More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2423 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE2423  50S ribosomal protein L10  100 
 
 		 205 aa  410  1e-114  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0393  50S ribosomal protein L10  39.35 
 
 		 162 aa  121  9e-27  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2722  ribosomal protein L10  35.98 
 
 		 170 aa  120  9.999999999999999e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0525449  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3691  ribosomal protein L10  41.72 
 
 		 164 aa  119  3e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000101089  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0096  50S ribosomal protein L10  38.36 
 
 		 166 aa  118  7e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0700  ribosomal protein L10  37.75 
 
 		 174 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.299689  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01070  ribosomal protein L10  37.91 
 
 		 172 aa  116  1.9999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  5.51299e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6059  50S ribosomal protein L10  40.82 
 
 		 182 aa  113  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.749447  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0099  50S ribosomal protein L10  35.85 
 
 		 166 aa  111  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000477259  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0120  50S ribosomal protein L10  35.85 
 
 		 166 aa  111  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000126178  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0099  50S ribosomal protein L10  35.85 
 
 		 166 aa  111  7.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000073314  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0095  50S ribosomal protein L10  35.85 
 
 		 166 aa  111  7.000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  8.69083e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0093  50S ribosomal protein L10  35.85 
 
 		 166 aa  111  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000338487  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0130  50S ribosomal protein L10  35.85 
 
 		 166 aa  111  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000124346  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0099  50S ribosomal protein L10  35.85 
 
 		 166 aa  111  7.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000718586  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0110  50S ribosomal protein L10  35.85 
 
 		 166 aa  111  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.02318e-62 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0100  50S ribosomal protein L10  36.48 
 
 		 166 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000689021  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20980  LSU ribosomal protein L10P  37.17 
 
 		 203 aa  109  3e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.996084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0576  50S ribosomal protein L10  37.33 
 
 		 166 aa  109  4.0000000000000004e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000179203  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0562  50S ribosomal protein L10  37.33 
 
 		 166 aa  109  4.0000000000000004e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000233555  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0094  50S ribosomal protein L10  35.22 
 
 		 166 aa  108  6e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000793252  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5206  50S ribosomal protein L10  34.59 
 
 		 166 aa  107  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000252117  unclonable  5.898740000000001e-26 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0180  50S ribosomal protein L10  35.33 
 
 		 166 aa  107  1e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0693527  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1302  50S ribosomal protein L10  36.36 
 
 		 166 aa  106  2e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000076628  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0310  ribosomal protein L10  37.33 
 
 		 176 aa  105  3e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.109625  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0698  50S ribosomal protein L10  39.27 
 
 		 228 aa  105  4e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0093  50S ribosomal protein L10  33.96 
 
 		 166 aa  105  5e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000759135  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0838  50S ribosomal protein L10P  37.33 
 
 		 172 aa  105  6e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0707377  normal  0.0995834 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2724  50S ribosomal protein L10  34.59 
 
 		 166 aa  103  2e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000159716  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2410  50S ribosomal protein L10  34.59 
 
 		 166 aa  103  2e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000332682  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2722  50S ribosomal protein L10P  33.11 
 
 		 178 aa  103  3e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000314918  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0567  50S ribosomal protein L10  35.1 
 
 		 167 aa  102  3e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00969269  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0504  50S ribosomal protein L10  35.44 
 
 		 180 aa  101  6e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000340487  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1667  50S ribosomal protein L10  36.97 
 
 		 173 aa  101  6e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4018  ribosomal protein L10  32.21 
 
 		 174 aa  101  9e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.491975 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0571  50S ribosomal protein L10  37.93 
 
 		 187 aa  100  1e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2179  50S ribosomal protein L10  37.98 
 
 		 175 aa  100  1e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.82519  normal  0.0244994 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1372  50S ribosomal protein L10  34.18 
 
 		 178 aa  100  2e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.188772  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1889  50S ribosomal protein L10  37.98 
 
 		 175 aa  99.8  3e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00905403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0441  50S ribosomal protein L10  34.78 
 
 		 189 aa  99.8  3e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0408  50S ribosomal protein L10  33.12 
 
 		 174 aa  98.2  7e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.79305e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1072  LSU ribosomal protein L10P  39.57 
 
 		 174 aa  97.1  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.37271  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17270  LSU ribosomal protein L10P  35.95 
 
 		 173 aa  97.8  1e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0692  50S ribosomal protein L10  30.67 
 
 		 172 aa  97.4  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000112903  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1124  ribosomal protein L10  39.44 
 
 		 174 aa  97.8  1e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2074  50S ribosomal protein L10  35.81 
 
 		 172 aa  96.7  2e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1821  ribosomal protein L10  31.84 
 
 		 179 aa  96.7  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0578  ribosomal protein L10  37.8 
 
 		 212 aa  97.1  2e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.141737  normal  0.0136421 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1804  50S ribosomal protein L10P  36 
 
 		 171 aa  96.7  2e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.160084 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0618  ribosomal protein L10  40.31 
 
 		 173 aa  95.9  3e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5961  50S ribosomal protein L10  38.03 
 
