More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_0270 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_0270  50S ribosomal protein L10  100 
 
 
174 aa  343  8.999999999999999e-94  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.247547  hitchhiker  0.00145059 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0757  50S ribosomal protein L10  71.84 
 
 
174 aa  259  2e-68  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0310  50S ribosomal protein L10  66.67 
 
 
165 aa  220  9.999999999999999e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0746923  normal  0.0249908 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3347  50S ribosomal protein L10  73.47 
 
 
167 aa  219  9.999999999999999e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.862427  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3191  50S ribosomal protein L10  66.26 
 
 
173 aa  218  3e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.579756  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0396  50S ribosomal protein L10  73.56 
 
 
173 aa  218  5e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.252363  hitchhiker  0.00709296 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3036  50S ribosomal protein L10  64.74 
 
 
168 aa  216  1e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0878547 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3437  50S ribosomal protein L10  63.58 
 
 
165 aa  214  4e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153429  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3316  50S ribosomal protein L10  65.66 
 
 
168 aa  214  5.9999999999999996e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.354504  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2969  50S ribosomal protein L10  65.66 
 
 
168 aa  214  5.9999999999999996e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.45658 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3336  50S ribosomal protein L10  68.63 
 
 
173 aa  214  5.9999999999999996e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0317  50S ribosomal protein L10  63.01 
 
 
165 aa  211  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00438278  normal  0.203557 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2850  50S ribosomal protein L10  63.37 
 
 
165 aa  211  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.675463 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2769  50S ribosomal protein L10  63.01 
 
 
165 aa  211  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0338  50S ribosomal protein L10  63.01 
 
 
165 aa  211  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.550948  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0044  50S ribosomal protein L10  64.29 
 
 
215 aa  199  1.9999999999999998e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000127438  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0040  50S ribosomal protein L10  64.71 
 
 
179 aa  199  1.9999999999999998e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0245031  hitchhiker  0.0000000000023806 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0317  50S ribosomal protein L10  56.07 
 
 
173 aa  189  1e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.146286  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0488  50S ribosomal protein L10  56.07 
 
 
173 aa  189  1e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.169718  hitchhiker  0.00000169108 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0266  50S ribosomal protein L10  63.01 
 
 
165 aa  188  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.646007  normal  0.635943 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0239  50S ribosomal protein L10  63.01 
 
 
165 aa  187  7e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0229066 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3078  50S ribosomal protein L10  63.01 
 
 
165 aa  187  9e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.892062  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2643  50S ribosomal protein L10  62.43 
 
 
165 aa  185  2e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3788  50S ribosomal protein L10  62.43 
 
 
165 aa  185  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.166109  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0304  50S ribosomal protein L10  62.79 
 
 
167 aa  185  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.125975  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3654  50S ribosomal protein L10  62.79 
 
 
167 aa  185  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0512272  hitchhiker  0.000000643388 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0257  50S ribosomal protein L10  63.16 
 
 
188 aa  186  2e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0591157  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3453  50S ribosomal protein L10  60.78 
 
 
174 aa  186  2e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0925685  normal  0.446601 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1912  50S ribosomal protein L10  62.43 
 
 
165 aa  185  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000184172  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3818  50S ribosomal protein L10  62.57 
 
 
184 aa  184  7e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.881367  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3756  50S ribosomal protein L10  62.57 
 
 
184 aa  184  7e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0407684  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3467  50S ribosomal protein L10  62.57 
 
 
184 aa  184  7e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0108818  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3180  50S ribosomal protein L10  61.49 
 
 
140 aa  179  2e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000385503  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0922  50S ribosomal protein L10  51.43 
 
 
176 aa  170  1e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00116615  hitchhiker  0.00000161737 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0586  50S ribosomal protein L10  55.21 
 
 
177 aa  167  5e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0314  ribosomal protein L10  49.71 
 
 
175 aa  167  6e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000329441  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2262  50S ribosomal protein L10  55.83 
 
 
174 aa  165  2.9999999999999998e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.168271  normal  0.476107 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0508  50S ribosomal protein L10  53.99 
 
 
175 aa  164  4e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.270625  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4533  50S ribosomal protein L10  54.22 
 
 
168 aa  164  5e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0867  50S ribosomal protein L10  49.71 
 
 
175 aa  164  5.9999999999999996e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2178  ribosomal protein L10  48 
 
 
175 aa  163  9e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.905696 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0596  50S ribosomal protein L10  46.51 
 
 
172 aa  163  9e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0140503  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1064  50S ribosomal protein L10  54.86 
 
 
175 aa  163  1.0000000000000001e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0220515  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0385  50S ribosomal protein L10  48.84 
 
 
177 aa  163  1.0000000000000001e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0360  50S ribosomal protein L10  48.84 
 
 
177 aa  163  1.0000000000000001e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3899  50S ribosomal protein L10  53.99 
 
 
168 aa  163  1.0000000000000001e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3248  50S ribosomal protein L10  53.99 
 
 
168 aa  163  1.0000000000000001e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0449  50S ribosomal protein L10  49.14 
 
 
175 aa  163  1.0000000000000001e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3594  50S ribosomal protein L10  53.37 
 
 
178 aa  161  3e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.196569  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0838  50S ribosomal protein L10P  49.7 
 
 
172 aa  162  3e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0707377  normal  0.0995834 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3642  50S ribosomal protein L10  56.76 
 
