More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0632 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0632  50S ribosomal protein L10  100 
 
 
175 aa  350  5.9999999999999994e-96  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.346234  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27791  50S ribosomal protein L10  64.57 
 
 
175 aa  234  5.0000000000000005e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4011  ribosomal protein L10  65.71 
 
 
175 aa  233  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0274883  hitchhiker  0.0000000471613 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1038  50S ribosomal protein L10  64.37 
 
 
183 aa  233  1.0000000000000001e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.101211  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1738  50S ribosomal protein L10  62.72 
 
 
189 aa  232  3e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1762  50S ribosomal protein L10  62.72 
 
 
189 aa  232  3e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.232126  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02201  50S ribosomal protein L10  61.14 
 
 
175 aa  230  9e-60  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.825352  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02221  50S ribosomal protein L10  60.57 
 
 
175 aa  229  2e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2554  50S ribosomal protein L10  64.57 
 
 
181 aa  229  2e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0140545  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0204  50S ribosomal protein L10  60.57 
 
 
175 aa  228  5e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02201  50S ribosomal protein L10  64.67 
 
 
175 aa  225  2e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.756015  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02311  50S ribosomal protein L10  59.43 
 
 
175 aa  225  2e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2469  50S ribosomal protein L10  64.33 
 
 
175 aa  223  1e-57  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.851244  normal  0.156602 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2154  50S ribosomal protein L10  61.14 
 
 
175 aa  218  3e-56  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.44563  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1018  50S ribosomal protein L10  57.56 
 
 
178 aa  217  7e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00251564 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1569  50S ribosomal protein L10  57.71 
 
 
175 aa  215  2.9999999999999998e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02781  50S ribosomal protein L10  57.71 
 
 
175 aa  215  2.9999999999999998e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.210657  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0263  50S ribosomal protein L10  53.01 
 
 
190 aa  200  9.999999999999999e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.273866  normal  0.119153 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08440  ribosomal protein L10  41.04 
 
 
173 aa  117  7e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.166227  normal  0.704722 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2331  ribosomal protein L10  44.71 
 
 
173 aa  117  7e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.910628 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_14715  predicted protein  39.43 
 
 
182 aa  113  2.0000000000000002e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0692  50S ribosomal protein L10  36.53 
 
 
172 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000112903  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0671  50S ribosomal protein L10  37.13 
 
 
174 aa  107  7.000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0838  50S ribosomal protein L10P  35.88 
 
 
172 aa  107  1e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0707377  normal  0.0995834 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3337  50S ribosomal protein L10  34.71 
 
 
173 aa  106  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000271161 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0924  50S ribosomal protein L10  34.71 
 
 
173 aa  106  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1927  ribosomal protein L10  38.73 
 
 
176 aa  105  3e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0948645  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0700  ribosomal protein L10  33.92 
 
 
174 aa  105  4e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.299689  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1043  ribosomal protein L10  39.73 
 
 
167 aa  104  5e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.144449  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0093  50S ribosomal protein L10  37.34 
 
 
166 aa  103  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000759135  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0099  50S ribosomal protein L10  36.71 
 
 
166 aa  103  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000477259  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0099  50S ribosomal protein L10  36.71 
 
 
166 aa  103  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000073314  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0095  50S ribosomal protein L10  36.71 
 
 
166 aa  103  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  8.69083e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0093  50S ribosomal protein L10  36.71 
 
 
166 aa  103  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000338487  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0130  50S ribosomal protein L10  36.71 
 
 
166 aa  103  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000124346  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0099  50S ribosomal protein L10  36.71 
 
 
166 aa  103  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000718586  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0120  50S ribosomal protein L10  36.71 
 
 
166 aa  103  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000126178  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0110  50S ribosomal protein L10  36.71 
 
 
166 aa  103  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.02318e-62 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1018  ribosomal protein L10  38.95 
 
 
202 aa  102  3e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5206  50S ribosomal protein L10  36.08 
 
 
166 aa  101  6e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000252117  unclonable  5.898740000000001e-26 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1547  50S ribosomal protein L10  36.09 
 
 
173 aa  101  6e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.834427 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2344  ribosomal protein L10  35.81 
 
 
173 aa  100  7e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.032292  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2865  50S ribosomal protein L10  35.71 
 
 
174 aa  100  9e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.161934  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0094  50S ribosomal protein L10  36.08 
 
 
166 aa  100  9e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000793252  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0857  50S ribosomal protein L10  34.86 
 
 
177 aa  99.4  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000259828  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1059  50S ribosomal protein L10  34.36 
 
 
174 aa  99.4  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0531801  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1325  ribosomal protein L10  34.55 
 
 
256 aa  99  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0325  50S ribosomal protein L10  33.14 
 
 
174 aa  98.6  4e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00522529  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1864  50S ribosomal protein L10  33.14 
 
 
174 aa  98.6  4e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0922754  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6637  ribosomal protein L10  41.29 
 
 
184 aa  97.8  7e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.858869  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0617  50S ribosomal protein L10  34.32 
 
