More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0300 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0300  ribosomal protein L10  100 
 
 		 181 aa  355  2.9999999999999997e-97  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000817286  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0700  ribosomal protein L10  42.35 
 
 		 174 aa  125  5e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.299689  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3337  50S ribosomal protein L10  42.01 
 
 		 173 aa  120  9e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000271161 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0924  50S ribosomal protein L10  42.01 
 
 		 173 aa  120  9e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2223  50S ribosomal protein L10  37.06 
 
 		 174 aa  117  7.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00194446 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0096  50S ribosomal protein L10  38.85 
 
 		 166 aa  117  9e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0857  50S ribosomal protein L10  39.53 
 
 		 177 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000259828  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1059  50S ribosomal protein L10  42.01 
 
 		 174 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0531801  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0100  50S ribosomal protein L10  38.15 
 
 		 166 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000689021  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0838  50S ribosomal protein L10P  37.95 
 
 		 172 aa  114  1.0000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0707377  normal  0.0995834 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0276  50S ribosomal protein L10  37.21 
 
 		 175 aa  112  3e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000204852  hitchhiker  0.000495958 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0567  50S ribosomal protein L10  36.77 
 
 		 167 aa  112  3e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00969269  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1547  50S ribosomal protein L10  39.88 
 
 		 173 aa  110  8.000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.834427 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1302  50S ribosomal protein L10  35.26 
 
 		 166 aa  110  1.0000000000000001e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000076628  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0205  50S ribosomal protein L10  38.01 
 
 		 181 aa  109  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000665859  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0256  50S ribosomal protein L10  35.47 
 
 		 178 aa  109  3e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000651654  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0671  50S ribosomal protein L10  40.36 
 
 		 174 aa  108  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1387  50S ribosomal protein L10  36.88 
 
 		 171 aa  108  4.0000000000000004e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000123079  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2722  ribosomal protein L10  37.01 
 
 		 170 aa  107  1e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0525449  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0094  50S ribosomal protein L10  35.14 
 
 		 166 aa  107  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000793252  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2865  50S ribosomal protein L10  39.05 
 
 		 174 aa  106  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.161934  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0093  50S ribosomal protein L10  32.95 
 
 		 166 aa  106  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000759135  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5206  50S ribosomal protein L10  32.95 
 
 		 166 aa  106  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000252117  unclonable  5.898740000000001e-26 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2361  50S ribosomal protein L10  34.12 
 
 		 174 aa  106  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2273  50S ribosomal protein L10  34.12 
 
 		 174 aa  105  3e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0310  ribosomal protein L10  39.64 
 
 		 176 aa  105  3e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.109625  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01070  ribosomal protein L10  35.12 
 
 		 172 aa  105  4e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  5.51299e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0183  ribosomal protein L10  34.09 
 
 		 176 aa  105  4e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000324199  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0099  50S ribosomal protein L10  35.14 
 
 		 166 aa  104  6e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000477259  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0099  50S ribosomal protein L10  35.14 
 
 		 166 aa  104  6e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000073314  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0095  50S ribosomal protein L10  35.14 
 
 		 166 aa  104  6e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  8.69083e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0093  50S ribosomal protein L10  35.14 
 
 		 166 aa  104  6e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000338487  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0110  50S ribosomal protein L10  35.14 
 
 		 166 aa  104  6e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.02318e-62 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0120  50S ribosomal protein L10  35.14 
 
 		 166 aa  104  6e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000126178  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0099  50S ribosomal protein L10  35.14 
 
 		 166 aa  104  6e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000718586  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1590  50S ribosomal protein L10  34.12 
 
 		 174 aa  104  6e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0130  50S ribosomal protein L10  35.14 
 
 		 166 aa  104  6e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000124346  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2722  50S ribosomal protein L10P  36.36 
 
 		 178 aa  104  9e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000314918  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0692  50S ribosomal protein L10  36.31 
 
 		 172 aa  103  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000112903  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0408  50S ribosomal protein L10  34.68 
 
 		 174 aa  103  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.79305e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1337  50S ribosomal protein L10  39.31 
 
 		 174 aa  103  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.900212  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0617  50S ribosomal protein L10  38.46 
 
 		 174 aa  102  3e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000383704 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0270  50S ribosomal protein L10  33.33 
 
 		 174 aa  102  3e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.247547  hitchhiker  0.00145059 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2344  ribosomal protein L10  35.12 
 
 		 173 aa  101  5e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.032292  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1145  ribosomal protein L10  35.8 
 
 		 182 aa  101  6e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000000394665  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1529  ribosomal protein L10  37.95 
 
 		 183 aa  99  3e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000554953  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2724  50S ribosomal protein L10  32.91 
 
 		 166 aa  98.6  5e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000159716  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2410  50S ribosomal protein L10  32.91 
 
 		 166 aa  98.6  5e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000332682  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1372  50S ribosomal protein L10  37.57 
 
 		 178 aa  97.8  8e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.188772  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0710  50S ribosomal protein L10  35.88 
 
 		 176 aa  97.1  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.303715  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0213  ribosomal protein L10  33.14 
 
 		 175 aa  96.3  2e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.623588  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0757  50S ribosomal protein L10  32.37 
 
