More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_2074 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_2074  50S ribosomal protein L10  100 
 
 		 172 aa  348  2e-95  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1453  50S ribosomal protein L10  56.47 
 
 		 173 aa  209  2e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2783  50S ribosomal protein L10  58.48 
 
 		 172 aa  204  4e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00189787  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2994  50S ribosomal protein L10  59.06 
 
 		 173 aa  204  6e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0441  50S ribosomal protein L10  55.88 
 
 		 189 aa  202  2e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1634  50S ribosomal protein L10  58.48 
 
 		 174 aa  202  2e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0700  ribosomal protein L10  47.67 
 
 		 174 aa  164  4e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.299689  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1547  50S ribosomal protein L10  46.78 
 
 		 173 aa  163  9e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.834427 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0692  50S ribosomal protein L10  43.6 
 
 		 172 aa  148  4e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000112903  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2865  50S ribosomal protein L10  43.93 
 
 		 174 aa  139  3e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.161934  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1337  50S ribosomal protein L10  43.35 
 
 		 174 aa  137  7e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.900212  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0276  50S ribosomal protein L10  40.35 
 
 		 175 aa  134  6.0000000000000005e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000204852  hitchhiker  0.000495958 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0617  50S ribosomal protein L10  42.77 
 
 		 174 aa  134  7.000000000000001e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000383704 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0183  ribosomal protein L10  39.41 
 
 		 176 aa  133  9.999999999999999e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000324199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0838  50S ribosomal protein L10P  40.35 
 
 		 172 aa  132  1.9999999999999998e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0707377  normal  0.0995834 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1059  50S ribosomal protein L10  40.46 
 
 		 174 aa  131  3.9999999999999996e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0531801  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0310  ribosomal protein L10  44.91 
 
 		 176 aa  130  9e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.109625  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01070  ribosomal protein L10  41.18 
 
 		 172 aa  130  1.0000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  5.51299e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0671  50S ribosomal protein L10  41.52 
 
 		 174 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0857  50S ribosomal protein L10  40.94 
 
 		 177 aa  127  9.000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000259828  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2470  50S ribosomal protein L10  39.88 
 
 		 176 aa  126  1.0000000000000001e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0147283  hitchhiker  0.00682166 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2722  ribosomal protein L10  40.12 
 
 		 170 aa  127  1.0000000000000001e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0525449  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3337  50S ribosomal protein L10  39.53 
 
 		 173 aa  124  5e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000271161 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0924  50S ribosomal protein L10  39.53 
 
 		 173 aa  124  5e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0205  50S ribosomal protein L10  38.95 
 
 		 181 aa  122  3e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000665859  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1927  ribosomal protein L10  37.65 
 
 		 176 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0948645  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0355  50S ribosomal protein L10  38.37 
 
 		 172 aa  118  3.9999999999999996e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000413063  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0231  50S ribosomal protein L10  38.37 
 
 		 172 aa  118  4.9999999999999996e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0103356  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0408  50S ribosomal protein L10  38.24 
 
 		 174 aa  115  3.9999999999999997e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.79305e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0270  50S ribosomal protein L10  37.21 
 
 		 174 aa  114  6.9999999999999995e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.247547  hitchhiker  0.00145059 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0317  50S ribosomal protein L10  34.88 
 
 		 173 aa  113  1.0000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0060406  hitchhiker  0.00087235 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0213  ribosomal protein L10  33.73 
 
 		 175 aa  112  2.0000000000000002e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.623588  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0571  50S ribosomal protein L10  38.37 
 
 		 187 aa  112  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2681  50S ribosomal protein L10  36.63 
 
 		 172 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000132453  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2344  ribosomal protein L10  35.12 
 
 		 173 aa  112  2.0000000000000002e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.032292  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5206  50S ribosomal protein L10  39.16 
 
 		 166 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000252117  unclonable  5.898740000000001e-26 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0093  50S ribosomal protein L10  39.16 
 
 		 166 aa  111  6e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000759135  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1964  50S ribosomal protein L10  33.72 
 
 		 172 aa  110  8.000000000000001e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.202865  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1529  ribosomal protein L10  37.06 
 
 		 183 aa  110  1.0000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000554953  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0099  50S ribosomal protein L10  38.55 
 
 		 166 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000477259  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0099  50S ribosomal protein L10  38.55 
 
 		 166 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000073314  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0095  50S ribosomal protein L10  38.55 
 
 		 166 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  8.69083e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0093  50S ribosomal protein L10  38.55 
 
 		 166 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000338487  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0120  50S ribosomal protein L10  38.55 
 
 		 166 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000126178  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0110  50S ribosomal protein L10  38.55 
 
 		 166 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.02318e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0099  50S ribosomal protein L10  38.55 
 
 		 166 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000718586  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0130  50S ribosomal protein L10  38.55 
 
 		 166 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000124346  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2273  50S ribosomal protein L10  36.78 
 
 		 174 aa  109  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0094  50S ribosomal protein L10  37.95 
 
 		 166 aa  108  3e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000793252  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1590  50S ribosomal protein L10  37.36 
 
