More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4479 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_4479  ribosomal protein L10  100 
 
 
177 aa  361  2e-99  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.028261  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3451  ribosomal protein L10  66.1 
 
 
176 aa  244  6.999999999999999e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00335052  normal  0.0391621 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0847  ribosomal protein L10  54.6 
 
 
173 aa  183  1.0000000000000001e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.283909 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0424  50S ribosomal protein L10  50.87 
 
 
171 aa  174  5e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000721465  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00035  putative 50S ribosomal protein L10  47.16 
 
 
177 aa  164  5e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1398  50S ribosomal protein L10  48.07 
 
 
181 aa  161  5.0000000000000005e-39  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1941  50S ribosomal protein L10  49.7 
 
 
167 aa  153  1e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.136408  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3171  50S ribosomal protein L10  46.5 
 
 
167 aa  152  2.9999999999999998e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0392  50S ribosomal protein L10  40.91 
 
 
174 aa  143  1e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1708  ribosomal protein L10  46.25 
 
 
177 aa  137  6e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0962108  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1106  ribosomal protein L10  42.22 
 
 
176 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0567771  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0700  ribosomal protein L10  36.05 
 
 
174 aa  102  2e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.299689  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2681  50S ribosomal protein L10  39.61 
 
 
172 aa  97.1  1e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000132453  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0355  50S ribosomal protein L10  37.97 
 
 
172 aa  96.3  2e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000413063  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4758  50S ribosomal protein L10  33.33 
 
 
166 aa  94.4  8e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00494482  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0231  50S ribosomal protein L10  34.09 
 
 
172 aa  94  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0103356  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0692  50S ribosomal protein L10  29.14 
 
 
172 aa  92  4e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000112903  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4557  50S ribosomal protein L10  32.2 
 
 
166 aa  91.7  5e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.669843  decreased coverage  0.0090203 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0445  50S ribosomal protein L10  32.39 
 
 
166 aa  91.3  6e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.470652  unclonable  0.000000241771 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0475  50S ribosomal protein L10  32.39 
 
 
166 aa  91.3  6e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.372242  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0617  ribosomal protein L10  32.2 
 
 
166 aa  90.9  7e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.532211  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0478  50S ribosomal protein L10  32.39 
 
 
195 aa  90.9  8e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00597987  hitchhiker  0.00527924 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3477  50S ribosomal protein L10  33.52 
 
 
171 aa  90.9  9e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.232416  hitchhiker  0.0000717521 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1964  50S ribosomal protein L10  34.81 
 
 
172 aa  89.7  2e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.202865  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1547  50S ribosomal protein L10  32.77 
 
 
173 aa  88.2  5e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.834427 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0194  50S ribosomal protein L10  32.57 
 
 
172 aa  87  1e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000548969  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0838  50S ribosomal protein L10P  33.52 
 
 
172 aa  87.4  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0707377  normal  0.0995834 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0828  50S ribosomal protein L10  31.07 
 
 
166 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0279492  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2470  50S ribosomal protein L10  30.29 
 
 
176 aa  86.7  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0147283  hitchhiker  0.00682166 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08740  50S ribosomal protein L10  31.07 
 
 
166 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00037754 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3918  50S ribosomal protein L10  31.07 
 
 
166 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5088  50S ribosomal protein L10  31.61 
 
 
166 aa  85.5  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000128873  normal  0.821712 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08440  ribosomal protein L10  31.07 
 
 
173 aa  85.5  4e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.166227  normal  0.704722 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0096  50S ribosomal protein L10  30.19 
 
 
166 aa  84.7  6e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3691  ribosomal protein L10  33.33 
 
 
164 aa  84.3  8e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000101089  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0183  ribosomal protein L10  30.77 
 
 
176 aa  84  0.000000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000324199  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0317  50S ribosomal protein L10  35.85 
 
 
173 aa  82.8  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0060406  hitchhiker  0.00087235 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01070  ribosomal protein L10  27.43 
 
 
172 aa  82.8  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  5.51299e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0286  50S ribosomal protein L10  30.9 
 
 
172 aa  82.8  0.000000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000520195  hitchhiker  0.00386218 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5206  50S ribosomal protein L10  29.53 
 
 
166 aa  80.5  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000252117  unclonable  5.898740000000001e-26 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0099  50S ribosomal protein L10  29.53 
 
 
166 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000477259  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0130  50S ribosomal protein L10  29.53 
 
 
166 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000124346  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3316  50S ribosomal protein L10  29.87 
 
 
168 aa  80.1  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.354504  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0099  50S ribosomal protein L10  29.53 
 
 
166 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000073314  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0095  50S ribosomal protein L10  29.53 
 
 
166 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  8.69083e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0093  50S ribosomal protein L10  29.53 
 
 
166 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000338487  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0110  50S ribosomal protein L10  29.53 
 
 
166 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.02318e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0099  50S ribosomal protein L10  29.53 
 
 
166 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000718586  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0120  50S ribosomal protein L10  29.53 
 
 
166 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000126178  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2969  50S ribosomal protein L10  29.87 
 
 
168 aa  80.1  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.45658 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2722  ribosomal protein L10  28.92 
 
