More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3866 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_3866  ribosomal protein L10  100 
 
 		 171 aa  336  9.999999999999999e-92  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0292685 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1345  50S ribosomal protein L10  79.53 
 
 		 172 aa  271  2.0000000000000002e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0320244  normal  0.100348 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3362  50S ribosomal protein L10  74.27 
 
 		 172 aa  260  6.999999999999999e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.256068  normal  0.223881 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0362  50S ribosomal protein L10  73.65 
 
 		 175 aa  247  5e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.656463 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5083  50S ribosomal protein L10  71.35 
 
 		 172 aa  246  8e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.614366  normal  0.894165 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4497  50S ribosomal protein L10  72.51 
 
 		 172 aa  246  8e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1898  50S ribosomal protein L10  72.46 
 
 		 175 aa  243  8e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3689  50S ribosomal protein L10  69.01 
 
 		 172 aa  243  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3841  50S ribosomal protein L10  70.76 
 
 		 172 aa  241  5e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0158219  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2283  50S ribosomal protein L10  69.01 
 
 		 172 aa  238  2e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0400383  normal  0.2116 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3197  50S ribosomal protein L10  68.42 
 
 		 172 aa  238  2e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.383116 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1529  50S ribosomal protein L10  69.01 
 
 		 172 aa  239  2e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.908936  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1348  50S ribosomal protein L10  66.67 
 
 		 172 aa  237  6.999999999999999e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.223396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3460  50S ribosomal protein L10  68.42 
 
 		 172 aa  234  5.0000000000000005e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1322  50S ribosomal protein L10  66.08 
 
 		 172 aa  233  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.850894  normal  0.161771 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1822  50S ribosomal protein L10  64.91 
 
 		 172 aa  230  6e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1821  50S ribosomal protein L10  67.25 
 
 		 172 aa  229  1e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0871653  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1945  50S ribosomal protein L10  66.08 
 
 		 172 aa  228  3e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.137242  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0976  50S ribosomal protein L10  65.5 
 
 		 195 aa  228  4e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0194348 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4384  50S ribosomal protein L10  71.93 
 
 		 172 aa  228  4e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.313613 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4015  50S ribosomal protein L10  71.93 
 
 		 172 aa  228  4e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.866731  normal  0.631329 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1420  50S ribosomal protein L10  63.74 
 
 		 172 aa  228  4e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.291032 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1207  50S ribosomal protein L10  66.08 
 
 		 194 aa  226  9e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.347273  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1246  50S ribosomal protein L10  65.5 
 
 		 172 aa  224  6e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.208748  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2727  ribosomal protein L10  63.16 
 
 		 172 aa  216  1e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.12165  normal  0.845294 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0569  50S ribosomal protein L10  61.99 
 
 		 172 aa  216  2e-55  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000818206  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3477  50S ribosomal protein L10  61.4 
 
 		 171 aa  200  6e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.232416  hitchhiker  0.0000717521 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2958  50S ribosomal protein L10  58.48 
 
 		 172 aa  197  7e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0648852 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1701  50S ribosomal protein L10  60.23 
 
 		 171 aa  197  7e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.302531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1954  50S ribosomal protein L10  57.31 
 
 		 174 aa  193  8.000000000000001e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.262202  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2697  50S ribosomal protein L10P  53.22 
 
 		 172 aa  186  1e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.561782  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0745  50S ribosomal protein L10  55.56 
 
 		 171 aa  186  1e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00501407 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0232  50S ribosomal protein L10  54.17 
 
 		 172 aa  183  1.0000000000000001e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0685965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0789  50S ribosomal protein L10  54.34 
 
 		 172 aa  183  1.0000000000000001e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.305137 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0566  50S ribosomal protein L10  58.93 
 
 		 170 aa  180  8.000000000000001e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0337  50S ribosomal protein L10  56.14 
 
 		 171 aa  173  8e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.635722  normal  0.581622 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1701  50S ribosomal protein L10  56.14 
 
 		 171 aa  173  8e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.653585  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0351  50S ribosomal protein L10  56.14 
 
 		 171 aa  173  8e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.703447 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2544  50S ribosomal protein L10  56.14 
 
 		 171 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0029  50S ribosomal protein L10  57.06 
 
 		 170 aa  166  1e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.167833  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0265  50S ribosomal protein L10  53.57 
 
 		 172 aa  162  2.0000000000000002e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0838  50S ribosomal protein L10P  43.86 
 
 		 172 aa  142  3e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0707377  normal  0.0995834 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1804  50S ribosomal protein L10P  45.83 
 
 		 171 aa  140  7e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.160084 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0270  50S ribosomal protein L10  40.35 
 
 		 174 aa  122  3e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.247547  hitchhiker  0.00145059 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0586  50S ribosomal protein L10  40.48 
 
 		 177 aa  112  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0317  50S ribosomal protein L10  39.29 
 
 		 173 aa  112  3e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.146286  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0488  50S ribosomal protein L10  39.29 
 
 		 173 aa  112  3e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.169718  hitchhiker  0.00000169108 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3594  50S ribosomal protein L10  39.77 
 
 		 178 aa  111  6e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.196569  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6637  ribosomal protein L10  43.2 
 
