More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2994 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_2994  50S ribosomal protein L10  100 
 
 		 173 aa  348  3e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1453  50S ribosomal protein L10  71.68 
 
 		 173 aa  251  5.000000000000001e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0441  50S ribosomal protein L10  70.52 
 
 		 189 aa  241  3e-63  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1634  50S ribosomal protein L10  70.52 
 
 		 174 aa  240  6e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2074  50S ribosomal protein L10  59.06 
 
 		 172 aa  204  6e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2783  50S ribosomal protein L10  55.56 
 
 		 172 aa  193  1e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00189787  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0700  ribosomal protein L10  46.47 
 
 		 174 aa  151  2.9999999999999998e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.299689  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0838  50S ribosomal protein L10P  43.93 
 
 		 172 aa  136  2e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0707377  normal  0.0995834 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01070  ribosomal protein L10  42.11 
 
 		 172 aa  130  7.999999999999999e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  5.51299e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0692  50S ribosomal protein L10  39.18 
 
 		 172 aa  127  8.000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000112903  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0857  50S ribosomal protein L10  42.11 
 
 		 177 aa  124  7e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000259828  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1547  50S ribosomal protein L10  40.46 
 
 		 173 aa  120  7e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.834427 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2470  50S ribosomal protein L10  40.12 
 
 		 176 aa  120  8e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0147283  hitchhiker  0.00682166 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0757  50S ribosomal protein L10  36.09 
 
 		 174 aa  109  2.0000000000000002e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0276  50S ribosomal protein L10  37.5 
 
 		 175 aa  107  8.000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000204852  hitchhiker  0.000495958 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0205  50S ribosomal protein L10  38.24 
 
 		 181 aa  107  9.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000665859  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4018  ribosomal protein L10  38.18 
 
 		 174 aa  106  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.491975 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0924  50S ribosomal protein L10  36.99 
 
 		 173 aa  106  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3337  50S ribosomal protein L10  36.99 
 
 		 173 aa  106  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000271161 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0213  ribosomal protein L10  33.92 
 
 		 175 aa  105  3e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.623588  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2722  50S ribosomal protein L10P  37.35 
 
 		 178 aa  105  3e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000314918  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1337  50S ribosomal protein L10  39.53 
 
 		 174 aa  105  4e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.900212  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0183  ribosomal protein L10  35.09 
 
 		 176 aa  105  4e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000324199  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1529  ribosomal protein L10  38.24 
 
 		 183 aa  104  7e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000554953  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0617  50S ribosomal protein L10  37.79 
 
 		 174 aa  104  8e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000383704 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0408  50S ribosomal protein L10  37.21 
 
 		 174 aa  103  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.79305e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2164  50S ribosomal protein L10P  37.57 
 
 		 174 aa  103  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0596262  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2865  50S ribosomal protein L10  36.63 
 
 		 174 aa  102  3e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.161934  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1059  50S ribosomal protein L10  36.63 
 
 		 174 aa  102  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0531801  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0671  50S ribosomal protein L10  36.26 
 
 		 174 aa  102  3e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0270  50S ribosomal protein L10  37.65 
 
 		 174 aa  101  6e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.247547  hitchhiker  0.00145059 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1784  50S ribosomal protein L10  37.64 
 
 		 181 aa  99.8  2e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2722  ribosomal protein L10  33.53 
 
 		 170 aa  99  3e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0525449  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0504  50S ribosomal protein L10  33.33 
 
 		 180 aa  99.4  3e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000340487  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2344  ribosomal protein L10  35.29 
 
 		 173 aa  98.6  4e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.032292  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0310  ribosomal protein L10  36.09 
 
 		 176 aa  97.4  9e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.109625  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5088  50S ribosomal protein L10  37.28 
 
 		 166 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000128873  normal  0.821712 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0096  50S ribosomal protein L10  36.14 
 
 		 166 aa  97.4  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06150  50S ribosomal protein L10  37.57 
 
 		 166 aa  97.1  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0232  50S ribosomal protein L10  32.95 
 
 		 172 aa  96.7  2e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0685965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4318  50S ribosomal protein L10  34.44 
 
 		 187 aa  95.5  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.561909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1954  50S ribosomal protein L10  41.78 
 
 		 174 aa  95.5  3e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.262202  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0300  ribosomal protein L10  36.09 
 
 		 181 aa  95.1  4e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000817286  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0100  50S ribosomal protein L10  36.75 
 
 		 166 aa  95.1  4e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000689021  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1302  50S ribosomal protein L10  37.87 
 
 		 166 aa  95.1  5e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000076628  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1927  ribosomal protein L10  35.84 
 
 		 176 aa  95.1  5e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0948645  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08740  50S ribosomal protein L10  37.57 
 
 		 166 aa  95.1  5e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00037754 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0828  50S ribosomal protein L10  37.57 
 
 		 166 aa  95.1  5e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0279492  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0479  50S ribosomal protein L10  34.66 
 
 		 179 aa  94  9e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.488036  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0464  50S ribosomal protein L10  34.66 
 
 		 179 aa  94  9e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0359791  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0567  50S ribosomal protein L10  38.01 
 
 		 167 aa  94  1e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00969269  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0745  50S ribosomal protein L10  32.56 
 
