More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0194 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0194  50S ribosomal protein L10  100 
 
 		 172 aa  343  5e-94  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000548969  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0231  50S ribosomal protein L10  84.3 
 
 		 172 aa  297  5e-80  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0103356  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2681  50S ribosomal protein L10  80.81 
 
 		 172 aa  292  2e-78  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000132453  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1964  50S ribosomal protein L10  81.4 
 
 		 172 aa  290  6e-78  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.202865  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0355  50S ribosomal protein L10  76.16 
 
 		 172 aa  276  7e-74  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000413063  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0317  50S ribosomal protein L10  72.09 
 
 		 173 aa  255  2e-67  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0060406  hitchhiker  0.00087235 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0286  50S ribosomal protein L10  72.09 
 
 		 172 aa  251  5.000000000000001e-66  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000520195  hitchhiker  0.00386218 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2722  ribosomal protein L10  42.69 
 
 		 170 aa  128  3e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0525449  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0692  50S ribosomal protein L10  38.37 
 
 		 172 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000112903  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0183  ribosomal protein L10  36.47 
 
 		 176 aa  120  9.999999999999999e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000324199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1547  50S ribosomal protein L10  39.53 
 
 		 173 aa  119  1.9999999999999998e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.834427 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01070  ribosomal protein L10  36.26 
 
 		 172 aa  114  6e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  5.51299e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1106  ribosomal protein L10  37.57 
 
 		 176 aa  114  6.9999999999999995e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0567771  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2470  50S ribosomal protein L10  36.84 
 
 		 176 aa  113  1.0000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0147283  hitchhiker  0.00682166 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0857  50S ribosomal protein L10  33.53 
 
 		 177 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000259828  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2074  50S ribosomal protein L10  34.88 
 
 		 172 aa  108  5e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0310  ribosomal protein L10  38.1 
 
 		 176 aa  105  3e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.109625  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0700  ribosomal protein L10  34.52 
 
 		 174 aa  105  3e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.299689  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0617  50S ribosomal protein L10  35.43 
 
 		 174 aa  103  9e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000383704 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0096  50S ribosomal protein L10  35.93 
 
 		 166 aa  103  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0276  50S ribosomal protein L10  36.09 
 
 		 175 aa  103  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000204852  hitchhiker  0.000495958 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0100  50S ribosomal protein L10  36.53 
 
 		 166 aa  102  3e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000689021  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2865  50S ribosomal protein L10  34.46 
 
 		 174 aa  101  5e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.161934  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2724  50S ribosomal protein L10  36.36 
 
 		 166 aa  101  5e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000159716  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2410  50S ribosomal protein L10  36.36 
 
 		 166 aa  101  5e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000332682  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1372  50S ribosomal protein L10  33.14 
 
 		 178 aa  99.4  2e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.188772  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0924  50S ribosomal protein L10  33.9 
 
 		 173 aa  99  3e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3337  50S ribosomal protein L10  33.9 
 
 		 173 aa  99  3e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000271161 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2783  50S ribosomal protein L10  30.81 
 
 		 172 aa  98.2  5e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00189787  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5206  50S ribosomal protein L10  36.09 
 
 		 166 aa  97.8  6e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000252117  unclonable  5.898740000000001e-26 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0094  50S ribosomal protein L10  36.69 
 
 		 166 aa  97.8  6e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000793252  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0099  50S ribosomal protein L10  36.09 
 
 		 166 aa  96.7  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000477259  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0099  50S ribosomal protein L10  36.09 
 
 		 166 aa  96.7  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000073314  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0095  50S ribosomal protein L10  36.09 
 
 		 166 aa  96.7  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  8.69083e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0093  50S ribosomal protein L10  36.09 
 
 		 166 aa  96.7  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000338487  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0120  50S ribosomal protein L10  36.09 
 
 		 166 aa  96.7  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000126178  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0099  50S ribosomal protein L10  36.09 
 
 		 166 aa  96.7  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000718586  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0130  50S ribosomal protein L10  36.09 
 
 		 166 aa  96.7  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000124346  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0110  50S ribosomal protein L10  36.09 
 
 		 166 aa  96.7  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.02318e-62 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0838  50S ribosomal protein L10P  35.47 
 
 		 172 aa  97.1  1e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0707377  normal  0.0995834 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0093  50S ribosomal protein L10  36.53 
 
 		 166 aa  96.3  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000759135  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1634  50S ribosomal protein L10  31.4 
 
 		 174 aa  95.1  4e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2344  ribosomal protein L10  30.59 
 
 		 173 aa  94  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.032292  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0671  50S ribosomal protein L10  32.37 
 
 		 174 aa  93.6  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0180  50S ribosomal protein L10  34.32 
 
 		 166 aa  92.4  3e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0693527  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1337  50S ribosomal protein L10  32.95 
 
 		 174 aa  92.4  3e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.900212  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1059  50S ribosomal protein L10  33.71 
 
 		 174 aa  92  4e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0531801  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1509  ribosomal protein L10  34.09 
 
 		 176 aa  92  4e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000272992  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2223  50S ribosomal protein L10  33.91 
 
 		 174 aa  91.3  5e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00194446 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2722  50S ribosomal protein L10P  32.14 
 
