More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_1018 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_1018  50S ribosomal protein L10  100 
 
 
178 aa  356  9.999999999999999e-98  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00251564 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4011  ribosomal protein L10  63.58 
 
 
175 aa  245  3e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0274883  hitchhiker  0.0000000471613 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1738  50S ribosomal protein L10  65.87 
 
 
189 aa  244  6e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1762  50S ribosomal protein L10  65.87 
 
 
189 aa  244  6e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.232126  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1038  50S ribosomal protein L10  64.57 
 
 
183 aa  237  6.999999999999999e-62  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.101211  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2554  50S ribosomal protein L10  63.84 
 
 
181 aa  235  3e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0140545  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0263  50S ribosomal protein L10  58.92 
 
 
190 aa  225  3e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.273866  normal  0.119153 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0632  50S ribosomal protein L10  57.56 
 
 
175 aa  217  7.999999999999999e-56  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.346234  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2469  50S ribosomal protein L10  52.57 
 
 
175 aa  204  5e-52  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.851244  normal  0.156602 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0204  50S ribosomal protein L10  51.15 
 
 
175 aa  202  2e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02221  50S ribosomal protein L10  51.15 
 
 
175 aa  202  2e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02201  50S ribosomal protein L10  51.15 
 
 
175 aa  202  3e-51  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.825352  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02201  50S ribosomal protein L10  50.29 
 
 
175 aa  197  5e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.756015  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02311  50S ribosomal protein L10  50 
 
 
175 aa  196  1.0000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2154  50S ribosomal protein L10  50.29 
 
 
175 aa  194  4.0000000000000005e-49  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.44563  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27791  50S ribosomal protein L10  48.54 
 
 
175 aa  192  2e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1569  50S ribosomal protein L10  49.71 
 
 
175 aa  187  9e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02781  50S ribosomal protein L10  49.71 
 
 
175 aa  187  9e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.210657  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08440  ribosomal protein L10  39.31 
 
 
173 aa  119  1.9999999999999998e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.166227  normal  0.704722 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0692  50S ribosomal protein L10  35.09 
 
 
172 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000112903  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0838  50S ribosomal protein L10P  33.53 
 
 
172 aa  108  4.0000000000000004e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0707377  normal  0.0995834 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1927  ribosomal protein L10  38.36 
 
 
176 aa  106  2e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0948645  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_14715  predicted protein  38.18 
 
 
182 aa  105  2e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0213  ribosomal protein L10  38.51 
 
 
175 aa  106  2e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.623588  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0232  50S ribosomal protein L10  36.63 
 
 
172 aa  104  5e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0685965  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6637  ribosomal protein L10  39.77 
 
 
184 aa  104  5e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.858869  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0140  50S ribosomal protein L10  35.8 
 
 
174 aa  104  7e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000236563  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0479  50S ribosomal protein L10  34.29 
 
 
179 aa  103  9e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.488036  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0464  50S ribosomal protein L10  34.29 
 
 
179 aa  103  9e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0359791  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1043  ribosomal protein L10  32.54 
 
 
167 aa  104  9e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.144449  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0093  50S ribosomal protein L10  34.18 
 
 
166 aa  103  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000759135  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0110  50S ribosomal protein L10  33.54 
 
 
166 aa  103  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.02318e-62 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0099  50S ribosomal protein L10  33.54 
 
 
166 aa  103  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000477259  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0099  50S ribosomal protein L10  33.54 
 
 
166 aa  103  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000073314  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0095  50S ribosomal protein L10  33.54 
 
 
166 aa  103  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  8.69083e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0093  50S ribosomal protein L10  33.54 
 
 
166 aa  103  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000338487  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0130  50S ribosomal protein L10  33.54 
 
 
166 aa  103  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000124346  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0099  50S ribosomal protein L10  33.54 
 
 
166 aa  103  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000718586  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0094  50S ribosomal protein L10  33.54 
 
 
166 aa  102  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000793252  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0120  50S ribosomal protein L10  33.54 
 
 
166 aa  103  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000126178  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4318  50S ribosomal protein L10  38.85 
 
 
187 aa  101  5e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.561909  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5206  50S ribosomal protein L10  32.91 
 
 
166 aa  101  5e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000252117  unclonable  5.898740000000001e-26 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0362  50S ribosomal protein L10  35.63 
 
 
175 aa  101  6e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.656463 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0700  ribosomal protein L10  29.59 
 
 
174 aa  100  1e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.299689  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0096  50S ribosomal protein L10  35.44 
 
 
166 aa  100  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17270  LSU ribosomal protein L10P  37.89 
 
 
173 aa  100  1e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2331  ribosomal protein L10  40 
 
 
173 aa  100  1e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.910628 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1124  ribosomal protein L10  37.06 
 
 
174 aa  99.8  2e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2697  50S ribosomal protein L10P  31.79 
 
 
172 aa  99.4  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.561782  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2656  50S ribosomal protein L10  34.91 
 
 
175 aa  99  3e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.220618  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5114  ribosomal protein L10  35.71 
 
