More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR1246 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR1246  50S ribosomal protein L10  100 
 
 		 172 aa  345  2e-94  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.208748  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1945  50S ribosomal protein L10  97.67 
 
 		 172 aa  339  1e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.137242  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1207  50S ribosomal protein L10  98.26 
 
 		 194 aa  337  4e-92  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.347273  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1322  50S ribosomal protein L10  76.16 
 
 		 172 aa  271  3e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.850894  normal  0.161771 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0569  50S ribosomal protein L10  76.16 
 
 		 172 aa  270  6e-72  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000818206  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1822  50S ribosomal protein L10  75 
 
 		 172 aa  267  4e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1821  50S ribosomal protein L10  76.16 
 
 		 172 aa  267  5e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0871653  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1420  50S ribosomal protein L10  73.84 
 
 		 172 aa  266  8.999999999999999e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.291032 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0976  50S ribosomal protein L10  72.67 
 
 		 195 aa  261  2e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0194348 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5083  50S ribosomal protein L10  65.7 
 
 		 172 aa  229  1e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.614366  normal  0.894165 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3362  50S ribosomal protein L10  62.79 
 
 		 172 aa  229  2e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.256068  normal  0.223881 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2727  ribosomal protein L10  66.86 
 
 		 172 aa  229  2e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.12165  normal  0.845294 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3689  50S ribosomal protein L10  63.37 
 
 		 172 aa  226  1e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3197  50S ribosomal protein L10  63.95 
 
 		 172 aa  224  5.0000000000000005e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.383116 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2283  50S ribosomal protein L10  63.95 
 
 		 172 aa  223  9e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0400383  normal  0.2116 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1345  50S ribosomal protein L10  63.37 
 
 		 172 aa  222  2e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0320244  normal  0.100348 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3841  50S ribosomal protein L10  63.95 
 
 		 172 aa  221  4e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0158219  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4497  50S ribosomal protein L10  63.37 
 
 		 172 aa  220  6e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1898  50S ribosomal protein L10  62.86 
 
 		 175 aa  217  5e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1529  50S ribosomal protein L10  62.21 
 
 		 172 aa  217  6e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.908936  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3460  50S ribosomal protein L10  61.63 
 
 		 172 aa  216  8.999999999999998e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1348  50S ribosomal protein L10  59.3 
 
 		 172 aa  211  2.9999999999999995e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.223396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0362  50S ribosomal protein L10  61.71 
 
 		 175 aa  210  7e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.656463 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4015  50S ribosomal protein L10  63.95 
 
 		 172 aa  209  1e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.866731  normal  0.631329 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4384  50S ribosomal protein L10  63.95 
 
 		 172 aa  209  1e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.313613 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3866  ribosomal protein L10  65.5 
 
 		 171 aa  201  3e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0292685 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2697  50S ribosomal protein L10P  55.81 
 
 		 172 aa  198  1.9999999999999998e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.561782  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2958  50S ribosomal protein L10  59.3 
 
 		 172 aa  198  1.9999999999999998e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0648852 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1701  50S ribosomal protein L10  57.31 
 
 		 171 aa  193  1e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.302531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1954  50S ribosomal protein L10  55.56 
 
 		 174 aa  190  9e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.262202  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3477  50S ribosomal protein L10  56.14 
 
 		 171 aa  188  4e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.232416  hitchhiker  0.0000717521 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0029  50S ribosomal protein L10  56.55 
 
 		 170 aa  187  5e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.167833  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0232  50S ribosomal protein L10  54.65 
 
 		 172 aa  183  1.0000000000000001e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0685965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0745  50S ribosomal protein L10  55.81 
 
 		 171 aa  178  2.9999999999999997e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00501407 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0566  50S ribosomal protein L10  58.64 
 
 		 170 aa  177  8e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1701  50S ribosomal protein L10  58.02 
 
 		 171 aa  169  1e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.653585  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0351  50S ribosomal protein L10  58.02 
 
 		 171 aa  169  1e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.703447 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0337  50S ribosomal protein L10  58.02 
 
 		 171 aa  169  1e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.635722  normal  0.581622 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2544  50S ribosomal protein L10  58.02 
 
 		 171 aa  169  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1804  50S ribosomal protein L10P  51.43 
 
 		 171 aa  166  1e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.160084 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0265  50S ribosomal protein L10  55.23 
 
 		 172 aa  166  2e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0789  50S ribosomal protein L10  46.51 
 
 		 172 aa  165  2.9999999999999998e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.305137 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0838  50S ribosomal protein L10P  39.88 
 
 		 172 aa  124  5e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0707377  normal  0.0995834 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2361  50S ribosomal protein L10  36.84 
 
 		 174 aa  114  5e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1590  50S ribosomal protein L10  37.43 
 
 		 174 aa  114  6e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2273  50S ribosomal protein L10  36.84 
 
 		 174 aa  114  8.999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3594  50S ribosomal protein L10  40.76 
 
 		 178 aa  112  3e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.196569  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0270  50S ribosomal protein L10  38.73 
 
 		 174 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.247547  hitchhiker  0.00145059 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0700  ribosomal protein L10  37.36 
 
