More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_1964 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_1964  50S ribosomal protein L10  100 
 
 
172 aa  345  1e-94  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.202865  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0231  50S ribosomal protein L10  81.98 
 
 
172 aa  294  3e-79  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0103356  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2681  50S ribosomal protein L10  80.81 
 
 
172 aa  292  1e-78  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000132453  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0194  50S ribosomal protein L10  81.4 
 
 
172 aa  290  6e-78  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000548969  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0355  50S ribosomal protein L10  75.58 
 
 
172 aa  279  1e-74  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000413063  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0317  50S ribosomal protein L10  71.51 
 
 
173 aa  258  3e-68  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0060406  hitchhiker  0.00087235 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0286  50S ribosomal protein L10  72.09 
 
 
172 aa  257  6e-68  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000520195  hitchhiker  0.00386218 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1547  50S ribosomal protein L10  42.44 
 
 
173 aa  135  4e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.834427 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0692  50S ribosomal protein L10  39.53 
 
 
172 aa  131  3.9999999999999996e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000112903  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2722  ribosomal protein L10  37.43 
 
 
170 aa  122  2e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0525449  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0183  ribosomal protein L10  35.29 
 
 
176 aa  120  9.999999999999999e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000324199  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0857  50S ribosomal protein L10  33.53 
 
 
177 aa  117  6e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000259828  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0617  50S ribosomal protein L10  36.99 
 
 
174 aa  117  7e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000383704 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1106  ribosomal protein L10  41.94 
 
 
176 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0567771  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01070  ribosomal protein L10  36.84 
 
 
172 aa  114  6.9999999999999995e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  5.51299e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0276  50S ribosomal protein L10  35.5 
 
 
175 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000204852  hitchhiker  0.000495958 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2074  50S ribosomal protein L10  33.72 
 
 
172 aa  110  8.000000000000001e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0700  ribosomal protein L10  34.71 
 
 
174 aa  108  3e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.299689  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2470  50S ribosomal protein L10  33.33 
 
 
176 aa  108  4.0000000000000004e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0147283  hitchhiker  0.00682166 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0310  ribosomal protein L10  36.9 
 
 
176 aa  108  5e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.109625  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2865  50S ribosomal protein L10  34.1 
 
 
174 aa  107  9.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.161934  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0924  50S ribosomal protein L10  34.29 
 
 
173 aa  106  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3337  50S ribosomal protein L10  34.29 
 
 
173 aa  106  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000271161 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2722  50S ribosomal protein L10P  32.74 
 
 
178 aa  104  5e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000314918  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0096  50S ribosomal protein L10  32.93 
 
 
166 aa  103  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2724  50S ribosomal protein L10  33.77 
 
 
166 aa  103  1e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000159716  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2410  50S ribosomal protein L10  33.77 
 
 
166 aa  103  1e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000332682  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0671  50S ribosomal protein L10  34.29 
 
 
174 aa  103  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1372  50S ribosomal protein L10  32.56 
 
 
178 aa  102  2e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.188772  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2344  ribosomal protein L10  31.76 
 
 
173 aa  102  3e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.032292  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2783  50S ribosomal protein L10  33.53 
 
 
172 aa  101  4e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00189787  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1059  50S ribosomal protein L10  34.09 
 
 
174 aa  100  7e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0531801  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1337  50S ribosomal protein L10  33.53 
 
 
174 aa  100  8e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.900212  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0100  50S ribosomal protein L10  32.34 
 
 
166 aa  98.2  5e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000689021  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5206  50S ribosomal protein L10  33.14 
 
 
166 aa  97.8  7e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000252117  unclonable  5.898740000000001e-26 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1634  50S ribosomal protein L10  31.58 
 
 
174 aa  97.8  7e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0094  50S ribosomal protein L10  33.73 
 
 
166 aa  97.8  7e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000793252  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0093  50S ribosomal protein L10  33.53 
 
 
166 aa  97.4  8e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000759135  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0120  50S ribosomal protein L10  33.14 
 
 
166 aa  96.7  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000126178  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0099  50S ribosomal protein L10  33.14 
 
 
166 aa  96.7  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000477259  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0099  50S ribosomal protein L10  33.14 
 
 
166 aa  96.7  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000073314  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0095  50S ribosomal protein L10  33.14 
 
 
166 aa  96.7  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  8.69083e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0093  50S ribosomal protein L10  33.14 
 
 
166 aa  96.7  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000338487  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0110  50S ribosomal protein L10  33.14 
 
 
166 aa  96.7  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.02318e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0099  50S ribosomal protein L10  33.14 
 
 
166 aa  96.7  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000718586  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0130  50S ribosomal protein L10  33.14 
 
 
166 aa  96.7  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000124346  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0180  50S ribosomal protein L10  31.36 
 
 
166 aa  95.5  3e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0693527  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0838  50S ribosomal protein L10P  34.88 
 
 
172 aa  95.1  4e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0707377  normal  0.0995834 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0408  50S ribosomal protein L10  37.5 
 
 
174 aa  94.7  5e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.79305e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0205  50S ribosomal protein L10  32.16 
 
 
181 aa  94.4  7e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000665859  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1667  50S ribosomal protein L10  34.48 
 