 
175 aa  99.4  3e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.316499  normal  0.732887 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2724  50S ribosomal protein L10  36.84 
 
 
166 aa  98.6  4e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000159716  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2410  50S ribosomal protein L10  36.84 
 
 
166 aa  98.6  4e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000332682  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1509  ribosomal protein L10  41.1 
 
 
176 aa  98.2  5e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000272992  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0100  50S ribosomal protein L10  34.81 
 
 
166 aa  97.8  6e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000689021  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3328  50S ribosomal protein L10  34.76 
 
 
186 aa  97.4  8e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.211537 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0617  50S ribosomal protein L10  32.18 
 
 
174 aa  97.1  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000383704 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0976  50S ribosomal protein L10  31.4 
 
 
195 aa  97.4  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0194348 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0389  ribosomal protein L10  31.4 
 
 
174 aa  96.3  2e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0562  50S ribosomal protein L10  33.54 
 
 
166 aa  96.3  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000233555  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0576  50S ribosomal protein L10  33.54 
 
 
166 aa  96.3  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000179203  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1822  50S ribosomal protein L10  34.29 
 
 
172 aa  96.3  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2958  50S ribosomal protein L10  35.26 
 
 
172 aa  95.9  3e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0648852 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0276  50S ribosomal protein L10  35.86 
 
 
175 aa  95.9  3e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000204852  hitchhiker  0.000495958 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1547  50S ribosomal protein L10  34.71 
 
 
173 aa  95.9  3e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.834427 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0441  50S ribosomal protein L10  37.06 
 
 
189 aa  95.9  3e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0857  50S ribosomal protein L10  30.86 
 
 
177 aa  95.1  4e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000259828  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3841  50S ribosomal protein L10  34.88 
 
 
172 aa  95.1  5e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0158219  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3337  50S ribosomal protein L10  30.12 
 
 
173 aa  94  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000271161 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1898  50S ribosomal protein L10  33.91 
 
 
175 aa  94  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0924  50S ribosomal protein L10  30.12 
 
 
173 aa  94  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0270  50S ribosomal protein L10  32.95 
 
 
174 aa  93.6  1e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.247547  hitchhiker  0.00145059 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10664  50S ribosomal protein L10  37.06 
 
 
178 aa  94  1e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.50048e-25  normal  0.41253 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02410  ribosomal protein L10  33.33 
 
 
173 aa  93.6  1e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.609192 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1322  50S ribosomal protein L10  32.95 
 
 
172 aa  93.6  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.850894  normal  0.161771 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0265  50S ribosomal protein L10  36.05 
 
 
172 aa  92.8  2e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1420  50S ribosomal protein L10  32.95 
 
 
172 aa  92.8  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.291032 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0569  50S ribosomal protein L10  35.12 
 
 
172 aa  92.4  3e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000818206  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0745  50S ribosomal protein L10  34.32 
 
 
171 aa  92.4  3e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00501407 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2865  50S ribosomal protein L10  30.06 
 
 
174 aa  92  4e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.161934  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0541  50S ribosomal protein L10  33.71 
 
 
174 aa  91.7  5e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.367918  normal  0.103583 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2074  50S ribosomal protein L10  30.81 
 
 
172 aa  91.7  6e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0310  ribosomal protein L10  36.81 
 
 
176 aa  91.3  6e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.109625  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0966  50S ribosomal protein L10  38.86 
 
 
175 aa  91.3  6e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.968319  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2344  ribosomal protein L10  34.9 
 
 
173 aa  91.3  6e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.032292  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0984  50S ribosomal protein L10  38.86 
 
 
175 aa  91.3  6e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.270382  normal  0.351336 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0313  50S ribosomal protein L10  31.79 
 
 
166 aa  90.9  8e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000558823  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1059  50S ribosomal protein L10  29.31 
 
 
174 aa  90.9  8e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0531801  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1246  50S ribosomal protein L10  31.98 
 
 
172 aa  90.5  1e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.208748  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1207  50S ribosomal protein L10  31.98 
 
 
194 aa  90.5  1e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.347273  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4497  50S ribosomal protein L10  32.56 
 
 
172 aa  90.1  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1018  ribosomal protein L10  33.14 
 
 
202 aa  90.5  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6059  50S ribosomal protein L10  36.93 
 
 
182 aa  90.1  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.749447  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0180  50S ribosomal protein L10  33.54 
 
 
166 aa  89.4  2e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0693527  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3362  50S ribosomal protein L10  31.98 
 
 
172 aa  90.1  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.256068  normal  0.223881 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1821  ribosomal protein L10  31.9 
 
 
179 aa  89  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0994  50S ribosomal protein L10  38.29 
 
 
175 aa  89  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1529  ribosomal protein L10  32.88 
 
 
183 aa  89.4  3e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000554953  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3918  50S ribosomal protein L10  31.97 
 
 
166 aa  89.4  3e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29850  LSU ribosomal protein L10P  33.91 
 
 
176 aa  88.6  4e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>