More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1529 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_1529  50S ribosomal protein L10  100 
 
 		 172 aa  335  9.999999999999999e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.908936  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1348  50S ribosomal protein L10  92.44 
 
 		 172 aa  313  8e-85  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.223396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3197  50S ribosomal protein L10  93.02 
 
 		 172 aa  312  9.999999999999999e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.383116 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3460  50S ribosomal protein L10  93.02 
 
 		 172 aa  310  5.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2283  50S ribosomal protein L10  92.44 
 
 		 172 aa  309  1e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0400383  normal  0.2116 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5083  50S ribosomal protein L10  88.95 
 
 		 172 aa  302  2.0000000000000002e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.614366  normal  0.894165 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3689  50S ribosomal protein L10  88.95 
 
 		 172 aa  299  1e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3362  50S ribosomal protein L10  73.84 
 
 		 172 aa  255  3e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.256068  normal  0.223881 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1345  50S ribosomal protein L10  70.93 
 
 		 172 aa  244  4e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0320244  normal  0.100348 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4497  50S ribosomal protein L10  71.51 
 
 		 172 aa  239  1e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0362  50S ribosomal protein L10  70.29 
 
 		 175 aa  234  3e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.656463 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3841  50S ribosomal protein L10  70.35 
 
 		 172 aa  233  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0158219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1898  50S ribosomal protein L10  70 
 
 		 175 aa  233  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4015  50S ribosomal protein L10  71.51 
 
 		 172 aa  224  4e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.866731  normal  0.631329 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4384  50S ribosomal protein L10  71.51 
 
 		 172 aa  224  4e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.313613 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1821  50S ribosomal protein L10  64.53 
 
 		 172 aa  218  1.9999999999999999e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0871653  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1945  50S ribosomal protein L10  62.79 
 
 		 172 aa  219  1.9999999999999999e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.137242  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1246  50S ribosomal protein L10  62.21 
 
 		 172 aa  217  6e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.208748  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2727  ribosomal protein L10  63.95 
 
 		 172 aa  217  6e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.12165  normal  0.845294 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1822  50S ribosomal protein L10  62.79 
 
 		 172 aa  217  7e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1207  50S ribosomal protein L10  62.21 
 
 		 194 aa  216  1e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.347273  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1322  50S ribosomal protein L10  61.63 
 
 		 172 aa  215  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.850894  normal  0.161771 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3866  ribosomal protein L10  69.01 
 
 		 171 aa  213  9e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0292685 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1420  50S ribosomal protein L10  59.88 
 
 		 172 aa  212  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.291032 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0976  50S ribosomal protein L10  60.47 
 
 		 195 aa  211  3.9999999999999995e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0194348 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0569  50S ribosomal protein L10  59.3 
 
 		 172 aa  205  3e-52  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000818206  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1701  50S ribosomal protein L10  61.4 
 
 		 171 aa  204  4e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.302531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3477  50S ribosomal protein L10  60.23 
 
 		 171 aa  192  1e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.232416  hitchhiker  0.0000717521 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2697  50S ribosomal protein L10P  54.07 
 
 		 172 aa  187  5e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.561782  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1954  50S ribosomal protein L10  56.73 
 
 		 174 aa  187  8e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.262202  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2958  50S ribosomal protein L10  56.98 
 
 		 172 aa  180  7e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0648852 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0029  50S ribosomal protein L10  57.4 
 
 		 170 aa  169  2e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.167833  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0232  50S ribosomal protein L10  50 
 
 		 172 aa  167  5e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0685965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0566  50S ribosomal protein L10  52.07 
 
 		 170 aa  166  1e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0745  50S ribosomal protein L10  52.47 
 
 		 171 aa  166  1e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00501407 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0789  50S ribosomal protein L10  48.84 
 
 		 172 aa  162  2.0000000000000002e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.305137 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0351  50S ribosomal protein L10  53.09 
 
 		 171 aa  153  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.703447 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1701  50S ribosomal protein L10  53.09 
 
 		 171 aa  153  1e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.653585  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0337  50S ribosomal protein L10  53.09 
 
 		 171 aa  153  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.635722  normal  0.581622 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2544  50S ribosomal protein L10  53.09 
 
 		 171 aa  152  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0265  50S ribosomal protein L10  50.58 
 
 		 172 aa  151  5e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1804  50S ribosomal protein L10P  43.27 
 
 		 171 aa  140  9.999999999999999e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.160084 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0838  50S ribosomal protein L10P  43.6 
 
 		 172 aa  131  5e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0707377  normal  0.0995834 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3191  50S ribosomal protein L10  44.78 
 
 		 173 aa  108  4.0000000000000004e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.579756  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0692  50S ribosomal protein L10  37.84 
 
 		 172 aa  106  1e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000112903  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2969  50S ribosomal protein L10  44.78 
 
 		 168 aa  105  4e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.45658 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3316  50S ribosomal protein L10  44.78 
 
 		 168 aa  105  4e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.354504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4018  ribosomal protein L10  37.82 
 
 		 174 aa  103  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.491975 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0700  ribosomal protein L10  36.31 
 
 		 174 aa  103  2e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.299689  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3336  50S ribosomal protein L10  42.52 
 
