More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1043 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_1043  ribosomal protein L10  100 
 
 
167 aa  336  8e-92  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.144449  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1038  50S ribosomal protein L10  38.07 
 
 
183 aa  120  8e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.101211  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0234  ribosomal protein L10  34.73 
 
 
164 aa  108  2.0000000000000002e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.675629  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02221  50S ribosomal protein L10  35.93 
 
 
175 aa  108  3e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0204  50S ribosomal protein L10  36.14 
 
 
175 aa  108  3e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02311  50S ribosomal protein L10  35.93 
 
 
175 aa  108  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2344  ribosomal protein L10  36.18 
 
 
173 aa  107  8.000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.032292  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2554  50S ribosomal protein L10  33.71 
 
 
181 aa  107  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0140545  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02201  50S ribosomal protein L10  35.33 
 
 
175 aa  106  1e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.825352  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0632  50S ribosomal protein L10  39.73 
 
 
175 aa  104  4e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.346234  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4011  ribosomal protein L10  35.93 
 
 
175 aa  104  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0274883  hitchhiker  0.0000000471613 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1018  50S ribosomal protein L10  32.54 
 
 
178 aa  104  7e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00251564 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27791  50S ribosomal protein L10  35.37 
 
 
175 aa  103  8e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02201  50S ribosomal protein L10  35.17 
 
 
175 aa  102  3e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.756015  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2469  50S ribosomal protein L10  35.37 
 
 
175 aa  100  7e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.851244  normal  0.156602 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0310  ribosomal protein L10  34.69 
 
 
176 aa  100  8e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.109625  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1762  50S ribosomal protein L10  34.25 
 
 
189 aa  100  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.232126  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1738  50S ribosomal protein L10  34.25 
 
 
189 aa  100  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2154  50S ribosomal protein L10  34.01 
 
 
175 aa  99.4  2e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.44563  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0562  50S ribosomal protein L10  32.7 
 
 
166 aa  98.6  3e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000233555  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0576  50S ribosomal protein L10  32.7 
 
 
166 aa  98.6  3e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000179203  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0700  ribosomal protein L10  33.11 
 
 
174 aa  98.2  5e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.299689  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0180  50S ribosomal protein L10  33.33 
 
 
166 aa  97.8  6e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0693527  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1172  ribosomal protein L10  38.46 
 
 
173 aa  97.8  6e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000357466  unclonable  0.0000000289216 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01070  ribosomal protein L10  31.37 
 
 
172 aa  96.3  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  5.51299e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0263  50S ribosomal protein L10  35.82 
 
 
190 aa  95.9  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.273866  normal  0.119153 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0094  50S ribosomal protein L10  35.22 
 
 
166 aa  95.5  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000793252  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0099  50S ribosomal protein L10  35.22 
 
 
166 aa  95.1  4e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000477259  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0099  50S ribosomal protein L10  35.22 
 
 
166 aa  95.1  4e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000073314  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0095  50S ribosomal protein L10  35.22 
 
 
166 aa  95.1  4e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  8.69083e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0093  50S ribosomal protein L10  35.22 
 
 
166 aa  95.1  4e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000338487  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0099  50S ribosomal protein L10  35.22 
 
 
166 aa  95.1  4e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000718586  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0110  50S ribosomal protein L10  35.22 
 
 
166 aa  95.1  4e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.02318e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0130  50S ribosomal protein L10  35.22 
 
 
166 aa  95.1  4e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000124346  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0120  50S ribosomal protein L10  35.22 
 
 
166 aa  95.1  4e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000126178  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5206  50S ribosomal protein L10  34.59 
 
 
166 aa  93.6  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000252117  unclonable  5.898740000000001e-26 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1569  50S ribosomal protein L10  33.78 
 
 
175 aa  92.4  2e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1634  50S ribosomal protein L10  38.13 
 
 
174 aa  92.8  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02781  50S ribosomal protein L10  33.78 
 
 
175 aa  92.8  2e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.210657  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2423  50S ribosomal protein L10  34.76 
 
 
205 aa  92  3e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1547  50S ribosomal protein L10  37.41 
 
 
173 aa  92  3e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.834427 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0140  50S ribosomal protein L10  37.86 
 
 
174 aa  91.7  4e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000236563  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2724  50S ribosomal protein L10  30.12 
 
 
166 aa  90.9  7e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000159716  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2410  50S ribosomal protein L10  30.12 
 
 
166 aa  90.9  7e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000332682  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0692  50S ribosomal protein L10  32.89 
 
 
172 aa  90.9  8e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000112903  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0093  50S ribosomal protein L10  33.33 
 
 
166 aa  89.7  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000759135  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5961  50S ribosomal protein L10  35.84 
 
 
178 aa  90.5  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.527483  normal  0.892445 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0096  50S ribosomal protein L10  33.55 
 
 
166 aa  90.1  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0100  50S ribosomal protein L10  32.91 
 
 
166 aa  89  3e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000689021  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2470  50S ribosomal protein L10  34.51 
 
 
176 aa  87.8  6e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0147283  hitchhiker  0.00682166 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2783  50S ribosomal protein L10  36.31 
 
