More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A0757 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007614  Nmul_A0757  50S ribosomal protein L10  100 
 
 		 174 aa  348  2e-95  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0270  50S ribosomal protein L10  71.84 
 
 		 174 aa  259  2e-68  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.247547  hitchhiker  0.00145059 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0396  50S ribosomal protein L10  71.35 
 
 		 173 aa  224  3e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.252363  hitchhiker  0.00709296 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0310  50S ribosomal protein L10  61.49 
 
 		 165 aa  210  7e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0746923  normal  0.0249908 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3191  50S ribosomal protein L10  60.74 
 
 		 173 aa  208  3e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.579756  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3347  50S ribosomal protein L10  65.99 
 
 		 167 aa  207  8e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.862427  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3036  50S ribosomal protein L10  63.4 
 
 		 168 aa  205  3e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0878547 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3336  50S ribosomal protein L10  62.09 
 
 		 173 aa  204  6e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3316  50S ribosomal protein L10  59.64 
 
 		 168 aa  203  1e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.354504  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2969  50S ribosomal protein L10  59.64 
 
 		 168 aa  203  1e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.45658 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3437  50S ribosomal protein L10  61.44 
 
 		 165 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2769  50S ribosomal protein L10  61.44 
 
 		 165 aa  197  6e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0317  50S ribosomal protein L10  61.44 
 
 		 165 aa  197  6e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00438278  normal  0.203557 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0338  50S ribosomal protein L10  61.44 
 
 		 165 aa  197  6e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.550948  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2850  50S ribosomal protein L10  61.44 
 
 		 165 aa  197  7e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.675463 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0488  50S ribosomal protein L10  53.22 
 
 		 173 aa  186  2e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.169718  hitchhiker  0.00000169108 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0317  50S ribosomal protein L10  53.22 
 
 		 173 aa  186  2e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.146286  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0314  ribosomal protein L10  49.71 
 
 		 175 aa  180  1e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000329441  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3453  50S ribosomal protein L10  58.17 
 
 		 174 aa  177  9e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0925685  normal  0.446601 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0044  50S ribosomal protein L10  54.9 
 
 		 215 aa  174  6e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000127438  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2643  50S ribosomal protein L10  62.75 
 
 		 165 aa  173  9e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3788  50S ribosomal protein L10  62.75 
 
 		 165 aa  173  9e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.166109  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1912  50S ribosomal protein L10  62.75 
 
 		 165 aa  173  9e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000184172  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0700  ribosomal protein L10  49.71 
 
 		 174 aa  172  9.999999999999999e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.299689  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3467  50S ribosomal protein L10  61.07 
 
 		 184 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0108818  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3818  50S ribosomal protein L10  61.07 
 
 		 184 aa  171  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.881367  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0040  50S ribosomal protein L10  53.59 
 
 		 179 aa  171  2.9999999999999996e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0245031  hitchhiker  0.0000000000023806 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3756  50S ribosomal protein L10  61.07 
 
 		 184 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0407684  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0239  50S ribosomal protein L10  62.09 
 
 		 165 aa  171  3.9999999999999995e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0229066 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3078  50S ribosomal protein L10  62.09 
 
 		 165 aa  171  5.999999999999999e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.892062  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0266  50S ribosomal protein L10  60.78 
 
 		 165 aa  169  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.646007  normal  0.635943 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0257  50S ribosomal protein L10  59.54 
 
 		 188 aa  169  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0591157  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3180  50S ribosomal protein L10  61.72 
 
 		 140 aa  167  5e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000385503  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3654  50S ribosomal protein L10  60.13 
 
 		 167 aa  166  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0512272  hitchhiker  0.000000643388 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0304  50S ribosomal protein L10  60.13 
 
 		 167 aa  166  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.125975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0867  50S ribosomal protein L10  48.57 
 
 		 175 aa  164  5.9999999999999996e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1064  50S ribosomal protein L10  53.71 
 
 		 175 aa  160  8.000000000000001e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0220515  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2178  ribosomal protein L10  45.14 
 
 		 175 aa  160  8.000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.905696 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0596  50S ribosomal protein L10  44.19 
 
 		 172 aa  160  1e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0140503  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0385  50S ribosomal protein L10  45.93 
 
 		 177 aa  157  5e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0360  50S ribosomal protein L10  45.93 
 
 		 177 aa  157  5e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0449  50S ribosomal protein L10  47.43 
 
 		 175 aa  157  7e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2333  50S ribosomal protein L10  48.57 
 
 		 176 aa  155  3e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.275074  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0838  50S ribosomal protein L10P  46.43 
 
 		 172 aa  154  5.0000000000000005e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0707377  normal  0.0995834 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0922  50S ribosomal protein L10  42.29 
 
 		 176 aa  148  4e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00116615  hitchhiker  0.00000161737 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3337  50S ribosomal protein L10  44.51 
 
 		 173 aa  147  7e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000271161 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0924  50S ribosomal protein L10  44.51 
 
 		 173 aa  147  7e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0586  50S ribosomal protein L10  49.67 
 
 		 177 aa  146  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2262  50S ribosomal protein L10  50.31 
 
 		 174 aa  145  2.0000000000000003e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.168271  normal  0.476107 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3642  50S ribosomal protein L10  51.02 
 
 		 183 aa  144  5e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.279713 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0286  ribosomal protein L10  42.53 
 