 		 178 aa  91.7  5e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000314918  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1529  ribosomal protein L10  33.92 
 
 		 183 aa  90.1  1e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000554953  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2164  50S ribosomal protein L10P  33.53 
 
 		 174 aa  90.5  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0596262  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1889  50S ribosomal protein L10  31.95 
 
 		 175 aa  89.4  3e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00905403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0576  50S ribosomal protein L10  33.14 
 
 		 166 aa  89  3e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000179203  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0562  50S ribosomal protein L10  33.14 
 
 		 166 aa  89  3e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000233555  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0408  50S ribosomal protein L10  37.5 
 
 		 174 aa  88.6  4e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.79305e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1667  50S ribosomal protein L10  34.88 
 
 		 173 aa  88.2  5e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0441  50S ribosomal protein L10  28.4 
 
 		 189 aa  88.2  6e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4479  ribosomal protein L10  32.57 
 
 		 177 aa  87  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.028261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0757  50S ribosomal protein L10  31.18 
 
 		 174 aa  87  1e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2179  50S ribosomal protein L10  31.36 
 
 		 175 aa  87  1e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.82519  normal  0.0244994 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2994  50S ribosomal protein L10  28.49 
 
 		 173 aa  85.9  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20980  LSU ribosomal protein L10P  37.11 
 
 		 203 aa  86.7  2e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.996084  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1453  50S ribosomal protein L10  28.65 
 
 		 173 aa  85.5  4e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0226  ribosomal protein L10  34.88 
 
 		 173 aa  85.1  4e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0205  50S ribosomal protein L10  33.33 
 
 		 181 aa  84.7  5e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000665859  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2361  50S ribosomal protein L10  32.18 
 
 		 174 aa  84.7  6e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0300  ribosomal protein L10  31.55 
 
 		 181 aa  84  9e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000817286  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4521  ribosomal protein L10  35.62 
 
 		 200 aa  84  9e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2273  50S ribosomal protein L10  32.18 
 
 		 174 aa  84  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3451  ribosomal protein L10  30.86 
 
 		 176 aa  83.2  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00335052  normal  0.0391621 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2697  50S ribosomal protein L10P  30.81 
 
 		 172 aa  83.2  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.561782  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0270  50S ribosomal protein L10  32.94 
 
 		 174 aa  82.8  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.247547  hitchhiker  0.00145059 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4018  ribosomal protein L10  36.84 
 
 		 174 aa  82.4  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.491975 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1590  50S ribosomal protein L10  31.61 
 
 		 174 aa  82.4  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0867  50S ribosomal protein L10  30.18 
 
 		 175 aa  82  0.000000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1821  ribosomal protein L10  31.1 
 
 		 179 aa  81.6  0.000000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0213  ribosomal protein L10  30.18 
 
 		 175 aa  79  0.00000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.623588  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1387  50S ribosomal protein L10  29.76 
 
 		 171 aa  79.3  0.00000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000123079  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0313  50S ribosomal protein L10  31.41 
 
 		 166 aa  79  0.00000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000558823  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08440  ribosomal protein L10  30.25 
 
 		 173 aa  78.6  0.00000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.166227  normal  0.704722 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4678  50S ribosomal protein L10  35.09 
 
 		 182 aa  78.6  0.00000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000989378  decreased coverage  0.00291158 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0389  ribosomal protein L10  29.59 
 
 		 174 aa  78.2  0.00000000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0271  50S ribosomal protein L10  30.97 
 
 		 178 aa  77.8  0.00000000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00121092  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl602  50S ribosomal protein L10  32.89 
 
 		 166 aa  77.4  0.00000000000008  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5114  ribosomal protein L10  33.1 
 
 		 175 aa  76.6  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.316499  normal  0.732887 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1064  50S ribosomal protein L10  31.94 
 
 		 175 aa  76.6  0.0000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0220515  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0297  50S ribosomal protein L10  35.71 
 
 		 172 aa  76.6  0.0000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0479  ribosomal protein L10  33.13 
 
 		 164 aa  75.9  0.0000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0571  50S ribosomal protein L10  30.81 
 
 		 187 aa  75.5  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0449  50S ribosomal protein L10  29.59 
 
 		 175 aa  75.9  0.0000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0745  50S ribosomal protein L10  34.32 
 
 		 171 aa  75.5  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00501407 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3157  ribosomal protein L10  37.4 
 
 		 173 aa  75.1  0.0000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500065  normal  0.290514 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2656  50S ribosomal protein L10  32.56 
 
 		 175 aa  74.7  0.0000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.220618  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0067  50S ribosomal protein L10  36.43 
 
 		 165 aa  75.1  0.0000000000005  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0915  ribosomal protein L10  32.37 
 
 		 174 aa  75.1  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.690445  normal  0.23712 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6059  50S ribosomal protein L10  35.42 
 
 		 182 aa  74.7  0.0000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.749447  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1430  ribosomal protein L10  29.07 
 
 		 173 aa  74.3  0.0000000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4758  50S ribosomal protein L10  29.52 
 
 		 166 aa  74.3  0.0000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00494482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08740  50S ribosomal protein L10  30.12 
 
 		 166 aa  74.3  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00037754 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>