 		 174 aa  108  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0286  50S ribosomal protein L10  34.88 
 
 		 172 aa  108  3e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000520195  hitchhiker  0.00386218 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2361  50S ribosomal protein L10  36.09 
 
 		 174 aa  108  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0194  50S ribosomal protein L10  34.88 
 
 		 172 aa  108  5e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000548969  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0180  50S ribosomal protein L10  35.54 
 
 		 166 aa  107  7.000000000000001e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0693527  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0576  50S ribosomal protein L10  35.54 
 
 		 166 aa  107  9.000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000179203  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0562  50S ribosomal protein L10  35.54 
 
 		 166 aa  107  9.000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000233555  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2223  50S ribosomal protein L10  35.5 
 
 		 174 aa  106  1e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00194446 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1821  ribosomal protein L10  33.14 
 
 		 179 aa  106  1e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0297  50S ribosomal protein L10  40.79 
 
 		 172 aa  105  2e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0464  50S ribosomal protein L10  36.16 
 
 		 179 aa  105  4e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0359791  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0479  50S ribosomal protein L10  36.16 
 
 		 179 aa  105  4e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.488036  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6059  50S ribosomal protein L10  37.14 
 
 		 182 aa  105  4e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.749447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0757  50S ribosomal protein L10  33.33 
 
 		 174 aa  104  6e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1784  50S ribosomal protein L10  36.52 
 
 		 181 aa  103  1e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0389  ribosomal protein L10  33.93 
 
 		 174 aa  103  1e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2722  50S ribosomal protein L10P  33.53 
 
 		 178 aa  103  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000314918  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3191  50S ribosomal protein L10  37.18 
 
 		 173 aa  102  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.579756  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2164  50S ribosomal protein L10P  37.21 
 
 		 174 aa  102  3e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0596262  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4018  ribosomal protein L10  34.3 
 
 		 174 aa  102  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.491975 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3036  50S ribosomal protein L10  38.37 
 
 		 168 aa  101  6e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0878547 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17270  LSU ribosomal protein L10P  36.75 
 
 		 173 aa  101  6e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2697  50S ribosomal protein L10P  35.1 
 
 		 172 aa  100  7e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.561782  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3316  50S ribosomal protein L10  40.27 
 
 		 168 aa  100  9e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.354504  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2969  50S ribosomal protein L10  40.27 
 
 		 168 aa  100  9e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.45658 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1458  50S ribosomal protein L10  38.36 
 
 		 159 aa  100  1e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000221032  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0507  50S ribosomal protein L10  37.74 
 
 		 159 aa  99.4  2e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000655679  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0351  ribosomal protein L10  37.5 
 
 		 160 aa  99.4  2e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0874946  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1345  50S ribosomal protein L10  35.76 
 
 		 172 aa  99  3e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0320244  normal  0.100348 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0317  50S ribosomal protein L10  36.53 
 
 		 173 aa  99  3e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.146286  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0488  50S ribosomal protein L10  36.53 
 
 		 173 aa  99  3e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.169718  hitchhiker  0.00000169108 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0526  50S ribosomal protein L10  37.74 
 
 		 159 aa  98.6  4e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.142497  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1372  50S ribosomal protein L10  31.4 
 
 		 178 aa  98.6  4e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.188772  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0698  50S ribosomal protein L10  38.95 
 
 		 228 aa  97.4  8e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3477  50S ribosomal protein L10  37.58 
 
 		 171 aa  97.4  9e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.232416  hitchhiker  0.0000717521 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29850  LSU ribosomal protein L10P  35.88 
 
 		 176 aa  97.4  9e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2423  50S ribosomal protein L10  35.81 
 
 		 205 aa  97.1  1e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0385  50S ribosomal protein L10  33.72 
 
 		 177 aa  96.7  1e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0360  50S ribosomal protein L10  33.72 
 
 		 177 aa  96.7  1e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2656  50S ribosomal protein L10  34.88 
 
 		 175 aa  97.1  1e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.220618  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0632  50S ribosomal protein L10  35.93 
 
 		 175 aa  96.7  1e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.346234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3594  50S ribosomal protein L10  40.71 
 
 		 178 aa  96.7  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.196569  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0922  50S ribosomal protein L10  33.53 
 
 		 176 aa  97.1  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00116615  hitchhiker  0.00000161737 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0504  50S ribosomal protein L10  32.22 
 
 		 180 aa  96.7  1e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000340487  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3336  50S ribosomal protein L10  36.6 
 
 		 173 aa  96.7  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0232  50S ribosomal protein L10  31.58 
 
 		 172 aa  97.1  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0685965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3691  ribosomal protein L10  39.16 
 
 		 164 aa  97.1  1e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000101089  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0096  50S ribosomal protein L10  34.94 
 
 		 166 aa  97.1  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4521  ribosomal protein L10  34.12 
 
 		 200 aa  95.9  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0745  50S ribosomal protein L10  31.18 
 
 		 171 aa  96.3  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00501407 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0140  50S ribosomal protein L10  31.93 
 
 		 174 aa  96.3  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000236563  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>