More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMASAVP1_A3180 on replicon NC_008785
Organism: Burkholderia mallei SAVP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009076  BURPS1106A_3818  50S ribosomal protein L10  99.29 
 
 
184 aa  278  2e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.881367  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3756  50S ribosomal protein L10  99.29 
 
 
184 aa  278  2e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0407684  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3467  50S ribosomal protein L10  99.29 
 
 
184 aa  278  2e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0108818  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3180  50S ribosomal protein L10  100 
 
 
140 aa  278  2e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000385503  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2643  50S ribosomal protein L10  99.29 
 
 
165 aa  277  3e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3788  50S ribosomal protein L10  99.29 
 
 
165 aa  277  3e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.166109  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1912  50S ribosomal protein L10  99.29 
 
 
165 aa  277  3e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000184172  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3078  50S ribosomal protein L10  98.57 
 
 
165 aa  275  2e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.892062  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0239  50S ribosomal protein L10  97.86 
 
 
165 aa  272  1.0000000000000001e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0229066 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0317  50S ribosomal protein L10  95 
 
 
165 aa  267  5e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00438278  normal  0.203557 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2769  50S ribosomal protein L10  95 
 
 
165 aa  267  5e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0338  50S ribosomal protein L10  95 
 
 
165 aa  267  5e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.550948  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3437  50S ribosomal protein L10  94.29 
 
 
165 aa  265  1e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153429  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2850  50S ribosomal protein L10  93.57 
 
 
165 aa  265  2e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.675463 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0266  50S ribosomal protein L10  94.29 
 
 
165 aa  264  2.9999999999999995e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.646007  normal  0.635943 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0257  50S ribosomal protein L10  93.57 
 
 
188 aa  261  2e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0591157  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0304  50S ribosomal protein L10  92.03 
 
 
167 aa  258  2e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.125975  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3654  50S ribosomal protein L10  92.03 
 
 
167 aa  258  2e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0512272  hitchhiker  0.000000643388 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3036  50S ribosomal protein L10  84.78 
 
 
168 aa  240  5e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0878547 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3316  50S ribosomal protein L10  79.43 
 
 
168 aa  224  2e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.354504  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2969  50S ribosomal protein L10  79.43 
 
 
168 aa  224  2e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.45658 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3191  50S ribosomal protein L10  79.26 
 
 
173 aa  219  9.999999999999999e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.579756  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3336  50S ribosomal protein L10  76.56 
 
 
173 aa  206  1e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0310  50S ribosomal protein L10  72.86 
 
 
165 aa  205  2e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0746923  normal  0.0249908 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3347  50S ribosomal protein L10  76.86 
 
 
167 aa  190  7e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.862427  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0270  50S ribosomal protein L10  61.49 
 
 
174 aa  179  1e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.247547  hitchhiker  0.00145059 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0040  50S ribosomal protein L10  69.53 
 
 
179 aa  178  2e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0245031  hitchhiker  0.0000000000023806 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3869  50S ribosomal protein L10  67.16 
 
 
182 aa  178  2e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0044  50S ribosomal protein L10  69.53 
 
 
215 aa  178  2.9999999999999997e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000127438  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3453  50S ribosomal protein L10  67.91 
 
 
174 aa  177  2.9999999999999997e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0925685  normal  0.446601 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0757  50S ribosomal protein L10  61.72 
 
 
174 aa  167  3e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0396  50S ribosomal protein L10  62.31 
 
 
173 aa  163  6.9999999999999995e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.252363  hitchhiker  0.00709296 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0586  50S ribosomal protein L10  62.96 
 
 
177 aa  160  5.0000000000000005e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3594  50S ribosomal protein L10  62.04 
 
 
178 aa  157  7e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.196569  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2262  50S ribosomal protein L10  62.22 
 
 
174 aa  150  7e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.168271  normal  0.476107 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4533  50S ribosomal protein L10  59.57 
 
 
168 aa  149  1e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0508  50S ribosomal protein L10  60 
 
 
175 aa  148  2e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.270625  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3642  50S ribosomal protein L10  58.52 
 
 
183 aa  147  4e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.279713 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3899  50S ribosomal protein L10  59.26 
 
 
168 aa  147  5e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3248  50S ribosomal protein L10  59.26 
 
 
168 aa  147  5e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4444  50S ribosomal protein L10  57.78 
 
 
176 aa  145  2.0000000000000003e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.651473  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0286  ribosomal protein L10  53.24 
 
 
166 aa  138  1.9999999999999998e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0147275  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0317  50S ribosomal protein L10  49.22 
 
 
173 aa  131  3e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.146286  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0488  50S ribosomal protein L10  49.22 
 
 
173 aa  131  3e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.169718  hitchhiker  0.00000169108 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2333  50S ribosomal protein L10  46.62 
 
 
176 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.275074  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0838  50S ribosomal protein L10P  46.56 
 
 
172 aa  124  4.0000000000000003e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0707377  normal  0.0995834 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2333  50S ribosomal protein L10  48.03 
 
 
175 aa  124  6e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00442702  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1064  50S ribosomal protein L10  51.18 
 
 
175 aa  123  1e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0220515  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0314  ribosomal protein L10  49.61 
 
