aa  193  8.000000000000001e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.256068  normal  0.223881 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4497  50S ribosomal protein L10  55.23 
 
 		 172 aa  192  1e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1348  50S ribosomal protein L10  54.65 
 
 		 172 aa  193  1e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.223396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3460  50S ribosomal protein L10  55.23 
 
 		 172 aa  192  3e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3841  50S ribosomal protein L10  54.07 
 
 		 172 aa  190  7e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0158219  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0362  50S ribosomal protein L10  53.71 
 
 		 175 aa  188  2e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.656463 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1529  50S ribosomal protein L10  54.07 
 
 		 172 aa  187  5e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.908936  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5083  50S ribosomal protein L10  53.49 
 
 		 172 aa  187  5e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.614366  normal  0.894165 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1898  50S ribosomal protein L10  54.22 
 
 		 175 aa  186  1e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0569  50S ribosomal protein L10  52.33 
 
 		 172 aa  185  2e-46  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000818206  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4015  50S ribosomal protein L10  55.23 
 
 		 172 aa  184  5e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.866731  normal  0.631329 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4384  50S ribosomal protein L10  55.23 
 
 		 172 aa  184  5e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.313613 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0789  50S ribosomal protein L10  53.49 
 
 		 172 aa  183  1.0000000000000001e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.305137 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0029  50S ribosomal protein L10  59.06 
 
 		 170 aa  179  2e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.167833  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3866  ribosomal protein L10  53.22 
 
 		 171 aa  162  3e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0292685 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0232  50S ribosomal protein L10  46.51 
 
 		 172 aa  162  3e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0685965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0838  50S ribosomal protein L10P  46.51 
 
 		 172 aa  161  4.0000000000000004e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0707377  normal  0.0995834 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1804  50S ribosomal protein L10P  47.37 
 
 		 171 aa  155  3e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.160084 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0745  50S ribosomal protein L10  45.03 
 
 		 171 aa  152  2.9999999999999998e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00501407 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1701  50S ribosomal protein L10  45.03 
 
 		 171 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.653585  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0337  50S ribosomal protein L10  45.03 
 
 		 171 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.635722  normal  0.581622 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2544  50S ribosomal protein L10  45.03 
 
 		 171 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0351  50S ribosomal protein L10  45.03 
 
 		 171 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.703447 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0566  50S ribosomal protein L10  45.83 
 
 		 170 aa  138  3e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2361  50S ribosomal protein L10  43.64 
 
 		 174 aa  137  4.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0265  50S ribosomal protein L10  45.35 
 
 		 172 aa  137  8.999999999999999e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2273  50S ribosomal protein L10  43.03 
 
 		 174 aa  135  2e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1590  50S ribosomal protein L10  43.64 
 
 		 174 aa  135  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2223  50S ribosomal protein L10  41.82 
 
 		 174 aa  133  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00194446 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0096  50S ribosomal protein L10  45.83 
 
 		 166 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0757  50S ribosomal protein L10  41.72 
 
 		 174 aa  130  9e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0100  50S ribosomal protein L10  46.41 
 
 		 166 aa  129  3e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000689021  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0270  50S ribosomal protein L10  41.67 
 
 		 174 aa  128  5.0000000000000004e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.247547  hitchhiker  0.00145059 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3036  50S ribosomal protein L10  42.11 
 
 		 168 aa  127  8.000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0878547 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3336  50S ribosomal protein L10  43.92 
 
 		 173 aa  127  9.000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0310  50S ribosomal protein L10  41.28 
 
 		 165 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0746923  normal  0.0249908 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3191  50S ribosomal protein L10  42.01 
 
 		 173 aa  126  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.579756  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0700  ribosomal protein L10  39.88 
 
 		 174 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.299689  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2969  50S ribosomal protein L10  42.01 
 
 		 168 aa  124  5e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.45658 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3316  50S ribosomal protein L10  42.01 
 
 		 168 aa  124  5e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.354504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3347  50S ribosomal protein L10  42.76 
 
 		 167 aa  124  6e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.862427  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2769  50S ribosomal protein L10  39.18 
 
