More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_4318 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_4318  50S ribosomal protein L10  100 
 
 		 187 aa  372  1e-102  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.561909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3328  50S ribosomal protein L10  91.4 
 
 		 186 aa  344  4e-94  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.211537 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1474  50S ribosomal protein L10  53.65 
 
 		 181 aa  198  3.9999999999999996e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000103472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0140  50S ribosomal protein L10  49.11 
 
 		 174 aa  166  1e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000236563  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1821  ribosomal protein L10  40.33 
 
 		 179 aa  142  3e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0213  ribosomal protein L10  41.92 
 
 		 175 aa  136  2e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.623588  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0276  50S ribosomal protein L10  37.87 
 
 		 175 aa  128  5.0000000000000004e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000204852  hitchhiker  0.000495958 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2470  50S ribosomal protein L10  39.41 
 
 		 176 aa  127  1.0000000000000001e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0147283  hitchhiker  0.00682166 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1927  ribosomal protein L10  39.13 
 
 		 176 aa  125  4.0000000000000003e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0948645  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0205  50S ribosomal protein L10  38.32 
 
 		 181 aa  124  1e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000665859  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1509  ribosomal protein L10  36.36 
 
 		 176 aa  122  3e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000272992  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0389  ribosomal protein L10  37.43 
 
 		 174 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0408  50S ribosomal protein L10  36.69 
 
 		 174 aa  115  3e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.79305e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0183  ribosomal protein L10  37.2 
 
 		 176 aa  115  3.9999999999999997e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000324199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1547  50S ribosomal protein L10  36.9 
 
 		 173 aa  115  5e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.834427 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01070  ribosomal protein L10  34.76 
 
 		 172 aa  114  1.0000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  5.51299e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0857  50S ribosomal protein L10  36.11 
 
 		 177 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000259828  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2724  50S ribosomal protein L10  36.42 
 
 		 166 aa  113  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000159716  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2410  50S ribosomal protein L10  36.42 
 
 		 166 aa  113  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000332682  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2722  50S ribosomal protein L10P  35.47 
 
 		 178 aa  113  2.0000000000000002e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000314918  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1529  ribosomal protein L10  35.67 
 
 		 183 aa  112  3e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000554953  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0671  50S ribosomal protein L10  36.75 
 
 		 174 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0362  50S ribosomal protein L10  38.18 
 
 		 175 aa  111  7.000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.656463 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0838  50S ribosomal protein L10P  40 
 
 		 172 aa  110  1.0000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0707377  normal  0.0995834 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1956  ribosomal protein L10  32.12 
 
 		 174 aa  109  2.0000000000000002e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2164  50S ribosomal protein L10P  38.51 
 
 		 174 aa  109  3e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0596262  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3337  50S ribosomal protein L10  36.69 
 
 		 173 aa  108  5e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000271161 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0924  50S ribosomal protein L10  36.69 
 
 		 173 aa  108  5e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2722  ribosomal protein L10  37.16 
 
 		 170 aa  107  7.000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0525449  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0096  50S ribosomal protein L10  36.91 
 
 		 166 aa  107  9.000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1898  50S ribosomal protein L10  36.67 
 
 		 175 aa  107  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0692  50S ribosomal protein L10  33.93 
 
 		 172 aa  107  1e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000112903  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1322  50S ribosomal protein L10  38.24 
 
 		 172 aa  107  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.850894  normal  0.161771 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3477  50S ribosomal protein L10  40 
 
 		 171 aa  107  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.232416  hitchhiker  0.0000717521 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1954  50S ribosomal protein L10  36.69 
 
 		 174 aa  107  1e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.262202  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4497  50S ribosomal protein L10  38.65 
 
 		 172 aa  106  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3841  50S ribosomal protein L10  36.9 
 
 		 172 aa  106  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0158219  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1345  50S ribosomal protein L10  39.39 
 
 		 172 aa  106  2e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0320244  normal  0.100348 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1821  50S ribosomal protein L10  37.06 
 
 		 172 aa  106  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0871653  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0617  50S ribosomal protein L10  33.73 
 
 		 174 aa  105  3e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000383704 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1372  50S ribosomal protein L10  33.14 
 
 		 178 aa  105  4e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.188772  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1420  50S ribosomal protein L10  37.65 
 
 		 172 aa  105  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.291032 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3689  50S ribosomal protein L10  38.79 
 
 		 172 aa  105  4e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2344  ribosomal protein L10  35.15 
 
 		 173 aa  105  6e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.032292  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1337  50S ribosomal protein L10  35.54 
 
 		 174 aa  104  6e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.900212  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5083  50S ribosomal protein L10  38.18 
 
 		 172 aa  104  7e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.614366  normal  0.894165 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0310  ribosomal protein L10  33.72 
 
 		 176 aa  104  8e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.109625  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2958  50S ribosomal protein L10  37.5 
 
 		 172 aa  103  2e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0648852 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0789  50S ribosomal protein L10  36.14 
 
 		 172 aa  102  3e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.305137 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1059  50S ribosomal protein L10  33.13 
 
 		 174 aa  102  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0531801  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0263  50S ribosomal protein L10  38.1 
 
