More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0265 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0265  50S ribosomal protein L10  100 
 
 		 172 aa  342  2e-93  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0232  50S ribosomal protein L10  82.56 
 
 		 172 aa  287  5.0000000000000004e-77  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0685965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0351  50S ribosomal protein L10  84.52 
 
 		 171 aa  264  4e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.703447 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1701  50S ribosomal protein L10  84.52 
 
 		 171 aa  264  4e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.653585  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0337  50S ribosomal protein L10  84.52 
 
 		 171 aa  264  4e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.635722  normal  0.581622 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0745  50S ribosomal protein L10  77.98 
 
 		 171 aa  263  8.999999999999999e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00501407 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2544  50S ribosomal protein L10  82.14 
 
 		 171 aa  258  2e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0566  50S ribosomal protein L10  78.11 
 
 		 170 aa  235  3e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0976  50S ribosomal protein L10  52.91 
 
 		 195 aa  186  1e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0194348 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1821  50S ribosomal protein L10  55.81 
 
 		 172 aa  185  3e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0871653  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1322  50S ribosomal protein L10  52.91 
 
 		 172 aa  183  9e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.850894  normal  0.161771 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1420  50S ribosomal protein L10  52.33 
 
 		 172 aa  181  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.291032 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2727  ribosomal protein L10  53.49 
 
 		 172 aa  181  3e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.12165  normal  0.845294 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1822  50S ribosomal protein L10  51.16 
 
 		 172 aa  180  7e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1246  50S ribosomal protein L10  55.23 
 
 		 172 aa  179  1e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.208748  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1945  50S ribosomal protein L10  55.23 
 
 		 172 aa  179  1e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.137242  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1804  50S ribosomal protein L10P  54.97 
 
 		 171 aa  178  4e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.160084 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1207  50S ribosomal protein L10  54.07 
 
 		 194 aa  176  2e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.347273  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3362  50S ribosomal protein L10  51.74 
 
 		 172 aa  173  9.999999999999999e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.256068  normal  0.223881 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0569  50S ribosomal protein L10  51.16 
 
 		 172 aa  173  9.999999999999999e-43  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000818206  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4497  50S ribosomal protein L10  52.91 
 
 		 172 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1345  50S ribosomal protein L10  50.58 
 
 		 172 aa  172  2.9999999999999996e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0320244  normal  0.100348 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3841  50S ribosomal protein L10  55.23 
 
 		 172 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0158219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3689  50S ribosomal protein L10  51.16 
 
 		 172 aa  170  6.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3197  50S ribosomal protein L10  51.16 
 
 		 172 aa  169  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.383116 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5083  50S ribosomal protein L10  51.16 
 
 		 172 aa  170  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.614366  normal  0.894165 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1898  50S ribosomal protein L10  52.35 
 
 		 175 aa  169  2e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0362  50S ribosomal protein L10  52.35 
 
 		 175 aa  169  2e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.656463 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1348  50S ribosomal protein L10  50.58 
 
 		 172 aa  169  3e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.223396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2283  50S ribosomal protein L10  51.16 
 
 		 172 aa  168  3e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0400383  normal  0.2116 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1529  50S ribosomal protein L10  50.58 
 
 		 172 aa  167  7e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.908936  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3460  50S ribosomal protein L10  49.42 
 
 		 172 aa  160  6e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0838  50S ribosomal protein L10P  45.35 
 
 		 172 aa  159  2e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0707377  normal  0.0995834 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3477  50S ribosomal protein L10  49.71 
 
 		 171 aa  156  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.232416  hitchhiker  0.0000717521 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4015  50S ribosomal protein L10  53.49 
 
 		 172 aa  155  2e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.866731  normal  0.631329 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4384  50S ribosomal protein L10  53.49 
 
 		 172 aa  155  2e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.313613 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1954  50S ribosomal protein L10  46.2 
 
 		 174 aa  156  2e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.262202  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2697  50S ribosomal protein L10P  45.35 
 
 		 172 aa  152  2e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.561782  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3866  ribosomal protein L10  53.57 
 
 		 171 aa  151  2.9999999999999998e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0292685 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1701  50S ribosomal protein L10  48.15 
 
 		 171 aa  143  9e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.302531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2958  50S ribosomal protein L10  45.93 
 
 		 172 aa  143  1e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0648852 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0789  50S ribosomal protein L10  41.42 
 
 		 172 aa  140  9.999999999999999e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.305137 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0029  50S ribosomal protein L10  45.68 
 
 		 170 aa  119  9.999999999999999e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.167833  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1509  ribosomal protein L10  39.2 
 
 		 176 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000272992  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01070  ribosomal protein L10  35.09 
 
 		 172 aa  109  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  5.51299e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3036  50S ribosomal protein L10  40.67 
 
 		 168 aa  105  3e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0878547 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3437  50S ribosomal protein L10  37.25 
 
 		 165 aa  105  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2769  50S ribosomal protein L10  37.25 
 
 		 165 aa  104  5e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0317  50S ribosomal protein L10  37.25 
 
 		 165 aa  104  5e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00438278  normal  0.203557 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0338  50S ribosomal protein L10  37.25 
 