 
174 aa  97.1  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000383704 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2074  50S ribosomal protein L10  35.93 
 
 
172 aa  96.7  1e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0562  50S ribosomal protein L10  32.28 
 
 
166 aa  95.5  3e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000233555  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0576  50S ribosomal protein L10  32.28 
 
 
166 aa  95.5  3e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000179203  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0276  50S ribosomal protein L10  39.84 
 
 
175 aa  95.5  4e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000204852  hitchhiker  0.000495958 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1337  50S ribosomal protein L10  34.97 
 
 
174 aa  94  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.900212  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0757  50S ribosomal protein L10  30.86 
 
 
174 aa  93.6  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0314  ribosomal protein L10  33.14 
 
 
175 aa  93.6  1e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000329441  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10664  50S ribosomal protein L10  36.9 
 
 
178 aa  93.2  2e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.50048e-25  normal  0.41253 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1124  ribosomal protein L10  37.84 
 
 
174 aa  92.8  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0313  50S ribosomal protein L10  32.05 
 
 
166 aa  91.3  7e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000558823  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1172  ribosomal protein L10  35.26 
 
 
173 aa  90.9  8e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000357466  unclonable  0.0000000289216 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1372  50S ribosomal protein L10  30.06 
 
 
178 aa  90.5  9e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.188772  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0389  ribosomal protein L10  33.73 
 
 
174 aa  90.9  9e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0096  50S ribosomal protein L10  32.5 
 
 
166 aa  89.7  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0100  50S ribosomal protein L10  35 
 
 
166 aa  89  3e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000689021  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2656  50S ribosomal protein L10  33.33 
 
 
175 aa  88.2  5e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.220618  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5114  ribosomal protein L10  31.33 
 
 
175 aa  87.8  7e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.316499  normal  0.732887 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0270  50S ribosomal protein L10  31.43 
 
 
174 aa  87.8  7e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.247547  hitchhiker  0.00145059 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1145  ribosomal protein L10  30.11 
 
 
182 aa  87.8  7e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000000394665  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0479  50S ribosomal protein L10  32 
 
 
179 aa  87.8  8e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.488036  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2333  50S ribosomal protein L10  33.33 
 
 
176 aa  87.4  8e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.275074  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0464  50S ribosomal protein L10  32 
 
 
179 aa  87.8  8e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0359791  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4318  50S ribosomal protein L10  37.5 
 
 
187 aa  87  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.561909  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2697  50S ribosomal protein L10P  33.73 
 
 
172 aa  87  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.561782  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2727  ribosomal protein L10  35.06 
 
 
172 aa  87  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.12165  normal  0.845294 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6059  50S ribosomal protein L10  37.91 
 
 
182 aa  87  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.749447  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02410  ribosomal protein L10  33.53 
 
 
173 aa  86.7  1e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.609192 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0180  50S ribosomal protein L10  34.85 
 
 
166 aa  86.3  2e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0693527  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4521  ribosomal protein L10  34.88 
 
 
200 aa  85.9  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17270  LSU ribosomal protein L10P  35.19 
 
 
173 aa  85.9  2e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0867  50S ribosomal protein L10  29.71 
 
 
175 aa  86.7  2e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0966  50S ribosomal protein L10  40.48 
 
 
175 aa  86.7  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.968319  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0310  ribosomal protein L10  34.48 
 
 
176 aa  86.3  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.109625  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0994  50S ribosomal protein L10  40.35 
 
 
175 aa  86.7  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0984  50S ribosomal protein L10  40.48 
 
 
175 aa  86.7  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.270382  normal  0.351336 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2038  50S ribosomal protein L10  30.86 
 
 
175 aa  85.5  3e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0258299  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0226  ribosomal protein L10  34.13 
 
 
173 aa  85.5  3e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2722  ribosomal protein L10  33.33 
 
 
170 aa  85.5  3e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0525449  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2783  50S ribosomal protein L10  37.32 
 
 
172 aa  85.5  4e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00189787  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3935  50S ribosomal protein L10  36.73 
 
 
181 aa  85.1  4e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.193843  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0213  ribosomal protein L10  32.93 
 
 
175 aa  85.1  4e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.623588  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4327  50S ribosomal protein L10  37.41 
 
 
181 aa  85.1  4e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1509  ribosomal protein L10  35.42 
 
 
176 aa  85.1  5e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000272992  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0571  50S ribosomal protein L10  35.54 
 
 
187 aa  84.7  6e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0317  50S ribosomal protein L10  30.29 
 
 
173 aa  84.3  8e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.146286  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2178  ribosomal protein L10  29.71 
 
 
175 aa  84.3  8e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.905696 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0441  50S ribosomal protein L10  35.62 
 
 
189 aa  84.3  8e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0488  50S ribosomal protein L10  30.29 
 
 
173 aa  84.3  8e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.169718  hitchhiker  0.00000169108 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0205  50S ribosomal protein L10  35.66 
 
 
181 aa  84  9e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000665859  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>