More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_2154 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_2154  50S ribosomal protein L10  100 
 
 		 175 aa  350  5.9999999999999994e-96  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.44563  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2469  50S ribosomal protein L10  90.23 
 
 		 175 aa  318  3.9999999999999996e-86  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.851244  normal  0.156602 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27791  50S ribosomal protein L10  76.57 
 
 		 175 aa  278  3e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02201  50S ribosomal protein L10  72 
 
 		 175 aa  266  1e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.756015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0204  50S ribosomal protein L10  71.43 
 
 		 175 aa  265  2e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02221  50S ribosomal protein L10  71.43 
 
 		 175 aa  265  2e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02311  50S ribosomal protein L10  70.86 
 
 		 175 aa  263  7e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02201  50S ribosomal protein L10  70.86 
 
 		 175 aa  263  8e-70  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.825352  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02781  50S ribosomal protein L10  70.86 
 
 		 175 aa  262  2e-69  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.210657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1569  50S ribosomal protein L10  70.86 
 
 		 175 aa  262  2e-69  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0632  50S ribosomal protein L10  61.14 
 
 		 175 aa  218  3e-56  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.346234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4011  ribosomal protein L10  55.56 
 
 		 175 aa  204  4e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0274883  hitchhiker  0.0000000471613 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2554  50S ribosomal protein L10  57.06 
 
 		 181 aa  202  2e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0140545  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1738  50S ribosomal protein L10  53.57 
 
 		 189 aa  201  6e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1762  50S ribosomal protein L10  53.57 
 
 		 189 aa  201  6e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.232126  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1038  50S ribosomal protein L10  55.37 
 
 		 183 aa  200  8e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.101211  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1018  50S ribosomal protein L10  50.29 
 
 		 178 aa  194  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00251564 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0263  50S ribosomal protein L10  47.75 
 
 		 190 aa  178  2.9999999999999997e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.273866  normal  0.119153 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2331  ribosomal protein L10  43.56 
 
 		 173 aa  107  7.000000000000001e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.910628 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08440  ribosomal protein L10  39.6 
 
 		 173 aa  104  7e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.166227  normal  0.704722 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0110  50S ribosomal protein L10  36.71 
 
 		 166 aa  102  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.02318e-62 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0099  50S ribosomal protein L10  36.71 
 
 		 166 aa  102  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000477259  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0099  50S ribosomal protein L10  36.71 
 
 		 166 aa  102  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000073314  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0095  50S ribosomal protein L10  36.71 
 
 		 166 aa  102  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  8.69083e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0093  50S ribosomal protein L10  36.71 
 
 		 166 aa  102  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000338487  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0099  50S ribosomal protein L10  36.71 
 
 		 166 aa  102  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000718586  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0130  50S ribosomal protein L10  36.71 
 
 		 166 aa  102  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000124346  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0093  50S ribosomal protein L10  37.34 
 
 		 166 aa  102  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000759135  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0120  50S ribosomal protein L10  36.71 
 
 		 166 aa  102  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000126178  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0325  50S ribosomal protein L10  34.34 
 
 		 174 aa  102  3e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00522529  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1864  50S ribosomal protein L10  34.34 
 
 		 174 aa  102  3e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0922754  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5206  50S ribosomal protein L10  36.71 
 
 		 166 aa  102  3e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000252117  unclonable  5.898740000000001e-26 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0094  50S ribosomal protein L10  36.71 
 
 		 166 aa  101  6e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000793252  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2344  ribosomal protein L10  32.93 
 
 		 173 aa  101  6e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.032292  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1043  ribosomal protein L10  34.01 
 
 		 167 aa  99.4  2e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.144449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0700  ribosomal protein L10  35.19 
 
 		 174 aa  98.2  6e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.299689  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1509  ribosomal protein L10  37.65 
 
 		 176 aa  95.9  2e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000272992  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0692  50S ribosomal protein L10  35.29 
 
 		 172 aa  96.7  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000112903  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1325  ribosomal protein L10  34.52 
 
 		 256 aa  96.7  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0096  50S ribosomal protein L10  34.81 
 
 		 166 aa  95.1  4e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02410  ribosomal protein L10  37.93 
 
 		 173 aa  93.6  1e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.609192 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1547  50S ribosomal protein L10  37.11 
 
 		 173 aa  94  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.834427 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_14715  predicted protein  33.53 
 
 		 182 aa  93.2  2e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0924  50S ribosomal protein L10  34.57 
 
 		 173 aa  90.9  7e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3337  50S ribosomal protein L10  34.57 
 
 		 173 aa  90.9  7e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000271161 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0838  50S ribosomal protein L10P  32.5 
 
 		 172 aa  90.9  9e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0707377  normal  0.0995834 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0100  50S ribosomal protein L10  34.93 
 
 		 166 aa  89.7  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000689021  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0270  50S ribosomal protein L10  31.93 
 
 		 174 aa  89.4  2e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.247547  hitchhiker  0.00145059 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0857  50S ribosomal protein L10  36.14 
 
 		 177 aa  88.6  4e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000259828  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0310  ribosomal protein L10  36.81 
 
 		 176 aa  88.2  5e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.109625  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2038  50S ribosomal protein L10  31.33 
 
