More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_1822 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_1822  50S ribosomal protein L10  100 
 
 		 172 aa  345  3e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1322  50S ribosomal protein L10  93.6 
 
 		 172 aa  327  4e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.850894  normal  0.161771 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1420  50S ribosomal protein L10  92.44 
 
 		 172 aa  326  1.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.291032 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0976  50S ribosomal protein L10  87.21 
 
 		 195 aa  308  2.9999999999999997e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0194348 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1821  50S ribosomal protein L10  75.58 
 
 		 172 aa  268  2.9999999999999997e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0871653  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1246  50S ribosomal protein L10  75 
 
 		 172 aa  267  4e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.208748  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1945  50S ribosomal protein L10  74.42 
 
 		 172 aa  266  7e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.137242  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1207  50S ribosomal protein L10  75 
 
 		 194 aa  266  1e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.347273  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0569  50S ribosomal protein L10  75 
 
 		 172 aa  265  2e-70  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000818206  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3362  50S ribosomal protein L10  68.6 
 
 		 172 aa  244  4e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.256068  normal  0.223881 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4497  50S ribosomal protein L10  66.86 
 
 		 172 aa  229  1e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2727  ribosomal protein L10  66.86 
 
 		 172 aa  228  4e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.12165  normal  0.845294 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1345  50S ribosomal protein L10  63.95 
 
 		 172 aa  225  3e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0320244  normal  0.100348 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5083  50S ribosomal protein L10  62.21 
 
 		 172 aa  222  2e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.614366  normal  0.894165 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0362  50S ribosomal protein L10  64 
 
 		 175 aa  219  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.656463 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3689  50S ribosomal protein L10  62.21 
 
 		 172 aa  219  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1898  50S ribosomal protein L10  64 
 
 		 175 aa  218  3e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3841  50S ribosomal protein L10  63.37 
 
 		 172 aa  218  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0158219  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1529  50S ribosomal protein L10  62.79 
 
 		 172 aa  217  7e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.908936  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1348  50S ribosomal protein L10  61.63 
 
 		 172 aa  215  2e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.223396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4015  50S ribosomal protein L10  66.86 
 
 		 172 aa  215  2e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.866731  normal  0.631329 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4384  50S ribosomal protein L10  66.86 
 
 		 172 aa  215  2e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.313613 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2958  50S ribosomal protein L10  62.79 
 
 		 172 aa  214  5e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0648852 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2283  50S ribosomal protein L10  61.05 
 
 		 172 aa  211  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0400383  normal  0.2116 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3460  50S ribosomal protein L10  61.05 
 
 		 172 aa  211  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3197  50S ribosomal protein L10  60.47 
 
 		 172 aa  211  5.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.383116 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3866  ribosomal protein L10  64.91 
 
 		 171 aa  210  7e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0292685 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2697  50S ribosomal protein L10P  56.98 
 
 		 172 aa  202  2e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.561782  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1954  50S ribosomal protein L10  57.31 
 
 		 174 aa  199  1.9999999999999998e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.262202  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3477  50S ribosomal protein L10  55.56 
 
 		 171 aa  194  5.000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.232416  hitchhiker  0.0000717521 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1701  50S ribosomal protein L10  54.39 
 
 		 171 aa  185  3e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.302531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0232  50S ribosomal protein L10  50 
 
 		 172 aa  180  1e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0685965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0789  50S ribosomal protein L10  52.91 
 
 		 172 aa  177  4e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.305137 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1701  50S ribosomal protein L10  52.63 
 
 		 171 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.653585  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0351  50S ribosomal protein L10  52.63 
 
 		 171 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.703447 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0337  50S ribosomal protein L10  52.63 
 
 		 171 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.635722  normal  0.581622 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0745  50S ribosomal protein L10  49.71 
 
 		 171 aa  171  3.9999999999999995e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00501407 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0029  50S ribosomal protein L10  54.76 
 
 		 170 aa  170  6.999999999999999e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.167833  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2544  50S ribosomal protein L10  52.63 
 
 		 171 aa  170  7.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0265  50S ribosomal protein L10  51.16 
 
 		 172 aa  167  5e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0566  50S ribosomal protein L10  50.6 
 
 		 170 aa  162  2.0000000000000002e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1804  50S ribosomal protein L10P  48.43 
 
 		 171 aa  151  2.9999999999999998e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.160084 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0838  50S ribosomal protein L10P  40.12 
 
 		 172 aa  131  5e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0707377  normal  0.0995834 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3642  50S ribosomal protein L10  41.4 
 
 		 183 aa  112  2.0000000000000002e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.279713 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0586  50S ribosomal protein L10  39.88 
 
 		 177 aa  108  3e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3594  50S ribosomal protein L10  38.6 
 
 		 178 aa  105  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.196569  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0270  50S ribosomal protein L10  35.12 
 
 		 174 aa  105  3e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.247547  hitchhiker  0.00145059 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0508  50S ribosomal protein L10  39.49 
 
 		 175 aa  105  3e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.270625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0700  ribosomal protein L10  36.69 
 
 		 174 aa  104  5e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.299689  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3191  50S ribosomal protein L10  38.56 
 