 
173 aa  92.8  2e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1821  ribosomal protein L10  32.56 
 
 
179 aa  92.4  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0562  50S ribosomal protein L10  30.41 
 
 
166 aa  91.7  5e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000233555  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0576  50S ribosomal protein L10  30.41 
 
 
166 aa  91.7  5e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000179203  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0441  50S ribosomal protein L10  27.81 
 
 
189 aa  90.9  9e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0757  50S ribosomal protein L10  32.93 
 
 
174 aa  90.1  1e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1453  50S ribosomal protein L10  29.65 
 
 
173 aa  89.7  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4479  ribosomal protein L10  34.81 
 
 
177 aa  89.7  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.028261  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2223  50S ribosomal protein L10  33.33 
 
 
174 aa  88.6  3e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00194446 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1889  50S ribosomal protein L10  33.33 
 
 
175 aa  88.6  4e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00905403  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1529  ribosomal protein L10  31.36 
 
 
183 aa  88.2  5e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000554953  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2178  ribosomal protein L10  32.16 
 
 
175 aa  87.8  7e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.905696 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0226  ribosomal protein L10  33.33 
 
 
173 aa  87.8  7e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20980  LSU ribosomal protein L10P  34.42 
 
 
203 aa  87.4  8e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.996084  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2164  50S ribosomal protein L10P  31.79 
 
 
174 aa  87.4  9e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0596262  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2179  50S ribosomal protein L10  32.75 
 
 
175 aa  86.3  2e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.82519  normal  0.0244994 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0300  ribosomal protein L10  29.76 
 
 
181 aa  85.5  3e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000817286  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0270  50S ribosomal protein L10  32.56 
 
 
174 aa  85.5  3e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.247547  hitchhiker  0.00145059 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3451  ribosomal protein L10  33.93 
 
 
176 aa  85.5  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00335052  normal  0.0391621 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1509  ribosomal protein L10  31.03 
 
 
176 aa  85.1  5e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000272992  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1927  ribosomal protein L10  27.33 
 
 
176 aa  84.3  8e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0948645  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4018  ribosomal protein L10  37.78 
 
 
174 aa  83.6  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.491975 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2994  50S ribosomal protein L10  27.91 
 
 
173 aa  83.6  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0213  ribosomal protein L10  29.59 
 
 
175 aa  82.8  0.000000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.623588  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2697  50S ribosomal protein L10P  31.03 
 
 
172 aa  83.2  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.561782  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4521  ribosomal protein L10  34.51 
 
 
200 aa  83.2  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2361  50S ribosomal protein L10  31.61 
 
 
174 aa  82.8  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4758  50S ribosomal protein L10  32.53 
 
 
166 aa  81.6  0.000000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00494482  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1387  50S ribosomal protein L10  30.92 
 
 
171 aa  81.6  0.000000000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000123079  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0445  50S ribosomal protein L10  31.93 
 
 
166 aa  81.3  0.000000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.470652  unclonable  0.000000241771 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0475  50S ribosomal protein L10  31.93 
 
 
166 aa  81.3  0.000000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.372242  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2273  50S ribosomal protein L10  31.03 
 
 
174 aa  81.3  0.000000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1474  50S ribosomal protein L10  32.96 
 
 
181 aa  81.3  0.000000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000103472  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0297  50S ribosomal protein L10  35 
 
 
172 aa  81.3  0.000000000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0478  50S ribosomal protein L10  31.93 
 
 
195 aa  80.9  0.000000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00597987  hitchhiker  0.00527924 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1665  50S ribosomal protein L10  33.97 
 
 
157 aa  80.9  0.000000000000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.701017  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6637  ribosomal protein L10  32.9 
 
 
184 aa  80.1  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.858869  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0313  50S ribosomal protein L10  29.87 
 
 
166 aa  79.3  0.00000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000558823  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0632  50S ribosomal protein L10  27.88 
 
 
175 aa  79.3  0.00000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.346234  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1590  50S ribosomal protein L10  30.46 
 
 
174 aa  79.7  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0567  50S ribosomal protein L10  32.24 
 
 
167 aa  79.3  0.00000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00969269  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0596  50S ribosomal protein L10  30.72 
 
 
172 aa  79  0.00000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0140503  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1318  50S ribosomal protein L10  33.76 
 
 
161 aa  79.3  0.00000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000548659  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0179  50S ribosomal protein L10  33.12 
 
 
161 aa  78.6  0.00000000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.215322  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1325  ribosomal protein L10  30.23 
 
 
256 aa  78.6  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0449  50S ribosomal protein L10  30.77 
 
 
175 aa  78.6  0.00000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0172  50S ribosomal protein L10  33.12 
 
 
161 aa  78.2  0.00000000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.33126  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3157  ribosomal protein L10  37.5 
 
 
173 aa  78.2  0.00000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500065  normal  0.290514 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4557  50S ribosomal protein L10  30.72 
 
 
166 aa  78.2  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.669843  decreased coverage  0.0090203 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4678  50S ribosomal protein L10  32.74 
 
 
182 aa  77.8  0.00000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000989378  decreased coverage  0.00291158 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>