 		 165 aa  121  6e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0338  50S ribosomal protein L10  39.18 
 
 		 165 aa  121  6e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.550948  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0317  50S ribosomal protein L10  39.18 
 
 		 165 aa  121  6e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00438278  normal  0.203557 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3437  50S ribosomal protein L10  38.6 
 
 		 165 aa  120  7e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153429  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2850  50S ribosomal protein L10  38.24 
 
 		 165 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.675463 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3453  50S ribosomal protein L10  41.4 
 
 		 174 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0925685  normal  0.446601 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01070  ribosomal protein L10  39.63 
 
 		 172 aa  119  3e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  5.51299e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0408  50S ribosomal protein L10  39.87 
 
 		 174 aa  118  3.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.79305e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0508  50S ribosomal protein L10  42.68 
 
 		 175 aa  118  4.9999999999999996e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.270625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4533  50S ribosomal protein L10  42.68 
 
 		 168 aa  117  9e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17270  LSU ribosomal protein L10P  41.82 
 
 		 173 aa  117  9e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3642  50S ribosomal protein L10  42.04 
 
 		 183 aa  115  3e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.279713 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3248  50S ribosomal protein L10  42.04 
 
 		 168 aa  115  3.9999999999999997e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0310  ribosomal protein L10  38.92 
 
 		 176 aa  114  3.9999999999999997e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.109625  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3899  50S ribosomal protein L10  42.04 
 
 		 168 aa  115  3.9999999999999997e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0040  50S ribosomal protein L10  40.67 
 
 		 179 aa  114  5e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0245031  hitchhiker  0.0000000000023806 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0044  50S ribosomal protein L10  40 
 
 		 215 aa  114  8.999999999999998e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000127438  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0586  50S ribosomal protein L10  41.94 
 
 		 177 aa  114  8.999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0692  50S ribosomal protein L10  35.67 
 
 		 172 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000112903  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3594  50S ribosomal protein L10  41.29 
 
 		 178 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.196569  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3869  50S ribosomal protein L10  40 
 
 		 182 aa  113  2.0000000000000002e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0396  50S ribosomal protein L10  43.26 
 
 		 173 aa  112  3e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.252363  hitchhiker  0.00709296 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2722  ribosomal protein L10  40 
 
 		 170 aa  111  4.0000000000000004e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0525449  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0671  50S ribosomal protein L10  39.16 
 
 		 174 aa  111  5e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4444  50S ribosomal protein L10  40.76 
 
 		 176 aa  110  8.000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.651473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1387  50S ribosomal protein L10  42.26 
 
 		 171 aa  110  9e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000123079  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0576  50S ribosomal protein L10  39.35 
 
 		 166 aa  108  3e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000179203  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2262  50S ribosomal protein L10  41.4 
 
 		 174 aa  108  3e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.168271  normal  0.476107 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0562  50S ribosomal protein L10  39.35 
 
 		 166 aa  108  3e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000233555  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10664  50S ribosomal protein L10  38.24 
 
 		 178 aa  107  8.000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.50048e-25  normal  0.41253 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1124  ribosomal protein L10  38.73 
 
 		 174 aa  107  9.000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0239  50S ribosomal protein L10  39.18 
 
 		 165 aa  106  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0229066 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2643  50S ribosomal protein L10  39.18 
 
 		 165 aa  106  1e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3788  50S ribosomal protein L10  39.18 
 
 		 165 aa  106  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.166109  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2722  50S ribosomal protein L10P  36.31 
 
 		 178 aa  107  1e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000314918  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1912  50S ribosomal protein L10  39.18 
 
 		 165 aa  106  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000184172  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1059  50S ribosomal protein L10  37.21 
 
 		 174 aa  106  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0531801  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0180  50S ribosomal protein L10  38.06 
 
 		 166 aa  105  2e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0693527  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3078  50S ribosomal protein L10  39.18 
 
 		 165 aa  106  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.892062  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0297  50S ribosomal protein L10  38.24 
 
 		 172 aa  106  2e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0093  50S ribosomal protein L10  38.71 
 
 		 166 aa  106  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000759135  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>