 		 190 aa  102  3e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.273866  normal  0.119153 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0297  50S ribosomal protein L10  35.76 
 
 		 172 aa  102  3e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0976  50S ribosomal protein L10  38.79 
 
 		 195 aa  101  6e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0194348 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1018  50S ribosomal protein L10  38.85 
 
 		 178 aa  101  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00251564 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1038  50S ribosomal protein L10  40.38 
 
 		 183 aa  101  7e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.101211  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1822  50S ribosomal protein L10  35.88 
 
 		 172 aa  101  8e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4521  ribosomal protein L10  33.94 
 
 		 200 aa  100  9e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2727  ribosomal protein L10  36.97 
 
 		 172 aa  100  9e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.12165  normal  0.845294 
 
 
-
 
NC_002936  DET0991  50S ribosomal protein L10  33.89 
 
 		 176 aa  100  2e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000204805  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2865  50S ribosomal protein L10  32.53 
 
 		 174 aa  99.8  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.161934  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0100  50S ribosomal protein L10  34.64 
 
 		 166 aa  99.8  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000689021  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2697  50S ribosomal protein L10P  32.73 
 
 		 172 aa  99.8  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.561782  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0882  50S ribosomal protein L10  33.91 
 
 		 176 aa  100  2e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.629984  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1246  50S ribosomal protein L10  36.31 
 
 		 172 aa  99  3e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.208748  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4384  50S ribosomal protein L10  39.01 
 
 		 172 aa  99.4  3e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.313613 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_863  ribosomal protein L10  33.89 
 
 		 176 aa  99  3e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000130926  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4015  50S ribosomal protein L10  39.01 
 
 		 172 aa  99.4  3e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.866731  normal  0.631329 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0094  50S ribosomal protein L10  34.25 
 
 		 166 aa  98.6  4e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000793252  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1738  50S ribosomal protein L10  38.82 
 
 		 189 aa  98.6  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3197  50S ribosomal protein L10  37.65 
 
 		 172 aa  99  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.383116 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1762  50S ribosomal protein L10  38.82 
 
 		 189 aa  98.6  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.232126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0232  50S ribosomal protein L10  34.36 
 
 		 172 aa  98.6  5e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0685965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5206  50S ribosomal protein L10  34.25 
 
 		 166 aa  98.2  6e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000252117  unclonable  5.898740000000001e-26 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1945  50S ribosomal protein L10  35.71 
 
 		 172 aa  98.2  6e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.137242  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1348  50S ribosomal protein L10  37.58 
 
 		 172 aa  97.8  7e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.223396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3362  50S ribosomal protein L10  35.71 
 
 		 172 aa  98.2  7e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.256068  normal  0.223881 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1207  50S ribosomal protein L10  36.81 
 
 		 194 aa  97.8  7e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.347273  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02410  ribosomal protein L10  35.57 
 
 		 173 aa  97.8  8e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.609192 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0093  50S ribosomal protein L10  34.25 
 
 		 166 aa  97.8  8e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000759135  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1453  50S ribosomal protein L10  37.5 
 
 		 173 aa  97.4  9e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0099  50S ribosomal protein L10  34.25 
 
 		 166 aa  97.4  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000477259  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0325  50S ribosomal protein L10  37.76 
 
 		 174 aa  97.4  1e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00522529  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0099  50S ribosomal protein L10  34.25 
 
 		 166 aa  97.4  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000073314  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0095  50S ribosomal protein L10  34.25 
 
 		 166 aa  97.4  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  8.69083e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0093  50S ribosomal protein L10  34.25 
 
 		 166 aa  97.4  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000338487  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0120  50S ribosomal protein L10  34.25 
 
 		 166 aa  97.4  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000126178  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0099  50S ribosomal protein L10  34.25 
 
 		 166 aa  97.4  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000718586  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0110  50S ribosomal protein L10  34.25 
 
 		 166 aa  97.4  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.02318e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0130  50S ribosomal protein L10  34.25 
 
 		 166 aa  97.4  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000124346  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1864  50S ribosomal protein L10  37.76 
 
 		 174 aa  97.4  1e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0922754  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2283  50S ribosomal protein L10  37.65 
 
 		 172 aa  96.7  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0400383  normal  0.2116 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3460  50S ribosomal protein L10  38.24 
 
 		 172 aa  96.3  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0745  50S ribosomal protein L10  34.36 
 
 		 171 aa  96.3  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00501407 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0700  ribosomal protein L10  31.58 
 
 		 174 aa  95.9  3e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.299689  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2994  50S ribosomal protein L10  34.44 
 
 		 173 aa  95.5  4e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0441  50S ribosomal protein L10  35.88 
 
 		 189 aa  95.1  5e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2554  50S ribosomal protein L10  36.48 
 
 		 181 aa  94.7  7e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0140545  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1529  50S ribosomal protein L10  37.06 
 
 		 172 aa  94.4  9e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.908936  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2951  ribosomal protein L10  33.77 
 
 		 186 aa  94.4  9e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0265827  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0265  50S ribosomal protein L10  34.97 
 
 		 172 aa  94  1e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>