More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1804 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1804  50S ribosomal protein L10P  100 
 
 
171 aa  341  2.9999999999999997e-93  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.160084 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0232  50S ribosomal protein L10  54.39 
 
 
172 aa  179  2e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0685965  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0745  50S ribosomal protein L10  53.57 
 
 
171 aa  171  3.9999999999999995e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00501407 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1945  50S ribosomal protein L10  53.09 
 
 
172 aa  167  8e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.137242  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1246  50S ribosomal protein L10  51.43 
 
 
172 aa  166  1e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.208748  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1207  50S ribosomal protein L10  52.47 
 
 
194 aa  163  9e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.347273  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2727  ribosomal protein L10  48.54 
 
 
172 aa  162  2.0000000000000002e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.12165  normal  0.845294 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0265  50S ribosomal protein L10  54.97 
 
 
172 aa  162  3e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1701  50S ribosomal protein L10  54.17 
 
 
171 aa  160  7e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.653585  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0337  50S ribosomal protein L10  54.17 
 
 
171 aa  160  7e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.635722  normal  0.581622 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0351  50S ribosomal protein L10  54.17 
 
 
171 aa  160  7e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.703447 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2544  50S ribosomal protein L10  54.17 
 
 
171 aa  160  8.000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1821  50S ribosomal protein L10  49.71 
 
 
172 aa  157  9e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0871653  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0976  50S ribosomal protein L10  47.95 
 
 
195 aa  156  1e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0194348 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2697  50S ribosomal protein L10P  47.37 
 
 
172 aa  155  3e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.561782  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0569  50S ribosomal protein L10  48.54 
 
 
172 aa  155  3e-37  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000818206  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0566  50S ribosomal protein L10  50.89 
 
 
170 aa  154  7e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1322  50S ribosomal protein L10  48.43 
 
 
172 aa  152  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.850894  normal  0.161771 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1822  50S ribosomal protein L10  48.43 
 
 
172 aa  151  2.9999999999999998e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1420  50S ribosomal protein L10  47.17 
 
 
172 aa  150  5.9999999999999996e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.291032 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0789  50S ribosomal protein L10  45.56 
 
 
172 aa  147  5e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.305137 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3197  50S ribosomal protein L10  43.86 
 
 
172 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.383116 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3689  50S ribosomal protein L10  43.86 
 
 
172 aa  144  5e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2283  50S ribosomal protein L10  43.86 
 
 
172 aa  144  5e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0400383  normal  0.2116 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3362  50S ribosomal protein L10  46.54 
 
 
172 aa  144  6e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.256068  normal  0.223881 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0029  50S ribosomal protein L10  52.2 
 
 
170 aa  143  1e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.167833  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1898  50S ribosomal protein L10  47.8 
 
 
175 aa  142  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3841  50S ribosomal protein L10  47.8 
 
 
172 aa  142  3e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0158219  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4497  50S ribosomal protein L10  47.17 
 
 
172 aa  142  3e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1348  50S ribosomal protein L10  43.27 
 
 
172 aa  140  6e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.223396  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3460  50S ribosomal protein L10  43.27 
 
 
172 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1529  50S ribosomal protein L10  43.27 
 
 
172 aa  140  9.999999999999999e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.908936  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1345  50S ribosomal protein L10  44.44 
 
 
172 aa  139  1.9999999999999998e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0320244  normal  0.100348 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1701  50S ribosomal protein L10  47.8 
 
 
171 aa  137  6e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.302531  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0362  50S ribosomal protein L10  47.17 
 
 
175 aa  136  1e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.656463 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5083  50S ribosomal protein L10  42.69 
 
 
172 aa  136  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.614366  normal  0.894165 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3477  50S ribosomal protein L10  46.51 
 
 
171 aa  135  4e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.232416  hitchhiker  0.0000717521 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1954  50S ribosomal protein L10  43.4 
 
 
174 aa  134  5e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.262202  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4015  50S ribosomal protein L10  47.17 
 
 
172 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.866731  normal  0.631329 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4384  50S ribosomal protein L10  47.17 
 
 
172 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.313613 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2958  50S ribosomal protein L10  42.77 
 
 
172 aa  126  2.0000000000000002e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0648852 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0838  50S ribosomal protein L10P  39.77 
 
 
172 aa  126  2.0000000000000002e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0707377  normal  0.0995834 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3866  ribosomal protein L10  45.83 
 
 
171 aa  123  1e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0292685 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0700  ribosomal protein L10  39.53 
 
 
174 aa  118  4.9999999999999996e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.299689  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2850  50S ribosomal protein L10  39.29 
 
 
165 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.675463 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01070  ribosomal protein L10  39.77 
 
 
172 aa  114  7.999999999999999e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  5.51299e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3036  50S ribosomal protein L10  40.49 
 
 
168 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0878547 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4018  ribosomal protein L10  36.59 
 
 
174 aa  112  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.491975 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0317  50S ribosomal protein L10  38.01 
 
