More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0479 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013515  Smon_0479  ribosomal protein L10  100 
 
 
164 aa  324  4.0000000000000003e-88  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2951  ribosomal protein L10  65.24 
 
 
186 aa  214  2.9999999999999998e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0265827  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2722  ribosomal protein L10  41.18 
 
 
170 aa  122  2e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0525449  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0310  ribosomal protein L10  42.07 
 
 
176 aa  122  2e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.109625  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0096  50S ribosomal protein L10  44.37 
 
 
166 aa  117  6e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1302  50S ribosomal protein L10  42.86 
 
 
166 aa  115  1.9999999999999998e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000076628  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1387  50S ribosomal protein L10  40.65 
 
 
171 aa  115  1.9999999999999998e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000123079  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2722  50S ribosomal protein L10P  40.24 
 
 
178 aa  115  3e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000314918  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2724  50S ribosomal protein L10  42.95 
 
 
166 aa  115  3e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000159716  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2410  50S ribosomal protein L10  42.95 
 
 
166 aa  115  3e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000332682  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0093  50S ribosomal protein L10  43.05 
 
 
166 aa  115  3.9999999999999997e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000759135  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01070  ribosomal protein L10  40.72 
 
 
172 aa  114  5e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  5.51299e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5206  50S ribosomal protein L10  41.56 
 
 
166 aa  112  3e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000252117  unclonable  5.898740000000001e-26 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0094  50S ribosomal protein L10  41.56 
 
 
166 aa  111  6e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000793252  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0120  50S ribosomal protein L10  40.91 
 
 
166 aa  110  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000126178  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0099  50S ribosomal protein L10  40.91 
 
 
166 aa  110  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000477259  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0099  50S ribosomal protein L10  40.91 
 
 
166 aa  110  8.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000073314  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0095  50S ribosomal protein L10  40.91 
 
 
166 aa  110  8.000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  8.69083e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0093  50S ribosomal protein L10  40.91 
 
 
166 aa  110  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000338487  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0110  50S ribosomal protein L10  40.91 
 
 
166 aa  110  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.02318e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0130  50S ribosomal protein L10  40.91 
 
 
166 aa  110  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000124346  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0099  50S ribosomal protein L10  40.91 
 
 
166 aa  110  8.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000718586  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0567  50S ribosomal protein L10  40.26 
 
 
167 aa  108  3e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00969269  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0100  50S ribosomal protein L10  43.05 
 
 
166 aa  108  4.0000000000000004e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000689021  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08440  ribosomal protein L10  41.48 
 
 
173 aa  107  7.000000000000001e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.166227  normal  0.704722 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0180  50S ribosomal protein L10  40.26 
 
 
166 aa  106  1e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0693527  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0276  50S ribosomal protein L10  38.26 
 
 
175 aa  106  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000204852  hitchhiker  0.000495958 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0351  50S ribosomal protein L10  39.35 
 
 
159 aa  104  4e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00255818  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0857  50S ribosomal protein L10  37.89 
 
 
177 aa  103  9e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000259828  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0183  ribosomal protein L10  40.29 
 
 
176 aa  103  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000324199  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0205  50S ribosomal protein L10  38.75 
 
 
181 aa  100  8e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000665859  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0576  50S ribosomal protein L10  38.96 
 
 
166 aa  98.6  3e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000179203  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0562  50S ribosomal protein L10  38.96 
 
 
166 aa  98.6  3e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000233555  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0179  50S ribosomal protein L10  38.16 
 
 
161 aa  95.5  3e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.215322  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0213  ribosomal protein L10  34.9 
 
 
175 aa  95.1  3e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.623588  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0408  50S ribosomal protein L10  39.04 
 
 
174 aa  95.5  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.79305e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0447  50S ribosomal protein L10  37.58 
 
 
159 aa  94  8e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000981328  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1172  ribosomal protein L10  35.43 
 
 
173 aa  93.6  1e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000357466  unclonable  0.0000000289216 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0313  50S ribosomal protein L10  35.98 
 
 
166 aa  92.4  2e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000558823  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2344  ribosomal protein L10  37.25 
 
 
173 aa  92.8  2e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.032292  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1318  50S ribosomal protein L10  38.82 
 
 
161 aa  92.8  2e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000548659  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2164  50S ribosomal protein L10P  36.99 
 
 
174 aa  92  3e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0596262  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1529  ribosomal protein L10  40.85 
 
 
183 aa  91.7  4e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000554953  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0067  50S ribosomal protein L10  37.27 
 
 
165 aa  91.3  5e-18  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3437  50S ribosomal protein L10  36.94 
 
 
165 aa  90.9  7e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153429  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0317  50S ribosomal protein L10  37.58 
 
 
165 aa  90.5  8e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00438278  normal  0.203557 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2769  50S ribosomal protein L10  37.58 
 
 
165 aa  90.5  8e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0338  50S ribosomal protein L10  37.58 
 
 
165 aa  90.5  8e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.550948  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0172  50S ribosomal protein L10  36.31 
 
 
161 aa  89.7  1e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.33126  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2470  50S ribosomal protein L10  34.88 
 