 		 171 aa  93.6  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00501407 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08440  ribosomal protein L10  31.79 
 
 		 173 aa  92.8  2e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.166227  normal  0.704722 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2697  50S ribosomal protein L10P  37.16 
 
 		 172 aa  92.4  3e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.561782  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1458  50S ribosomal protein L10  37.5 
 
 		 159 aa  92.4  3e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000221032  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0231  50S ribosomal protein L10  31.98 
 
 		 172 aa  92.4  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0103356  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3918  50S ribosomal protein L10  35.26 
 
 		 166 aa  92  4e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3328  50S ribosomal protein L10  33.33 
 
 		 186 aa  92  4e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.211537 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1106  ribosomal protein L10  36.36 
 
 		 176 aa  92  4e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0567771  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0507  50S ribosomal protein L10  37.5 
 
 		 159 aa  91.7  4e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000655679  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3691  ribosomal protein L10  37.06 
 
 		 164 aa  92  4e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000101089  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2423  50S ribosomal protein L10  34.48 
 
 		 205 aa  91.3  6e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1804  50S ribosomal protein L10P  40.74 
 
 		 171 aa  91.3  6e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.160084 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0526  50S ribosomal protein L10  37.5 
 
 		 159 aa  90.9  7e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.142497  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3477  50S ribosomal protein L10  38.16 
 
 		 171 aa  90.9  8e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.232416  hitchhiker  0.0000717521 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4758  50S ribosomal protein L10  32.95 
 
 		 166 aa  90.9  9e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00494482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0175  50S ribosomal protein L10  34.91 
 
 		 165 aa  90.5  9e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000220587  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2808  50S ribosomal protein L10  35.71 
 
 		 165 aa  90.1  1e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000036942  normal  0.222423 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0337  50S ribosomal protein L10  35.71 
 
 		 165 aa  90.1  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.239078  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0355  50S ribosomal protein L10  31.98 
 
 		 172 aa  90.1  1e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000413063  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3347  50S ribosomal protein L10  40 
 
 		 167 aa  90.1  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.862427  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3862  50S ribosomal protein L10  35.71 
 
 		 165 aa  90.1  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000104786  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0991  50S ribosomal protein L10  33.53 
 
 		 176 aa  89.4  2e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000204805  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2681  50S ribosomal protein L10  31.98 
 
 		 172 aa  89.4  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000132453  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1372  50S ribosomal protein L10  32.56 
 
 		 178 aa  90.1  2e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.188772  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0139  50S ribosomal protein L10  34.1 
 
 		 166 aa  89.4  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000054937  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0149  50S ribosomal protein L10  34.1 
 
 		 165 aa  89  3e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000191294  normal  0.034689 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0412  50S ribosomal protein L10P  38.97 
 
 		 167 aa  89  3e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.33563  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1387  50S ribosomal protein L10  34.71 
 
 		 171 aa  89  3e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000123079  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0445  50S ribosomal protein L10  33.14 
 
 		 166 aa  88.6  4e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.470652  unclonable  0.000000241771 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3453  50S ribosomal protein L10  34.84 
 
 		 174 aa  88.6  4e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0925685  normal  0.446601 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0475  50S ribosomal protein L10  33.14 
 
 		 166 aa  88.6  4e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.372242  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3887  50S ribosomal protein L10  34.32 
 
 		 165 aa  88.2  5e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.452938  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3733  50S ribosomal protein L10  34.32 
 
 		 165 aa  88.2  5e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0571  50S ribosomal protein L10  35.09 
 
 		 187 aa  88.2  5e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0478  50S ribosomal protein L10  33.14 
 
 		 195 aa  88.2  6e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00597987  hitchhiker  0.00527924 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0617  ribosomal protein L10  33.53 
 
 		 166 aa  87.8  6e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.532211  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4557  50S ribosomal protein L10  33.53 
 
 		 166 aa  88.2  6e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.669843  decreased coverage  0.0090203 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0867  50S ribosomal protein L10  31.95 
 
 		 175 aa  87.8  6e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0389  ribosomal protein L10  32.94 
 
 		 174 aa  87.8  7e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0179  50S ribosomal protein L10  34.09 
 
 		 161 aa  87.8  7e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.215322  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1018  50S ribosomal protein L10  30.23 
 
 		 178 aa  87.8  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00251564 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_863  ribosomal protein L10  32.94 
 
 		 176 aa  87.4  8e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000130926  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3036  50S ribosomal protein L10  37.5 
 
 		 168 aa  87.4  9e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0878547 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0286  50S ribosomal protein L10  30.46 
 
 		 172 aa  87.4  9e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000520195  hitchhiker  0.00386218 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0222  50S ribosomal protein L10  33.53 
 
 		 166 aa  87  1e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5206  50S ribosomal protein L10  33.13 
 
 		 166 aa  86.7  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000252117  unclonable  5.898740000000001e-26 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0185  50S ribosomal protein L10  33.53 
 
 		 166 aa  87  1e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000592329  normal  0.0118628 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0275  50S ribosomal protein L10  34.91 
 
 		 165 aa  87  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000206065  normal  0.0858323 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0190  50S ribosomal protein L10  33.53 
 
 		 166 aa  87  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000177262  hitchhiker  0.000758972 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>