 		 184 aa  110  9e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.858869  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3336  50S ribosomal protein L10  41.5 
 
 		 173 aa  109  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08440  ribosomal protein L10  42.77 
 
 		 173 aa  109  2.0000000000000002e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.166227  normal  0.704722 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3191  50S ribosomal protein L10  41.18 
 
 		 173 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.579756  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0508  50S ribosomal protein L10  40.76 
 
 		 175 aa  109  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.270625  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1927  ribosomal protein L10  37.06 
 
 		 176 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0948645  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3453  50S ribosomal protein L10  40.65 
 
 		 174 aa  108  3e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0925685  normal  0.446601 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2969  50S ribosomal protein L10  41.18 
 
 		 168 aa  108  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.45658 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3316  50S ribosomal protein L10  41.18 
 
 		 168 aa  108  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.354504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3248  50S ribosomal protein L10  40.13 
 
 		 168 aa  108  4.0000000000000004e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3899  50S ribosomal protein L10  40.13 
 
 		 168 aa  108  4.0000000000000004e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4533  50S ribosomal protein L10  40.76 
 
 		 168 aa  108  4.0000000000000004e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0464  50S ribosomal protein L10  35.03 
 
 		 179 aa  107  9.000000000000001e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0359791  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0700  ribosomal protein L10  33.72 
 
 		 174 aa  107  9.000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.299689  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0479  50S ribosomal protein L10  35.03 
 
 		 179 aa  107  9.000000000000001e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.488036  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3869  50S ribosomal protein L10  37.5 
 
 		 182 aa  107  1e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2361  50S ribosomal protein L10  37.87 
 
 		 174 aa  105  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2273  50S ribosomal protein L10  37.87 
 
 		 174 aa  105  4e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1124  ribosomal protein L10  39.64 
 
 		 174 aa  105  4e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0757  50S ribosomal protein L10  36.25 
 
 		 174 aa  104  5e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4444  50S ribosomal protein L10  39.49 
 
 		 176 aa  103  9e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.651473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0562  50S ribosomal protein L10  38.93 
 
 		 166 aa  103  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000233555  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4318  50S ribosomal protein L10  36.36 
 
 		 187 aa  103  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.561909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1590  50S ribosomal protein L10  37.28 
 
 		 174 aa  103  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0576  50S ribosomal protein L10  38.93 
 
 		 166 aa  103  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000179203  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3036  50S ribosomal protein L10  39.49 
 
 		 168 aa  103  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0878547 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0313  50S ribosomal protein L10  37.42 
 
 		 166 aa  103  2e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000558823  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2262  50S ribosomal protein L10  40.76 
 
 		 174 aa  103  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.168271  normal  0.476107 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0710  50S ribosomal protein L10  37.58 
 
 		 176 aa  102  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.303715  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3642  50S ribosomal protein L10  40.54 
 
 		 183 aa  102  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.279713 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4018  ribosomal protein L10  37.18 
 
 		 174 aa  102  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.491975 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2178  ribosomal protein L10  36.9 
 
 		 175 aa  102  3e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.905696 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0671  50S ribosomal protein L10  37.35 
 
 		 174 aa  101  4e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3328  50S ribosomal protein L10  36.36 
 
 		 186 aa  101  6e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.211537 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0310  50S ribosomal protein L10  41.01 
 
 		 165 aa  101  6e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0746923  normal  0.0249908 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0044  50S ribosomal protein L10  38.51 
 
 		 215 aa  100  8e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000127438  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2223  50S ribosomal protein L10  35.5 
 
 		 174 aa  100  9e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00194446 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0040  50S ribosomal protein L10  38.51 
 
 		 179 aa  100  9e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0245031  hitchhiker  0.0000000000023806 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10664  50S ribosomal protein L10  39.18 
 
 		 178 aa  100  9e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.50048e-25  normal  0.41253 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0408  50S ribosomal protein L10  36.77 
 
 		 174 aa  100  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.79305e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0396  50S ribosomal protein L10  40.28 
 
 		 173 aa  100  1e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.252363  hitchhiker  0.00709296 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1509  ribosomal protein L10  36.14 
 
 		 176 aa  100  1e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000272992  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3347  50S ribosomal protein L10  39.72 
 
 		 167 aa  99.8  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.862427  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0867  50S ribosomal protein L10  36.65 
 
 		 175 aa  99.4  2e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0449  50S ribosomal protein L10  38.32 
 
 		 175 aa  99  3e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1889  50S ribosomal protein L10  36.84 
 
 		 175 aa  98.2  4e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00905403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1172  ribosomal protein L10  37.72 
 
 		 173 aa  98.2  5e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000357466  unclonable  0.0000000289216 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0385  50S ribosomal protein L10  35.09 
 
 		 177 aa  98.2  5e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0360  50S ribosomal protein L10  35.09 
 
 		 177 aa  98.2  5e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0445  50S ribosomal protein L10  41.1 
 
 		 166 aa  97.8  6e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.470652  unclonable  0.000000241771 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0475  50S ribosomal protein L10  41.1 
 
 		 166 aa  97.8  6e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.372242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0571  50S ribosomal protein L10  37.28 
 
 		 187 aa  97.8  7e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>