 
183 aa  161  5.0000000000000005e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.279713 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3869  50S ribosomal protein L10  55.35 
 
 
182 aa  159  1e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4444  50S ribosomal protein L10  52.83 
 
 
176 aa  156  2e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.651473  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0710  50S ribosomal protein L10  47.43 
 
 
176 aa  155  2e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.303715  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2333  50S ribosomal protein L10  50 
 
 
175 aa  155  3e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00442702  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2333  50S ribosomal protein L10  49.71 
 
 
176 aa  154  6e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.275074  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4285  ribosomal protein L10  49.13 
 
 
166 aa  154  7e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000716484  hitchhiker  0.000000472968 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0700  ribosomal protein L10  46.82 
 
 
174 aa  152  2e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.299689  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0924  50S ribosomal protein L10  47.98 
 
 
173 aa  151  4e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3337  50S ribosomal protein L10  47.98 
 
 
173 aa  151  4e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000271161 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2038  50S ribosomal protein L10  46.29 
 
 
175 aa  151  5.9999999999999996e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0258299  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0325  50S ribosomal protein L10  45.98 
 
 
174 aa  149  2e-35  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00522529  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0149  50S ribosomal protein L10  48.3 
 
 
165 aa  149  2e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000191294  normal  0.034689 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1864  50S ribosomal protein L10  45.98 
 
 
174 aa  149  2e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0922754  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3887  50S ribosomal protein L10  47.73 
 
 
165 aa  149  3e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.452938  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0175  50S ribosomal protein L10  48.3 
 
 
165 aa  148  3e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000220587  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3733  50S ribosomal protein L10  47.73 
 
 
165 aa  149  3e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0286  ribosomal protein L10  45.98 
 
 
166 aa  147  7e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0147275  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0203  50S ribosomal protein L10  47.43 
 
 
165 aa  147  8e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0744309  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4361  50S ribosomal protein L10  47.16 
 
 
165 aa  146  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.43206  normal  0.360014 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4483  50S ribosomal protein L10  47.16 
 
 
165 aa  146  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.763348  hitchhiker  0.0000000000000236313 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0195  50S ribosomal protein L10  47.16 
 
 
165 aa  147  1.0000000000000001e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000187486  normal  0.229046 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4480  50S ribosomal protein L10  47.16 
 
 
165 aa  146  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.375547  hitchhiker  0.00110307 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4557  50S ribosomal protein L10  47.16 
 
 
165 aa  146  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.153585  hitchhiker  0.0000000000122855 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0208  50S ribosomal protein L10  47.43 
 
 
165 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000217712  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4393  50S ribosomal protein L10  47.16 
 
 
165 aa  146  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000406359  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5088  50S ribosomal protein L10  46.29 
 
 
166 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000128873  normal  0.821712 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0408  50S ribosomal protein L10  47.65 
 
 
174 aa  145  2.0000000000000003e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.79305e-16  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03861  50S ribosomal protein L10  47.16 
 
 
165 aa  145  3e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000311393  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4010  ribosomal protein L10  47.16 
 
 
165 aa  145  3e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000237202  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4525  50S ribosomal protein L10  47.16 
 
 
165 aa  145  3e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000111294  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03814  hypothetical protein  47.16 
 
 
165 aa  145  3e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000360524  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5450  50S ribosomal protein L10  47.16 
 
 
165 aa  145  3e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000850473  hitchhiker  0.000626343 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4473  50S ribosomal protein L10  47.16 
 
 
165 aa  145  3e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000239877  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4040  50S ribosomal protein L10  47.16 
 
 
165 aa  145  3e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00830699  hitchhiker  0.000887574 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4433  50S ribosomal protein L10  47.16 
 
 
165 aa  145  3e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000818528  hitchhiker  0.00000264015 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4218  50S ribosomal protein L10  47.16 
 
 
165 aa  145  3e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.4618e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4758  50S ribosomal protein L10  46.29 
 
 
166 aa  144  5e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00494482  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0171  50S ribosomal protein L10  47.43 
 
 
163 aa  144  5e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0111095  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0445  50S ribosomal protein L10  45.98 
 
 
166 aa  144  8.000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.470652  unclonable  0.000000241771 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3918  50S ribosomal protein L10  46.29 
 
 
166 aa  144  8.000000000000001e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0475  50S ribosomal protein L10  45.98 
 
 
166 aa  144  8.000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.372242  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0617  ribosomal protein L10  46.86 
 
 
166 aa  144  9e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.532211  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002171  LSU ribosomal protein L10p (P0)  45.71 
 
 
164 aa  143  1e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000109594  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1059  50S ribosomal protein L10  47.67 
 
 
174 aa  143  1e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0531801  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0275  50S ribosomal protein L10  45.71 
 
 
165 aa  143  1e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000206065  normal  0.0858323 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06150  50S ribosomal protein L10  46.86 
 
 
166 aa  143  1e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4557  50S ribosomal protein L10  46.29 
 
 
166 aa  142  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.669843  decreased coverage  0.0090203 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2179  50S ribosomal protein L10  44.57 
 
 
175 aa  142  2e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.82519  normal  0.0244994 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4699  50S ribosomal protein L10  46.86 
 
 
166 aa  142  3e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000246782  hitchhiker  0.00000548606 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>