 		 175 aa  87.8  7e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0258299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0314  ribosomal protein L10  30.49 
 
 		 175 aa  87.8  7e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000329441  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1927  ribosomal protein L10  35.62 
 
 		 176 aa  86.7  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0948645  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2074  50S ribosomal protein L10  37.16 
 
 		 172 aa  86.3  2e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0617  50S ribosomal protein L10  37.95 
 
 		 174 aa  86.7  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000383704 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1059  50S ribosomal protein L10  34.57 
 
 		 174 aa  86.3  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0531801  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0562  50S ribosomal protein L10  29.11 
 
 		 166 aa  85.9  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000233555  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0576  50S ribosomal protein L10  29.11 
 
 		 166 aa  85.9  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000179203  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1018  ribosomal protein L10  33.73 
 
 		 202 aa  85.1  4e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0449  50S ribosomal protein L10  29.27 
 
 		 175 aa  84.7  7e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0300  ribosomal protein L10  30.57 
 
 		 181 aa  84.3  9e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000817286  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0226  ribosomal protein L10  33.53 
 
 		 173 aa  84  0.000000000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4327  50S ribosomal protein L10  36.3 
 
 		 181 aa  83.6  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6637  ribosomal protein L10  36.08 
 
 		 184 aa  83.6  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.858869  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1667  50S ribosomal protein L10  33.33 
 
 		 173 aa  83.2  0.000000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0757  50S ribosomal protein L10  29.52 
 
 		 174 aa  83.2  0.000000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2697  50S ribosomal protein L10P  31.93 
 
 		 172 aa  82.8  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.561782  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0389  ribosomal protein L10  32.16 
 
 		 174 aa  83.2  0.000000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20980  LSU ribosomal protein L10P  32.48 
 
 		 203 aa  83.2  0.000000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.996084  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0541  50S ribosomal protein L10  34.81 
 
 		 174 aa  82.8  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.367918  normal  0.103583 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2333  50S ribosomal protein L10  31.88 
 
 		 176 aa  82.8  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.275074  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0789  50S ribosomal protein L10  33.13 
 
 		 172 aa  82.4  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.305137 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0922  50S ribosomal protein L10  33.13 
 
 		 176 aa  82.4  0.000000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00116615  hitchhiker  0.00000161737 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1072  LSU ribosomal protein L10P  35.03 
 
 		 174 aa  82.4  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.37271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3935  50S ribosomal protein L10  35.62 
 
 		 181 aa  82.4  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.193843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2178  ribosomal protein L10  30.49 
 
 		 175 aa  82  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.905696 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2727  ribosomal protein L10  34.15 
 
 		 172 aa  82.4  0.000000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.12165  normal  0.845294 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0313  50S ribosomal protein L10  30.46 
 
 		 166 aa  82.8  0.000000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000558823  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17270  LSU ribosomal protein L10P  35.86 
 
 		 173 aa  82  0.000000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4318  50S ribosomal protein L10  33.77 
 
 		 187 aa  82  0.000000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.561909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2179  50S ribosomal protein L10  28.92 
 
 		 175 aa  81.6  0.000000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.82519  normal  0.0244994 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0180  50S ribosomal protein L10  30.38 
 
 		 166 aa  81.3  0.000000000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0693527  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1889  50S ribosomal protein L10  29.52 
 
 		 175 aa  81.3  0.000000000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00905403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5088  50S ribosomal protein L10  32.24 
 
 		 166 aa  81.3  0.000000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000128873  normal  0.821712 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1172  ribosomal protein L10  34.75 
 
 		 173 aa  81.3  0.000000000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000357466  unclonable  0.0000000289216 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0297  50S ribosomal protein L10  37.04 
 
 		 172 aa  81.3  0.000000000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1898  50S ribosomal protein L10  32.74 
 
 		 175 aa  81.3  0.000000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0867  50S ribosomal protein L10  29.52 
 
 		 175 aa  80.9  0.000000000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2865  50S ribosomal protein L10  36.14 
 
 		 174 aa  80.1  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.161934  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2722  ribosomal protein L10  32.89 
 
 		 170 aa  80.1  0.00000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0525449  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2164  50S ribosomal protein L10P  32.93 
 
 		 174 aa  80.1  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0596262  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0276  50S ribosomal protein L10  36.07 
 
 		 175 aa  80.5  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000204852  hitchhiker  0.000495958 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0204  50S ribosomal protein L10  34.03 
 
 		 166 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000122994  hitchhiker  0.000100039 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23960  LSU ribosomal protein L10P  34.93 
 
 		 172 aa  80.5  0.00000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2656  50S ribosomal protein L10  33.53 
 
 		 175 aa  80.1  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.220618  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3841  50S ribosomal protein L10  32.75 
 
 		 172 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0158219  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0213  ribosomal protein L10  32.62 
 
 		 175 aa  79.7  0.00000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.623588  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10664  50S ribosomal protein L10  31.65 
 
 		 178 aa  79  0.00000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.50048e-25  normal  0.41253 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4557  50S ribosomal protein L10  30.92 
 
 		 166 aa  79  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.669843  decreased coverage  0.0090203 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4351  ribosomal protein L10  35.71 
 
 		 184 aa  79  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>