 		 173 aa  101  4e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2361  50S ribosomal protein L10  36.26 
 
 		 174 aa  101  5e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08440  ribosomal protein L10  40.36 
 
 		 173 aa  101  5e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.166227  normal  0.704722 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1590  50S ribosomal protein L10  36.84 
 
 		 174 aa  100  7e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0270  50S ribosomal protein L10  36.53 
 
 		 174 aa  100  8e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.247547  hitchhiker  0.00145059 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2273  50S ribosomal protein L10  36.26 
 
 		 174 aa  100  9e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0276  50S ribosomal protein L10  36.54 
 
 		 175 aa  99.4  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000204852  hitchhiker  0.000495958 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0385  50S ribosomal protein L10  38.55 
 
 		 177 aa  98.6  4e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0360  50S ribosomal protein L10  38.55 
 
 		 177 aa  98.6  4e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3869  50S ribosomal protein L10  40.6 
 
 		 182 aa  98.6  4e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3036  50S ribosomal protein L10  42.54 
 
 		 168 aa  97.8  7e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0878547 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6637  ribosomal protein L10  39.77 
 
 		 184 aa  96.7  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.858869  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2223  50S ribosomal protein L10  33.33 
 
 		 174 aa  97.1  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00194446 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0562  50S ribosomal protein L10  40.69 
 
 		 166 aa  95.9  3e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000233555  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0180  50S ribosomal protein L10  39.31 
 
 		 166 aa  95.9  3e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0693527  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0408  50S ribosomal protein L10  37.25 
 
 		 174 aa  95.9  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.79305e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0576  50S ribosomal protein L10  40.69 
 
 		 166 aa  95.9  3e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000179203  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0671  50S ribosomal protein L10  37.95 
 
 		 174 aa  95.5  3e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4533  50S ribosomal protein L10  41.67 
 
 		 168 aa  95.5  4e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0698  50S ribosomal protein L10  40.35 
 
 		 228 aa  95.1  4e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0183  ribosomal protein L10  36.26 
 
 		 176 aa  95.1  4e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000324199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3248  50S ribosomal protein L10  41.03 
 
 		 168 aa  94.7  5e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3899  50S ribosomal protein L10  41.03 
 
 		 168 aa  94.7  5e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2262  50S ribosomal protein L10  38.22 
 
 		 174 aa  94.7  6e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.168271  normal  0.476107 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17270  LSU ribosomal protein L10P  37.36 
 
 		 173 aa  94.4  6e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4318  50S ribosomal protein L10  37.06 
 
 		 187 aa  94.4  8e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.561909  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0508  50S ribosomal protein L10  41.67 
 
 		 175 aa  94.4  8e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.270625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0867  50S ribosomal protein L10  35.71 
 
 		 175 aa  94  9e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0040  50S ribosomal protein L10  39.37 
 
 		 179 aa  94  9e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0245031  hitchhiker  0.0000000000023806 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0044  50S ribosomal protein L10  39.37 
 
 		 215 aa  93.6  1e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000127438  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0096  50S ribosomal protein L10  37.5 
 
 		 166 aa  93.6  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0757  50S ribosomal protein L10  35.57 
 
 		 174 aa  93.6  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0922  50S ribosomal protein L10  35.71 
 
 		 176 aa  94  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00116615  hitchhiker  0.00000161737 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0586  50S ribosomal protein L10  41.79 
 
 		 177 aa  93.6  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0313  50S ribosomal protein L10  34.71 
 
 		 166 aa  93.2  2e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000558823  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0488  50S ribosomal protein L10  39.29 
 
 		 173 aa  92.8  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.169718  hitchhiker  0.00000169108 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3594  50S ribosomal protein L10  40.25 
 
 		 178 aa  93.2  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.196569  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0317  50S ribosomal protein L10  39.29 
 
 		 173 aa  92.8  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.146286  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3453  50S ribosomal protein L10  42.42 
 
 		 174 aa  92  3e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0925685  normal  0.446601 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2178  ribosomal protein L10  37.41 
 
 		 175 aa  92.4  3e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.905696 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1927  ribosomal protein L10  34.68 
 
 		 176 aa  92.4  3e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0948645  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1509  ribosomal protein L10  33.71 
 
 		 176 aa  92  4e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000272992  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3337  50S ribosomal protein L10  33.53 
 
 		 173 aa  91.7  5e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000271161 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0924  50S ribosomal protein L10  33.53 
 
 		 173 aa  91.7  5e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4444  50S ribosomal protein L10  36.94 
 
 		 176 aa  91.3  6e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.651473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3328  50S ribosomal protein L10  37.06 
 
 		 186 aa  91.3  6e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.211537 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5206  50S ribosomal protein L10  36.11 
 
 		 166 aa  91.3  6e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000252117  unclonable  5.898740000000001e-26 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0710  50S ribosomal protein L10  37.04 
 
 		 176 aa  91.3  6e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.303715  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0099  50S ribosomal protein L10  36.11 
 
 		 166 aa  90.9  8e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000477259  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2470  50S ribosomal protein L10  33.33 
 
 		 176 aa  90.9  8e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0147283  hitchhiker  0.00682166 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0130  50S ribosomal protein L10  36.11 
 
 		 166 aa  90.9  8e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000124346  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>