 
175 aa  122  2e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000329441  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0867  50S ribosomal protein L10  46.26 
 
 
175 aa  121  3e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4285  ribosomal protein L10  43.26 
 
 
166 aa  117  3.9999999999999996e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000716484  hitchhiker  0.000000472968 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0385  50S ribosomal protein L10  43.85 
 
 
177 aa  117  7.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0360  50S ribosomal protein L10  43.85 
 
 
177 aa  117  7.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2178  ribosomal protein L10  42.47 
 
 
175 aa  116  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.905696 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5206  50S ribosomal protein L10  45.39 
 
 
166 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000252117  unclonable  5.898740000000001e-26 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0093  50S ribosomal protein L10  45.39 
 
 
166 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000759135  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3691  ribosomal protein L10  44.12 
 
 
164 aa  115  1.9999999999999998e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000101089  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0596  50S ribosomal protein L10  45.21 
 
 
172 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0140503  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0222  50S ribosomal protein L10  45.59 
 
 
166 aa  114  3e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0190  50S ribosomal protein L10  45.59 
 
 
166 aa  114  3e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000262315  hitchhiker  0.00315877 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0185  50S ribosomal protein L10  45.59 
 
 
166 aa  114  3e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000592329  normal  0.0118628 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0190  50S ribosomal protein L10  45.59 
 
 
166 aa  114  3e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000177262  hitchhiker  0.000758972 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5088  50S ribosomal protein L10  43.26 
 
 
166 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000128873  normal  0.821712 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0094  50S ribosomal protein L10  44.68 
 
 
166 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000793252  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04532  50S ribosomal protein L10  45.52 
 
 
177 aa  114  3.9999999999999997e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.165522  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0187  50S ribosomal protein L10  45.59 
 
 
166 aa  114  5e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000330294  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0747  50S ribosomal protein L10  45.19 
 
 
178 aa  114  5e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0329012  normal  0.965103 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4065  50S ribosomal protein L10  45.59 
 
 
166 aa  114  5e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000275908  hitchhiker  0.00991378 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0191  50S ribosomal protein L10  45.59 
 
 
166 aa  114  5e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000192331  hitchhiker  0.000568378 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3768  50S ribosomal protein L10  45.59 
 
 
166 aa  114  5e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000062266  n/a   
 
 
-
 
NC_009037  Sbal_4473  50S ribosomal protein L10  45.59 
 
 
166 aa  114  5e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0110  50S ribosomal protein L10  44.68 
 
 
166 aa  114  6e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.02318e-62 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0099  50S ribosomal protein L10  44.68 
 
 
166 aa  114  6e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000477259  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0099  50S ribosomal protein L10  44.68 
 
 
166 aa  114  6e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000073314  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0095  50S ribosomal protein L10  44.68 
 
 
166 aa  114  6e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  8.69083e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0093  50S ribosomal protein L10  44.68 
 
 
166 aa  114  6e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000338487  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0099  50S ribosomal protein L10  44.68 
 
 
166 aa  114  6e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000718586  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0120  50S ribosomal protein L10  44.68 
 
 
166 aa  114  6e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000126178  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0130  50S ribosomal protein L10  44.68 
 
 
166 aa  114  6e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000124346  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0445  50S ribosomal protein L10  41.84 
 
 
166 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.470652  unclonable  0.000000241771 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4557  50S ribosomal protein L10  43.26 
 
 
166 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.669843  decreased coverage  0.0090203 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0700  ribosomal protein L10  43.62 
 
 
174 aa  113  1.0000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.299689  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0149  50S ribosomal protein L10  41.73 
 
 
165 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000191294  normal  0.034689 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0475  50S ribosomal protein L10  41.84 
 
 
166 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.372242  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0204  50S ribosomal protein L10  44.2 
 
 
166 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000122994  hitchhiker  0.000100039 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0478  50S ribosomal protein L10  41.84 
 
 
195 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00597987  hitchhiker  0.00527924 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0617  ribosomal protein L10  42.55 
 
 
166 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.532211  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0139  50S ribosomal protein L10  43.48 
 
 
166 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000054937  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0408  50S ribosomal protein L10  46.88 
 
 
174 aa  111  3e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.79305e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002171  LSU ribosomal protein L10p (P0)  42.25 
 
 
164 aa  111  3e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000109594  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3918  50S ribosomal protein L10  42.55 
 
 
166 aa  111  3e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0096  50S ribosomal protein L10  42.55 
 
 
166 aa  110  5e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4758  50S ribosomal protein L10  41.13 
 
 
166 aa  110  5e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00494482  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0576  50S ribosomal protein L10  43.57 
 
 
166 aa  110  5e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000179203  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0449  50S ribosomal protein L10  43.54 
 
 
175 aa  110  5e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0562  50S ribosomal protein L10  43.57 
 
 
166 aa  110  5e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000233555  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0828  50S ribosomal protein L10  41.84 
 
 
166 aa  110  6e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0279492  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2722  ribosomal protein L10  43.97 
 
 
170 aa  110  6e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0525449  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0161  50S ribosomal protein L10  42.75 
 
 
166 aa  110  6e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000494732  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08740  50S ribosomal protein L10  41.84 
 
 
166 aa  110  6e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00037754 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>