 		 174 aa  96.3  2e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2470  50S ribosomal protein L10  33.53 
 
 		 176 aa  95.5  3e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0147283  hitchhiker  0.00682166 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0828  50S ribosomal protein L10  34.64 
 
 		 166 aa  95.1  4e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0279492  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3918  50S ribosomal protein L10  34.64 
 
 		 166 aa  95.5  4e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08740  50S ribosomal protein L10  34.64 
 
 		 166 aa  95.1  4e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00037754 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0488  50S ribosomal protein L10  33.93 
 
 		 173 aa  95.1  5e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.169718  hitchhiker  0.00000169108 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2994  50S ribosomal protein L10  36.09 
 
 		 173 aa  95.1  5e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0317  50S ribosomal protein L10  33.93 
 
 		 173 aa  95.1  5e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.146286  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3691  ribosomal protein L10  37.04 
 
 		 164 aa  95.1  5e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000101089  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3036  50S ribosomal protein L10  33.12 
 
 		 168 aa  94  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0878547 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1417  50S ribosomal protein L10  35.22 
 
 		 197 aa  94  1e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000013127  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0313  50S ribosomal protein L10  32.48 
 
 		 166 aa  93.6  1e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000558823  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0389  ribosomal protein L10  34.13 
 
 		 174 aa  93.2  2e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3328  50S ribosomal protein L10  35.58 
 
 		 186 aa  92.8  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.211537 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0231  50S ribosomal protein L10  32.74 
 
 		 172 aa  93.2  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0103356  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2074  50S ribosomal protein L10  33.53 
 
 		 172 aa  92.8  2e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0271  50S ribosomal protein L10  34.18 
 
 		 178 aa  92.8  3e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00121092  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4318  50S ribosomal protein L10  34.36 
 
 		 187 aa  92  4e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.561909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0361  50S ribosomal protein L10  32.9 
 
 		 190 aa  92  4e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000502234  hitchhiker  0.0000804712 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06150  50S ribosomal protein L10  33.99 
 
 		 166 aa  91.7  5e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0478  50S ribosomal protein L10  32.68 
 
 		 195 aa  91.3  6e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00597987  hitchhiker  0.00527924 
 
 
-
 
NC_002936  DET0991  50S ribosomal protein L10  32.34 
 
 		 176 aa  90.9  8e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000204805  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0445  50S ribosomal protein L10  32.68 
 
 		 166 aa  91.3  8e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.470652  unclonable  0.000000241771 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0180  50S ribosomal protein L10  31.41 
 
 		 166 aa  90.9  8e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0693527  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0475  50S ribosomal protein L10  32.68 
 
 		 166 aa  91.3  8e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.372242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3453  50S ribosomal protein L10  33.55 
 
 		 174 aa  90.5  1e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0925685  normal  0.446601 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1453  50S ribosomal protein L10  33.93 
 
 		 173 aa  90.1  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0576  50S ribosomal protein L10  31.41 
 
 		 166 aa  90.1  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000179203  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3191  50S ribosomal protein L10  32.5 
 
 		 173 aa  89.4  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.579756  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5088  50S ribosomal protein L10  33.12 
 
 		 166 aa  89.7  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000128873  normal  0.821712 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2469  50S ribosomal protein L10  32.48 
 
 		 175 aa  90.1  2e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.851244  normal  0.156602 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1956  ribosomal protein L10  28.65 
 
 		 174 aa  90.1  2e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0412  50S ribosomal protein L10P  33.55 
 
 		 167 aa  89.4  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.33563  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4758  50S ribosomal protein L10  32.68 
 
 		 166 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00494482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0562  50S ribosomal protein L10  31.41 
 
 		 166 aa  90.1  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000233555  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4557  50S ribosomal protein L10  32.03 
 
 		 166 aa  88.6  4e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.669843  decreased coverage  0.0090203 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20980  LSU ribosomal protein L10P  33.14 
 
 		 203 aa  89  4e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.996084  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3316  50S ribosomal protein L10  31.25 
 
 		 168 aa  88.6  5e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.354504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2164  50S ribosomal protein L10P  33.33 
 
 		 174 aa  88.2  5e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0596262  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0882  50S ribosomal protein L10  31.21 
 
 		 176 aa  88.6  5e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.629984  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2969  50S ribosomal protein L10  31.25 
 
 		 168 aa  88.6  5e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.45658 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4018  ribosomal protein L10  31.93 
 
 		 174 aa  87.8  7e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.491975 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_863  ribosomal protein L10  31.14 
 
 		 176 aa  87.8  7e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000130926  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0922  50S ribosomal protein L10  32.54 
 
 		 176 aa  87.4  9e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00116615  hitchhiker  0.00000161737 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0044  50S ribosomal protein L10  32.68 
 
 		 215 aa  87.4  1e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000127438  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0617  ribosomal protein L10  31.37 
 
 		 166 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.532211  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1106  ribosomal protein L10  34.12 
 
 		 176 aa  87  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0567771  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27791  50S ribosomal protein L10  30.57 
 
 		 175 aa  87  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0040  50S ribosomal protein L10  32.03 
 
 		 179 aa  86.3  2e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0245031  hitchhiker  0.0000000000023806 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>