 		 165 aa  104  5e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.550948  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0576  50S ribosomal protein L10  40.27 
 
 		 166 aa  104  7e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000179203  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0562  50S ribosomal protein L10  40.27 
 
 		 166 aa  104  7e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000233555  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2850  50S ribosomal protein L10  37.42 
 
 		 165 aa  104  8e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.675463 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2969  50S ribosomal protein L10  39.47 
 
 		 168 aa  103  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.45658 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3316  50S ribosomal protein L10  39.47 
 
 		 168 aa  103  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.354504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0325  50S ribosomal protein L10  34.55 
 
 		 174 aa  103  1e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00522529  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1864  50S ribosomal protein L10  34.55 
 
 		 174 aa  103  1e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0922754  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08440  ribosomal protein L10  39.41 
 
 		 173 aa  102  3e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.166227  normal  0.704722 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0239  50S ribosomal protein L10  41.22 
 
 		 165 aa  102  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0229066 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0488  50S ribosomal protein L10  36.36 
 
 		 173 aa  100  7e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.169718  hitchhiker  0.00000169108 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3191  50S ribosomal protein L10  39.74 
 
 		 173 aa  101  7e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.579756  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0317  50S ribosomal protein L10  36.36 
 
 		 173 aa  100  7e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.146286  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3078  50S ribosomal protein L10  40.91 
 
 		 165 aa  100  7e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.892062  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3336  50S ribosomal protein L10  39.86 
 
 		 173 aa  100  8e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4318  50S ribosomal protein L10  35.58 
 
 		 187 aa  100  8e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.561909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0408  50S ribosomal protein L10  36.53 
 
 		 174 aa  100  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.79305e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1912  50S ribosomal protein L10  41.22 
 
 		 165 aa  100  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000184172  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2643  50S ribosomal protein L10  41.22 
 
 		 165 aa  100  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3788  50S ribosomal protein L10  41.22 
 
 		 165 aa  100  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.166109  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3756  50S ribosomal protein L10  41.04 
 
 		 184 aa  100  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0407684  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0700  ribosomal protein L10  35.06 
 
 		 174 aa  100  1e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.299689  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0266  50S ribosomal protein L10  40.15 
 
 		 165 aa  100  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.646007  normal  0.635943 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0270  50S ribosomal protein L10  33.14 
 
 		 174 aa  100  1e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.247547  hitchhiker  0.00145059 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3818  50S ribosomal protein L10  41.04 
 
 		 184 aa  100  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.881367  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3467  50S ribosomal protein L10  41.04 
 
 		 184 aa  100  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0108818  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1018  50S ribosomal protein L10  36.05 
 
 		 178 aa  99.8  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00251564 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2783  50S ribosomal protein L10  30.41 
 
 		 172 aa  99.4  2e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00189787  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0692  50S ribosomal protein L10  32.75 
 
 		 172 aa  99.8  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000112903  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0257  50S ribosomal protein L10  40.46 
 
 		 188 aa  99.8  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0591157  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0314  ribosomal protein L10  35.5 
 
 		 175 aa  99  3e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000329441  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4444  50S ribosomal protein L10  37.82 
 
 		 176 aa  99  3e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.651473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0205  50S ribosomal protein L10  35.29 
 
 		 181 aa  99  3e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000665859  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2223  50S ribosomal protein L10  33.92 
 
 		 174 aa  98.6  4e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00194446 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0140  50S ribosomal protein L10  38.71 
 
 		 174 aa  98.2  5e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000236563  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0304  50S ribosomal protein L10  40.3 
 
 		 167 aa  98.2  5e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.125975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3654  50S ribosomal protein L10  40.3 
 
 		 167 aa  98.2  5e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0512272  hitchhiker  0.000000643388 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3347  50S ribosomal protein L10  40 
 
 		 167 aa  98.2  5e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.862427  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0508  50S ribosomal protein L10  38.46 
 
 		 175 aa  97.8  7e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.270625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3594  50S ribosomal protein L10  39.35 
 
 		 178 aa  97.4  8e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.196569  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3328  50S ribosomal protein L10  36.2 
 
 		 186 aa  97.4  9e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.211537 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3248  50S ribosomal protein L10  37.82 
 
 		 168 aa  96.7  1e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0586  50S ribosomal protein L10  38.71 
 
 		 177 aa  97.1  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4533  50S ribosomal protein L10  38.46 
 
 		 168 aa  97.1  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2164  50S ribosomal protein L10P  35.84 
 
 		 174 aa  96.7  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0596262  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3180  50S ribosomal protein L10  40.15 
 
 		 140 aa  97.1  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000385503  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3899  50S ribosomal protein L10  37.82 
 
 		 168 aa  96.7  1e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2722  ribosomal protein L10  36.73 
 
 		 170 aa  95.9  2e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0525449  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0040  50S ribosomal protein L10  37.41 
 
 		 179 aa  96.3  2e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0245031  hitchhiker  0.0000000000023806 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2361  50S ribosomal protein L10  33.33 
 
 		 174 aa  96.7  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0044  50S ribosomal protein L10  37.41 
 
 		 215 aa  96.3  2e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000127438  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>