 		 166 aa  144  7.0000000000000006e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0147275  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3869  50S ribosomal protein L10  52.94 
 
 		 182 aa  144  8.000000000000001e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3594  50S ribosomal protein L10  49.67 
 
 		 178 aa  143  1e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.196569  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2038  50S ribosomal protein L10  43.43 
 
 		 175 aa  143  1e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0258299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4533  50S ribosomal protein L10  47.59 
 
 		 168 aa  142  2e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0508  50S ribosomal protein L10  47.24 
 
 		 175 aa  142  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.270625  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2865  50S ribosomal protein L10  44.77 
 
 		 174 aa  142  3e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.161934  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4444  50S ribosomal protein L10  47.17 
 
 		 176 aa  141  5e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.651473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3899  50S ribosomal protein L10  47.17 
 
 		 168 aa  140  6e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3248  50S ribosomal protein L10  47.17 
 
 		 168 aa  140  6e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0710  50S ribosomal protein L10  42.05 
 
 		 176 aa  140  9e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.303715  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0692  50S ribosomal protein L10  43.98 
 
 		 172 aa  139  9.999999999999999e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000112903  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1059  50S ribosomal protein L10  43.6 
 
 		 174 aa  139  3e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0531801  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0325  50S ribosomal protein L10  41.28 
 
 		 174 aa  138  3.9999999999999997e-32  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00522529  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1864  50S ribosomal protein L10  41.28 
 
 		 174 aa  138  3.9999999999999997e-32  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0922754  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4285  ribosomal protein L10  43.93 
 
 		 166 aa  137  4.999999999999999e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000716484  hitchhiker  0.000000472968 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03861  50S ribosomal protein L10  43.75 
 
 		 165 aa  137  7.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000311393  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4010  ribosomal protein L10  43.75 
 
 		 165 aa  137  7.999999999999999e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000237202  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03814  hypothetical protein  43.75 
 
 		 165 aa  137  7.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000360524  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4040  50S ribosomal protein L10  43.75 
 
 		 165 aa  137  7.999999999999999e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00830699  hitchhiker  0.000887574 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4525  50S ribosomal protein L10  43.75 
 
 		 165 aa  137  7.999999999999999e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000111294  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5450  50S ribosomal protein L10  43.75 
 
 		 165 aa  137  7.999999999999999e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000850473  hitchhiker  0.000626343 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4433  50S ribosomal protein L10  43.75 
 
 		 165 aa  137  7.999999999999999e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000818528  hitchhiker  0.00000264015 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4473  50S ribosomal protein L10  43.75 
 
 		 165 aa  137  7.999999999999999e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000239877  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4218  50S ribosomal protein L10  43.75 
 
 		 165 aa  137  7.999999999999999e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.4618e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0617  50S ribosomal protein L10  44.77 
 
 		 174 aa  136  1e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000383704 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2179  50S ribosomal protein L10  41.71 
 
 		 175 aa  137  1e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.82519  normal  0.0244994 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1889  50S ribosomal protein L10  41.71 
 
 		 175 aa  136  2e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00905403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4557  50S ribosomal protein L10  41.14 
 
 		 166 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.669843  decreased coverage  0.0090203 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2333  50S ribosomal protein L10  43.68 
 
 		 175 aa  135  3.0000000000000003e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00442702  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0617  ribosomal protein L10  40.57 
 
 		 166 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.532211  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5088  50S ribosomal protein L10  40.57 
 
 		 166 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000128873  normal  0.821712 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0671  50S ribosomal protein L10  40.94 
 
 		 174 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3733  50S ribosomal protein L10  42.61 
 
 		 165 aa  134  9e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3887  50S ribosomal protein L10  42.61 
 
 		 165 aa  134  9e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.452938  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0149  50S ribosomal protein L10  42.86 
 
 		 165 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000191294  normal  0.034689 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0208  50S ribosomal protein L10  42.61 
 
 		 165 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000217712  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0203  50S ribosomal protein L10  42.61 
 
 		 165 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0744309  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06150  50S ribosomal protein L10  40.57 
 
 		 166 aa  132  3e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4483  50S ribosomal protein L10  42.61 
 
 		 165 aa  132  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.763348  hitchhiker  0.0000000000000236313 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4557  50S ribosomal protein L10  42.61 
 
 		 165 aa  132  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.153585  hitchhiker  0.0000000000122855 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4361  50S ribosomal protein L10  42.61 
 
 		 165 aa  132  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.43206  normal  0.360014 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0408  50S ribosomal protein L10  40.59 
 
 		 174 aa  132  3e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.79305e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4480  50S ribosomal protein L10  42.61 
 
 		 165 aa  132  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.375547  hitchhiker  0.00110307 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4393  50S ribosomal protein L10  42.61 
 
 		 165 aa  132  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000406359  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0175  50S ribosomal protein L10  43.18 
 
 		 165 aa  132  3e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000220587  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0275  50S ribosomal protein L10  40.57 
 
 		 165 aa  131  3.9999999999999996e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000206065  normal  0.0858323 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01070  ribosomal protein L10  41.42 
 
 		 172 aa  131  3.9999999999999996e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  5.51299e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0445  50S ribosomal protein L10  40.23 
 
 		 166 aa  130  7.999999999999999e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.470652  unclonable  0.000000241771 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4758  50S ribosomal protein L10  40.57 
 
 		 166 aa  130  7.999999999999999e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00494482  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>