More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2681 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_2681  50S ribosomal protein L10  100 
 
 		 172 aa  347  6e-95  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000132453  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0231  50S ribosomal protein L10  84.88 
 
 		 172 aa  301  3.0000000000000004e-81  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0103356  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0355  50S ribosomal protein L10  81.98 
 
 		 172 aa  295  2e-79  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000413063  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1964  50S ribosomal protein L10  80.81 
 
 		 172 aa  292  1e-78  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.202865  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0194  50S ribosomal protein L10  80.81 
 
 		 172 aa  292  2e-78  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000548969  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0286  50S ribosomal protein L10  70.35 
 
 		 172 aa  252  1.0000000000000001e-66  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000520195  hitchhiker  0.00386218 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0317  50S ribosomal protein L10  66.28 
 
 		 173 aa  244  4e-64  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0060406  hitchhiker  0.00087235 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0692  50S ribosomal protein L10  39.53 
 
 		 172 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000112903  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1547  50S ribosomal protein L10  39.53 
 
 		 173 aa  126  2.0000000000000002e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.834427 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2722  ribosomal protein L10  38.01 
 
 		 170 aa  121  6e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0525449  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0857  50S ribosomal protein L10  34.12 
 
 		 177 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000259828  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0183  ribosomal protein L10  34.71 
 
 		 176 aa  118  3.9999999999999996e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000324199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1106  ribosomal protein L10  36.99 
 
 		 176 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0567771  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0700  ribosomal protein L10  38.82 
 
 		 174 aa  116  1.9999999999999998e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.299689  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2470  50S ribosomal protein L10  36.84 
 
 		 176 aa  116  1.9999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0147283  hitchhiker  0.00682166 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2074  50S ribosomal protein L10  36.63 
 
 		 172 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0617  50S ribosomal protein L10  36.42 
 
 		 174 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000383704 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0310  ribosomal protein L10  38.69 
 
 		 176 aa  108  4.0000000000000004e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.109625  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01070  ribosomal protein L10  36.26 
 
 		 172 aa  107  1e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  5.51299e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3337  50S ribosomal protein L10  36 
 
 		 173 aa  104  7e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000271161 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0924  50S ribosomal protein L10  36 
 
 		 173 aa  104  7e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1634  50S ribosomal protein L10  34.3 
 
 		 174 aa  103  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2722  50S ribosomal protein L10P  34.52 
 
 		 178 aa  102  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000314918  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0276  50S ribosomal protein L10  34.32 
 
 		 175 aa  102  3e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000204852  hitchhiker  0.000495958 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2724  50S ribosomal protein L10  33.77 
 
 		 166 aa  102  4e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000159716  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2410  50S ribosomal protein L10  33.77 
 
 		 166 aa  102  4e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000332682  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2865  50S ribosomal protein L10  33.53 
 
 		 174 aa  99.4  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.161934  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1372  50S ribosomal protein L10  33.14 
 
 		 178 aa  99.8  2e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.188772  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0096  50S ribosomal protein L10  32.54 
 
 		 166 aa  99.8  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1059  50S ribosomal protein L10  33.71 
 
 		 174 aa  99  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0531801  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2344  ribosomal protein L10  32.94 
 
 		 173 aa  98.6  3e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.032292  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0671  50S ribosomal protein L10  34.86 
 
 		 174 aa  97.8  6e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4479  ribosomal protein L10  39.61 
 
 		 177 aa  97.1  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.028261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1453  50S ribosomal protein L10  33.92 
 
 		 173 aa  96.7  1e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1337  50S ribosomal protein L10  35.26 
 
 		 174 aa  96.3  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.900212  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2783  50S ribosomal protein L10  32.95 
 
 		 172 aa  95.5  3e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00189787  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0441  50S ribosomal protein L10  30.99 
 
 		 189 aa  94.7  5e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0093  50S ribosomal protein L10  31.74 
 
 		 166 aa  94  8e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000759135  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0094  50S ribosomal protein L10  31.95 
 
 		 166 aa  94  9e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000793252  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5206  50S ribosomal protein L10  31.36 
 
 		 166 aa  94  9e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000252117  unclonable  5.898740000000001e-26 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2164  50S ribosomal protein L10P  35.26 
 
 		 174 aa  94  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0596262  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0099  50S ribosomal protein L10  31.36 
 
 		 166 aa  92.8  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000477259  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0099  50S ribosomal protein L10  31.36 
 
 		 166 aa  92.8  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000073314  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0095  50S ribosomal protein L10  31.36 
 
 		 166 aa  92.8  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  8.69083e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0093  50S ribosomal protein L10  31.36 
 
 		 166 aa  92.8  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000338487  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0130  50S ribosomal protein L10  31.36 
 
 		 166 aa  92.8  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000124346  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0099  50S ribosomal protein L10  31.36 
 
 		 166 aa  92.8  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000718586  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0120  50S ribosomal protein L10  31.36 
 
 		 166 aa  92.8  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000126178  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0100  50S ribosomal protein L10  31.74 
 
 		 166 aa  92.8  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000689021  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0110  50S ribosomal protein L10  31.36 
 
 		 166 aa  92.8  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.02318e-62 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0838  50S ribosomal protein L10P  35.63 
 