 
170 aa  80.5  0.00000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0525449  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1302  50S ribosomal protein L10  29.41 
 
 
166 aa  79.3  0.00000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000076628  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06150  50S ribosomal protein L10  29.94 
 
 
166 aa  80.1  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0100  50S ribosomal protein L10  31.76 
 
 
166 aa  79.7  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000689021  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0094  50S ribosomal protein L10  29.53 
 
 
166 aa  79.3  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000793252  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2724  50S ribosomal protein L10  30.25 
 
 
166 aa  79.3  0.00000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000159716  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2410  50S ribosomal protein L10  30.25 
 
 
166 aa  79.3  0.00000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000332682  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0789  50S ribosomal protein L10  29.55 
 
 
172 aa  79  0.00000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.305137 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3362  50S ribosomal protein L10  28.81 
 
 
172 aa  79  0.00000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.256068  normal  0.223881 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1417  50S ribosomal protein L10  29.94 
 
 
197 aa  78.6  0.00000000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000013127  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2697  50S ribosomal protein L10P  30.51 
 
 
172 aa  78.2  0.00000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.561782  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0232  50S ribosomal protein L10  29.38 
 
 
172 aa  78.6  0.00000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0685965  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0093  50S ribosomal protein L10  29.53 
 
 
166 aa  78.2  0.00000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000759135  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0310  ribosomal protein L10  28.74 
 
 
176 aa  77.4  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.109625  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3036  50S ribosomal protein L10  29.22 
 
 
168 aa  77.4  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0878547 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3191  50S ribosomal protein L10  28.08 
 
 
173 aa  76.6  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.579756  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3689  50S ribosomal protein L10  29.38 
 
 
172 aa  76.6  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2727  ribosomal protein L10  28.49 
 
 
172 aa  76.3  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.12165  normal  0.845294 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0313  50S ribosomal protein L10  29.3 
 
 
166 aa  76.3  0.0000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000558823  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0567  50S ribosomal protein L10  28.66 
 
 
167 aa  76.3  0.0000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00969269  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0745  50S ribosomal protein L10  30.34 
 
 
171 aa  76.3  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00501407 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2994  50S ribosomal protein L10  31.64 
 
 
173 aa  75.9  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0276  50S ribosomal protein L10  30.13 
 
 
175 aa  75.9  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000204852  hitchhiker  0.000495958 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1634  50S ribosomal protein L10  32.77 
 
 
174 aa  75.5  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1701  50S ribosomal protein L10  32.39 
 
 
171 aa  75.1  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.653585  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3197  50S ribosomal protein L10  29.38 
 
 
172 aa  75.1  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.383116 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3336  50S ribosomal protein L10  28.08 
 
 
173 aa  75.1  0.0000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0337  50S ribosomal protein L10  32.39 
 
 
171 aa  75.1  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.635722  normal  0.581622 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1784  50S ribosomal protein L10  28.16 
 
 
181 aa  75.1  0.0000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0351  50S ribosomal protein L10  32.39 
 
 
171 aa  75.1  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.703447 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0175  50S ribosomal protein L10  29.31 
 
 
165 aa  74.7  0.0000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000220587  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0271  50S ribosomal protein L10  27.92 
 
 
178 aa  74.7  0.0000000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00121092  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0757  50S ribosomal protein L10  28.57 
 
 
174 aa  74.3  0.0000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1822  50S ribosomal protein L10  27.68 
 
 
172 aa  74.3  0.0000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4521  ribosomal protein L10  29.94 
 
 
200 aa  73.9  0.0000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2344  ribosomal protein L10  25.86 
 
 
173 aa  74.3  0.0000000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.032292  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0562  50S ribosomal protein L10  28.3 
 
 
166 aa  73.6  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000233555  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3437  50S ribosomal protein L10  28.31 
 
 
165 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153429  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0576  50S ribosomal protein L10  28.3 
 
 
166 aa  73.6  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000179203  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0922  50S ribosomal protein L10  27.12 
 
 
176 aa  73.9  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00116615  hitchhiker  0.00000161737 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4326  50S ribosomal protein L10  30.99 
 
 
166 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000437071  unclonable  0.0000000000820773 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1954  50S ribosomal protein L10  29.21 
 
 
174 aa  73.2  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.262202  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1701  50S ribosomal protein L10  29.55 
 
 
171 aa  72.8  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.302531  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2164  50S ribosomal protein L10P  28.41 
 
 
174 aa  72.8  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0596262  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2178  ribosomal protein L10  28.16 
 
 
175 aa  72.8  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.905696 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0180  50S ribosomal protein L10  31.16 
 
 
166 aa  72.4  0.000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0693527  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2283  50S ribosomal protein L10  29.38 
 
 
172 aa  72.4  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0400383  normal  0.2116 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2783  50S ribosomal protein L10  27.43 
 
 
172 aa  72.4  0.000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00189787  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1387  50S ribosomal protein L10  27.12 
 
 
171 aa  72  0.000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000123079  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2676  ribosomal protein L10  33.76 
 
 
174 aa  72  0.000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000001837  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>