 
172 aa  87.8  7e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00189787  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0441  50S ribosomal protein L10  36.69 
 
 
189 aa  87.4  8e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1821  ribosomal protein L10  30.68 
 
 
179 aa  87  9e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1453  50S ribosomal protein L10  33.72 
 
 
173 aa  87  1e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0838  50S ribosomal protein L10P  35.97 
 
 
172 aa  86.7  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0707377  normal  0.0995834 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3691  ribosomal protein L10  32.05 
 
 
164 aa  85.9  2e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000101089  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0408  50S ribosomal protein L10  32.3 
 
 
174 aa  85.9  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.79305e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0757  50S ribosomal protein L10  33.09 
 
 
174 aa  85.9  3e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08440  ribosomal protein L10  33.11 
 
 
173 aa  85.1  4e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.166227  normal  0.704722 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2969  50S ribosomal protein L10  32.08 
 
 
168 aa  84.3  6e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.45658 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3316  50S ribosomal protein L10  32.08 
 
 
168 aa  84.3  6e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.354504  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0276  50S ribosomal protein L10  30.26 
 
 
175 aa  84.7  6e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000204852  hitchhiker  0.000495958 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1387  50S ribosomal protein L10  31.61 
 
 
171 aa  84.3  6e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000123079  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0213  ribosomal protein L10  32.21 
 
 
175 aa  84  9e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.623588  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3036  50S ribosomal protein L10  32.12 
 
 
168 aa  83.2  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0878547 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3191  50S ribosomal protein L10  30.19 
 
 
173 aa  82.8  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.579756  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0183  ribosomal protein L10  27.92 
 
 
176 aa  82.8  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000324199  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2074  50S ribosomal protein L10  35.25 
 
 
172 aa  82.8  0.000000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0567  50S ribosomal protein L10  34.23 
 
 
167 aa  82  0.000000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00969269  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6637  ribosomal protein L10  36.26 
 
 
184 aa  80.9  0.000000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.858869  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2722  ribosomal protein L10  31.71 
 
 
170 aa  80.5  0.000000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0525449  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1302  50S ribosomal protein L10  31.79 
 
 
166 aa  80.1  0.00000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000076628  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3336  50S ribosomal protein L10  30.87 
 
 
173 aa  80.1  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2331  ribosomal protein L10  40.41 
 
 
173 aa  80.5  0.00000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.910628 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2722  50S ribosomal protein L10P  27.7 
 
 
178 aa  80.1  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000314918  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0270  50S ribosomal protein L10  31.76 
 
 
174 aa  78.6  0.00000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.247547  hitchhiker  0.00145059 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1325  ribosomal protein L10  35.26 
 
 
256 aa  77.8  0.00000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2994  50S ribosomal protein L10  33.81 
 
 
173 aa  77.8  0.00000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0617  50S ribosomal protein L10  32.86 
 
 
174 aa  77.8  0.00000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000383704 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1509  ribosomal protein L10  29.66 
 
 
176 aa  77.4  0.00000000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000272992  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5114  ribosomal protein L10  33.12 
 
 
175 aa  77.4  0.00000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.316499  normal  0.732887 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0205  50S ribosomal protein L10  30.46 
 
 
181 aa  77.4  0.00000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000665859  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10664  50S ribosomal protein L10  35.71 
 
 
178 aa  77.4  0.00000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.50048e-25  normal  0.41253 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0313  50S ribosomal protein L10  31.58 
 
 
166 aa  76.6  0.0000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000558823  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1372  50S ribosomal protein L10  29.75 
 
 
178 aa  77  0.0000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.188772  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1124  ribosomal protein L10  34.29 
 
 
174 aa  75.9  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0361  50S ribosomal protein L10  27.39 
 
 
190 aa  75.5  0.0000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000502234  hitchhiker  0.0000804712 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4327  50S ribosomal protein L10  32.68 
 
 
181 aa  75.1  0.0000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1927  ribosomal protein L10  29.22 
 
 
176 aa  74.7  0.0000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0948645  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0310  50S ribosomal protein L10  29.45 
 
 
165 aa  73.9  0.0000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0746923  normal  0.0249908 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4318  50S ribosomal protein L10  32.05 
 
 
187 aa  73.9  0.0000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.561909  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0040  50S ribosomal protein L10  29.73 
 
 
179 aa  73.9  0.0000000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0245031  hitchhiker  0.0000000000023806 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5088  50S ribosomal protein L10  28.93 
 
 
166 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000128873  normal  0.821712 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4521  ribosomal protein L10  32.68 
 
 
200 aa  73.9  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2164  50S ribosomal protein L10P  34.48 
 
 
174 aa  73.6  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0596262  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2865  50S ribosomal protein L10  30.56 
 
 
174 aa  73.2  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.161934  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3477  50S ribosomal protein L10  33.56 
 
 
171 aa  72.8  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.232416  hitchhiker  0.0000717521 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2656  50S ribosomal protein L10  32.28 
 
 
175 aa  72.8  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.220618  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3935  50S ribosomal protein L10  31.21 
 
 
181 aa  72.8  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.193843  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0044  50S ribosomal protein L10  29.05 
 
 
215 aa  73.2  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000127438  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>