More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_1172 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_1172  ribosomal protein L10  100 
 
 		 173 aa  349  1e-95  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000357466  unclonable  0.0000000289216 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08440  ribosomal protein L10  43.35 
 
 		 173 aa  152  2e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.166227  normal  0.704722 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1509  ribosomal protein L10  40.91 
 
 		 176 aa  129  3e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000272992  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2331  ribosomal protein L10  43.35 
 
 		 173 aa  128  5.0000000000000004e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.910628 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02410  ribosomal protein L10  41.62 
 
 		 173 aa  123  1e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.609192 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01070  ribosomal protein L10  38.01 
 
 		 172 aa  113  1.0000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  5.51299e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0310  ribosomal protein L10  39.26 
 
 		 176 aa  112  3e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.109625  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1529  ribosomal protein L10  35.93 
 
 		 183 aa  109  2.0000000000000002e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000554953  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0130  50S ribosomal protein L10  37.72 
 
 		 166 aa  107  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000124346  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0099  50S ribosomal protein L10  37.72 
 
 		 166 aa  107  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000477259  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0120  50S ribosomal protein L10  37.72 
 
 		 166 aa  107  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000126178  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0099  50S ribosomal protein L10  37.72 
 
 		 166 aa  107  8.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000073314  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0095  50S ribosomal protein L10  37.72 
 
 		 166 aa  107  8.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  8.69083e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0093  50S ribosomal protein L10  37.72 
 
 		 166 aa  107  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000338487  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0099  50S ribosomal protein L10  37.72 
 
 		 166 aa  107  8.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000718586  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0094  50S ribosomal protein L10  37.72 
 
 		 166 aa  107  8.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000793252  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0110  50S ribosomal protein L10  37.72 
 
 		 166 aa  107  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.02318e-62 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2676  ribosomal protein L10  38.76 
 
 		 174 aa  107  8.000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000001837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2722  50S ribosomal protein L10P  34.48 
 
 		 178 aa  105  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000314918  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5206  50S ribosomal protein L10  37.13 
 
 		 166 aa  105  3e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000252117  unclonable  5.898740000000001e-26 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1927  ribosomal protein L10  34.32 
 
 		 176 aa  105  3e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0948645  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0362  50S ribosomal protein L10  40.35 
 
 		 175 aa  104  5e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.656463 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2470  50S ribosomal protein L10  39.73 
 
 		 176 aa  104  5e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0147283  hitchhiker  0.00682166 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0232  50S ribosomal protein L10  36.99 
 
 		 172 aa  103  8e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0685965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3362  50S ribosomal protein L10  38.15 
 
 		 172 aa  103  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.256068  normal  0.223881 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0504  50S ribosomal protein L10  38.24 
 
 		 180 aa  103  1e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000340487  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0093  50S ribosomal protein L10  36.53 
 
 		 166 aa  102  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000759135  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2164  50S ribosomal protein L10P  35.63 
 
 		 174 aa  103  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0596262  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0183  ribosomal protein L10  33.53 
 
 		 176 aa  102  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000324199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0276  50S ribosomal protein L10  34.5 
 
 		 175 aa  101  5e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000204852  hitchhiker  0.000495958 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0838  50S ribosomal protein L10P  36.99 
 
 		 172 aa  101  5e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0707377  normal  0.0995834 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1325  ribosomal protein L10  35.5 
 
 		 256 aa  100  8e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3841  50S ribosomal protein L10  39.88 
 
 		 172 aa  100  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0158219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1898  50S ribosomal protein L10  39.64 
 
 		 175 aa  99.8  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0464  50S ribosomal protein L10  35.75 
 
 		 179 aa  99.4  2e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0359791  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0479  50S ribosomal protein L10  35.75 
 
 		 179 aa  99.4  2e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.488036  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2344  ribosomal protein L10  33.92 
 
 		 173 aa  99.8  2e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.032292  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2727  ribosomal protein L10  38.1 
 
 		 172 aa  99  3e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.12165  normal  0.845294 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4497  50S ribosomal protein L10  38.73 
 
 		 172 aa  98.2  5e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0297  50S ribosomal protein L10  40.88 
 
 		 172 aa  98.2  5e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1043  ribosomal protein L10  38.46 
 
 		 167 aa  97.8  7e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.144449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1124  ribosomal protein L10  38.15 
 
 		 174 aa  97.4  9e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0385  50S ribosomal protein L10  32.1 
 
 		 177 aa  97.1  1e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0360  50S ribosomal protein L10  32.1 
 
 		 177 aa  97.1  1e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0408  50S ribosomal protein L10  34.1 
 
 		 174 aa  96.7  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.79305e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6637  ribosomal protein L10  37.43 
 
 		 184 aa  97.1  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.858869  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0576  50S ribosomal protein L10  34.73 
 
 		 166 aa  96.7  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000179203  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0389  ribosomal protein L10  35.09 
 
 		 174 aa  97.1  1e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0205  50S ribosomal protein L10  35.15 
 
 		 181 aa  97.1  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000665859  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0562  50S ribosomal protein L10  34.73 
 
 		 166 aa  96.7  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000233555  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0096  50S ribosomal protein L10  33.94 
 