 
176 aa  89.7  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0147283  hitchhiker  0.00682166 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1372  50S ribosomal protein L10  33.33 
 
 
178 aa  89  2e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.188772  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1821  ribosomal protein L10  37.5 
 
 
179 aa  88.6  4e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0317  50S ribosomal protein L10  38.85 
 
 
173 aa  88.6  4e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0060406  hitchhiker  0.00087235 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3036  50S ribosomal protein L10  36.31 
 
 
168 aa  88.2  5e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0878547 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2697  50S ribosomal protein L10P  41.26 
 
 
172 aa  87.8  5e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.561782  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0351  ribosomal protein L10  34.19 
 
 
160 aa  88.2  5e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0874946  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0385  50S ribosomal protein L10  37.59 
 
 
177 aa  87.8  6e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0360  50S ribosomal protein L10  37.59 
 
 
177 aa  87.8  6e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1509  ribosomal protein L10  33.12 
 
 
176 aa  87.4  7e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000272992  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0671  50S ribosomal protein L10  37.41 
 
 
174 aa  87.4  8e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1665  50S ribosomal protein L10  37.91 
 
 
157 aa  87  1e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.701017  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0266  50S ribosomal protein L10  38.19 
 
 
165 aa  86.7  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.646007  normal  0.635943 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0617  50S ribosomal protein L10  38.85 
 
 
174 aa  86.7  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000383704 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0700  ribosomal protein L10  35.71 
 
 
174 aa  86.7  1e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.299689  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1337  50S ribosomal protein L10  39.13 
 
 
174 aa  87  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.900212  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1458  50S ribosomal protein L10  34.55 
 
 
159 aa  85.9  2e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000221032  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02410  ribosomal protein L10  38.12 
 
 
173 aa  86.3  2e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.609192 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0924  50S ribosomal protein L10  36.53 
 
 
173 aa  86.3  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2969  50S ribosomal protein L10  36.13 
 
 
168 aa  85.9  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.45658 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1927  ribosomal protein L10  36.02 
 
 
176 aa  86.3  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0948645  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2850  50S ribosomal protein L10  35.9 
 
 
165 aa  85.9  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.675463 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3316  50S ribosomal protein L10  36.13 
 
 
168 aa  85.9  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.354504  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0140  50S ribosomal protein L10  34.38 
 
 
174 aa  86.3  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000236563  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3337  50S ribosomal protein L10  36.53 
 
 
173 aa  86.3  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000271161 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0692  50S ribosomal protein L10  35.57 
 
 
172 aa  85.5  3e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000112903  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0257  50S ribosomal protein L10  38.19 
 
 
188 aa  85.5  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0591157  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0507  50S ribosomal protein L10  33.94 
 
 
159 aa  85.1  4e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000655679  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_863  ribosomal protein L10  35.53 
 
 
176 aa  84.7  5e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000130926  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0526  50S ribosomal protein L10  33.94 
 
 
159 aa  84.3  6e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.142497  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3756  50S ribosomal protein L10  36.81 
 
 
184 aa  84.3  6e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0407684  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3467  50S ribosomal protein L10  36.81 
 
 
184 aa  84.3  6e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0108818  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1059  50S ribosomal protein L10  37.41 
 
 
174 aa  84.7  6e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0531801  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3818  50S ribosomal protein L10  36.81 
 
 
184 aa  84.3  7e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.881367  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0361  50S ribosomal protein L10  35.33 
 
 
190 aa  84.3  7e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000502234  hitchhiker  0.0000804712 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0271  50S ribosomal protein L10  33.55 
 
 
178 aa  84.3  7e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00121092  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2643  50S ribosomal protein L10  36.81 
 
 
165 aa  84  8e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3788  50S ribosomal protein L10  36.81 
 
 
165 aa  84  8e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.166109  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1634  50S ribosomal protein L10  39.85 
 
 
174 aa  84  8e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1912  50S ribosomal protein L10  36.81 
 
 
165 aa  84  8e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000184172  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0991  50S ribosomal protein L10  36.18 
 
 
176 aa  83.6  0.000000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000204805  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0882  50S ribosomal protein L10  36.18 
 
 
176 aa  83.6  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.629984  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17270  LSU ribosomal protein L10P  41.13 
 
 
173 aa  83.2  0.000000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1956  ribosomal protein L10  32.91 
 
 
174 aa  83.2  0.000000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3691  ribosomal protein L10  35.25 
 
 
164 aa  83.6  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000101089  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0286  50S ribosomal protein L10  36.14 
 
 
172 aa  84  0.000000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000520195  hitchhiker  0.00386218 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2223  50S ribosomal protein L10  35.57 
 
 
174 aa  82.4  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00194446 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1547  50S ribosomal protein L10  38.36 
 
 
173 aa  83.2  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.834427 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0231  50S ribosomal protein L10  33.33 
 
 
172 aa  82.8  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0103356  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2865  50S ribosomal protein L10  35.25 
 
 
174 aa  82  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.161934  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0239  50S ribosomal protein L10  36.81 
 
 
165 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0229066 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>