 		 174 aa  111  5e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.299689  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4444  50S ribosomal protein L10  39.49 
 
 		 176 aa  110  8.000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.651473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3642  50S ribosomal protein L10  39.49 
 
 		 183 aa  110  1.0000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.279713 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3453  50S ribosomal protein L10  38.85 
 
 		 174 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0925685  normal  0.446601 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0508  50S ribosomal protein L10  39.49 
 
 		 175 aa  109  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.270625  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0586  50S ribosomal protein L10  39.49 
 
 		 177 aa  108  3e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0044  50S ribosomal protein L10  40.25 
 
 		 215 aa  107  9.000000000000001e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000127438  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3248  50S ribosomal protein L10  38.22 
 
 		 168 aa  106  1e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3899  50S ribosomal protein L10  38.22 
 
 		 168 aa  106  1e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4533  50S ribosomal protein L10  38.85 
 
 		 168 aa  107  1e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0757  50S ribosomal protein L10  39.47 
 
 		 174 aa  106  2e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2223  50S ribosomal protein L10  34.5 
 
 		 174 aa  106  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00194446 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3869  50S ribosomal protein L10  41.3 
 
 		 182 aa  105  3e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3336  50S ribosomal protein L10  39.04 
 
 		 173 aa  105  4e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0040  50S ribosomal protein L10  38.99 
 
 		 179 aa  104  5e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0245031  hitchhiker  0.0000000000023806 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3191  50S ribosomal protein L10  37.2 
 
 		 173 aa  104  5e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.579756  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0276  50S ribosomal protein L10  39.44 
 
 		 175 aa  102  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000204852  hitchhiker  0.000495958 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2262  50S ribosomal protein L10  38.85 
 
 		 174 aa  102  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.168271  normal  0.476107 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3347  50S ribosomal protein L10  38.85 
 
 		 167 aa  103  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.862427  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1667  50S ribosomal protein L10  40.23 
 
 		 173 aa  101  7e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08440  ribosomal protein L10  38.85 
 
 		 173 aa  100  8e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.166227  normal  0.704722 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3036  50S ribosomal protein L10  35.09 
 
 		 168 aa  100  9e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0878547 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3316  50S ribosomal protein L10  34.91 
 
 		 168 aa  100  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.354504  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2969  50S ribosomal protein L10  34.91 
 
 		 168 aa  100  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.45658 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0096  50S ribosomal protein L10  35.29 
 
 		 166 aa  99.4  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3437  50S ribosomal protein L10  33.92 
 
 		 165 aa  99.8  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4318  50S ribosomal protein L10  36.31 
 
 		 187 aa  99  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.561909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3328  50S ribosomal protein L10  36.31 
 
 		 186 aa  98.6  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.211537 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0286  ribosomal protein L10  35.86 
 
 		 166 aa  98.2  4e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0147275  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0317  50S ribosomal protein L10  33.92 
 
 		 165 aa  98.2  5e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00438278  normal  0.203557 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2769  50S ribosomal protein L10  33.92 
 
 		 165 aa  98.2  5e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0338  50S ribosomal protein L10  33.92 
 
 		 165 aa  98.2  5e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.550948  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4018  ribosomal protein L10  35.09 
 
 		 174 aa  97.8  6e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.491975 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0093  50S ribosomal protein L10  35.29 
 
 		 166 aa  96.7  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000759135  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3337  50S ribosomal protein L10  34.39 
 
 		 173 aa  97.1  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000271161 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0100  50S ribosomal protein L10  34.64 
 
 		 166 aa  96.7  1e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000689021  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0924  50S ribosomal protein L10  34.39 
 
 		 173 aa  97.1  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0317  50S ribosomal protein L10  40 
 
 		 173 aa  96.7  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.146286  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0488  50S ribosomal protein L10  40 
 
 		 173 aa  96.7  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.169718  hitchhiker  0.00000169108 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1547  50S ribosomal protein L10  35.63 
 
 		 173 aa  97.1  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.834427 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2850  50S ribosomal protein L10  33.53 
 
 		 165 aa  96.7  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.675463 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1927  ribosomal protein L10  34.68 
 
 		 176 aa  96.3  2e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0948645  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0310  50S ribosomal protein L10  35.97 
 
 		 165 aa  95.5  3e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0746923  normal  0.0249908 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1124  ribosomal protein L10  38.15 
 
 		 174 aa  95.9  3e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01070  ribosomal protein L10  36.81 
 
 		 172 aa  95.5  3e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  5.51299e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08740  50S ribosomal protein L10  40 
 
 		 166 aa  95.5  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00037754 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0828  50S ribosomal protein L10  40 
 
 		 166 aa  95.5  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0279492  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0867  50S ribosomal protein L10  33.73 
 
 		 175 aa  95.1  4e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0226  ribosomal protein L10  38.51 
 
 		 173 aa  95.5  4e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2722  ribosomal protein L10  34.55 
 
 		 170 aa  95.5  4e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0525449  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3818  50S ribosomal protein L10  37.33 
 
 		 184 aa  94.4  6e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.881367  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0571  50S ribosomal protein L10  38.01 
 
 		 187 aa  94.4  6e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>