 		 166 aa  96.3  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03670  LSU ribosomal protein L10P  37.79 
 
 		 181 aa  95.5  4e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.692531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2697  50S ribosomal protein L10P  34.1 
 
 		 172 aa  95.1  4e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.561782  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4384  50S ribosomal protein L10  38.73 
 
 		 172 aa  95.1  4e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.313613 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4015  50S ribosomal protein L10  38.73 
 
 		 172 aa  95.1  4e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.866731  normal  0.631329 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2951  ribosomal protein L10  34.48 
 
 		 186 aa  95.1  5e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0265827  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3689  50S ribosomal protein L10  38.79 
 
 		 172 aa  94.4  8e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1738  50S ribosomal protein L10  39.72 
 
 		 189 aa  94  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1174  50S ribosomal protein L10  34.66 
 
 		 174 aa  93.6  1e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000000920712  normal  0.67375 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2722  ribosomal protein L10  35.14 
 
 		 170 aa  93.6  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0525449  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0479  ribosomal protein L10  35.43 
 
 		 164 aa  93.6  1e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1762  50S ribosomal protein L10  39.72 
 
 		 189 aa  94  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.232126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0698  50S ribosomal protein L10  39.13 
 
 		 228 aa  93.6  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1345  50S ribosomal protein L10  36.14 
 
 		 172 aa  93.2  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0320244  normal  0.100348 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10664  50S ribosomal protein L10  37.34 
 
 		 178 aa  92.8  2e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.50048e-25  normal  0.41253 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0571  50S ribosomal protein L10  36.6 
 
 		 187 aa  93.2  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1956  ribosomal protein L10  32.35 
 
 		 174 aa  93.2  2e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1821  50S ribosomal protein L10  34.68 
 
 		 172 aa  92.4  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0871653  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2724  50S ribosomal protein L10  35.85 
 
 		 166 aa  93.2  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000159716  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2410  50S ribosomal protein L10  35.85 
 
 		 166 aa  93.2  2e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000332682  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0263  50S ribosomal protein L10  36.05 
 
 		 190 aa  93.2  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.273866  normal  0.119153 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6059  50S ribosomal protein L10  36.2 
 
 		 182 aa  93.2  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.749447  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0180  50S ribosomal protein L10  33.33 
 
 		 166 aa  92.4  3e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0693527  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1322  50S ribosomal protein L10  34.1 
 
 		 172 aa  91.7  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.850894  normal  0.161771 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1864  50S ribosomal protein L10  34.25 
 
 		 174 aa  91.3  6e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0922754  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0976  50S ribosomal protein L10  35.12 
 
 		 195 aa  91.3  6e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0194348 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0325  50S ribosomal protein L10  34.25 
 
 		 174 aa  91.3  6e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00522529  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0692  50S ribosomal protein L10  31.76 
 
 		 172 aa  90.9  8e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000112903  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0632  50S ribosomal protein L10  35.26 
 
 		 175 aa  90.9  8e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.346234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1701  50S ribosomal protein L10  35.15 
 
 		 171 aa  90.9  9e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.302531  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0100  50S ribosomal protein L10  32.73 
 
 		 166 aa  90.1  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000689021  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0488  50S ribosomal protein L10  32.5 
 
 		 173 aa  90.5  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.169718  hitchhiker  0.00000169108 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4521  ribosomal protein L10  32.56 
 
 		 200 aa  90.5  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0317  50S ribosomal protein L10  32.5 
 
 		 173 aa  90.5  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.146286  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0857  50S ribosomal protein L10  31.18 
 
 		 177 aa  90.1  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000259828  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3328  50S ribosomal protein L10  33.33 
 
 		 186 aa  90.5  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.211537 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2283  50S ribosomal protein L10  36.97 
 
 		 172 aa  90.1  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0400383  normal  0.2116 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0671  50S ribosomal protein L10  34.5 
 
 		 174 aa  90.1  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3477  50S ribosomal protein L10  34.3 
 
 		 171 aa  89.7  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.232416  hitchhiker  0.0000717521 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3460  50S ribosomal protein L10  36.97 
 
 		 172 aa  89.4  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1529  50S ribosomal protein L10  38.93 
 
 		 172 aa  89.7  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.908936  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1420  50S ribosomal protein L10  33.53 
 
 		 172 aa  88.6  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.291032 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5083  50S ribosomal protein L10  34.68 
 
 		 172 aa  88.6  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.614366  normal  0.894165 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1348  50S ribosomal protein L10  34.68 
 
 		 172 aa  88.6  4e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.223396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3691  ribosomal protein L10  36.72 
 
 		 164 aa  88.6  4e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000101089  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3337  50S ribosomal protein L10  32.95 
 
 		 173 aa  88.6  4e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000271161 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0700  ribosomal protein L10  33.33 
 
 		 174 aa  88.6  4e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.299689  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0924  50S ribosomal protein L10  32.95 
 
 		 173 aa  88.6  4e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0745  50S ribosomal protein L10  34.3 
 
 		 171 aa  88.6  4e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00501407 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0140  50S ribosomal protein L10  33.53 
 
 		 174 aa  88.6  4e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000236563  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>