 		 173 aa  104  5e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.579756  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1927  ribosomal protein L10  34.68 
 
 		 176 aa  103  8e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0948645  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6637  ribosomal protein L10  39.77 
 
 		 184 aa  103  8e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.858869  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3336  50S ribosomal protein L10  38.89 
 
 		 173 aa  103  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4533  50S ribosomal protein L10  38.85 
 
 		 168 aa  103  1e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3248  50S ribosomal protein L10  38.22 
 
 		 168 aa  102  2e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4444  50S ribosomal protein L10  39.49 
 
 		 176 aa  102  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.651473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3899  50S ribosomal protein L10  38.22 
 
 		 168 aa  102  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3869  50S ribosomal protein L10  41.18 
 
 		 182 aa  102  3e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2361  50S ribosomal protein L10  35.76 
 
 		 174 aa  102  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0044  50S ribosomal protein L10  38.1 
 
 		 215 aa  101  4e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000127438  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0040  50S ribosomal protein L10  38.1 
 
 		 179 aa  101  4e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0245031  hitchhiker  0.0000000000023806 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1821  ribosomal protein L10  37.58 
 
 		 179 aa  101  4e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0757  50S ribosomal protein L10  33.93 
 
 		 174 aa  101  5e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1590  50S ribosomal protein L10  35.67 
 
 		 174 aa  101  5e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0710  50S ribosomal protein L10  37.89 
 
 		 176 aa  101  5e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.303715  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4318  50S ribosomal protein L10  35.88 
 
 		 187 aa  101  6e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.561909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3453  50S ribosomal protein L10  36.31 
 
 		 174 aa  101  6e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0925685  normal  0.446601 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3347  50S ribosomal protein L10  38.3 
 
 		 167 aa  101  6e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.862427  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1124  ribosomal protein L10  38.73 
 
 		 174 aa  100  7e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0692  50S ribosomal protein L10  32.16 
 
 		 172 aa  100  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000112903  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2273  50S ribosomal protein L10  35.76 
 
 		 174 aa  100  1e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2969  50S ribosomal protein L10  40.26 
 
 		 168 aa  99.8  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.45658 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3316  50S ribosomal protein L10  40.26 
 
 		 168 aa  99.8  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.354504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0276  50S ribosomal protein L10  34.13 
 
 		 175 aa  99  3e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000204852  hitchhiker  0.000495958 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01070  ribosomal protein L10  34.3 
 
 		 172 aa  98.6  4e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  5.51299e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2223  50S ribosomal protein L10  33.33 
 
 		 174 aa  98.2  5e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00194446 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0671  50S ribosomal protein L10  37.35 
 
 		 174 aa  97.8  6e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2262  50S ribosomal protein L10  36.94 
 
 		 174 aa  97.4  8e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.168271  normal  0.476107 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0171  50S ribosomal protein L10  38.18 
 
 		 163 aa  97.1  1e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0111095  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0408  50S ribosomal protein L10  34.73 
 
 		 174 aa  97.1  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.79305e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1547  50S ribosomal protein L10  33.53 
 
 		 173 aa  96.7  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.834427 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1018  50S ribosomal protein L10  34.29 
 
 		 178 aa  96.3  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00251564 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06150  50S ribosomal protein L10  39.31 
 
 		 166 aa  95.9  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0385  50S ribosomal protein L10  34.94 
 
 		 177 aa  96.3  2e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0360  50S ribosomal protein L10  34.94 
 
 		 177 aa  96.3  2e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03670  LSU ribosomal protein L10P  39.77 
 
 		 181 aa  96.3  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.692531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0828  50S ribosomal protein L10  37.28 
 
 		 166 aa  96.3  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0279492  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08740  50S ribosomal protein L10  37.28 
 
 		 166 aa  96.3  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00037754 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0867  50S ribosomal protein L10  35.5 
 
 		 175 aa  96.7  2e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0100  50S ribosomal protein L10  35.1 
 
 		 166 aa  94.7  5e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000689021  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0317  50S ribosomal protein L10  38.16 
 
 		 173 aa  94.7  5e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.146286  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10664  50S ribosomal protein L10  37.87 
 
 		 178 aa  94.7  5e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.50048e-25  normal  0.41253 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4758  50S ribosomal protein L10  37.28 
 
 		 166 aa  94.7  5e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00494482  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0488  50S ribosomal protein L10  38.16 
 
 		 173 aa  94.7  5e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.169718  hitchhiker  0.00000169108 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3918  50S ribosomal protein L10  37.87 
 
 		 166 aa  94.7  5e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3328  50S ribosomal protein L10  34.12 
 
 		 186 aa  95.1  5e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.211537 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0617  50S ribosomal protein L10  36.14 
 
 		 174 aa  94.7  6e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000383704 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0286  ribosomal protein L10  35.17 
 
 		 166 aa  94.4  6e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0147275  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0571  50S ribosomal protein L10  36.26 
 
 		 187 aa  94.7  6e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0313  50S ribosomal protein L10  33.53 
 
 		 166 aa  94.4  8e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000558823  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>