 
165 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00438278  normal  0.203557 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3437  50S ribosomal protein L10  39.74 
 
 
165 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153429  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2769  50S ribosomal protein L10  38.01 
 
 
165 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0338  50S ribosomal protein L10  38.01 
 
 
165 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.550948  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3336  50S ribosomal protein L10  42.75 
 
 
173 aa  109  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4444  50S ribosomal protein L10  40.54 
 
 
176 aa  107  5e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.651473  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2223  50S ribosomal protein L10  38.46 
 
 
174 aa  107  8.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00194446 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2361  50S ribosomal protein L10  36.69 
 
 
174 aa  106  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3191  50S ribosomal protein L10  41.98 
 
 
173 aa  106  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.579756  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3642  50S ribosomal protein L10  40.52 
 
 
183 aa  106  1e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.279713 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0096  50S ribosomal protein L10  40.96 
 
 
166 aa  105  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0757  50S ribosomal protein L10  41.67 
 
 
174 aa  105  4e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2273  50S ribosomal protein L10  36.69 
 
 
174 aa  105  4e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0508  50S ribosomal protein L10  40.54 
 
 
175 aa  105  4e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.270625  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3756  50S ribosomal protein L10  40.67 
 
 
184 aa  104  6e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0407684  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0239  50S ribosomal protein L10  40.67 
 
 
165 aa  104  6e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0229066 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3818  50S ribosomal protein L10  40.67 
 
 
184 aa  104  6e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.881367  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3467  50S ribosomal protein L10  40.67 
 
 
184 aa  104  6e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0108818  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0270  50S ribosomal protein L10  35.93 
 
 
174 aa  104  7e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.247547  hitchhiker  0.00145059 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4533  50S ribosomal protein L10  40.54 
 
 
168 aa  104  7e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3654  50S ribosomal protein L10  40.14 
 
 
167 aa  103  8e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0512272  hitchhiker  0.000000643388 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2643  50S ribosomal protein L10  40.67 
 
 
165 aa  103  8e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3788  50S ribosomal protein L10  40.67 
 
 
165 aa  103  8e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.166109  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1912  50S ribosomal protein L10  40.67 
 
 
165 aa  103  8e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000184172  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3078  50S ribosomal protein L10  40.67 
 
 
165 aa  103  8e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.892062  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0304  50S ribosomal protein L10  40.14 
 
 
167 aa  103  8e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.125975  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0586  50S ribosomal protein L10  39.38 
 
 
177 aa  103  9e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2969  50S ribosomal protein L10  41.22 
 
 
168 aa  103  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.45658 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3248  50S ribosomal protein L10  39.86 
 
 
168 aa  103  1e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3594  50S ribosomal protein L10  39.1 
 
 
178 aa  103  1e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.196569  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3899  50S ribosomal protein L10  39.86 
 
 
168 aa  103  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3316  50S ribosomal protein L10  41.22 
 
 
168 aa  103  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.354504  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0226  ribosomal protein L10  36.69 
 
 
173 aa  102  3e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0266  50S ribosomal protein L10  39.33 
 
 
165 aa  102  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.646007  normal  0.635943 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3453  50S ribosomal protein L10  36.65 
 
 
174 aa  101  4e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0925685  normal  0.446601 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2722  ribosomal protein L10  38.92 
 
 
170 aa  101  5e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0525449  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08440  ribosomal protein L10  38.79 
 
 
173 aa  101  5e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.166227  normal  0.704722 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1590  50S ribosomal protein L10  36.88 
 
 
174 aa  101  5e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3347  50S ribosomal protein L10  41.98 
 
 
167 aa  101  6e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.862427  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0257  50S ribosomal protein L10  38.67 
 
 
188 aa  100  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0591157  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3180  50S ribosomal protein L10  39.86 
 
 
140 aa  100  1e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000385503  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0100  50S ribosomal protein L10  44.7 
 
 
166 aa  100  1e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000689021  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0488  50S ribosomal protein L10  43.18 
 
 
173 aa  99.4  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.169718  hitchhiker  0.00000169108 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0317  50S ribosomal protein L10  43.18 
 
 
173 aa  99.4  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.146286  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3869  50S ribosomal protein L10  40.74 
 
 
182 aa  98.6  3e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0408  50S ribosomal protein L10  34.88 
 
 
174 aa  99  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.79305e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2262  50S ribosomal protein L10  40 
 
 
174 aa  99  3e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.168271  normal  0.476107 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17270  LSU ribosomal protein L10P  35.8 
 
 
173 aa  98.6  3e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3935  50S ribosomal protein L10  39.53 
 
 
181 aa  98.6  4e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.193843  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0040  50S ribosomal protein L10  37.67 
 
 
179 aa  98.6  4e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0245031  hitchhiker  0.0000000000023806 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0310  ribosomal protein L10  40.24 
 
 
176 aa  98.2  5e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.109625  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0044  50S ribosomal protein L10  36.99 
 
 
215 aa  97.8  6e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000127438  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>