 		 172 aa  92.4  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0707377  normal  0.0995834 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0180  50S ribosomal protein L10  31.95 
 
 		 166 aa  92.4  3e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0693527  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1927  ribosomal protein L10  32.2 
 
 		 176 aa  92  3e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0948645  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3451  ribosomal protein L10  35.96 
 
 		 176 aa  92.4  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00335052  normal  0.0391621 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0562  50S ribosomal protein L10  31.95 
 
 		 166 aa  91.7  5e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000233555  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0576  50S ribosomal protein L10  31.95 
 
 		 166 aa  91.7  5e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000179203  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0205  50S ribosomal protein L10  32.75 
 
 		 181 aa  91.3  7e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000665859  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1529  ribosomal protein L10  31.95 
 
 		 183 aa  90.9  8e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000554953  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2994  50S ribosomal protein L10  31.98 
 
 		 173 aa  89.4  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1821  ribosomal protein L10  32.32 
 
 		 179 aa  89.4  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0408  50S ribosomal protein L10  30.77 
 
 		 174 aa  87.8  6e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.79305e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1889  50S ribosomal protein L10  32.54 
 
 		 175 aa  87.8  6e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00905403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1667  50S ribosomal protein L10  33.72 
 
 		 173 aa  88.2  6e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4521  ribosomal protein L10  35.33 
 
 		 200 aa  88.2  6e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0226  ribosomal protein L10  34.3 
 
 		 173 aa  87.4  9e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2179  50S ribosomal protein L10  31.95 
 
 		 175 aa  85.5  3e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.82519  normal  0.0244994 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0297  50S ribosomal protein L10  37.14 
 
 		 172 aa  85.9  3e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2178  ribosomal protein L10  32.75 
 
 		 175 aa  85.1  4e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.905696 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0757  50S ribosomal protein L10  30.23 
 
 		 174 aa  85.1  4e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1509  ribosomal protein L10  31.03 
 
 		 176 aa  85.1  4e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000272992  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1387  50S ribosomal protein L10  29.76 
 
 		 171 aa  85.1  4e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000123079  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20980  LSU ribosomal protein L10P  33.77 
 
 		 203 aa  84.7  5e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.996084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4678  50S ribosomal protein L10  35.12 
 
 		 182 aa  84.7  6e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000989378  decreased coverage  0.00291158 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1474  50S ribosomal protein L10  34.64 
 
 		 181 aa  83.6  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000103472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0313  50S ribosomal protein L10  30.77 
 
 		 166 aa  82  0.000000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000558823  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0915  ribosomal protein L10  32.95 
 
 		 174 aa  82  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.690445  normal  0.23712 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6637  ribosomal protein L10  33.33 
 
 		 184 aa  82  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.858869  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2223  50S ribosomal protein L10  32.76 
 
 		 174 aa  82.4  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00194446 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0867  50S ribosomal protein L10  30.41 
 
 		 175 aa  81.6  0.000000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0270  50S ribosomal protein L10  32 
 
 		 174 aa  81.6  0.000000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.247547  hitchhiker  0.00145059 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0567  50S ribosomal protein L10  31.55 
 
 		 167 aa  81.6  0.000000000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00969269  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0578  ribosomal protein L10  40.74 
 
 		 212 aa  81.3  0.000000000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.141737  normal  0.0136421 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1064  50S ribosomal protein L10  32.19 
 
 		 175 aa  80.9  0.000000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0220515  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08440  ribosomal protein L10  29.01 
 
 		 173 aa  80.9  0.000000000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.166227  normal  0.704722 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4758  50S ribosomal protein L10  32.28 
 
 		 166 aa  80.9  0.000000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00494482  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1302  50S ribosomal protein L10  32.94 
 
 		 166 aa  80.5  0.00000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000076628  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0618  ribosomal protein L10  38.93 
 
 		 173 aa  80.1  0.00000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1124  ribosomal protein L10  33.53 
 
 		 174 aa  80.1  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0213  ribosomal protein L10  28.4 
 
 		 175 aa  80.5  0.00000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.623588  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0445  50S ribosomal protein L10  31.41 
 
 		 166 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.470652  unclonable  0.000000241771 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0475  50S ribosomal protein L10  31.41 
 
 		 166 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.372242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0478  50S ribosomal protein L10  31.41 
 
 		 195 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00597987  hitchhiker  0.00527924 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1018  ribosomal protein L10  33.33 
 
 		 202 aa  79.7  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4018  ribosomal protein L10  35.34 
 
 		 174 aa  79.7  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.491975 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6059  50S ribosomal protein L10  36.3 
 
 		 182 aa  79.7  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.749447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0067  50S ribosomal protein L10  37.5 
 
 		 165 aa  79  0.00000000000003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0479  50S ribosomal protein L10  30.51 
 
 		 179 aa  78.6  0.00000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.488036  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0464  50S ribosomal protein L10  30.51 
 
 		 179 aa  78.6  0.00000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0359791  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2656  50S ribosomal protein L10  35.03 
 
 		 175 aa  78.2  0.00000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.220618  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2951  ribosomal protein L10  33.75 
 
 		 186 aa  78.2  0.00000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0265827  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>