 		 178 aa  95.9  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.527483  normal  0.892445 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2656  50S ribosomal protein L10  34.88 
 
 		 175 aa  95.9  4e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.220618  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0226  ribosomal protein L10  38.67 
 
 		 173 aa  95.5  5e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4521  ribosomal protein L10  35.95 
 
 		 200 aa  95.5  5e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3935  50S ribosomal protein L10  38.1 
 
 		 181 aa  95.1  6e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.193843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0313  50S ribosomal protein L10  33.12 
 
 		 166 aa  94.7  7e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000558823  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0385  50S ribosomal protein L10  37.34 
 
 		 177 aa  94  1e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0360  50S ribosomal protein L10  37.34 
 
 		 177 aa  94  1e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4327  50S ribosomal protein L10  38.1 
 
 		 181 aa  94.4  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0449  50S ribosomal protein L10  32.47 
 
 		 175 aa  94  1e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1387  50S ribosomal protein L10  31.82 
 
 		 171 aa  94.4  1e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000123079  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0671  50S ribosomal protein L10  34.19 
 
 		 174 aa  94.4  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1064  50S ribosomal protein L10  39.68 
 
 		 175 aa  93.6  2e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0220515  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0757  50S ribosomal protein L10  31.79 
 
 		 174 aa  93.6  2e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0389  ribosomal protein L10  31.41 
 
 		 174 aa  93.6  2e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1529  ribosomal protein L10  33.99 
 
 		 183 aa  92.8  4e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000554953  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2865  50S ribosomal protein L10  33.11 
 
 		 174 aa  92.4  4e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.161934  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0276  50S ribosomal protein L10  32.47 
 
 		 175 aa  92.4  4e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000204852  hitchhiker  0.000495958 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4351  ribosomal protein L10  38.52 
 
 		 184 aa  92.4  4e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29850  LSU ribosomal protein L10P  35.71 
 
 		 176 aa  92.4  4e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2038  50S ribosomal protein L10  35.66 
 
 		 175 aa  92  5e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0258299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2333  50S ribosomal protein L10  36.09 
 
 		 175 aa  92  5e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00442702  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0351  50S ribosomal protein L10  36.36 
 
 		 159 aa  92  6e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00255818  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1043  ribosomal protein L10  34.76 
 
 		 167 aa  91.7  7e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.144449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6637  ribosomal protein L10  33.94 
 
 		 184 aa  91.3  9e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.858869  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0297  50S ribosomal protein L10  34.33 
 
 		 172 aa  91.3  9e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2994  50S ribosomal protein L10  34.48 
 
 		 173 aa  90.5  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2223  50S ribosomal protein L10  32.68 
 
 		 174 aa  90.9  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00194446 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2783  50S ribosomal protein L10  34.19 
 
 		 172 aa  90.9  1e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00189787  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2669  ribosomal protein L10  37.42 
 
 		 175 aa  90.9  1e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.69004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0924  50S ribosomal protein L10  32.24 
 
 		 173 aa  90.1  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1590  50S ribosomal protein L10  33.77 
 
 		 174 aa  90.1  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0541  50S ribosomal protein L10  38.03 
 
 		 174 aa  90.1  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.367918  normal  0.103583 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3337  50S ribosomal protein L10  32.24 
 
 		 173 aa  90.1  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000271161 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2361  50S ribosomal protein L10  33.11 
 
 		 174 aa  90.1  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2273  50S ribosomal protein L10  33.11 
 
 		 174 aa  89.4  3e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1453  50S ribosomal protein L10  32.9 
 
 		 173 aa  89.7  3e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5114  ribosomal protein L10  34.55 
 
 		 175 aa  89.7  3e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.316499  normal  0.732887 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1337  50S ribosomal protein L10  32.45 
 
 		 174 aa  89  5e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.900212  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0361  50S ribosomal protein L10  30.32 
 
 		 190 aa  89  5e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000502234  hitchhiker  0.0000804712 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0213  ribosomal protein L10  30.87 
 
 		 175 aa  88.6  6e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.623588  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08440  ribosomal protein L10  30.52 
 
 		 173 aa  88.2  7e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.166227  normal  0.704722 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1018  ribosomal protein L10  32.67 
 
 		 202 aa  88.2  7e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2164  50S ribosomal protein L10P  34.23 
 
 		 174 aa  88.2  7e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0596262  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0617  50S ribosomal protein L10  33.55 
 
 		 174 aa  87.8  9e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000383704 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1325  ribosomal protein L10  36.13 
 
 		 256 aa  87.8  9e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0710  50S ribosomal protein L10  33.54 
 
 		 176 aa  87.8  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.303715  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3477  50S ribosomal protein L10  35.33 
 
 		 171 aa  87.4  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.232416  hitchhiker  0.0000717521 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0271  50S ribosomal protein L10  32.68 
 
 		 178 aa  87.8  1e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00121092  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3157  ribosomal protein L10  36.14 
 
 		 173 aa  87.4  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500065  normal  0.290514 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>